DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment BCAS3 and bcas3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001340073.1 Gene:BCAS3 / 54828 HGNCID:14347 Length:958 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_031752809.1 Gene:bcas3 / 100487875 XenbaseID:XB-GENE-6050317 Length:924 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:952 Identity:818/952 - (85%)
Similarity:873/952 - (91%) Gaps:30/952 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     5 MATDSPRRPSRCTGGVVVRPQAVTEQSYMESVVTFLQDVVPQAYSGTPLTEEKEKIVWVRFENAD 69
            |.|:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|.|||||||||||||:||
 Frog     1 MTTESPRRPSRCTGGVVVRPQAVTEQSYMESVVTFLQDVVPQAYSGSPTTEEKEKIVWVRFEDAD 65

Human    70 LNDTSRNLEFHEIHSTGNEPPLLIMIGYSDGMQVWSIPISGEAQELFSVRHGPIRAARILPAPQF 134
            |||..||:||||:|||||:||||:||||:||||:||||:|||||||||.|||.:|.||:||.|.|
 Frog    66 LNDAYRNMEFHEMHSTGNDPPLLLMIGYTDGMQIWSIPVSGEAQELFSARHGSVRCARVLPCPLF 130

Human   135 GAQKCDNFAEKRPLLGVCKSIGSSGTSPPYCCVDLYSLRTGEMVKSIQFKTPIYDLHCNKRILVV 199
            |:|.||:|:|||||||:|||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||:|||
 Frog   131 GSQMCDSFSEKRPLLGMCKSTGSCGTSQPYCCVDLYSLRTGEMVKSIQFKTPIYDLHCNKRVLVV 195

Human   200 VLQEKIAAFDSCTFTKKFFVTSCYPCPGPNMNPIALGSRWLAYAENKLIRCHQSRGGACGDNIQS 264
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||
 Frog   196 VLQEKIAAFDSCTFTKKFFVTSCYPCPGPNMNPIALGSRWLAYSENKLIRCHQSRGGACGDNIQS 260

Human   265 YTATVISAAKTLKSGLTMVGKVVTQLTGTLPSGVTEDDVAIHSNSRRSPLVPGIITVIDTETVGE 329
            ||||||:||||||:|||||||||||||||||:|..::|...|||:||||.|||:||:||||||.:
 Frog   261 YTATVINAAKTLKTGLTMVGKVVTQLTGTLPAGTPDEDQPTHSNARRSPFVPGVITIIDTETVPK 325

Human   330 GQVLVSEDSDSDGIVAHFPAHEKPVCCMAFNTSGMLLVTTDTLGHDFHVFQILTHPWSSSQCAVH 394
            |||||||:||.:||||||||||||:||||||.|||:|||:|||||||||||||||||||||.|||
 Frog   326 GQVLVSEESDGEGIVAHFPAHEKPICCMAFNPSGMMLVTSDTLGHDFHVFQILTHPWSSSQSAVH 390

Human   395 HLYTLHRGETEAKVQDICFSHDCRWVVVSTLRGTSHVFPINPYGGQPCVRTHMSPRVVNRMSRFQ 459
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
 Frog   391 HLYTLHRGETEAKVQDICFSHDCRWVVVSTLRGTSHVFPINPYGGQPCVRTHTSPRVVNRMSRFQ 455

Human   460 KSAGLEEIEQELTSKQGGRCSPVPGLSSSPSGSPLHANQQINTKELIGSFLNVGRAYRLIGISGL 524
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                             
 Frog   456 KSAGLEEIEQELTSKQGGRCSPVPGLSSSPSGSPLH----------------------------- 491

Human   525 SGKLNSQDSYNNFTNNNPGNPRLSPLPSLMVVMPLAQIKQPMTLGTITKRTGPYLFGAGCFSIKA 589
             ||||||||||||.|||||||||||||||:||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   492 -GKLNSQDSYNNFINNNPGNPRLSPLPSLIVVQPLVQIKQPMTLGTITKRTGPYLFGAGCFSIKA 555

Human   590 PCKVKPPPQISPSKSMGGEFCVAAIFGTSRSWFANNAGLKREKDQSKQVVVESLYIISCYGTLVE 654
            |||.||.||||||||.||||||||:||:||||||:|..:||:||||||.:|||||||||||||||
 Frog   556 PCKAKPAPQISPSKSTGGEFCVAAVFGSSRSWFASNQSIKRDKDQSKQCIVESLYIISCYGTLVE 620

Human   655 HMMEPRPLSTAPKISDDTPLEMMTSPRASWTLVRTPQWNELQPPFNANHPLLLAADAVQYYQFLL 719
            |.:||||.|||.||:|||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||:||
 Frog   621 HFLEPRPSSTALKINDDTPLEMWTSPRASWTLVRTPQWNELQPPFYANHPLLLAADVVQYYQYLL 685

Human   720 AGLVPPGSPGPITRHGSYDSLASDHSGQEDEEWLSQVEIVTHTGPHRRLWMGPQFQFKTIHPSGQ 784
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   686 AGLVPPGSPGPITRHGSYDSLASDHSGQEDEEWLSQVEIVTHTGPHRRLWMGPQFQFKTIHPSGQ 750

Human   785 TTVISSSSSVLQSHGPSDTPQPLLDFDTDDLDLNSLRIQPVRSDPVSMPGSSRPVSDRRGVSTVI 849
            |||||||||||.||||:|||||||:||||||.|||||||||||:|||||||.||||||||.||||
 Frog   751 TTVISSSSSVLHSHGPNDTPQPLLEFDTDDLALNSLRIQPVRSEPVSMPGSPRPVSDRRGTSTVI 815

Human   850 DAASGTFDRSVTLLEVCGSWPEGFGLRHMSSMEHTEEGLRERLADAMAESPSRDVVGSGTELQRE 914
            ||.||.:|||||||||||||||..||||:||:|.|:|||||||||||:|||:||||||||||:|:
 Frog   816 DATSGAYDRSVTLLEVCGSWPESSGLRHISSIESTDEGLRERLADAMSESPNRDVVGSGTELRRD 880

Human   915 GSIETLSNSSGSTSGSIPRNFDGYRSPLPTNESQPLSLFPTG 956
            |||||||||||||||||||||||||:.|||||:|||||||||
 Frog   881 GSIETLSNSSGSTSGSIPRNFDGYRTTLPTNENQPLSLFPTG 922

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
BCAS3NP_001340073.1 BCAS3 611..783 CDD:463605 153/171 (89%)
bcas3XP_031752809.1 WD40 340..>445 CDD:475233 98/104 (94%)
WD40 repeat 350..397 CDD:293791 41/46 (89%)
WD40 repeat 405..443 CDD:293791 37/37 (100%)
BCAS3 577..749 CDD:463605 153/171 (89%)

Return to query results.
Submit another query.