DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment BRWD1 and Brwd1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_061836.2 Gene:BRWD1 / 54014 HGNCID:12760 Length:2320 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_006248248.1 Gene:Brwd1 / 304061 RGDID:1309030 Length:2303 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2331 Identity:1844/2331 - (79%)
Similarity:2016/2331 - (86%) Gaps:42/2331 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAEPSSARRPVPLIESELYFLIARYLSAGPCRRAAQVLVQELEQYQLLPKRLDWEGNEHNRSYEE 65
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MAEPSPARRPVPLIESELYFLIARYLSAGPCRRAAQVLVQELEQYQLLPKRLDWEGNEHNRSYEE 65

Human    66 LVLSNKHVAPDHLLQICQRIGPMLDKEIPPSISRVTSLLGAGRQSLLRTAKDCRHTVWKGSAFAA 130
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 LVLSNKHVAPDHLLQICQRIGPMLDKEAPPSISRVTSLLGAGRQSLLRTAKDCRHTVWKGSAFAA 130

Human   131 LHRGRPPEMPVNYGSPPNLVEIHRGKQLTGCSTFSTAFPGTMYQHIKMHRRILGHLSAVYCVAFD 195
            ||||||||||||||.||:||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 LHRGRPPEMPVNYGPPPSLVDIHRGKQLTGCSTFSTAFPGTMYQHIKMHRRILGHLSAVYCVAFD 195

Human   196 RTGHRIFTGSDDCLVKIWSTHNGRLLSTLRGHSAEISDMAVNYENTMIAAGSCDKIIRVWCLRTC 260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||
  Rat   196 RTGHRIFTGSDDCLVKIWSTHNGRLLSTLRGHSAEISDMAVNYENTLIAAGSCDKIIRVWCLRTC 260

Human   261 APVAVLQGHTGSITSLQFSPMAKGSQRYMVSTGADGTVCFWQWDLESLKFSPRPLKFTEKPRPGV 325
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 APVAVLQGHTGSITSLQFSPMAKGPQRYMVSTGADGTVCFWQWDLESLKFSPRPLKFTEKPRPGV 325

Human   326 QMLCSSFSVGGMFLATGSTDHVIRMYFLGFEAPEKIAELESHTDKVDSIQFCNNGDRFLSGSRDG 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 QMLCSSFSVGGMFLATGSTDHVIRMYFLGFEAPEKIAELESHTDKVDSIQFCNNGDRFLSGSRDG 390

Human   391 TARIWRFEQLEWRSILLDMATRISGDLSSEEERFMKPKVTMIAWNQNDSIVVTAVNDHVLKVWNS 455
            ||||||||||||:|||||||.|||||.|:|||||||||||||||||:||.|||||||||||||:|
  Rat   391 TARIWRFEQLEWKSILLDMAARISGDTSAEEERFMKPKVTMIAWNQDDSTVVTAVNDHVLKVWSS 455

Human   456 YTGQLLHNLMGHADEVFVLETHPFDSRIMLSAGHDGSIFIWDITKGTKMKHYFNMIEGQGHGAVF 520
            |||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
  Rat   456 YTGQLLHNLLGHADEVFVLETHPFDSRIMLSAGHDGSIFIWDITKGIKMKHYFNMIEGQGHGAVF 520

Human   521 DCKFSQDGQHFACTDSHGHLLIFGFGCSKPYEKIPDQMFFHTDYRPLIRDSNNYVLDEQTQQAPH 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   521 DCKFSQDGQHFACTDSHGHLLIFGFGCSKPYEKIPDQMFFHTDYRPLIRDSNNYVLDEQTQQAPH 585

Human   586 LMPPPFLVDVDGNPHPTKYQRLVPGRENSADEHLIPQLGYVATSDGEVIEQIISLQTNDNDERSP 650
            ||||||||||||||||||:|||||||||||||||:||||||||||||||||:|||.|||:.:.||
  Rat   586 LMPPPFLVDVDGNPHPTKFQRLVPGRENSADEHLVPQLGYVATSDGEVIEQVISLHTNDSGDASP 650

Human   651 ESSILDGMIRQLQQQQDQRMGADQDTIPRGLSNGEETPRRG-FRRLSLDIQSPPNIGLRRSGQVE 714
            |||:|||||||||||||.|:|.|||....||.|.|.||||| |||||||||||||||||||||||
  Rat   651 ESSVLDGMIRQLQQQQDLRLGVDQDVTANGLPNEEGTPRRGSFRRLSLDIQSPPNIGLRRSGQVE 715

