DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment KIF1A and unc-104

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_047300774.1 Gene:KIF1A / 547 HGNCID:888 Length:1825 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001022041.2 Gene:unc-104 / 174144 WormBaseID:WBGene00006831 Length:1628 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:1856 Identity:879/1856 - (47%)
Similarity:1154/1856 - (62%) Gaps:298/1856 - (16%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     4 ASVKVAVRVRPFNSREMSRDSKCIIQMSGSTTTIVNPKQPKETPKSFSFDYSYWSHTSPEDINYA 68
            :||||||||||||.||:|..|||::|::|:||||......||. .||:||:||||. :..|.::.
 Worm     2 SSVKVAVRVRPFNQREISNTSKCVLQVNGNTTTINGHSINKEN-FSFNFDHSYWSF-ARNDPHFI 64

Human    69 SQKQVYRDIGEEMLQHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGK-QEKDQQGIIPQLCEDLFSRIND 132
            :|||||.::|.|||:|||||||||||||||||:||||||||| .:.|:.||||:||.|||:||::
 Worm    65 TQKQVYEELGVEMLEHAFEGYNVCIFAYGQTGSGKSYTMMGKANDPDEMGIIPRLCNDLFARIDN 129

Human   133 TTNDNMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVEDLSKLAVTSYNDIQDLMD 197
            ..:.::.|||||||||||||||:|||||.:.|||||||||||||||:||:|:||.||:||.:|||
 Worm   130 NNDKDVQYSVEVSYMEIYCERVKDLLNPNSGGNLRVREHPLLGPYVDDLTKMAVCSYHDICNLMD 194

Human   198 SGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFNIIFTQKRHDAETNITTEKVSKISLVDLAGSERADSTGAKG 262
            .|||||||||||||.|||||||||.|:.|||||.|::|:.|||.||||||||||||||:||||:|
 Worm   195 EGNKARTVAATNMNSTSSRSHAVFTIVLTQKRHCADSNLDTEKHSKISLVDLAGSERANSTGAEG 259

Human   263 TRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEMDSGPNKNKKKKKTDFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSRTAM 327
            .||||||||||||||||.|||.|||    .:..|||.....||||||||||||||||||||:|||
 Worm   260 QRLKEGANINKSLTTLGLVISKLAE----ESTKKKKSNKGVIPYRDSVLTWLLRENLGGNSKTAM 320

Human   328 VAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIRCNAVINEDPNNKLIRELKDEVTRLRDLLYAQGLGDIT 392
            :|||||||||:||||||||||||||||.|.||:|||||.||||||.:||.:||.:|..:|: |:|
 Worm   321 LAALSPADINFDETLSTLRYADRAKQIVCQAVVNEDPNAKLIRELNEEVIKLRHILKDKGI-DVT 384

Human   393 DTNTVPG----GPKYVSDLENNNLNRGGTVNEAPDPLSTVTNALVGMSPSSSLSALSSRAASVSS 453
            |....||    |||.                                               .:.
 Worm   385 DVQETPGKHKKGPKL-----------------------------------------------PAH 402

Human   454 LHERILFAPGSEEAIERLKETEKIIAELNETWEEKLRRTEAIRMEREALLAEMGVAMREDGGTLG 518
            :||:          :|:|:|:||::||:.:|||:||..||.||.:||..|.:||:|..|||.|||
 Worm   403 VHEQ----------LEKLQESEKLMAEIGKTWEQKLIHTEEIRKQREEELRDMGLACAEDGTTLG 457

Human   519 VFSPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYYIKDGITRVGREDGERRQDIVLSGHFIKEEHCVFRSDSRG 583
            ||||||.||||||||||||||||:||:|:|:|.|||.:.|.|.||:|||..|.|.||.|.::.  
 Worm   458 VFSPKKLPHLVNLNEDPLMSECLIYYLKEGVTSVGRPEAEHRPDILLSGEAILELHCEFINED-- 520

Human   584 GSEAVVTLEPCEGADTYVNGKKVTEPSILRSGNRIIMGKSHVFRFNHPEQARQERERTPCAETPA 648
             ....:|::|  .|..|:|||:||.|::|.:|:|:|:|:.||||:|.|::|||.|..  .|....
 Worm   521 -GNVTLTMKP--NASCYINGKQVTTPTVLHTGSRVILGEHHVFRYNDPQEARQSRHN--LAAIAE 580

