DRSC - DRSC Integrative Ortholog Prediction Tool

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Protein Alignment KIF1A and Kif1a

DIOPT Version :9

Sequence 1:	NP_001366560.1	Gene:	KIF1A / 547	HGNCID:	888	Length:	1816	Species:	Homo sapiens
Sequence 2:	XP_038940678.1	Gene:	Kif1a / 363288	RGDID:	1304996	Length:	1800	Species:	Rattus norvegicus

Alignment Length:	1826	Identity:	1745/1826 - (95%)
Similarity:	1767/1826 - (96%)	Gaps:	36/1826 - (1%)

- Green bases have known domain annotations that are detailed below.

Human     1 MAGASVKVAVRVRPFNSREMSRDSKCIIQMSGSTTTIVNPKQPKETPKSFSFDYSYWSHTSPEDI 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MAGASVKVAVRVRPFNSREMSRDSKCIIQMSGSTTTIVNPKQPKETPKSFSFDYSYWSHTSPEDI 65

Human    66 NYASQKQVYRDIGEEMLQHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEKDQQGIIPQLCEDLFSRI 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 NYASQKQVYRDIGEEMLQHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEKDQQGIIPQLCEDLFSRI 130

Human   131 NDTTNDNMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVEDLSKLAVTSYNDIQDL 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 NDTTNDNMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVEDLSKLAVTSYNDIQDL 195

Human   196 MDSGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFNIIFTQKRHDAETNITTEKVSKISLVDLAGSERADSTGA 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 MDSGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFNIIFTQKRHDAETNITTEKVSKISLVDLAGSERADSTGA 260

Human   261 KGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEMDSGPNKNKKKKKTDFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSRT 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 KGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEMDSGPNKNKKKKKTDFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSRT 325

Human   326 AMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIRCNAVINEDPNNKLIRELKDEVTRLRDLLYAQGLGD 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 AMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIRCNAIINEDPNNKLIRELKDEVTRLRDLLYAQGLGD 390

Human   391 ITDTNTVPGGPKYVSDLENNNLNRGGTVNEAPDPLSTVTNALVGMSPSSSLSALSSRAASVSSLH 455
            ||||||||||||                         :|||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 ITDTNTVPGGPK-------------------------LTNALVGMSPSSSLSALSSRAASVSSLH 430

Human   456 ERILFAPGSEEAIERLKETEKIIAELNETWEEKLRRTEAIRMEREALLAEMGVAMREDGGTLGVF 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   431 ERILFAPGSEEAIERLKETEKIIAELNETWEEKLRRTEAIRMEREALLAEMGVAMREDGGTLGVF 495

Human   521 SPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYYIKDGITRVGREDGERRQDIVLSGHFIKEEHCVFRSDSRGGS 585
            ||||||||||||||||||||||||||||:|||||||.||||||||||||||||||:||||||||.
  Rat   496 SPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYYIKDGVTRVGREDAERRQDIVLSGHFIKEEHCIFRSDSRGGG 560

Human   586 EAVVTLEPCEGADTYVNGKKVTEPSILRSGNRIIMGKSHVFRFNHPEQARQERERTPCAETPAEP 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   561 EAVVTLEPCEGADTYVNGKKVTEPSILRSGNRIIMGKSHVFRFNHPEQARQERERTPCAETPAEP 625

Human   651 VDWAFAQRELLEKQGIDMKQEMEQRLQELEDQYRREREEATYLLEQQRLDYESKLEALQKQMDSR 715
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   626 VDWAFAQRELLEKQGIDMKQEMEQRLQELEDQYRREREEATYLLEQQRLDYESKLEALQKQMDSR 690

Human   716 YYPEVNEEEEEPEDEVQWTERECELALWAFRKWKWYQFTSLRDLLWGNAIFLKEANAISVELKKK 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   691 YYPEVNEEEEEPEDEVQWTERECELALWAFRKWKWYQFTSLRDLLWGNAIFLKEANAISVELKKK 755

