DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ATP7A and atp7a

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_000043.4 Gene:ATP7A / 538 HGNCID:869 Length:1500 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001361526.1 Gene:atp7a / 100170482 XenbaseID:XB-GENE-1010489 Length:1501 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:1508 Identity:1035/1508 - (68%)
Similarity:1217/1508 - (80%) Gaps:37/1508 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human    12 ISVEGMTCNSCVWTIEQQIGKVNGVHHIKVSLEEKNATIIYDPKLQTPKTLQEAIDDMGFDAVIH 76
            |.||||||||||.||||:||.:||||.||||||.|||.||||.||||||.||||::||||::.:.
 Frog    12 IPVEGMTCNSCVQTIEQKIGSINGVHSIKVSLEGKNAAIIYDAKLQTPKALQEAVEDMGFESTLS 76

Human    77 NPDPLPVLTDTLFLTVTASLTLPWDHIQSTLLKTKGVTDIKIYPQKRTVAVTIIPSIVNANQIKE 141
            ..:|.||..|:.||.::|..:.  :.|:|.|.:.|||.|:|...:.:...||.|||:||...:.:
 Frog    77 YANPQPVPMDSTFLRLSAEQSA--EQIRSGLSQFKGVLDVKTSLEGKVACVTFIPSVVNPGLLIQ 139

Human   142 LVPELSLDTGTLEK-KSGACEDHSMAQAGEVVLKMKVEGMTCHSCTSTIEGKIGKLQGVQRIKVS 205
            .:|.||||:...:| .||:.|..| :.|.:|::|||:|||||||||||||||:|||:||||||||
 Frog   140 KIPGLSLDSMASKKTTSGSVESRS-SVASDVLVKMKIEGMTCHSCTSTIEGKVGKLKGVQRIKVS 203

Human   206 LDNQEATIVYQPHLISVEEMKKQIEAMGFPAFVKKQPKYLKLGAIDVERLKNTPVKSSEGSQQRS 270
            ||:|||.|:||||||..|:::.|||..||.|.:|.:|.. ||||||:|||.||...|:....|:.
 Frog   204 LDSQEAQILYQPHLIKPEDIRTQIEEAGFIAQIKSKPPQ-KLGAIDIERLTNTQTNSNGDLPQKI 267

Human   271 PSYTND-STATFIIDGMHCKSCVSNIESTLSALQYVSSIVVSLENRSAIVKYNASSVTPESLRKA 334
            |.:.|| ..|.|.|:||||||||.||||.:.:...||||.|||||:.|::.:.::..|.::|.:|
 Frog   268 PKHQNDLIRAIFQIEGMHCKSCVVNIESNIGSQHGVSSIEVSLENKLAVIHFYSNITTSDALIQA 332

Human   335 IEAVSPGLYRVSITSEVE------STSNSPSSSSLQKIPLNVVSQPLTQE-----TVINIDGMTC 388
            |||:|||.::||:.:..|      ...||.:|.:.:     :.|.|..|:     |||||:||||
 Frog   333 IEALSPGTFKVSLCNHPELAETFSMQKNSEASCAKE-----IFSSPSNQDFCSKVTVINIEGMTC 392

Human   389 NSCVQSIEGVISKKPGVKSIRVSLANSNGTVEYDPLLTSPETLRGAIEDMGFDATLSDTNEPLVV 453
            .||||||||:||||||||||:|||.|:||||:|||.:||||.:|.|||||||||:|.........
 Frog   393 MSCVQSIEGLISKKPGVKSIQVSLVNNNGTVQYDPAVTSPEDIRAAIEDMGFDASLLANTGQADA 457

Human   454 IAQPSSEMPLLTS------TNEFYTKGMTPVQDKEEGKNSSKCYIQVTGMTCASCVANIERNLRR 512
            ....:|:.|.|.|      ||:     .|||..|.|.:..:||:||:||||||||||||||||||
 Frog   458 FTSEASQKPFLNSLLPKERTNK-----ETPVHSKPEKRTVNKCFIQITGMTCASCVANIERNLRR 517

