DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment cmet and Cenpe

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_524993.3 Gene:cmet / 53561 FlyBaseID:FBgn0040232 Length:2189 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038959788.1 Gene:Cenpe / 362044 RGDID:1307115 Length:2456 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2547 Identity:646/2547 - (25%)
Similarity:1083/2547 - (42%) Gaps:617/2547 - (24%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     7 SSIQVCIKVRPC-----EPGLTS--LWQVKERRSIHLADSHAEPYVFDYVFDEGASNQEVFDRMA 64
            :::.||::|||.     |.|..|  .|:. ::.:|:.:|. .:.:.||.||....:.:.|::.:|
  Rat     5 AAVAVCVRVRPLNSREEELGEASHIYWKT-DKNAIYQSDG-GKSFQFDRVFHSNETTKNVYEEIA 67

  Fly    65 KHIVHACMQGFNGTIFAYGQTSSGKTYTMMGDEQNPGVMVLAAKEIFQQISSETERDFLLRVGYI 129
            ..|:.:.:||:||||||||||:||||:||||.|...||:..|..:|||:|....||:|||||.|:
  Rat    68 VPIISSAIQGYNGTIFAYGQTASGKTHTMMGSEDCLGVIPRAIHDIFQRIKKFPEREFLLRVSYM 132

  Fly   130 EIYNEKIYDLL--NKKNQDLKIHESGNGIVNVN--CEECIITSEVDLLRLLCLGNKERTVGETNM 190
            |||||.|.|||  .:|.:.|.|.|..|..|.|.  .||.:.|:|: .|:.|..|.|.|..|.|.|
  Rat   133 EIYNETITDLLCNTQKVKPLIIREDINRNVYVADLTEEVVYTAEM-ALKWLATGEKNRHYGITKM 196

  Fly   191 NERSSRSHAIFKIIIESR-KSDHSDDDAVIQ-SVLNLVDLAGSERADQTGARGARLKEGGHINKS 253
            |:||||||.||::|:||| |::.|:.|..|: |.||||||||||||.||||.|.|||||.:||::
  Rat   197 NQRSSRSHTIFRMILESREKAESSNCDGSIKVSHLNLVDLAGSERAAQTGAEGMRLKEGCYINRN 261

  Fly   254 LLFLSNVIKSLSENADNRFTNYRDSKLTRILQASLGGNAFTSIICTIKPSIMEESQSTLSFATRA 318
            ||.|..|||.||:.....|.||||||||||||.||||||.|.|||||.|:.::|:.:||.||:.|
  Rat   262 LLILGQVIKKLSDGQVGGFINYRDSKLTRILQNSLGGNAKTRIICTITPASLDETLTTLQFASTA 326

  Fly   319 KKIRIKPQVNEMVSDATMMKRLEREIKVLKDKLAEEERKNENQ-----------------QKVEH 366
            |.::..|.|||:.:|..::||..|||..||.:|.|...|...|                 |||: 
  Rat   327 KYMKNTPYVNEVSNDEALLKRYRREIVDLKKQLEEVNTKTRAQEIEKDQLAQLLDEKDLLQKVQ- 390

  Fly   367 LERQIKHDMHKIICGHSLSDKGQ----QKRRRTWC--PTASGSHLELAETGTTEDRIDQFPKVSH 425
             :.:|::....::...|::.:.:    :|||.|||  .....::::..:..|......:...|:.
  Rat   391 -DEKIQNLKRMLVTSSSIALQQELEIKKKRRVTWCFGKMKDSNYVKEFKIPTNITTRTRKTSVTP 454

  Fly   426 LPKPVFFHTSNAGKRWDN--IPKTINILGSLDIGTESNSISEEFLPAECIDFGSPRPDVLKPMLT 488
            |.:........:...|::  ...|:..|...:..:.:..:|||.|.:|.....:...::   :|.
  Rat   455 LRENSLMKLGESALSWESEVFDNTLEPLAEAEWSSATALLSEENLESELTSLNTQYNNL---VLD 516

  Fly   489 IRQL----PDLPLTPKGPLTTDKIK-KEIQDLQMFTSLEKHFEVECE-----EVQGLKEKLAEVT 543
            ..||    .||           |:| ||..:|:.|..||:..|.:.|     ||..||..:....
  Rat   517 YEQLRRENEDL-----------KLKLKEKNELEEFEFLEQREEKDQELQLMHEVSNLKNLIKHAE 570