Human   781 VQFQFVLLTDTLYSPLPPDLLPPEAAKDRETRPFPRTIVAVEVQDQKNGATHYWTLEKLRQRLDL 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   756 VQFQFVLLTDTLYSPLPPDLLPPEAAKDRETRPFPRTIVAVEVQDQKNGATHYWTLEKLRQRLDL 820

Human   846 MREMYDRAAEVPSSVIEDCDNVVTGGDPFYDRFPWFRLVGSSAISGCNSYPLLNTCMSERMAALT 910
            |||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
  Rat   821 MREMYDRAAEVPSSVVEDCDNVVTGGDPFYDRFPWFRLVGSSVISGCNSYPLLNTCMSERMAALT 885

Human   911 PSPTFSSPDSDATEPAEEQSVG-EEEEEEEEEEDEEEEDLEDDVFPEHALCDGRDPFYDRPPLFS 974
            |||||||||||.|||||||||| ||||||||||:||||||||||||||.||||:|||||||||||
  Rat   886 PSPTFSSPDSDTTEPAEEQSVGEEEEEEEEEEEEEEEEDLEDDVFPEHTLCDGQDPFYDRPPLFS 950

Human   975 LVGRAFVYLSNLLYPVPLVHRVAIVSEKGEVKGFLRVAVQAISADEEAPDYGSGVRQSGTAKISF 1039
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   951 LVGRAFVYLSNLLYPVPLVHRVAIVSEKGEVKGFLRVAVQAISADEEAPDYGSGVRQSGTAKISF 1015

Human  1040 DDQHFEKFQSESCPVVGMSRSGTSQEELRIVEGQGQGADVGPSADEVNNNTCSAVPPEGLLLDSS 1104
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||| ||||.
  Rat  1016 DDQHFEKFQSESCPVVGMSRSGTSQEELRIVEGQGQGADAGPSADEVNNNTCSAVPPEG-LLDSP 1079

Human  1105 EKAALDGPLDAALDHLRLGNTFTFRVTVLQASSISAEYADIFCQFNFIHRHDEAFSTEPLKNTGR 1169
            ||||||||||.||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1080 EKAALDGPLDTALDHLRLGSTFTFRVTVLQASSISAEYADIFCQFNFIHRHDEAFSTEPLKNTGR 1144

Human  1170 GPPLGFYHVQNIAVEVTKSFIEYIKSQPIVFEVFGHYQQHPFPPLCKDVLSPLRPSRRHFPRVMP 1234
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1145 GPPLGFYHVQNIAVEVTKSFIEYIKSQPIVFEVFGHYQQHPFPPLCKDVLSPLRPSRRHFPRVMP 1209

Human  1235 LSKPVPATKLSTLTRPCPGPCHCKYDLLVYFEICELEANGDYIPAVVDHRGGMPCMGTFLLHQGI 1299
            ||||||||||||:|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1210 LSKPVPATKLSTMTRPSPGPCHCKYDLLVYFEICELEANGDYIPAVVDHRGGMPCMGTFLLHQGI 1274

Human  1300 QRRITVTLLHETGSHIRWKEVRELVVGRIRNTPETDESLIDPNILSLNILSSGYIHPAQDD---- 1360
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||:||||||
  Rat  1275 QRRITVTLLHETGSHIRWKEVRELVVGRIRNTPETDEALIDPNILSLNILSSGYVHPAQDDRQFL 1339

Human  1361 -----RTFYQFEAAWDSSMHNSLLLNRVTPYREKIYMTLSAYIEMENCTQPAVVTKDFCMVFYSR 1420
                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||
  Rat  1340 DSDIPRTFYQFEAAWDSSMHNSLLLNRVTPYREKIYMTLSAYIEMENCTQPAVITKDFCMVFYSR 1404

Human  1421 DAKLPASRSIRNLFGSGSLRASESNRVTGVYELSLCHVADAGSPGMQRRRRRVLDTSVAYVRGEE 1485
            |||||||||||||||||||||:|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1405 DAKLPASRSIRNLFGSGSLRATEGNRVTGVYELSLCHVADAGSPGMQRRRRRVLDTSVAYVRGEE 1469