Human   649 EPVDWAFAQRELLEKQGIDMKQEMEQRLQELEDQYRREREEATYLLEQQRLDYESKLEALQKQMD 713
            :|:||.:||:|||:|||||:|.:||:::.|:|.|||||:.|....:..|..:|||.:|.||||:|
 Worm   581 QPIDWKYAQQELLDKQGIDLKADMEKKMLEMESQYRREKVELEQKMYHQTREYESMIENLQKQVD 645

Human   714 -SRYY----PEVNEEE--------EEPEDEVQWTERECELALWAFRKWKWYQFTSLRDLLWGNAI 765
             ::.|    ..:.|.|        |.|| |::||..:..:.|.|..||:::||||:||.||||||
 Worm   646 LAQSYISGGGSIWEGERMLTSSLLEFPE-ELKWTSDQKRVVLKAAIKWRYHQFTSVRDDLWGNAI 709

Human   766 FLKEANAISVELKKKVQFQFVLLTDTLYSPLPPDLLPPEAAKDRETRPFPRTIVAVEVQDQKNGA 830
            |:||||||||||||||||||.|||||:|||||||||||  .:|...||:|:|:||::|||.||||
 Worm   710 FVKEANAISVELKKKVQFQFALLTDTMYSPLPPDLLPP--GEDLTLRPYPKTVVAIQVQDLKNGA 772

Human   831 THYWTLEKLRQRLDLMREMYDRAAEVPSSVIEDCDNVVTGGDPFYDRFP-----WFRLVGSSAIS 890
            ||||::|||:|||:.||..|:....|             .|.|....:|     |          
 Worm   773 THYWSIEKLKQRLEDMRIFYNSELSV-------------AGTPVDVPYPPVAEGW---------- 814

Human   891 GCNSYPLLNTCMSERMAALTPSPTFSSPDSDATEPAEEQSVGEEEEEEEEEEDEEEEDLEDDVFP 955
                           :|||..:.....||....|...:.          .|.|.|....:.|...
 Worm   815 ---------------LAALNRNSARLIPDRQRLEAMRDM----------YETDAEMSPADGDPMM 854

Human   956 EHALCDGRDPFYDRPPLFSLVGRAFVYLSNLLYPVPLVHRVAIVSEKGEVKGFLRVAVQAISADE 1020
            :..:  |.||||||.|.|.:||||||||:|||:.|||:|:||:|:|||||||:|:||::.:..| 
 Worm   855 DALM--GTDPFYDRFPWFRMVGRAFVYLNNLLHNVPLIHKVAVVNEKGEVKGYLKVAIEPVQKD- 916

Human  1021 EAPDYGSGVRQSGTAKISFDDQHFEKFQSESCPVVGMSRSGTSQEELRIVEGQGQGADVGPSADE 1085
            |..:...||||  |||:.|..:.|.|.....                                  
 Worm   917 EVINQKKGVRQ--TAKLHFRKEDFLKSHKNG---------------------------------- 945

Human  1086 VNNNTCSAVPPEGLLLDSSEKAALDGPLDAALDHLRLGNTFTFRVTVLQASSISAEYADIFCQFN 1150
                            ::|:..||..|     :|::....|.|||.||||..::..|:|:|||||
 Worm   946 ----------------ETSDSDALAFP-----EHMQEEVEFCFRVVVLQAIDVADTYSDVFCQFN 989

Human  1151 FIHRHDEAFSTEPLKNTGRGPPLGFYHVQNIAVEVTKSFIEYIKSQPIVFEVFGHYQ----QHPF 1211
            |:|||||||||||:||:  ..||.|.|.||:.::::|:|:.|:...||:||||||:|    |..|
 Worm   990 FLHRHDEAFSTEPMKNS--KSPLTFEHTQNLHIKMSKTFLHYLHHFPIIFEVFGHFQPKSEQFNF 1052

Human  1212 ----PPLCKDVLSPL---RPSRRHFPRVMPLSKPVPATKLSTLTRPCPGPCHCKYDLLVYFEICE 1269
                ..|.:.:.:.|   :||       :.:|.||.:.|.:...:........|:||||:|||||
 Worm  1053 ERQNSALGRRLSTKLTFQQPS-------LVISTPVKSKKANAPIQNNNASVKSKHDLLVWFEICE 1110

Human  1270 LEANGDYIPAVVDHRGGMPCMGTFLLHQGIQRRITVTLLHETGSHIRWKEVRELVVGRIRNTPE- 1333
            |..||:|:|.:|||..|:|..|.|||||||||||.:|:.||.| .::||:.:||||||||..|| 
 Worm  1111 LANNGEYVPTIVDHAQGLPTHGIFLLHQGIQRRIKITICHEKG-ELKWKDCQELVVGRIRAGPEW 1174