  Fly   544 AQRDNLEQ------ESLAEKE-------RY-DALEKEVTS------------------------- 569
            ....:||.      |.|.|||       || ||.:.|.|.                         
  Rat   571 EYNQDLENELSSKVELLKEKEDQIKELQRYIDAQKSETTKTDLSYSSEATEDLKQAMRTLSDLDT 635

  Fly   570 -----------LRADNEAANSKISELEEKLSTLKQTM----RIMEVENQVAVGLEFEFE-AHKKS 618
                       ||::|.....:|:||.:....::..:    |.:|.:.||...||.|.: |.::.
  Rat   636 VALDAKRESAFLRSENLELKERINELSDSCKQMENGIQMYQRQLEAKKQVQADLEKELQLAFQEI 700

  Fly   619 SKLR--VD--DLLSALLEKESTIESLQKSLDNLTRDVLRNSKEGHMLSIAPEQEDIAGDSICNKC 679
            |||.  ||  .|||. ||.|..|..|||.|:....:.....||.|:||                 
  Rat   701 SKLSALVDGKGLLSN-LELEKRITDLQKELNKEVEEKETLQKEVHLLS----------------- 747

  Fly   680 EELEKLIADLESKKNSCECDQLRLEIVSVRDKLESVESAFNLASSEIIQKATDCERLSKELSTSQ 744
             ||:.|.:::|:         ||.|:....::|..:.:......||:..|.:..:.|.:|:..::
  Rat   748 -ELKSLPSEVET---------LRRELHEKSEELCVITTEREKLFSEMAHKDSRIQGLLEEIGNTK 802

  Fly   745 N--AFGQLQERYDALDQQWQAQQAGITTLHEKHEHVQEKYQKLQEEYEQLESRARSASSAEFQRL 807
            :  |..||.:|  :.|::.||.::....|..:.|.|.|:.:::::|..| :::..:..:||.|.:
  Rat   803 DDLAASQLSQR--SSDEECQALKSLHVELKHRQEEVLEESERVKQELSQ-KTQELAQKTAEGQEM 864

  Fly   808 QNDNTKFQADIASLNERLEEAQ---NMLTEVQNSESTVEKLRIQNHELTAKIKELETNFEEMQRE 869
            .|...:.:..:...:..|:.|:   |:|||  ..:.|:|::|    .||.:..:|:...|.:|.|
  Rat   865 LNQMEELREKLERRDSSLQSAEKEKNLLTE--KLQQTLEEVR----ALTQEKNDLKQLQESLQTE 923

  Fly   870 YDCLSNQLMESVQENDALREE-----------------IKQRPTSHVEESMRSSGISSDFDEQKQ 917
            .|.|.:.:.::|..|...:|:                 :|.:.|..:.:.:...|.....||.:|
  Rat   924 RDQLRSDIQDTVNMNIDTQEQLLNALESLKQHQETINMLKMKATEEMSDHLPIKGREGSSDEVEQ 988

  Fly   918 DINLLHQFVQLSESVQQI--------ELQHHSGISRLFRAN---------------QMKLDQSEP 959
            .::.:.:...|:||...:        |.:....|..|.:.|               |:|:|..| 
  Rat   989 KLDGIDEENLLAESAHTVVGSGEDHGETEEQRKIDSLLQENSRLQQTLESIIAEKEQLKMDLKE- 1052

  Fly   960 GLKLCLESAEYIEEDNRQSDATEPICLKGFLKRHRFQIKRLSQEHV-DMGEE-KRLLDIISQLEQ 1022
            .:::.:|:.|.:.            .|:..|||.: :|....::|| :..|| .|..:.::::|:
  Rat  1053 NIEMSVENQEELR------------ILRDELKRQQ-EIAAQEKDHVTEKSEELSRAHERLAEIEE 1104

  Fly  1023 EIEEKSALMEATEATI---------------------NEMREQMTNLESALLEKSVIINKVEDYQ 1066
            :::||:..::.|:..:                     ||.|.|...||....|:..:..|:.:..
  Rat  1105 KLKEKNQKLQETQQQLVSIQEAMSEMQAKVTDLENLQNEFRNQALALERVETERLELAQKLHENY 1169

  Fly  1067 RQIESLEKQNAEMTMVYE--ELQDRVTRE----------------------------------SS 1095
            .::||:.|:..::..:.|  |::.:..:|                                  .|
  Rat  1170 EKMESITKERNDLKELQESFEIEKKQLKEYAREMESAGLQTKEQLNIAHANLKEYQEIIKELRGS 1234

