DRSC - DRSC Integrative Ortholog Prediction Tool

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits

Protein Alignment SDK2 and Sdk2

DIOPT Version :9

Sequence 1:	NP_001138424.1	Gene:	SDK2 / 54549	HGNCID:	19308	Length:	2172	Species:	Homo sapiens
Sequence 2:	XP_006247755.1	Gene:	Sdk2 / 360652	RGDID:	1310397	Length:	2175	Species:	Rattus norvegicus

Alignment Length:	2172	Identity:	2062/2172 - (94%)
Similarity:	2121/2172 - (97%)	Gaps:	0/2172 - (0%)

- Green bases have known domain annotations that are detailed below.

Human     1 MWGLLIWTLLALHQIRAARAQDDVSPYFKTEPVRTQVHLEGNRLVLTCMAEGSWPLEFKWLHNNR 65
            ||.|.||||||||:|.:|.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     4 MWRLPIWTLLALHRIHSAGAQDDVPPYFKTEPVRTQVHLEGNRLVLTCMAEGSWPLEFKWLHNNR 68

Human    66 ELTKFSLEYRYMITSLDRTHAGFYRCIVRNRMGALLQRQTEVQVAYMGSFEEGEKHQSVSHGEAA 130
            |||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    69 ELTRFSLEYRYMITSLDRTHAGFYRCIVRNRMGALLQRQTEVQVAYMGSFEEGEKHQSVSHGEAA 133

Human   131 VIRAPRIASFPQPQVTWFRDGRKIPPSSRIAITLENTLVILSTVAPDAGRYYVQAVNDKNGDNKT 195
            ||:||||:|||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   134 VIKAPRISSFPRPQVTWFRDGRKIPPSSRIAITLENTLVILSTVAPDAGRYYVQAVNDKNGDNKT 198

Human   196 SQPITLTVENVGGPADPIAPTIIIPPKNTSVVAGTSEVTLECVANARPLIKLHIIWKKDGVLLSG 260
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||:|||||.|||.
  Rat   199 SQPITLAVENVGGPADPIAPTIIIPPKNTSVVAGTSEVTMECVANARPLIKLHIVWKKDGALLSN 263

Human   261 GISDHNRRLTIPNPTGSDAGYYECEAVLRSSSVPSVVRGAYLSVLEPPQFVKEPERHITAEMEKV 325
            ||||:||||||.||..||||||||||:||||||..|.||||||||||||||:|||||||||||||
  Rat   264 GISDYNRRLTITNPMVSDAGYYECEAMLRSSSVAPVTRGAYLSVLEPPQFVREPERHITAEMEKV 328

Human   326 VDIPCQAKGVPPPSITWYKDAAVVEVEKLTRFRQRNDGGLQISGLVPDDTGMFQCFARNAAGEVQ 390
            |||||:||||||||||||||||:|||.|||||:||:|||||||||:||||||.||||.|||||.|
  Rat   329 VDIPCRAKGVPPPSITWYKDAALVEVGKLTRFKQRSDGGLQISGLLPDDTGMVQCFAHNAAGEAQ 393

Human   391 TSTYLAVTSIAPNITRGPLDSTVIDGMSVVLACETSGAPRPAITWQKGERILASGSVQLPRFTPL 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
  Rat   394 TSTYLAVTSIAPNITRGPLDSTVIDGMSVVLACETSGAPRPAITWQKGERILASGSVQLPRFTLL 458

Human   456 ESGSLLISPTHISDAGTYTCLATNSRGVDEASADLVVWARTRITKPPQDQSVIKGTQASMVCGVT 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   459 ESGSLLISPTHISDAGTYTCLATNSRGVDEASADLVVWARTRITKPPQDQSVIKGTQASMVCGVT 523

Human   521 HDPRVTIRYIWEKDGATLGTESHPRIRLDRNGSLHISQTWSGDIGTYTCRVISAGGNDSRSAHLR 585
            ||||||:||:||||||||..|::||||||||||||||||||||||||||||:||||||||:||||
  Rat   524 HDPRVTVRYVWEKDGATLAVETNPRIRLDRNGSLHISQTWSGDIGTYTCRVLSAGGNDSRNAHLR 588

Human   586 VRQLPHAPEHPVATLSTVERRAINLTWTKPFDGNSPLIRYILEMSENNAPWTVLLASVDPKATSV 650
            |||||||||||||||||:|||||||||.|||||||||:||||||||||||||:|||||||:||||
  Rat   589 VRQLPHAPEHPVATLSTMERRAINLTWAKPFDGNSPLMRYILEMSENNAPWTILLASVDPEATSV 653