Human   715 GVRQMHQNAPRSQIATERDLQAWKRRVVVPEVPLGIFRKLEDFRLEKGEEERNLYIIGRKRKTLQ 779
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|.|:||:|||.|:|:||||||||:||||:||.|
  Rat   716 GVRQMHQNAPRSQIATERDLQAWKRRVVVPEAPPGVFRRLEDIRIERGEEERNLYVIGRKKKTFQ 780

Human   780 LSHKSDSVVLVSQSRQRTCRRKYPNYGRRNRSWRELSSGNESSSSVRHETSCDQSEGSGSSEEDE 844
            |..||:|:|||||||||||||||.||.|||....|||||||||.||||||||||||||.|||:||
  Rat   781 LPQKSNSMVLVSQSRQRTCRRKYANYSRRNAGQCELSSGNESSGSVRHETSCDQSEGSCSSEDDE 845

Human   845 WRSDRKSESYSESSSDSSSRYSDWTADAGINLQPPLRTSCRRRITRFCSSSEDEISTENLSPPKR 909
            |||||:|.|.|:|.|:|||:|||||||.|::|:||||||||||:|||||:||||:||||:|||||
  Rat   846 WRSDRRSGSDSDSPSESSSQYSDWTADTGVHLEPPLRTSCRRRVTRFCSTSEDEMSTENISPPKR 910

Human   910 RRKRKKENKPKKENLRRMTPAELANMEHLYEFHPPVWITDTTLRKSPFVPQMGDEVIYFRQGHEA 974
            ||||:||:|||:|:|||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||:||||||||
  Rat   911 RRKRRKESKPKRESLRRTTPAELANMEPLYEFHPPVWITDTTLRKSPFVPQMGDEVMYFRQGHEA 975

Human   975 YIEAVRRNNIYELNPNKEPWRKMDLRDQELVKIVGIRYEVGPPTLCCLKLAFIDPATGKLMDKSF 1039
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||:|.||||
  Rat   976 YIEAVRRNNIYELNPNKEPWRKMDLRDQELVKIVGLRYEVGPPTLCCLKLAFIDPATGRLTDKSF 1040

Human  1040 SIRYHDMPDVIDFLVLRQFYDEARQRNWQSCDRFRSIIDDAWWFGTVLSQEPYQPQYPDSHFQCY 1104
            |||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1041 SIRYHDMPDVIDFLVLRQFYDEARQRNWQPSDRFRSIIDDAWWFGTVLSQEPYQPQYPDSHFQCY 1105

Human  1105 IVRWDNTEIEKLSPWDMEPIPDNVDPPEELGASISVTTDELEKLLYKPQAGEWGQKSRDEECDRI 1169
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||.|||||:||||||:||
  Rat  1106 SVRWDNTEIEKLSPWDMEPIPDNVDPPEELGASISVTSDELEKLLYKPQDGEWGQRSRDEECERI 1170

Human  1170 ISGIDQLLNLDIAAAFAGPVDLCTYPKYCTVVAYPTDLYTIRMRLVNRFYRRLSALVWEVRYIEH 1234
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||:||||||||
  Rat  1171 ISGIDQLLNLDIAAAFAGPVDLCTYPKYCTVVAYPTDLYTIRMRLVHRFYRRLSALIWEVRYIEH 1235

Human  1235 NARTFNEPESVIARSAKKITDQLLKFIKNQHCTNISELSNTSENDEQNAEDLDDSDLPKTSSGRR 1299
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||.|||::|..:|:|||||||||||||||
  Rat  1236 NARTFNEPESVIARSAKKITDQLLKFIKNQDCTNILELCNTSDSDGDSADDLDDSDLPKTSSGRR 1300

Human  1300 RVHDGKKSIRATNYVESNWKKQCKELVNLIFQCEDSEPFRQPVDLVEYPDYRDIIDTPMDFGTVR 1364
            |||:.|:..|.::.:||:|::|||.|:.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1301 RVHNWKRRSRGSSCIESDWRRQCKALLILIFQCEDSEPFRQPVDLVEYPDYRDIIDTPMDFGTVR 1365

Human  1365 ETLDAGNYDSPLEFCKDIRLIFSNAKAYTPNKRSKIYSMTLRLSALFEEKMKKISSDFKIGQKFN 1429
            |||:|||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
  Rat  1366 ETLEAGNYDSPVEFCKDIRLIFSNAKAYTPNKRSKIYSMTLRLSALFEEKMKKISFDFKIGQKFK 1430