  Fly  1096 MSESLLRVPPDEDTLPGCPTS----PSRREQEVATLKTSITELQSQVSDLKAELENHLRQ----- 1151
            :||...:....:||....|.|    |..||||:............:.|:|: .:|.|.|.     
  Rat  1235 ISEKEAQASSTQDTGKTNPASQGETPVPREQELLPDAEEARASAEKGSELE-PVEEHSRTAHSLT 1298

  Fly  1152 ---IQLKDGNIARLQTDFEEMSER--CLSMEVRLAELDEDTKQKQELLDRQAQKLSDDLCLIDQL 1211
               |:::   |..|....||..:.  ||:.|      ..|.::.||.|..:..:|.||.      
  Rat  1299 TEGIEME---ILALTKKLEESQKEISCLTKE------RSDLRRTQEALQVECAQLKDDA------ 1348

  Fly  1212 QKKNAQLVEQYHKATESLSLADAKPDQILLSSQ---YDSQIEKLNQLLNAAKDELHDVRRIKDDE 1273
                .:.:..:.:..|.||||     :..|..|   .||.|..|:|               |:.|
  Rat  1349 ----RRTLANHLETEEELSLA-----RCCLKEQENKIDSLIVSLSQ---------------KEAE 1389

  Fly  1274 ISALRMEFLLQIETNEKENQAKFYAELQE---TKDRYE-----SNVAELKEKLLQVEETLSSV-- 1328
            :|::|::  |::.|.|.|.:.:...|.||   .|:..|     |.:..::..||..:..|.||  
  Rat  1390 LSSVRVQ--LEVTTGELERKVQELCEKQEQLNIKETSEVQGKMSELDHIRALLLTKDSALQSVES 1452

  Fly  1329 -TVRCQAELEALKSAHKENISQAVEERNNLIVQHQAEMETIRETLKNKLAEASTQQSKMED---- 1388
             .:|...:||    ..:|.|...::||..| .:.|..:...||..:..:.|.||:..:::|    
  Rat  1453 DRLRLNKQLE----ESQEEIKILIKEREEL-RRAQEALHVEREQQQESIKEISTRLQELQDKEYE 1512

  Fly  1389 -AFRAEINEVRATLMEQLNQTKEDRDKGASKLEEVKKTLEQMINGGRVMSDTIAELEKTKAEQD- 1451
             .....:||.:....|.|||..|.:.....|:|.....|.|.:|      :|:.|::....|:| 
  Rat  1513 YLVMKSLNETQGNKCEDLNQQLEAQKSSLEKVEMQNVNLTQRLN------ETLEEMKSVAKERDE 1571

  Fly  1452 --LAVNKLTKDNIELEKQCSKTQEQLQMESLTRDQISFEIEAHIKKLELIVASSKKRIIELEEK- 1513
              ....:||.|..:|:|...        |::|:   ..|.|..::...:.:...::.|.||.:. 
  Rat  1572 LRSVEERLTADRDQLKKSLE--------ETITK---GLEKEEELRVAHMHLQEHQETINELRKSV 1625

  Fly  1514 --CDQQVL----ELDKCR------LEKLSLESEIQKANSEHSCTMEKLQELQAEMKVLSNRNEKE 1566
              |..::.    :|:...      ||......|:|:...:.|.....|:|...:|:.|..:.|.:
  Rat  1626 SDCTDEIAHIHGDLEHTHAVIHGDLEHTHANQELQEKGHQLSQVKADLRETMDQMEQLKEQLEAQ 1690

  Fly  1567 KCDFETKLETFTFKIT-DLEEVLKEAQHKVILYDDLVSQHERLKICLAEANELSSNL-------- 1622
            ....|: :|....|:| .|.|.|||........|||....|.|:   .|.::|..:|        
  Rat  1691 NSTLES-IEIEKLKLTQQLNENLKEMTLVAKENDDLKIMDEALR---EERDQLRESLRQTEASDL 1751

  Fly  1623 --QKKVMSLHTELIDSQK-------GISSRDVEINELREELKAAMDAKATASAEQMTLVTQLKD- 1677
              |:|:...|.:|.:.|:       .::.|..|::::..||:.|.              |:|:: 
  Rat  1752 EKQEKLRIAHLDLKEHQETIERLMGSVAKRTEEVSDMNMELERAN--------------TRLQEK 1802

  Fly  1678 VEERMANQAE--KFTREAANLKGSINELLLKLNSMQETKDMLESGNEELKEQLRNSQNLRNMLDE 1740
            |:|..|::.:  |...||...|..:.|..|.|:.       :|..|..|.:|:.  |||     |
  Rat  1803 VQELKASELQLLKSKVEAGETKKQLKEQGLALSK-------IEMENLNLAQQIH--QNL-----E 1853