Human   651 TVKGLVPARSYQFRLCAVNDVGKGQFSKDTERVSLPEEPPTAPPQNVIASGRTNQSIMIQWQPPP 715
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   654 MVKGLVPARSYQFRLCAVNDVGKGQFSKDTERVSLPEEPPTAPPQNVIASGRTNQSIMIQWQPPP 718

Human   716 ESHQNGILKGYIIRYCLAGLPVGYQFKNITDADVNNLLLEDLIIWTNYEIEVAAYNSAGLGVYSS 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   719 ESHQNGILKGYIIRYCLAGLPVGYQFKNITDADVNNLLLEDLIIWTNYEIEVAAYNSAGLGVYSS 783

Human   781 KVTEWTLQGVPTVPPGNVHAEATNSTTIRFTWNAPSPQFINGINQGYKLIAWEPEQEEEVTMVTA 845
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
  Rat   784 KVTEWTLQGVPTVPPGNVHAEATNSTAIRFTWNAPSPQFINGINQGYKLIAWEPTQEEEVTMVTA 848

Human   846 RPNFQDSIHVGFVSGLKKFTEYFTSVLCFTTPGDGPRSTPQLVRTHEDVPGPVGHLSFSEILDTS 910
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||::|||||
  Rat   849 RPNFQDSIHVGFVSGLKKFTEYFTSVLCFTTPGDGPRSSPQLVRTHEDVPGPVGHLSFNDILDTS 913

Human   911 LKVSWQEPGEKNGILTGYRISWEEYNRTNTRVTHYLPNVTLEYRVTGLTALTTYTIEVAAMTSKG 975
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   914 LKVSWQEPGEKNGILTGYRISWEEYNRTNTRVTHYLPNVTLEYRVTGLTALTTYTIEVAAMTSKG 978

Human   976 QGQVSASTISSGVPPELPGPPTNLGISNIGPRSVTLQFRPGYDGKTSISRWLVEAQVGVVGEGEE 1040
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||:||||||::|||||
  Rat   979 QGQVSASTISSGVPPELPGAPTNLGISNIGPRSVTLQFRPGYDGKTSISRWVVEAQVGMIGEGEE 1043

Human  1041 WLLIHQLSNEPDARSMEVPDLNPFTCYSFRMRQVNIVGTSPPSQPSRKIQTLQAPPDMAPANVSL 1105
            ||||:||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|
  Rat  1044 WLLIYQLSNEPDARSMEVPDLNPFTYYSFRMRQVNIVGTSPPSQPSRKIQTLQAPPDMAPANVTL 1108

Human  1106 RTASETSLWLRWMPLPEMEYNGNPESVGYKIKYSRSDGHGKTLSHVVQDRVERDYTIEDLEEWTE 1170
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||:|||||||||||
  Rat  1109 RTASETSLWLRWMPLPEMEYNGNPESVGYKIKYSRSDGHGKTLSHTVQDRVEREYTIEDLEEWTE 1173

Human  1171 YRVQVQAFNAIGSGPWSQTVVGRTRESVPSSGPTNVSALATTSSSMLVRWSEVPEADRNGLVLGY 1235
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||
  Rat  1174 YRVQVQAFNAIGSGPWSQAVVGRTRESVPSSGPTNVSALATTSSSMLVRWSEIPEADRNGLVLGY 1238

Human  1236 KVMYKEKDSDTQPRFWLVEGNSSRSAQLTGLGKYVLYEVQVLAFTRIGDGSPSHPPILERTLDDV 1300
            ||.|||||||:|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1239 KVRYKEKDSDSQARFWLVEGNSSRSAQLTGLGKYVLYEVQVLAFTRIGDGSPSHPPILERTLDDV 1303

Human  1301 PGPPMGILFPEVRTTSVRLIWQPPAAPNGIILAYQITHRLNTTTANTATVEVLAPSARQYTATGL 1365
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||
  Rat  1304 PGPPMGILFPEVRTTSVRLIWQPPATPNGIILAYQITHRLNATTANTATVEVLAPSARQYMATGL 1368

Human  1366 KPESVYLFRITAQTRKGWGEAAEALVVTTEKRDRPQPPSRPMVQQEDVRARSVLLSWEPGSDGLS 1430
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|:||||||:||||||||||||||||
  Rat  1369 KPESVYLFRITAQTRKGWGEAAEALVVTTEKRDRPQPPSKPVVQQEDVKARSVLLSWEPGSDGLS 1433