Human  1430 EKLRRSQRFKQRQNCKGDSQPNKSIRNLKPKRLKSQTKIIPELVGSPTQSTSSRTAYLGTHKTSA 1494
            |||||||||||||.|.|....::|:|::|.|:.:||||:||:|:.||:|||||:.....|.||||
  Rat  1431 EKLRRSQRFKQRQKCNGAVPVDRSMRSVKQKQFRSQTKVIPQLMCSPSQSTSSKVPLSATRKTSA 1495

Human  1495 GISSGVTSGDSSDSAESSERRKRNRPIT--NGSTLSESEVEDSLATSLSSSASSSSEESKESSRA 1557
            |:|||.|||||||||.|.||.:|:|..|  :||.|..||:||.||||.|||:|:||:||||||.|
  Rat  1496 GVSSGCTSGDSSDSAGSLERVRRHRAETLRSGSVLFGSEMEDFLATSSSSSSSNSSDESKESSGA 1560

Human  1558 RESSSRSGLSRSSNLRVTRTRAAQRKTGPVSLANGCGRKATRKRVYLSDSDNNSLETGEILKARA 1622
            :|.|.|||:.|||||||||||||:||.|.|||.|||||||||||||||||||:|:||.|.||::|
  Rat  1561 QECSLRSGVLRSSNLRVTRTRAARRKAGSVSLENGCGRKATRKRVYLSDSDNHSVETDENLKSKA 1625

Human  1623 GNNRKVLRKCAAVAANKIKLMSDVEENSSSESVCSGRKLPHRNASAVARKKLLHNSEDEQSLKSE 1687
            |::||||||||||||:|||||||.|: |||||.||||||||||||||||||||||| |:||||| 
  Rat  1626 GSSRKVLRKCAAVAASKIKLMSDAED-SSSESPCSGRKLPHRNASAVARKKLLHNS-DDQSLKS- 1687

Human  1688 IEEEELKDENQLLPVSSSHTAQSNVDESENRDSESESDLRVARKNWHANGYKSHTPAPSKTKFLK 1752
             |.||::|.||.|.:||.|..|:.:.     ||||:|||:.|||.|||||..||..|..|.|...
  Rat  1688 -ETEEVRDRNQALLMSSPHAVQNCIS-----DSESDSDLQAARKTWHANGCTSHPAAACKAKSRP 1746

Human  1753 IESSEEDSKSHDSDHACNRTAGPSTSVQKLKAESISEEADSEPGRSGGRKYNTFHKNASFFKKTK 1817
            ||||||||:.|:|||..:.|..|.||.|||.|:|||||||||||.|      ...||....||.|
  Rat  1747 IESSEEDSRCHESDHGPSSTVDPLTSGQKLGADSISEEADSEPGSS------ALGKNTHLSKKAK 1805

Human  1818 ILSDSEDSESEEQDREDGKCHKMEMNPISGNLNCDPIAMSQCSSDHGCETDLDSDDDKI-EKPNN 1881
            |||||||.|.:..:|   :..::|.:|:|..|. :.:.:.||.|.||.|||:|||...: ||.::
  Rat  1806 ILSDSEDCEEKYGER---RGPEVEGSPVSEALR-EAVIVPQCLSHHGPETDVDSDGSAVREKSHS 1866

Human  1882 FMKDSASQDNGLSRKISRKRVCSSDSDSSLQVVKKSSKARTGLLRITRRCAATAANKIKLMSDVE 1946
            .:.||.|::||..:|:||||.|||||:|:|||::||...:|...||| |.|....:|.||.||.|
  Rat  1867 NVNDSVSRENGQRKKVSRKRFCSSDSESNLQVIQKSPIDQTSPSRIT-RSAGMVTDKTKLTSDAE 1930

Human  1947 DVSLENVHTRSKNGRKKPLHLACTTAKKKLSDCEGS-VHCEVPSEQYACEGKPPDPDSEGSTKVL 2010
            |||||:|.||||..||||:..||||| |.:...||. ..||||.||.||.....:|:.:||.:..
  Rat  1931 DVSLESVCTRSKRRRKKPVRFACTTA-KSIPSSEGKHARCEVPEEQSACRSSLAEPEQQGSAENA 1994