Human   513 EEGIYSILVALMAGKAEVRYNPAVIQPPMIAEFIRELGFGATVIENADEGDGVLELVVRGMTCAS 577
            ||||||:|||||||||||||||.|:||..|||.|:||||.|:|:||.|:|.|:|||:||||||||
 Frog   518 EEGIYSVLVALMAGKAEVRYNPEVLQPSGIAELIQELGFEASVLENYDDGTGILELLVRGMTCAS 582

Human   578 CVHKIESSLTKHRGILYCSVALATNKAHIKYDPEIIGPRDIIHTIESLGFEASLVKKDRSASHLD 642
            |||||||.|.|.:|:||.||||||||||||:|||:||||||:..|..|||..|||||||||||||
 Frog   583 CVHKIESRLMKTKGVLYSSVALATNKAHIKFDPEVIGPRDIMKIINDLGFSTSLVKKDRSASHLD 647

Human   643 HKREIRQWRRSFLVSLFFCIPVMGLMIYMMVMDHHFATLHHNQNMSKEEMINLHSSMFLERQILP 707
            |:.||::|:||||:||.|||||||||::||.|::|:...||: ||:.|::.:.|.:|.||.||:|
 Frog   648 HRVEIQRWKRSFLISLIFCIPVMGLMVHMMFMENHYLMPHHH-NMTMEDIASYHPTMVLEYQIIP 711

Human   708 GLSVMNLLSFLLCVPVQFFGGWYFYIQAYKALKHKTANMDVLIVLATTIAFAYSLIILLVAMYER 772
            |||:|||:|.|||:||||.|||||||||||||||:||||||||||||::||.||||:|:||::|:
 Frog   712 GLSIMNLVSLLLCIPVQFLGGWYFYIQAYKALKHRTANMDVLIVLATSVAFIYSLIVLIVAIFEK 776

Human   773 AKVNPITFFDTPPMLFVFIALGRWLEHIAKGKTSEALAKLISLQATEATIVTLDSDNILLSEEQV 837
            :|||||||||||||||||||||||||||||.||||||::||||||||||:|.||.||.:.|||||
 Frog   777 SKVNPITFFDTPPMLFVFIALGRWLEHIAKSKTSEALSRLISLQATEATVVILDPDNTVKSEEQV 841

Human   838 DVELVQRGDIIKVVPGGKFPVDGRVIEGHSMVDESLITGEAMPVAKKPGSTVIAGSINQNGSLLI 902
            ||||||||||::|.||||||||||||||.|||||||||||||||:|||||:||||||||||||||
 Frog   842 DVELVQRGDIVRVTPGGKFPVDGRVIEGQSMVDESLITGEAMPVSKKPGSSVIAGSINQNGSLLI 906

Human   903 CATHVGADTTLSQIVKLVEEAQTSKAPIQQFADKLSGYFVPFIVFVSIATLLVWIVIGFLNFEIV 967
            .|||||:||||||||||||:||||||||||||||||||||||||.||:.||.|||:||:.|||||
 Frog   907 AATHVGSDTTLSQIVKLVEDAQTSKAPIQQFADKLSGYFVPFIVAVSVLTLFVWIIIGYHNFEIV 971

Human   968 ETYFPGYNRSISRTETIIRFAFQASITVLCIACPCSLGLATPTAVMVGTGVGAQNGILIKGGEPL 1032
            |.||||||:|||:.|.|:||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   972 EKYFPGYNKSISKGEVIVRFAFQAAITVLCIACPCSLGLATPTAVMVGTGVGAQNGILIKGGEPL 1036