Human  1431 PVRYYTIQTRELPSGRWALHSASVSHNASSFIVDRLKPFTSYKFRVKATNDIGDSEFSEESESLT 1495
            |||||||||||||||||||||||||||||:|.|||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1434 PVRYYTIQTRELPSGRWALHSASVSHNASAFTVDRLKPFTSYKFRVKATNDIGDSEFSEESESLT 1498

Human  1496 TLQAAPDEAPTILSVTPHTTTSVLIRWQPPAEDKINGILLGFRIRYRELLYEGLRGFTLRGINNP 1560
            ||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1499 TLQAAPDEAPTILSVTPHTTTSVLIRWQPPSEDKINGILLGFRIRYRELLYEGLRGFTLRGINNP 1563

Human  1561 GATWAELTSMYSMRNLSRPSLTQYELDNLNKHRRYEIRMSVYNAVGEGPSSPPQEVFVGEAVPTA 1625
            ||.||||||:||||||:||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||
  Rat  1564 GAKWAELTSLYSMRNLTRPSLTQYELDNLTKHRRYEIRMSVYNAVGEGPLSPPQEVFVGEAVPTA 1628

Human  1626 APRNVVVHGATATQLDVTWEPPPLDSQNGDIQGYKIYFWEAQRGNLTERVKTLFLAENSVKLKNL 1690
            ||:||.:|.||||||||||||||||:||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||
  Rat  1629 APQNVAIHSATATQLDVTWEPPPLDNQNGDIQGYKIYFWEVQRRNLTERVKTLFLAENSVKLKNL 1693

Human  1691 TGYTAYMVSVAAFNAAGDGPRSTPTQGQTQQAAPSAPSSVKFSELTTTSVNVSWEAPQFPNGILE 1755
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||:|||||||.||
  Rat  1694 TGYTAYMVSVAAFNAAGDGPRSTPTQGQTQQAAPSAPGSVKFSELTTTSVNVSWDAPQFPNGPLE 1758

Human  1756 GYRLVYEPCSPVDGVSKIVTVDVKGNSPLWLKVKDLAEGVTYRFRIRAKTFTYGPEIEANVTTGP 1820
            |||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||:||||||:|||||||||||||:||||
  Rat  1759 GYRLVYEPCTPVDGVSKIVTVDVKGNSPLWLKVKDLAEGMTYRFRIKAKTFTYGPEIEANITTGP 1823

Human  1821 GEGAPGPPGVPIIVRYSSAIAIHWSSGDPGKGPITRYVIEARPSDEGLWDILIKDIPKEVSSYTF 1885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||
  Rat  1824 GEGAPGPPGVPIIVRYSSAIAIHWSSGDPGKGPITRYVIEARPSDEGLWDILIKDIPKEVTSYTF 1888

Human  1886 SMDILKPGVSYDFRVIAVNDYGFGTPSSPSQSVPAQKANPFYEEWWFLVVIALVGLIFILLLVFV 1950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1889 SMDILKPGVSYDFRVIAVNDYGFGTPSSPSQSVPAQKASPFYEEWWFLVVIALVGLIFILLLVFV 1953

Human  1951 LIIRGQSKKYAKKTDSGNSAKSGALGHSEMMSLDESSFPALELNNRRLSVKNSFCRKNGLYTRSP 2015
            ||||||||||:||||:|.:.|||||||.||:||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1954 LIIRGQSKKYSKKTDAGGNTKSGALGHGEMLSLDESSFPALELNNRRLSVKNSFCRKNGLYTRSP 2018

Human  2016 PRPSPGSLHYSDEDVTKYNDLIPAESSSLTEKPSEISDSQGSDSEYEVDSNHQKAHSFVNHYISD 2080
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|.|||||||||||||
  Rat  2019 PRPSPGSLHYSDEDVTKYNDLIPAESSSLTEKPSEISDSQGSDSEYEVDTNTQKAHSFVNHYISD 2083

Human  2081 PTYYNSWRRQQKGISRAQAYSYTESDSGEPDHTTVTNSTSTQQGSLFRPKASRTPTPQNPPNPPS 2145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2084 PTYYNSWRRQQKGISRAQAYSYTESDSGEPDHVTVPNSNSTQQGSLFRPKASRTPTPQNPPNPPS 2148

Human  2146 QQSTLYRPPSSLAPGSRAPIAGFSSFV 2172
            |||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2149 QQSTLYRPPSSLAPGSRAPIAGFSSFV 2175

Known Domains:

Indicated by green bases in alignment.

