DRSC - DRSC Integrative Ortholog Prediction Tool

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Protein Alignment ATR and Atr

DIOPT Version :9

Sequence 1:	XP_011511226.1	Gene:	ATR / 545	HGNCID:	882	Length:	2646	Species:	Homo sapiens
Sequence 2:	XP_003750609.1	Gene:	Atr / 685055	RGDID:	1305796	Length:	2636	Species:	Rattus norvegicus

Alignment Length:	2649	Identity:	2400/2649 - (90%)
Similarity:	2515/2649 - (94%)	Gaps:	16/2649 - (0%)

- Green bases have known domain annotations that are detailed below.

Human     1 MGEHGLELASMIPALRELGSATPEEYNTVVQKPRQILCQFIDRILTDVNVVAVELVKKTDSQPTS 65
            ||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||:||||
  Rat     1 MGDHGLELASMIPALRELGSATPEEYNTVVQKPRQILCQFIDRILTDVNVVALELVKKTDTQPTS 65

Human    66 VMLLDFIQHIMKSSPLMFVNVSGS---HEAKGSCIEFSNWIITRLLRIAATPSCHLLHKKICEVI 127
            |||||||||||||||||||||:||   :|||.||||||:||||||||||||||||:|||||||||
  Rat    66 VMLLDFIQHIMKSSPLMFVNVNGSQGQNEAKDSCIEFSHWIITRLLRIAATPSCHMLHKKICEVI 130

Human   128 CSLLFLFKSKSPAIFGVLTKELLQLFEDLVYLHRRNVMGHAVEWPVVMSRFLSQLDEHMGYLQSA 192
            ||||||||||:||||||||:|||.|||||:|||:||.:|..:|||||:|||||:||||||.||.|
  Rat   131 CSLLFLFKSKNPAIFGVLTRELLYLFEDLIYLHKRNAVGDVMEWPVVVSRFLSRLDEHMGCLQPA 195

Human   193 PLQLMSMQNLEFIEVTLLMVLTRIIAIVFFRRQELLLWQIGCVLLEYGSPKIKSLAISFLTELFQ 257
            |||.|:|||:|||||||||||..|:..|||||||||||||||.|||:|||||:|||||.|||||:
  Rat   196 PLQFMNMQNVEFIEVTLLMVLIHIVPTVFFRRQELLLWQIGCALLEHGSPKIRSLAISLLTELFE 260

Human   258 LGGLPAQPASTFFSSFLELLKHLVEMDTDQLKLYEEPLSKLIKTLFPFEAEAYRNIEPVYLNMLL 322
            ||||||||||||||.|||||:||:.||.|||||||||||||:||||||||||||||||||||:||
  Rat   261 LGGLPAQPASTFFSLFLELLQHLIGMDADQLKLYEEPLSKLVKTLFPFEAEAYRNIEPVYLNVLL 325

Human   323 EKLCVMFEDGVLMRLKSDLLKAALCHLLQYFLKFVPAGYESALQVRKVYVRNICKALLDVLGIEV 387
            |||.|||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.:||:||:||||::.
  Rat   326 EKLRVMFEDRVLMRLKSDLLKAALCHLLQYFLTFVPAGYESALQVRKVYVTDICRALVDVLGVQT 390

Human   388 DAEYLLGPLYAALKMESMEIIEEIQCQTQQENLSSNSDGISPKRRRLSSSLNPSKRAPKQTEEIK 452
            ...|||||.||||||||.||||.||||.|||||..::||:|||||||||||:..||..:|:|||.
  Rat   391 HVGYLLGPFYAALKMESTEIIERIQCQAQQENLRGSNDGVSPKRRRLSSSLSSYKRPSRQSEEIN 455

Human   453 HVDMNQKSILWSALKQKAESLQISLEYSGLKNPVIEMLEGIAVVLQLTALCTVHCSHQNMNCRTF 517
            ||||::|||||:.|||||||||||||...|||.|.|.||||.:|||||||||||||||:|:....
  Rat   456 HVDMDKKSILWNVLKQKAESLQISLECGTLKNSVAEALEGITIVLQLTALCTVHCSHQDMDGHNA 520

Human   518 KDCQHKSKKKPSVVITWMSLDFYTKVLKSCRSLLESVQKLDLEATIDKVVKIYDALIYMQVNSSF 582
            ||||||.||||.||||||||||||||||||:||||||||.:||..||.||:|||||:|:||.|||
  Rat   521 KDCQHKYKKKPPVVITWMSLDFYTKVLKSCKSLLESVQKHELELVIDSVVRIYDALMYIQVKSSF 585

