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Protein Alignment ATP7A and Atp7a

DIOPT Version :10

Sequence 1:	NP_000043.4	Gene:	ATP7A / 538	HGNCID:	869	Length:	1500	Species:	Homo sapiens
Sequence 2:	NP_434690.1	Gene:	Atp7a / 24941	RGDID:	2179	Length:	1492	Species:	Rattus norvegicus

Alignment Length:	1501	Identity:	1331/1501 - (88%)
Similarity:	1411/1501 - (94%)	Gaps:	10/1501 - (0%)

- Green bases have known domain annotations that are detailed below.

Human     1 MDPSMGVNSVTISVEGMTCNSCVWTIEQQIGKVNGVHHIKVSLEEKNATIIYDPKLQTPKTLQEA 65
            |:|:|..||:||:||||||.|||.||||||||||||||||||||||:||:||:||||||||||||
  Rat     1 MEPNMDANSITITVEGMTCISCVRTIEQQIGKVNGVHHIKVSLEEKSATVIYNPKLQTPKTLQEA 65

Human    66 IDDMGFDAVIHNPDPLPVLTDTLFLTVTASLTLPWDHIQSTLLKTKGVTDIKIYPQKRTVAVTII 130
            ||||||||::||.:||||||:|:||||||.|.|||||||||||||||||.:||.||:|:..||||
  Rat    66 IDDMGFDALLHNANPLPVLTNTVFLTVTAPLALPWDHIQSTLLKTKGVTGVKISPQQRSAVVTII 130

Human   131 PSIVNANQIKELVPELSLDTGTLEKKSGACEDHSMAQAGEVVLKMKVEGMTCHSCTSTIEGKIGK 195
            ||:|:||||.||||:||||.||.|||||..|:||..|||||:|||:||||||||||||||||:||
  Rat   131 PSVVSANQIVELVPDLSLDMGTQEKKSGTSEEHSTPQAGEVLLKMRVEGMTCHSCTSTIEGKVGK 195

Human   196 LQGVQRIKVSLDNQEATIVYQPHLISVEEMKKQIEAMGFPAFVKKQPKYLKLGAIDVERLKNTPV 260
            |||||||||||||||||||||||||:.||:||||||:|||||:||||||||||||||||||:|||
  Rat   196 LQGVQRIKVSLDNQEATIVYQPHLITAEEIKKQIEAVGFPAFIKKQPKYLKLGAIDVERLKSTPV 260

Human   261 KSSEGSQQRSPSYTNDSTATFIIDGMHCKSCVSNIESTLSALQYVSSIVVSLENRSAIVKYNASS 325
            ||||||||:||:|.:||..||.|||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.
  Rat   261 KSSEGSQQKSPAYPSDSAITFTIDGMHCKSCVSNIESALSTLQYVSSIVVSLENRSAIVKYNASL 325

Human   326 VTPESLRKAIEAVSPGLYRVSITSEVESTSNSPSSSSLQKIPLNVVSQPLTQETVINIDGMTCNS 390
            ||||.|||||||||||.|||||:|||||.::|||||||||:|||:||||||||.||||:||||||
  Rat   326 VTPEILRKAIEAVSPGQYRVSISSEVESPTSSPSSSSLQKMPLNLVSQPLTQEVVININGMTCNS 390

Human   391 CVQSIEGVISKKPGVKSIRVSLANSNGTVEYDPLLTSPETLRGAIEDMGFDATL-SDTNEPLVVI 454
            ||||||||||||||||||.|||.||.||:||||||||||.||.|||||||||.| :|..||||||
  Rat   391 CVQSIEGVISKKPGVKSIHVSLTNSTGTIEYDPLLTSPEPLREAIEDMGFDAVLPADMKEPLVVI 455

Human   455 AQPSSEMPLLTSTNEFYTKGMTPVQDKEEGKNSSKCYIQVTGMTCASCVANIERNLRREEGIYSI 519
            ||||.|.|||.||.| ....|||||        :||||||:|||||||||||||||||||||||:
  Rat   456 AQPSLETPLLPSTTE-PENVMTPVQ--------NKCYIQVSGMTCASCVANIERNLRREEGIYSV 511

Human   520 LVALMAGKAEVRYNPAVIQPPMIAEFIRELGFGATVIENADEGDGVLELVVRGMTCASCVHKIES 584
            ||||||||||||||||||||.:|||.||||||||.|:|||.||:|:|||||||||||||||||||
  Rat   512 LVALMAGKAEVRYNPAVIQPRVIAELIRELGFGAVVMENAGEGNGILELVVRGMTCASCVHKIES 576

Human   585 SLTKHRGILYCSVALATNKAHIKYDPEIIGPRDIIHTIESLGFEASLVKKDRSASHLDHKREIRQ 649
            :||||:||.|||||||||||||||||||||||||||||.:||||||||||||||:||||||||:|
  Rat   577 TLTKHKGIFYCSVALATNKAHIKYDPEIIGPRDIIHTIGNLGFEASLVKKDRSANHLDHKREIKQ 641

Human   650 WRRSFLVSLFFCIPVMGLMIYMMVMDHHFATLHHNQNMSKEEMINLHSSMFLERQILPGLSVMNL 714
            ||.|||||||||||||||||||||||||.|||:||||||.|||||:|||||||||||||||:|||
  Rat   642 WRGSFLVSLFFCIPVMGLMIYMMVMDHHLATLNHNQNMSNEEMINMHSSMFLERQILPGLSIMNL 706