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
SDK2	NP_001138424.1	Ig	27..109	CDD:299845	80/81 (99%)
		IG_like	40..109	CDD:214653	67/68 (99%)
		I-set	120..203	CDD:254352	79/82 (96%)
		Ig	132..210	CDD:299845	73/77 (95%)
		IG_like	222..304	CDD:214653	69/81 (85%)
		IGc2	233..286	CDD:197706	44/52 (85%)
		I-set	308..397	CDD:254352	78/88 (89%)
		Ig	326..394	CDD:143165	58/67 (87%)
		I-set	402..492	CDD:254352	88/89 (99%)
		Ig	416..492	CDD:299845	74/75 (99%)
		Ig	502..586	CDD:299845	75/83 (90%)
		IG_like	502..586	CDD:214653	75/83 (90%)
		FN3	590..681	CDD:238020	84/90 (93%)
		FN3	693..786	CDD:238020	92/92 (100%)
		FN3	794..890	CDD:238020	92/95 (97%)
		FN3	895..983	CDD:238020	85/87 (98%)
		FN3	993..1087	CDD:238020	87/93 (94%)
		FN3	1099..1194	CDD:238020	90/94 (96%)
		FN3	1201..1290	CDD:238020	84/88 (95%)
		FN3	1301..1394	CDD:238020	89/92 (97%)
		FN3	1400..1484	CDD:238020	78/83 (94%)
		FN3	1503..1616	CDD:238020	106/112 (95%)
		FN3	1626..1719	CDD:238020	85/92 (92%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256\|SAM:MobiDB-lite	1707..1729		21/21 (100%)
		FN3	1724..1805	CDD:238020	74/80 (93%)
		FN3	1837..1916	CDD:238020	77/78 (99%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256\|SAM:MobiDB-lite	2039..2067		26/27 (96%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256\|SAM:MobiDB-lite	2098..2172		70/73 (96%)
		PDZ-binding. /evidence=ECO:0000250\|UniProtKB:Q6V4S5	2166..2172		5/5 (100%)
Sdk2	XP_006247755.1	IG_like	43..112	CDD:214653	67/68 (99%)
		IGc2	43..101	CDD:197706	56/57 (98%)
		IG_like	123..206	CDD:214653	79/82 (96%)
		Ig	135..191	CDD:299845	52/55 (95%)
		IG_like	225..307	CDD:214653	69/81 (85%)
		IGc2	236..289	CDD:197706	44/52 (85%)
		I-set	311..400	CDD:254352	78/88 (89%)
		Ig	329..397	CDD:143165	58/67 (87%)
		I-set	405..495	CDD:254352	88/89 (99%)
		Ig	419..495	CDD:299845	74/75 (99%)
		Ig	505..589	CDD:299845	75/83 (90%)
		IG_like	505..589	CDD:214653	75/83 (90%)
		FN3	593..684	CDD:238020	84/90 (93%)
		FN3	696..789	CDD:238020	92/92 (100%)
		FN3	797..893	CDD:238020	92/95 (97%)
		FN3	898..986	CDD:238020	85/87 (98%)
		FN3	996..1090	CDD:238020	87/93 (94%)
		FN3	1102..1197	CDD:238020	90/94 (96%)
		FN3	1204..1293	CDD:238020	84/88 (95%)
		FN3	1304..1397	CDD:238020	89/92 (97%)
		FN3	1403..1487	CDD:238020	78/83 (94%)
		FN3	1506..1619	CDD:238020	106/112 (95%)
		FN3	1629..1722	CDD:238020	85/92 (92%)
		FN3	1727..1808	CDD:238020	74/80 (93%)
		FN3	1840..1919	CDD:238020	77/78 (99%)

Information from Original Tools:

Tool	Simple Score	Weighted Score	Original Tool Information
Tool	Simple Score	Weighted Score	BLAST Result	Score	Score Type	Cluster ID
Compara	1	0.930	-	-		C83690854
Domainoid	1	1.000	504	1.000	Domainoid score	I7144
eggNOG	1	0.900	-	-		E1_KOG3510
HGNC	1	1.500	-	-
Hieranoid	1	1.000	-	-
Homologene	1	1.000	-	-		H10406
Inparanoid	1	1.050	4168	1.000	Inparanoid score	I191
NCBI	1	1.000	-	-
OMA	1	1.010	-	-		QHG46050
OrthoDB	1	1.010	-	-		D134749at2759
OrthoFinder	1	1.000	-	-		FOG0002891
OrthoInspector	1	1.000	-	-		oto133064
orthoMCL	1	0.900	-	-		OOG6_104033
Panther	1	1.100	-	-	LDO	PTHR13817
Phylome	1	0.910	-	-
SonicParanoid	1	1.000	-	-		X1909
SwiftOrtho	1	1.000	-	-
TreeFam	0	0.000	Not matched by this tool.
	17	17.310