Human   583 EDHILEDLCGMLSLPWIYSHSDDGCLKLTTFAANLLTLSCRISDSYSPQAQSRCVFLLTLFPRRI 647
            :||:||:||||||||||||:|||..||:||||.|||.||.|:.:||||||||:|||||||||:||
  Rat   586 QDHVLEELCGMLSLPWIYSYSDDNSLKMTTFATNLLRLSQRVWESYSPQAQSQCVFLLTLFPKRI 650

Human   648 FLEWRTAVYNWALQSSHEVIRASCVSGFFILLQQQNSCNRVPKILIDKVKDDSDIVKKEFASILG 712
            ||:|||.||||||:|||||||.|||.||||||||:||||::||:|||:|||||.:|||||||:||
  Rat   651 FLDWRTTVYNWALKSSHEVIRTSCVKGFFILLQQENSCNQIPKMLIDRVKDDSHVVKKEFASVLG 715

Human   713 QLVCTLHGMFYLTSSLTEPFSEHGHVDLFCRNLKATSQHECSSSQLKASVCKPFLFLLKKKIPSP 777
            |||||||||||||||..|||  .|.|||||:||||||||||||||:||||||||||||.|..|||
  Rat   716 QLVCTLHGMFYLTSSSVEPF--FGPVDLFCKNLKATSQHECSSSQVKASVCKPFLFLLTKNTPSP 778

Human   778 VKLAFIDNLHHLCKHLDFREDETDVKAVLGTLLNLMEDPDKDVRVAFSGNIKHILESLDSEDGFI 842
            ||||||||||||||||||:||||:||||||||||||||||||||:|||||||:|||||:||||||
  Rat   779 VKLAFIDNLHHLCKHLDFQEDETEVKAVLGTLLNLMEDPDKDVRIAFSGNIKYILESLNSEDGFI 843

Human   843 KELFVLRMKEAYTHAQISRNNELKDTLILTTGDIGRAAKGDLVPFALLHLLHCLLSKSASVSGAA 907
            |||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||
  Rat   844 KELFVLRMKEAYTHAQISRSNELKDTLILTTGDIGRAAKGDLIPFALLHLLHCLLSKSASVSGAA 908

Human   908 YTEIRALVAAKSVKLQSFFSQYKKPICQFLVESLHSSQMTALPNTPCQNADVRKQDVAHQREMAL 972
            ||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||:||||.|::|||.|||.|||||
  Rat   909 YTEIRALVAAKSVKLQNFFSQYKKPICQFLVESLHSSQMTALPSTPCQTAEMRKQHVAHHREMAL 973

Human   973 NTLSEIANVFDFPDLNRFLTRTLQVLLPDLAAKASPAASALIRTLGKQLNVNRREILINNFKYIF 1037
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   974 NTLSEIANVFDFPDLNRFLTRTLQVLLPDLAAKASPAASALIRTLGKQLNVNRREILINNFKYIF 1038

Human  1038 SHLVCSCSKDELERALHYLKNETEIELGSLLRQDFQGLHNELLLRIGEHYQQVFNGLSILASFAS 1102
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1039 SHLVCSCSKDELERALHYLKNETEIELGSLLRQDFQGLHNELLLRIGEHYQQVFNGLSILASFAS 1103

Human  1103 SDDPYQGPRDIISPELMADYLQPKLLGILAFFNMQLLSSSVGIEDKKMALNSLMSLMKLMGPKHV 1167
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
  Rat  1104 SDDPYQGPRDITSPELMADYLQPKLLGILAFFNMQLLSSSVGIEDKKMALTSLMSLMKLMGPKHV 1168

Human  1168 SSVRVKMMTTLRTGLRFKDDFPELCCRAWDCFVRCLDHACLGSLLSHVIVALLPLIHIQPKETAA 1232
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||.:|||||||
  Rat  1169 SSVRVKMMTTLRTGLRFKDDFPELCCRAWDCFVRCLDHAYLGPLLSHVIVALLPLIQMQPKETAA 1233

Human  1233 IFHYLIIENRDAVQDFLHEIYFLPDHPELKKIKAVLQEYRKETSESTDLQTTLQLSMKAIQHENV 1297
            ||||||||||.||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1234 IFHYLIIENRVAVQDFLHEIYFLPDHPELEKIKAVLQEYRKETSESTDLQTTLQLSMKAIQHENV 1298

Human  1298 DVRIHALTSLKETLYKNQEKLIKYATDSETVEPIISQLVTVLLKGCQDANSQARLLCGECLGELG 1362
            |||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||:|||||||||||||||||||||||
  Rat  1299 DVRIHALTSLKETLYKNQEKLIKYATDSETVEPVISQLVTVILKGCQDANSQARLLCGECLGELG 1363

