DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment NLGN3 and Nlgn3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_851820.1 Gene:NLGN3 / 54413 HGNCID:14289 Length:848 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_599163.2 Gene:Nlgn3 / 171297 RGDID:621119 Length:848 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:848 Identity:839/848 - (98%)
Similarity:841/848 - (99%) Gaps:0/848 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MWLRLGPPSLSLSPKPTVGRSLCLTLWFLSLALRASTQAPAPTVNTHFGKLRGARVPLPSEILGP 65
            |||:||.|||||||.|||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MWLQLGLPSLSLSPTPTVGRSLCLILWFLSLVLRASTQAPAPTVNTHFGKLRGARVPLPSEILGP 65

Human    66 VDQYLGVPYAAPPIGEKRFLPPEPPPSWSGIRNATHFPPVCPQNIHTAVPEVMLPVWFTANLDIV 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 VDQYLGVPYAAPPIGEKRFLPPEPPPSWSGIRNATHFPPVCPQNIHTAVPEVMLPVWFTANLDIV 130

Human   131 ATYIQEPNEDCLYLNVYVPTEDVKRISKECARKPNKKICRKGGSGAKKQGEDLADNDGDEDEDIR 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 ATYIQEPNEDCLYLNVYVPTEDVKRISKECARKPNKKICRKGGSGAKKQGEDLADNDGDEDEDIR 195

Human   196 DSGAKPVMVYIHGGSYMEGTGNMIDGSILASYGNVIVITLNYRVGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLD 260
            |||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 DSGAKPVMVYIHGGSYMEGTGNMIDGSVLASYGNVIVITLNYRVGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLD 260

Human   261 QIQALRWVSENIAFFGGDPRRITVFGSGIGASCVSLLTLSHHSEGLFQRAIIQSGSALSSWAVNY 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 QIQALRWVSENIAFFGGDPRRITVFGSGIGASCVSLLTLSHHSEGLFQRAIIQSGSALSSWAVNY 325

Human   326 QPVKYTSLLADKVGCNVLDTVDMVDCLRQKSAKELVEQDIQPARYHVAFGPVIDGDVIPDDPEIL 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 QPVKYTSLLADKVGCNVLDTVDMVDCLRQKSAKELVEQDIQPARYHVAFGPVIDGDVIPDDPEIL 390

Human   391 MEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKFVEGVVDPEDGVSGTDFDYSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETIK 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 MEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKFVEGVVDPEDGVSGTDFDYSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETIK 455

Human   456 FMYTDWADRDNPETRRKTLVALFTDHQWVEPSVVTADLHARYGSPTYFYAFYHHCQSLMKPAWSD 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 FMYTDWADRDNPETRRKTLVALFTDHQWVEPSVVTADLHARYGSPTYFYAFYHHCQSLMKPAWSD 520

Human   521 AAHGDEVPYVFGVPMVGPTDLFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNKPVPQDTKFIHTKA 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   521 AAHGDEVPYVFGVPMVGPTDLFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNKPVPQDTKFIHTKA 585

Human   586 NRFEEVAWSKYNPRDQLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWKHLVPHLYNLHDMFHYTSTTTKVPPP 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   586 NRFEEVAWSKYNPRDQLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWKHLVPHLYNLHDMFHYTSTTTKVPPP 650

Human   651 DTTHSSHITRRPNGKTWSTKRPAISPAYSNENAQGSWNGDQDAGPLLVENPRDYSTELSVTIAVG 715
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   651 DTTHSSHITRRPNGKTWSTKRPAISPAYSNENAPGSWNGDQDAGPLLVENPRDYSTELSVTIAVG 715

Human   716 ASLLFLNVLAFAALYYRKDKRRQEPLRQPSPQRGAGAPELGAAPEEELAALQLGPTHHECEAGPP 780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||
  Rat   716 ASLLFLNVLAFAALYYRKDKRRQEPLRQPSPQRGTGAPELGTAPEEELAALQLGPTHHECEAGPP 780

Human   781 HDTLRLTALPDYTLTLRRSPDDIPLMTPNTITMIPNSLVGLQTLHPYNTFAAGFNSTGLPHSHST 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   781 HDTLRLTALPDYTLTLRRSPDDIPLMTPNTITMIPNSLVGLQTLHPYNTFAAGFNSTGLPHSHST 845

Human   846 TRV 848
            |||
  Rat   846 TRV 848

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
NLGN3NP_851820.1 COesterase 40..624 CDD:395084 582/583 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 170..195 24/24 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 645..694 47/48 (98%)
Nlgn3NP_599163.2 COesterase 40..624 CDD:395084 582/583 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 169..195 25/25 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 645..691 44/45 (98%)

Return to query results.
Submit another query.