Human  2011 SQALNGDSDSEDMLNSEH----KHRHTNIHKIDAPSKRKSSSVTSSGEDSKSHIPGSETDRTFSS 2071
            |||.|.|.|.|...:.|.    :.|..:...|.||||.::||...|.||.|||.  .::|.:.||
  Rat  1995 SQAANADLDFEGSSSFEQTKSIQKRQMDSVCIRAPSKTQNSSAGPSQEDPKSHT--QDSDISLSS 2057

Human  2072 ESTLAQKATAENNFEVELNYGLRRWNGRRLRTYGKAPFSKTKVIHDS-QETAEKEVKRKRSHPEL 2135
            ||.|||||..|||||.|||||||||||||||||||||.|:|..:..| |..||..|||:|.|||:
  Rat  2058 ESVLAQKAIGENNFEEELNYGLRRWNGRRLRTYGKAPLSRTAPVTPSLQAAAEVRVKRRRVHPEV 2122

Human  2136 ENVKISETTGNSKFRPDTSSKSSDLGSVTESDIDCTDNTKTKRR-KTKGKAKVVRKEFVPRDREP 2199
            :...|....|:|...||||.||||||||||||:|||||||.:|| |.|||.:|:.:|.|.:||||
  Rat  2123 DGEDIPGQMGSSGCGPDTSPKSSDLGSVTESDVDCTDNTKAQRRKKRKGKTRVLSQESVRKDREP 2187

Human  2200 NTKVRTCMHNQKDAVQMPSETLKAKMVPEKVPRRCATVAANKIKIMSNLKETISGPENVWIRKSS 2264
            :||.|.||.|:|:||||.|:|||.|.||||:|||||.:||||||.|.||||.:||||||.||.:|
  Rat  2188 HTKTRPCMFNEKEAVQMHSDTLKPKTVPEKIPRRCAAIAANKIKTMCNLKEVVSGPENVGIRTNS 2252

Human  2265 RKLPHRNASAAAKKKLLNVYKEDDTTINSESEKELEDINRKMLFLRGFRSWKENAQ 2320
            ||||:|.||||||||||:||||||..|:||:|:|        ::||.|||.||.||
  Rat  2253 RKLPYRQASAAAKKKLLSVYKEDDALIHSENEEE--------VYLRRFRSQKEKAQ 2300

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
BRWD1NP_061836.2 WD40 <180..499 CDD:441893 308/318 (97%)
WD 1 184..223 38/38 (100%)
WD40 repeat 189..226 CDD:293791 36/36 (100%)
WD 2 226..265 37/38 (97%)
WD40 repeat 232..268 CDD:293791 34/35 (97%)
WD 3 268..311 41/42 (98%)
WD40 repeat 273..318 CDD:293791 43/44 (98%)
WD 4 322..365 42/42 (100%)
WD40 repeat 326..365 CDD:293791 38/38 (100%)
WD 5 366..405 37/38 (97%)
WD40 repeat 371..417 CDD:293791 43/45 (96%)
WD 6 424..463 35/38 (92%)
WD40 repeat 429..465 CDD:293791 32/35 (91%)
WD 7 466..506 38/39 (97%)
WD40 repeat 471..496 CDD:293791 24/24 (100%)
WD 8 514..553 38/38 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 668..691 12/22 (55%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 809..867 43/57 (75%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 895..925 23/29 (79%)
Bromo_WDR9_I_like 1149..1264 CDD:99958 109/114 (96%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1271..1304 25/32 (78%)
Bromo_WDR9_II 1313..1431 CDD:99928 105/117 (90%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1434..1593 102/160 (64%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1670..1805 78/134 (58%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1817..1839 10/21 (48%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1862..1899 16/37 (43%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2014..2077 25/66 (38%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2112..2184 42/73 (58%)
Brwd1XP_006248248.1 WD40 <180..499 CDD:441893 308/318 (97%)
WD40 repeat 189..226 CDD:293791 36/36 (100%)
WD40 repeat 232..268 CDD:293791 34/35 (97%)
WD40 repeat 273..318 CDD:293791 43/44 (98%)
WD40 repeat 326..365 CDD:293791 38/38 (100%)
WD40 repeat 371..408 CDD:293791 35/36 (97%)
WD40 repeat 429..468 CDD:293791 34/38 (89%)
WD40 repeat 471..496 CDD:293791 24/24 (100%)
Bromo_WDR9_I_like 1150..1265 CDD:99958 109/114 (96%)
Bromo_WDR9_II 1316..1432 CDD:99928 105/115 (91%)

Return to query results.
Submit another query.