Human  1363 AIDPGRLDFSTTETQGKDFTFVIETGVEDSSFAYGLLMELTRAYLAYADNSRAQDSAAYAIQELL 1427
            ||||||||||||||||||||||  |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1364 AIDPGRLDFSTTETQGKDFTFV--TGVEDLSFAYGLLMELTRAYLAYADNSRAQDSAAYAIQELL 1426

Human  1428 SIYDCREMETNGPGHQLWRRFPEHVREILEPHLNTRYKSSQKSTDWSGVKKPIYLSKLGSNFAEW 1492
            ||||||||::||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||:|||||
  Rat  1427 SIYDCREMQSNGPGHQLWKRFPEHVREILEPHLNTRYKSSQKSTDWSGVTKPIYLSKLGNNFAEW 1491

Human  1493 SASWAGYLITKVRHDLASKIFTCCSIMMKHDFKVTIYLLPHILVYVLLGCNQEDQQEVYAEIMAV 1557
            |:|||||||||||.:|||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||
  Rat  1492 SSSWAGYLITKVRDNLASKIFTCCSIMMKHDFKVTIYLLPHILVYVLLGCSQEDQQEVYAEIMAV 1556

Human  1558 LKHDDQHTINTQDIASDLCQLSTQTVFSMLDHLTQWARHKFQALKAEKCPHSKSNRNKVDSMVST 1622
            |||||||.|:|||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||...:|...      ||:
  Rat  1557 LKHDDQHAISTQDSASDLCQLSTQTVFSMLDHLTQWARHKFQALNAEKLAQNKPKG------VSS 1615

Human  1623 VDYEDYQSVTRFLDLIPQDTLAVASFRSKAYTRAVMHFESFITEKKQNIQEHLGFLQKLYAAMHE 1687
            |::|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||
  Rat  1616 VNFEDYQSVTRFLDLIPQDTLAVASFRSKAYTRAVMHFESFITEKKQNIQKHLGFLQKLYAAMHE 1680

Human  1688 PDGVAGVSAIRKAEPSLKEQILEHESLGLLRDATACYDRAIQLEPDQIIHYHGVVKSMLGLGQLS 1752
            ||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1681 PDGVAGVSAIRKAEPSLKEQILEHESIGLLRDATACYDRAIQLEPDQIIHYHGVVKSMLGLGQLS 1745

Human  1753 TVITQVNGVHANRSEWTDELNTYRVEAAWKLSQWDLVENYLAADGKSTTWSVRLGQLLLSAKKRD 1817
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1746 TVITQVNGVHANRSEWTDELNTYRVEAAWKLSQWDLVENYLAADGKSTTWSVRLGQLLLSAKKRD 1810

Human  1818 ITAFYDSLKLVRAEQIVPLSAASFERGSYQRGYEYIVRLHMLCELEHSIKPLFQHSPGDSSQEDS 1882
            .|||||:|||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||:||||...||||..|||
  Rat  1811 TTAFYDTLKLVRAEQIVPLSAASFERGSYQRGYEFIVRLHMLCELEHSLKPLFHKFPGDSCNEDS 1875

Human  1883 LNWVARLEMTQNSYRAKEPILALRRALLSLNKRPDYNEMVGECWLQSARVARKAGHHQTAYNALL 1947
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1876 LNWAARLEMTQNSYRAKEPILALRRALLSLNKRPDYNEMVGECWLQSARVARKAGHHQTAYNALL 1940

Human  1948 NAGESRLAELYVERAKWLWSKGDVHQALIVLQKGVELCFPENETPPEGKNMLIHGRAMLLVGRFM 2012
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  Rat  1941 NAGESRLAELYVERAKWLWSKGDVHQALIVLQKGVELCFPENKSPTESKHMLIHGRATLLVGRFM 2005

Human  2013 EETANFESNAIMKKYKDVTACLPEWEDGHFYLAKYYDKLMPMVTDNKMEKQGDLIRYIVLHFGRS 2077
            |||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2006 EETANFESNAIMKKYKDVTLFLPEWEDGHFYLAKYYDKLMPMVTDNKMEKQGDLIRYIVLHFGRS 2070

Human  2078 LQYGNQFIYQSMPRMLTLWLDYGTKAYEWEKAGRSDRVQMRNDLGKINKVITEHTNYLAPYQFLT 2142
            ||||||||||||||||:||||:|.|||||||.|||||:||||||.|||.|:|||||.||||||||
  Rat  2071 LQYGNQFIYQSMPRMLSLWLDFGAKAYEWEKGGRSDRLQMRNDLAKINSVLTEHTNRLAPYQFLT 2135

Human  2143 AFSQLISRICHSHDEVFVVLMEIIAKVFLAYPQQAMWMMTAVSKSSYPMRVNRCKEILNKAIHMK 2207
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
  Rat  2136 AFSQLISRICHSHDEVFVVLMEIIAKVFLAYPQQAMWMMTAVSKSSYPMRVNRCKEILTKAIHMK 2200