  Fly  1741 ESKMCISLKEKLVKLEDAKTSLEQQLRDNKSEI-YQRHTELTKEVELGRN--------------- 1789
            |.|.....::.|.::|:.....:.||:|:..|. ::.|....:.|:.|:.               
  Rat  1854 EMKSISKERDDLKRMEEILRMEKDQLKDSLREAKFKAHQNYEETVQYGKGLLCGGEQHCTGRLRE 1918

  Fly  1790 ---RIGELTKKCEELCSDLENSDQIRLDLQ---ETKEQLKKTLENNLG--WQQKVDEVTRECEKL 1846
               ||.:|.|:..|:.:|.|..::..|||:   :|:::|..|::..|.  :.|     |:|.|||
  Rat  1919 KCLRIEKLLKRYSEMANDYECLNRFSLDLEKETKTQKELSVTIKTKLSLPYTQ-----TKEIEKL 1978

  Fly  1847 -------------------------------------RFDM---QSKEVQNE--SKVQELISECE 1869
                                                 :|:|   |..|.|||  .|:|.|     
  Rat  1979 LTANQRCSMEFHRILKKLKYVLSYITRIKEEQHEFINKFEMAFIQEVEKQNELQIKIQSL----- 2038

  Fly  1870 ELRSTLKSKEASFQSEKESMDRTISSLLEDKRNLEEKLCSANDIVAKLETEIAALRPRKSLDRNP 1934
            ...|.:.|:::..:..:| ||..|..:|:|        .|.||.:. ::||:      |.:..| 
  Rat  2039 SQTSNIPSRDSQSKLSQE-MDLHIEEILKD--------FSENDFLT-IKTEV------KQVLSN- 2086

  Fly  1935 VPRKSIT----------FESEIRKNRRISVHDERRQSYWNDVREFGIMTDPVDNNCNCAELNSKL 1989
              ||.||          |::|   |.:.|:..|.        :..|::     ||.    .:||:
  Rat  2087 --RKEITEFLEKWLNTHFDTE---NLKSSIQKEN--------KSIGLV-----NNF----YHSKI 2129

  Fly  1990 QDCQRELFIRESQVTALKMELDHH--PLKDENAQLTK---------RVI--EEQDKAKVEQKRLK 2041
            .....|....|.:..|...:|:.|  .|.:...||:|         .::  ..||.   :..|:.
  Rat  2130 TAMVNESTEFEERCAARAKDLERHLKALTETTEQLSKVYQSLTVSWSIVRPSTQDS---KDPRVA 2191

  Fly  2042 MKLQDLNAR-INDLTTASAKEPESNQMAQAAKPATVAAQTQTESDLETILEKTNVKYQEAVRMLR 2105
            ::.:.|.:: .|.|.....||...:...|..|..........|.:.|.:..|..|::||.|    
  Rat  2192 LEAEQLTSKDKNALGAMPYKEEIEDLKMQLVKIDLEKKAKAKEFEKEMLAIKATVEHQEEV---- 2252

  Fly  2106 YRYHLIQELKEKLRQNENS-DTSNITS---------LSAGQTSA---------LKAQCESQKKEI 2151
                 |:.|:|.||:|:.: |||.::.         |:.|..|.         ||::.:..:.||
  Rat  2253 -----IRLLRENLRRNQQAQDTSMLSEQDSHPLRKPLTCGGGSGIVQSTKALILKSEYKKMESEI 2312

  Fly  2152 LAIKYKYEAAKR 2163
            ..:|.:.|..::
  Rat  2313 SKLKQQNEQLRK 2324

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
cmetNP_524993.3 KISc 8..328 CDD:214526 166/332 (50%)
Motor_domain 8..321 CDD:277568 165/325 (51%)
Smc <680..1449 CDD:224117 189/905 (21%)
TMPIT 779..>867 CDD:285135 20/90 (22%)
Smc 1042..1910 CDD:224117 226/1039 (22%)
CenpeXP_038959788.1 KISc_CENP_E 6..329 CDD:276825 165/325 (51%)
Smc <334..1057 CDD:224117 171/776 (22%)
Smc 787..1603 CDD:224117 190/902 (21%)
Smc 1320..2167 CDD:224117 221/987 (22%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C166334494
Domainoid 1 1.000 261 1.000 Domainoid score I1891
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 1 1.050 468 1.000 Inparanoid score I1463
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 1 1.000 - - otm45121
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_101662
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR47968
Phylome 00.000 Not matched by this tool.
SonicParanoid 1 1.000 - - X5166
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
98.980

Return to query results.
Submit another query.