Human  1334 --TDESLIDPNILSLNILSSGYIHPAQDDRQFLDSDIPRTFYQFEAAWDSSMHNSLLLNRVTPYR 1396
              .|    |.::|||.:....::..:.||         |||:|||||||||:|||.|||||:.|.
 Worm  1175 AGGD----DVDVLSLGLFPGTFMEFSMDD---------RTFFQFEAAWDSSLHNSPLLNRVSNYG 1226

Human  1397 EKIYMTLSAYIEMENCTQPAVVTKDFCMVFYSRDAKL-PASRSIRNLFGSGSLRASESNRVTGVY 1460
            ::||||||||:|::.|.||||||||.|::.|:||:|: .|||..|:|.| |..::.|.|||.|||
 Worm  1227 DQIYMTLSAYMELDGCAQPAVVTKDLCLLIYARDSKISAASRFCRSLVG-GISKSPEMNRVPGVY 1290

Human  1461 ELSLCHVADAGSPGMQRRRRRVLDTSVAYVRGEENLAGWRPRSDSLILDHQWELEKLSLLQEVEK 1525
            :|.|   .|....|..||:|||||||.|||||||||..||||.||||.:||||||||:.||:||:
 Worm  1291 QLCL---KDGSDSGAIRRQRRVLDTSSAYVRGEENLGQWRPRGDSLIFEHQWELEKLTRLQQVER 1352

Human  1526 TRHYLLLREKLETAQRPVPEALSPAFSEDSESHGSSSASSPLSAEGRPSPLEAPNERQRELAVKC 1590
            .|.:|.||::|: .::...||.:|.           |...|:.|......|:   |:.:.:..|.
 Worm  1353 VRLFLRLRDRLK-GKKNKGEARTPV-----------SPCDPVCAIPESIKLD---EKDKGIVGKV 1402

Human  1591 LRLLTH--TFNREYTHSHVCVSASESKLSEMSVTLLRDPSMSPLGVATLTPSSTCPSLVEGRYGA 1653
            |.|:..  ..|::        ..:.:|..|:|.....:...||:...:|..||....|:      
 Worm  1403 LGLIRRKIPMNKD--------PPTGNKAQELSDESGSNSITSPVSDKSLIKSSRSSDLL------ 1453

Human  1654 TDLRTPQPCSRPASPEPELLPEAD-------SKKLPSPARATETDKEPQRLLVPDIQEIRVSPIV 1711
                    |.:.:..:..|....|       .|:..|.:|..:.:     :|||::.|.||..:|
 Worm  1454 --------CRQKSKSDQNLASNDDIVDNLGGMKRSLSGSRILQLN-----ILVPEVLEERVGVVV 1505

Human  1712 SKKGYLHFLEPHTSGWARRFVVVRRPYAYMYNSDKDTVERFVLNLATAQVEYSEDQQAMLKTPNT 1776
            |||||::|||..|.||.||:|:|||||..::..|:|.|.|.::|||.|::|:|||||||:|.|||
 Worm  1506 SKKGYMNFLEEKTQGWTRRWVIVRRPYILLFRDDRDLVIRGIINLANARIEHSEDQQAMVKVPNT 1570

Human  1777 FAVCTEHRGILLQAASDKDMHDWLYAFNPLLAGTIR 1812
            |:|||..||.|:|.....:|:|||||.|||:||.::
 Worm  1571 FSVCTNQRGFLMQMMPGDEMYDWLYAINPLMAGQMK 1606

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
KIF1AXP_047300774.1 KISc_KIF1A_KIF1B 4..361 CDD:276816 257/357 (72%)
Kinesin_assoc 358..549 CDD:465047 82/194 (42%)
FHA_KIF1A 525..639 CDD:438778 60/113 (53%)
ERM_helical 658..>711 CDD:466641 26/52 (50%)
KIF1B 839..886 CDD:463574 12/51 (24%)
DUF3694 1275..1431 CDD:463599 84/158 (53%)
PH_KIFIA_KIFIB 1706..1808 CDD:269939 59/101 (58%)
unc-104NP_001022041.2 KISc_KIF1A_KIF1B 2..354 CDD:276816 257/357 (72%)
Kinesin_assoc 351..488 CDD:465047 82/194 (42%)
FHA_KIF1 464..564 CDD:438757 55/104 (53%)
Rcc_KIF21 595..652 CDD:425381 27/56 (48%)
KIF1B 829..875 CDD:463574 15/57 (26%)
DUF3694 1116..1260 CDD:463599 83/157 (53%)
PH_KIFIA_KIFIB 1500..1602 CDD:269939 59/101 (58%)

Return to query results.
Submit another query.