Human  2208 KSLEKFVGDATRLTDKLLELCNKPVDGSSSTLSMSTHFKMLKKLVEEATFSEILIPLQSVMIPTL 2272
            |||||||||||||||||||||||.||||:|||||||||||||||||:.|||||||||||||||||
  Rat  2201 KSLEKFVGDATRLTDKLLELCNKSVDGSNSTLSMSTHFKMLKKLVEDPTFSEILIPLQSVMIPTL 2265

Human  2273 PSILGTHANHASHEPFPGHWAYIAGFDDMVEILASLQKPKKISLKGSDGKFYIMMCKPKDDLRKD 2337
            |||||.|||   |:||||||||:|||||:||||:|||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2266 PSILGAHAN---HDPFPGHWAYLAGFDDVVEILSSLQKPKKISLKGSDGKFYIMMCKPKDDLRKD 2327

Human  2338 CRLMEFNSLINKCLRKDAESRRRELHIRTYAVIPLNDECGIIEWVNNTAGLRPILTKLYKEKGVY 2402
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2328 CRLMEFNSLINKSLRKDAESRRRELHIRTYAVIPLNDECGIIEWVNNTAGLRPILTKLYKEKGVY 2392

Human  2403 MTGKELRQCMLPKSAALSEKLKVFREFLLPRHPPIFHEWFLRTFPDPTSWYSSRSAYCRSTAVMS 2467
            ||||||||||||||||||||||||:|.|||||||:||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2393 MTGKELRQCMLPKSAALSEKLKVFQEILLPRHPPVFHEWFLRTFPDPTSWYSSRSAYCRSTAVMS 2457

Human  2468 MVGYILGLGDRHGENILFDSLTGECVHVDFNCLFNKGETFEVPEIVPFRLTHNMVNGMGPMGTEG 2532
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2458 MVGYILGLGDRHGENILFDSFTGECVHVDFNCLFNKGETFEVPEIVPFRLTHNMVNGMGPMGTEG 2522

Human  2533 LFRRACEVTMRLMRDQREPLMSVLKTFLHDPLVEWSKPVKGHSKAPLNETGEVVNEKAKTHVLDI 2597
            |||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
  Rat  2523 LFRRACEVTLRLMRDQREPLMSVLKTFLHDPLVEWSKPVKGHSKAPPNETGEVVNEKAKTHVLDI 2587

Human  2598 EQRLQGVIKTRNRVTGLPLSIEGHVHYLIQEATDENLLCQMYLGWTPYM 2646
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  Rat  2588 EQRLQGVIKTRNRVTGLPLSIEGHVHYLIQEATDENLLCQMYLGWTPYM 2636

Known Domains:

Indicated by green bases in alignment.

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
ATR	XP_011511226.1	UME	1119..1224	CDD:214825	101/104 (97%)
		FAT	1773..2094	CDD:280429	302/320 (94%)
		TEL1	<2135..2646	CDD:227365	490/510 (96%)
		PIKKc_ATR	2295..2569	CDD:270625	264/273 (97%)
		FATC	2615..2646	CDD:280430	30/30 (100%)
Atr	XP_003750609.1	UME	1120..1226	CDD:214825	102/105 (97%)
		FAT	1766..2087	CDD:280429	302/320 (94%)
		TEL1	<2118..2636	CDD:227365	497/520 (96%)
		PIKKc_ATR	2285..2559	CDD:270625	264/273 (97%)
		FATC	2605..2636	CDD:280430	30/30 (100%)

Information from Original Tools:

Tool	Simple Score	Weighted Score	Original Tool Information
Tool	Simple Score	Weighted Score	BLAST Result	Score	Score Type	Cluster ID
Compara	1	0.930	-	-		C83680294
Domainoid	1	1.000	1919	1.000	Domainoid score	I301
eggNOG	1	0.900	-	-		E1_COG5032
HGNC	1	1.500	-	-
Hieranoid	1	1.000	-	-
Homologene	1	1.000	-	-		H96916
Inparanoid	1	1.050	4805	1.000	Inparanoid score	I128
NCBI	1	1.000	-	-
OMA	1	1.010	-	-		QHG44005
OrthoDB	1	1.010	-	-		D10493at33208
OrthoFinder	1	1.000	-	-		FOG0004409
OrthoInspector	1	1.000	-	-		oto132465
orthoMCL	1	0.900	-	-		OOG6_102609
Panther	1	1.100	-	-	LDO	PTHR11139
Phylome	1	0.910	-	-
SonicParanoid	1	1.000	-	-		X3128
SwiftOrtho	1	1.000	-	-
TreeFam	1	0.960	-	-
	18	18.270