Human   715 LSFLLCVPVQFFGGWYFYIQAYKALKHKTANMDVLIVLATTIAFAYSLIILLVAMYERAKVNPIT 779
            ||.|||:||||.|||||||||||||:||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||
  Rat   707 LSLLLCLPVQFCGGWYFYIQAYKALRHKTANMDVLIVLATTIAFAYSLVILLVAMYERAKVNPIT 771

Human   780 FFDTPPMLFVFIALGRWLEHIAKGKTSEALAKLISLQATEATIVTLDSDNILLSEEQVDVELVQR 844
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|:|:||||||||||||||
  Rat   772 FFDTPPMLFVFIALGRWLEHIAKGKTSEALAKLISLQATEATIVTLNSENLLLSEEQVDVELVQR 836

Human   845 GDIIKVVPGGKFPVDGRVIEGHSMVDESLITGEAMPVAKKPGSTVIAGSINQNGSLLICATHVGA 909
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
  Rat   837 GDIIKVVPGGKFPVDGRVIEGHSMVDESLITGEAMPVAKKPGSTVIAGSINQNGSLLIRATHVGA 901

Human   910 DTTLSQIVKLVEEAQTSKAPIQQFADKLSGYFVPFIVFVSIATLLVWIVIGFLNFEIVETYFPGY 974
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||:|||.||||||.|||||
  Rat   902 DTTLSQIVKLVEEAQTSKAPIQQFADKLSGYFVPFIVLVSIVTLLVWIIIGFQNFEIVEAYFPGY 966

Human   975 NRSISRTETIIRFAFQASITVLCIACPCSLGLATPTAVMVGTGVGAQNGILIKGGEPLEMAHKVK 1039
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   967 NRSISRTETIIRFAFQASITVLCIACPCSLGLATPTAVMVGTGVGAQNGILIKGGEPLEMAHKVK 1031

Human  1040 VVVFDKTGTITHGTPVVNQVKVLTESNRISHHKILAIVGTAESNSEHPLGTAITKYCKQELDTET 1104
            |||||||||||||||||||||||.|||:||.:||||||||||||||||||.|:||||||||||||
  Rat  1032 VVVFDKTGTITHGTPVVNQVKVLVESNKISRNKILAIVGTAESNSEHPLGAAVTKYCKQELDTET 1096

Human  1105 LGTCIDFQVVPGCGISCKVTNIEGLLHKNNWNIEDNNIKNASLVQIDASNEQSSTSSSMIIDAQI 1169
            ||||.|||||||||||||||||||||||:|..||:|||||||||||||.|||||.||||||||.:
  Rat  1097 LGTCTDFQVVPGCGISCKVTNIEGLLHKSNLKIEENNIKNASLVQIDAINEQSSPSSSMIIDAHL 1161

Human  1170 SNALNAQQYKVLIGNREWMIRNGLVINNDVNDFMTEHERKGRTAVLVAVDDELCGLIAIADTVKP 1234
            |||:|.||||||||||||||||||||:|||::.|.||||:|||||||.:||||||||||||||||
  Rat  1162 SNAVNTQQYKVLIGNREWMIRNGLVISNDVDESMIEHERRGRTAVLVTIDDELCGLIAIADTVKP 1226

Human  1235 EAELAIHILKSMGLEVVLMTGDNSKTARSIASQVGITKVFAEVLPSHKVAKVKQLQEEGKRVAMV 1299
            |||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1227 EAELAVHILKSMGLEVVLMTGDNSKTARSIASQVGITKVFAEVLPSHKVAKVKQLQEEGKRVAMV 1291

Human  1300 GDGINDSPALAMANVGIAIGTGTDVAIEAADVVLIRNDLLDVVASIDLSRKTVKRIRINFVFALI 1364
            |||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1292 GDGINDSPALAMASVGIAIGTGTDVAIEAADVVLIRNDLLDVVASIDLSRKTVKRIRINFVFALI 1356

Human  1365 YNLVGIPIAAGVFMPIGLVLQPWMGSAAMAASSVSVVLSSLFLKLYRKPTYESYELPARSQIGQK 1429
            |||:|||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||::|||..||..||:
  Rat  1357 YNLIGIPIAAGVFLPIGLVLQPWMGSAAMAASSVSVVLSSLFLKLYRKPTYDNYELRPRSHTGQR 1421

Human  1430 SPSEISVHVGIDDTSRNSPKLGLLDRIVNYSRASINSLLSDKRSLNSVVTSEPDKHSLLVGDFRE 1494
            |||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1422 SPSEISVHVGIDDTSRNSPRLGLLDRIVNYSRASINSLLSDKRSLNSVVTSEPDKHSLLVGDFRE 1486

Human  1495 DDDTAL 1500
            ||||.|
  Rat  1487 DDDTTL 1492

Known Domains:

Indicated by green bases in alignment.

Software error:

Illegal division by zero at /www/www.flyrnai.org/docroot/cgi-bin/DRSC_prot_align.pl line 592.

For help, please send mail to the webmaster (ritg@hms.harvard.edu), giving this error message and the time and date of the error.