DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment BCAS3 and Bcas3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001340073.1 Gene:BCAS3 / 54828 HGNCID:14347 Length:958 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_063125603.1 Gene:Bcas3 / 363662 RGDID:1560788 Length:1009 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:910 Identity:844/910 - (92%)
Similarity:858/910 - (94%) Gaps:45/910 - (4%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MNEAMATDSPRRPSRCTGGVVVRPQAVTEQSYMESVVTFLQDVVPQAYSGTPLTEEKEKIVWVRF 65
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MNETMATDSPRRPSRCTGGVVVRPQAVTEQSYMESVVTFLQDVVPQAYSGTPLTEEKEKIVWVRF 65

Human    66 ENADLNDTSRNLEFHEIHSTGNEPPLLIMIGYSDGMQVWSIPISGEAQELFSVRHGPIRAARILP 130
            ||||||||||||||||:||||||||||:|||||||||||.|||||||||||||||||:|||||||
  Rat    66 ENADLNDTSRNLEFHELHSTGNEPPLLVMIGYSDGMQVWGIPISGEAQELFSVRHGPVRAARILP 130

Human   131 APQFGAQKCDNFAEKRPLLGVCKSIGSSGTSPPYCCVDLYSLRTGEMVKSIQFKTPIYDLHCNKR 195
            |||.||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 APQLGAQKCDNFAEKRPLLGVCKSIGSSGTTPPYCCVDLYSLRTGEMVKSIQFKTPIYDLHCNKR 195

Human   196 ILVVVLQEKIAAFDSCTFTKKFFVTSCYPCPGPNMNPIALGSRWLAYAENKLIRCHQSRGGACGD 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 ILVVVLQEKIAAFDSCTFTKKFFVTSCYPCPGPNMNPIALGSRWLAYAENKLIRCHQSRGGACGD 260

Human   261 NIQSYTATVISAAKTLKSGLTMVGKVVTQLTGTLPSGVTEDDVAIHSNSRRSPLVPGIITVIDTE 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||:|||.||||||||||||||||||
  Rat   261 NIQSYTATVISAAKTLKSGLTMVGKVVTQLTGTLPSGVTDDDIAIHCNSRRSPLVPGIITVIDTE 325

Human   326 TVGEGQVLVSEDSDSDGIVAHFPAHEKPVCCMAFNTSGMLLVTTDTLGHDFHVFQILTHPWSSSQ 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 TVGEGQVLVSEDSDSDGIVAHFPAHEKPVCCMAFNTSGMLLVTTDTLGHDFHVFQILTHPWSSSQ 390

Human   391 CAVHHLYTLHRGETEAKVQDICFSHDCRWVVVSTLRGTSHVFPINPYGGQPCVRTHMSPRVVNRM 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 CAVHHLYTLHRGETEAKVQDICFSHDCRWVVVSTLRGTSHVFPINPYGGQPCVRTHMSPRVVNRM 455

Human   456 SRFQKSAGLEEIEQELTSKQGGRCSPVPGLSSSPSGSPLHANQQINTKELIGSFLNVGRAYRLIG 520
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                         
  Rat   456 SRFQKSAGLEEIEQELTSKQGGRCSPVPGLSSSPSGSPLH------------------------- 495

Human   521 ISGLSGKLNSQDSYNNFTNNNPGNPRLSPLPSLMVVMPLAQIKQPMTLGTITKRTGPYLFGAGCF 585
                 |||:|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||         
  Rat   496 -----GKLSSQDSYNNFTNNNPGNPRLSPLPSLMVVTPLAQIKQPMTLGTITKRTG--------- 546

Human   586 SIKAPCKVKPPPQISPSKSMGGEFCVAAIFGTSRSWFANNAGLKREKDQSKQVVVESLYIISCYG 650
                  ||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   547 ------KVKPPPQISPSKSMGGEFCVAAVFGTSRSWFANNAGLKREKDQSKQVVVESLYIISCYG 605

Human   651 TLVEHMMEPRPLSTAPKISDDTPLEMMTSPRASWTLVRTPQWNELQPPFNANHPLLLAADAVQYY 715
            ||||||:||||:|||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||
  Rat   606 TLVEHMIEPRPISTAPKISDDTPLEIMTSPRASWTLVRTPQWNELQPPFNANHPLLLAAEAVQYY 670

Human   716 QFLLAGLVPPGSPGPITRHGSYDSLASDHSGQEDEEWLSQVEIVTHTGPHRRLWMGPQFQFKTIH 780
            |.||||.:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   671 QLLLAGSLPPGSPGPITRHGSYDSLASDHSGQEDEEWLSQVEIVTHTGPHRRLWMGPQFQFKTIH 735

Human   781 PSGQTTVISSSSSVLQSHGPSDTPQPLLDFDTDDLDLNSLRIQPVRSDPVSMPGSSRPVSDRRGV 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   736 PSGQTTVISSSSSVLQSHGPSDTPQPLLDFDTDDLDLNSLRIQPVRSDPVSMPGSSRPVSDRRGV 800

Human   846 STVIDAASGTFDRSVTLLEVCGSWPEGFGLRHMSSMEHTEEGLRERLADAMAESPSRDVVGSGTE 910
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:
  Rat   801 STVIDAASGTFDRSVTLLEVCGSWPEGFGLRHMSSMEHTEEGLRERLADAMAESPSRDVVGSGTD 865

Human   911  910
              Rat   866  865

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
BCAS3NP_001340073.1 BCAS3 611..783 CDD:463605 163/171 (95%)
Bcas3XP_063125603.1 None

Return to query results.
Submit another query.