Human  1033 EMAHKVKVVVFDKTGTITHGTPVVNQVKVLTESNRISHHKILAIVGTAESNSEHPLGTAITKYCK 1097
            |||||||.||||||||||.|||||.|||||.||||:..:|:||||||||||||||||:|:.||||
 Frog  1037 EMAHKVKTVVFDKTGTITKGTPVVMQVKVLVESNRMPSNKLLAIVGTAESNSEHPLGSAVIKYCK 1101

Human  1098 QELDTETLGTCIDFQVVPGCGISCKVTNIEGLLHKNNWNIEDNNIKNASLVQIDASNEQSSTSSS 1162
            :.|:.||||||.|||.||||||||||.|||.|||..|   ..:|.:||.|||||..:|.|...|.
 Frog  1102 EVLNAETLGTCYDFQAVPGCGISCKVNNIEPLLHAAN---GPDNKRNAVLVQIDGQHEDSILPSI 1163

Human  1163 MIIDAQISNALNAQQYKVLIGNREWMIRNGLVINNDVNDFMTEHERKGRTAVLVAVDDELCGLIA 1227
            .:.....:.:...|.|.|||||||||.||.|.:..:.:..|||||:|||||||||||..||||||
 Frog  1164 TVSQNPSNGSSPPQTYSVLIGNREWMNRNFLTLTAETDSLMTEHEKKGRTAVLVAVDGVLCGLIA 1228

Human  1228 IADTVKPEAELAIHILKSMGLEVVLMTGDNSKTARSIASQVGITKVFAEVLPSHKVAKVKQLQEE 1292
            |||||||||.||||.|:||||::|||||||||||::||:|||||||||||||||||||||||||:
 Frog  1229 IADTVKPEAALAIHSLRSMGLDIVLMTGDNSKTAKTIAAQVGITKVFAEVLPSHKVAKVKQLQEQ 1293

Human  1293 GKRVAMVGDGINDSPALAMANVGIAIGTGTDVAIEAADVVLIRNDLLDVVASIDLSRKTVKRIRI 1357
            |.||||||||||||||||||:|||.||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1294 GTRVAMVGDGINDSPALAMADVGITIGSGTDVAIEAADVVLIRNDLLDVVASIDLSRKTVKRIRI 1358

Human  1358 NFVFALIYNLVGIPIAAGVFMPIGLVLQPWMGSAAMAASSVSVVLSSLFLKLYRKPTYESYELPA 1422
            ||||||||||||||||||||||:||:||||||||||||||||||.|||.|||||||:.|..|...
 Frog  1359 NFVFALIYNLVGIPIAAGVFMPVGLILQPWMGSAAMAASSVSVVFSSLLLKLYRKPSREKLEQRV 1423

Human  1423 RSQIGQKSPSEISVHVGIDDTSRNSPKLGLLDRIVNYSRASINSLLSDKRSLNSVVTSEPDKHSL 1487
            :.|:.|||.|:||||:|:.:..|.|.||.||||||||||||:||.||||.|.:|:..||||||||
 Frog  1424 QGQMRQKSLSDISVHIGLTENRRTSTKLDLLDRIVNYSRASLNSFLSDKHSQHSIPLSEPDKHSL 1488

Human  1488 LVGDFREDDDTAL 1500
            |:|:.:.::||.|
 Frog  1489 LLGELKGEEDTFL 1501

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

Software error:

Illegal division by zero at /www/www.flyrnai.org/docroot/cgi-bin/DRSC_prot_align.pl line 592.

For help, please send mail to the webmaster (ritg@hms.harvard.edu), giving this error message and the time and date of the error.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ATP7ANP_000043.4 HMA 11..73 CDD:238219 48/60 (80%)
HMA 174..236 CDD:238219 47/61 (77%)
HMA 280..337 CDD:238219 28/56 (50%)
HMA 380..443 CDD:238219 50/62 (81%)
HMA 492..554 CDD:238219 52/61 (85%)
HMA 567..630 CDD:238219 47/62 (76%)
P-type_ATPase_Cu-like 652..1388 CDD:319783 580/735 (79%)