DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment BCAS3 and bcas3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001340073.1 Gene:BCAS3 / 54828 HGNCID:14347 Length:958 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_021337035.1 Gene:bcas3 / 393594 ZFINID:ZDB-GENE-040426-1257 Length:925 Species:Danio rerio


Alignment Length:955 Identity:791/955 - (82%)
Similarity:849/955 - (88%) Gaps:31/955 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     5 MATDSPRRPSRCTGGVVVRPQAVTEQSYMESVVTFLQDVVPQAYSGTPLTEEKEKIVWVRFENAD 69
            ||:|||||||||.||||||.||.|||||||||||||||||||||:|.|..:|||||||||||..|
Zfish     1 MASDSPRRPSRCAGGVVVRAQAATEQSYMESVVTFLQDVVPQAYTGAPPNDEKEKIVWVRFEKTD 65

Human    70 LNDTSRNLEFHEIHSTGNEPPLLIMIGYSDGMQVWSIPISGEAQELFSVRHGPIRAARILPAPQF 134
            :||.:|..||.|:||:||:|||.:||||:||||:|||.::|||||||||||||:|.|||||||..
Zfish    66 INDVARLPEFQEMHSSGNDPPLCLMIGYADGMQIWSISLNGEAQELFSVRHGPVRTARILPAPHI 130

Human   135 GAQKCDNFAEKRPLLGVCKSIGSSGTSPPYCCVDLYSLRTGEMVKSIQFKTPIYDLHCNKRILVV 199
            .:...|:|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   131 SSLNTDSFAEKRPLLGVCKSTGSSGTSPPYCCVDLYSLRTGEMVKSIQFKTPIYDLHCNKRILVV 195

Human   200 VLQEKIAAFDSCTFTKKFFVTSCYPCPGPNMNPIALGSRWLAYAENKLIRCHQSRGGACGDNIQS 264
            .|||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||
Zfish   196 SLQEKIAAFDSCTFMKKFFVTSCYPCPGPNFNPIALGSRWLAYAENKLIRCHQSRGGACGDNAQS 260

Human   265 YTATVISAAKTLKSGLTMVGKVVTQLTGTLPSGVTEDDVAIHSNSRRSPLVPGIITVIDTETVGE 329
            |||||||||||||:||||||||||||.|||||||.:::...||.:||||..||::|:|||.||||
Zfish   261 YTATVISAAKTLKTGLTMVGKVVTQLAGTLPSGVPDEEGTAHSGTRRSPHQPGVVTIIDTHTVGE 325

Human   330 GQVLVSEDSDSDGIVAHFPAHEKPVCCMAFNTSGMLLVTTDTLGHDFHVFQILTHPWSSSQCAVH 394
            ||||||||||.:|::||||||:||:.|||||.|||||||.|||||||||||||||||:|||.|||
Zfish   326 GQVLVSEDSDGEGLIAHFPAHDKPISCMAFNPSGMLLVTADTLGHDFHVFQILTHPWASSQSAVH 390

Human   395 HLYTLHRGETEAKVQDICFSHDCRWVVVSTLRGTSHVFPINPYGGQPCVRTHMSPRVVNRMSRFQ 459
            |||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||
Zfish   391 HLYTLHRGETEAKVQDICFSHDCRWVVISTLRGTSHVFPINPYGGAPCARTHMSPRVVNRMSRFQ 455

Human   460 KSAGLEEIEQELTSKQGGRCSPVPGLSSSPSGSPLHANQQINTKELIGSFLNVGRAYRLIGISGL 524
            ||||||||||||:|||||||||:||||||||||||||                            
Zfish   456 KSAGLEEIEQELSSKQGGRCSPIPGLSSSPSGSPLHA---------------------------- 492

Human   525 SGKLNSQDSYNNFTNNNPGNPRLSPLPSLMVVMPLAQIKQPMTLGTITKRTGPYLFGAGCFSIKA 589
              ||.||:|:|||||||.||||||.||||.||:|||||||||||||||||||||||||||||||.
Zfish   493 --KLTSQESFNNFTNNNMGNPRLSSLPSLTVVLPLAQIKQPMTLGTITKRTGPYLFGAGCFSIKT 555

Human   590 PCKVKPPPQISPSKSMGGEFCVAAIFGTSRSWFANNAGLKREKDQSKQVVVESLYIISCYGTLVE 654
            |||.|||||||||||.||||||||:|.:|||||..|..:|||||||:|.|||||||:||||.|||
Zfish   556 PCKAKPPPQISPSKSSGGEFCVAAVFASSRSWFITNPNIKREKDQSRQAVVESLYILSCYGNLVE 620

Human   655 HMMEPRPLSTAPKISDDTPLEMMTSPRASWTLVRTPQWNELQPPFNANHPLLLAADAVQYYQFLL 719
            |::||||:|||.|||||||||:.|.|||.|.|.|||||||||||||:||||:||:|.|||||:||
Zfish   621 HVLEPRPISTAQKISDDTPLELNTCPRACWNLARTPQWNELQPPFNSNHPLVLASDFVQYYQYLL 685

Human   720 AGLVPPGSPGPITRHGSYDSLASDHSGQEDEEWLSQVEIVTHTGPHRRLWMGPQFQFKTIHPSGQ 784
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   686 AGLVPPGSPGPITRHESYDSLASDHSGQEDEEWLSQVEIVTHTGPHRRLWMGPQFQFKTIHPSGQ 750

Human   785 TTVISSSSSVLQSHGPSDTPQPLLDFDTDDLDLNSLRIQPVRSDPVSMPGSSRPVSDRRGVSTVI 849
            |||||||||||||.|||||.|||||||||||||:|||||||||:|||||||||.|:||||.||||
Zfish   751 TTVISSSSSVLQSQGPSDTQQPLLDFDTDDLDLHSLRIQPVRSEPVSMPGSSRLVADRRGQSTVI 815

Human   850 DAASGTFDRSVTLLEVCGSWPEGFGLRHMSSMEHTEEGLRERLADAMAESPSRDVVGSGT-ELQR 913
            |..||.||||||||||||||||.||||||.|:|.|||||:|||||||:||||||:||||| ||||
Zfish   816 DTGSGMFDRSVTLLEVCGSWPESFGLRHMPSVEATEEGLKERLADAMSESPSRDIVGSGTAELQR 880

Human   914 EGSIETLSNSSGSTSGSIPRNFDGYRSPLPTNESQPLSLFPTGFP 958
            ||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||:||.||
Zfish   881 EGSIETLSNSSGSTSGSIPRNFEGYRSPLPTNESQPLSLYPTAFP 925

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
BCAS3NP_001340073.1 BCAS3 611..783 CDD:463605 143/171 (84%)
bcas3XP_021337035.1 WD40 <326..>428 CDD:441893 89/101 (88%)
BCAS3 577..749 CDD:463605 143/171 (84%)

Return to query results.
Submit another query.