Human  1486 NLAGWRPRSDSLILDHQWELEKLSLLQEVEKTRHYLLLREKLETAQRPVPEALSPAFSEDSESHG 1550
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||.||||||..
  Rat  1470 NLAGWRPRSDSLILDHQWELEKLSLLQEVEKTRHYLLLREKLETTQRPVPEVLSPASSEDSESRS 1534

Human  1551 SSSASSPLSAEGRPSPLEAPNERQRELAVKCLRLLTHTFNREYTHSHVCVSASESKLSEMSVTLL 1615
            ||.|||||||||:|||||.||||||||||||||||.|||||||||||||:||||||||||||||:
  Rat  1535 SSGASSPLSAEGQPSPLEVPNERQRELAVKCLRLLMHTFNREYTHSHVCISASESKLSEMSVTLM 1599

Human  1616 RDPSMSPLGVATLTPSSTCPSLVEGRYGATDLRTPQPCSRPASPEPELLPEADSKKLPSPARATE 1680
            |||||||||.||||||||||||:||||||||:|||||||||||||||||||.||||.|||.||||
  Rat  1600 RDPSMSPLGAATLTPSSTCPSLIEGRYGATDVRTPQPCSRPASPEPELLPELDSKKTPSPVRATE 1664

Human  1681 TDKEPQRLLVPDIQEIRVSPIVSKKGYLHFLEPHTSGWARRFVVVRRPYAYMYNSDKDTVERFVL 1745
            |:|||||||||||||||||||||||||||||||||:|||:|||||||||||||||||||||||||
  Rat  1665 TEKEPQRLLVPDIQEIRVSPIVSKKGYLHFLEPHTAGWAKRFVVVRRPYAYMYNSDKDTVERFVL 1729

Human  1746 NLATAQVEYSEDQQAMLKTPNTFAVCTEHRGILLQAASDKDMHDWLYAFNPLLAGTIRSKLSRRR 1810
            ||:|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1730 NLSTAQVEYSEDQQAMLKTPNTFAVCTEHRGILLQANSDKDMHDWLYAFNPLLAGTIRSKLSRRR 1794

Human  1811 SAQMRV 1816
            ||||||
  Rat  1795 SAQMRV 1800

Known Domains:

Indicated by green bases in alignment.

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
KIF1A	NP_001366560.1	None
Kif1a	XP_038940678.1	KISc_KIF1A_KIF1B	4..361	CDD:276816	355/356 (100%)
		Kinesin_assoc	358..524	CDD:406567	163/190 (86%)
		FHA	501..605	CDD:238017	99/103 (96%)
		KIF1B	814..861	CDD:403579	45/46 (98%)
		DUF3694	1250..1406	CDD:403614	143/155 (92%)
		PH_KIFIA_KIFIB	1681..1783	CDD:269939	97/101 (96%)

Information from Original Tools:

Tool	Simple Score	Weighted Score	Original Tool Information
Tool	Simple Score	Weighted Score	BLAST Result	Score	Score Type	Cluster ID
Compara	1	0.930	-	-		C83681192
Domainoid	1	1.000	688	1.000	Domainoid score	I3685
eggNOG	1	0.900	-	-		E2759_KOG0245
HGNC	1	1.500	-	-
Hieranoid	1	1.000	-	-
Homologene	1	1.000	-	-		H99729
Inparanoid	1	1.050	3305	1.000	Inparanoid score	I399
NCBI	1	1.000	-	-
OMA	1	1.010	-	-		QHG52590
OrthoDB	1	1.010	-	-		D131864at33208
OrthoFinder	1	1.000	-	-		FOG0001470
OrthoInspector	1	1.000	-	-		oto141307
orthoMCL	1	0.900	-	-		OOG6_100247
Panther	1	1.100	-	-	LDO	PTHR24115
Phylome	1	0.910	-	-
SonicParanoid	1	1.000	-	-		X1999
SwiftOrtho	1	1.000	-	-
TreeFam	0	0.000	Not matched by this tool.
	17	17.310