DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ACXB and ACXC

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_620474.2 Gene:ACXB / 53427 FlyBaseID:FBgn0040509 Length:1114 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_609593.1 Gene:ACXC / 34689 FlyBaseID:FBgn0040508 Length:1130 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1114 Identity:726/1114 - (65%)
Similarity:882/1114 - (79%) Gaps:18/1114 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    10 RKCYLDYTDERLWERGYLKAKCKELCLEEEYKKYQIRLMISYLTVFFPLFIFVVVGCELCPWIFS 74
            |.|:|||.:|||||..||:.|||||.|||||:.||:|||:|.||:|:.|||.:.:.......::.
  Fly    19 RPCHLDYANERLWEHSYLREKCKELNLEEEYRYYQVRLMVSNLTIFYVLFIILAMSFLTIELLYV 83

  Fly    75 EQKKLIYYESLTAIVVLVAVPGILSINFFESFVLRHRWIMVFSSILSAYIVVLVDIFQILVFHFK 139
            :....:::..:..:|..:.|..:|||||.|.||.||||:|:.||:||.|:|||.||..|....:|
  Fly    84 QHYNAVFFNFVIRVVSTILVLTVLSINFCEKFVSRHRWVMIASSVLSVYLVVLTDIVMISYHFYK 148

  Fly   140 YHWPLNTLYDVFVLCMIYMFLPIPSIRGAALLATSVSLMYIGLFIYFLKSDDEDISEVVHDLDTI 204
            ..|||||.:|||.|||||||||||||:||||||:||||:|:..|::.|..:...........|.|
  Fly   149 NDWPLNTSFDVFTLCMIYMFLPIPSIKGAALLASSVSLIYVAFFMHSLTFNAVYTDRDSFGYDVI 213

  Fly   205 CVDIFHYLGFNLMGIFFRIMNDTMVRSSFLDRHQFLKEEMWLRQARQQESMLLDSILPPQIAKPI 269
            ..||.|.||||:||||||||||||||:||||||||:.||.|||.|..|||:|||||||||||||:
  Fly   214 STDILHNLGFNMMGIFFRIMNDTMVRASFLDRHQFIMEETWLRHALLQESILLDSILPPQIAKPV 278

  Fly   270 QQSIKERIMLSETDSDRIVVNARRTENFMAIQIHPDVSILYADVVNYTHLTTTLTVEKLVKVLHD 334
            |:.||.:|..||...||..:..|.||:|||||||||||||||||||||||||||||..|||||||
  Fly   279 QEKIKSKITQSENSPDRFQMGPRTTESFMAIQIHPDVSILYADVVNYTHLTTTLTVGNLVKVLHD 343

  Fly   335 LYGRFDMAASTFKVQRIKFLGDCYYCVAGLGEADPDHARMAVSLGISMIANIQEVRAHRALDIDM 399
            ||||||:|||.|||||||||||||||||||...|||||:..||||||||:|||||||.|.|||||
  Fly   344 LYGRFDIAASNFKVQRIKFLGDCYYCVAGLTTPDPDHAKCCVSLGISMISNIQEVRAERGLDIDM 408

  Fly   400 RIGVHSGTLLAGVIGQAKLQYDIWGPDVDIANRLEATGKPGYVHVSGRTLSSLNVAEYTVFPGTE 464
            |||||||:||||:||:||||:||||.||:|||.||:||:||||||||||||.||.|:||:..||:
  Fly   409 RIGVHSGSLLAGIIGEAKLQFDIWGTDVEIANHLESTGEPGYVHVSGRTLSMLNPADYTILSGTQ 473

  Fly   465 VAQSDPILQKQPMTTYLLTAAPSRNS-VRSVDAVHSYAEIDINALGASRKSPILRP--TLMSDEL 526
            .|||||:||.  :.|||||...:|.| :.|:..|.|.:.:::.::...|.|   ||  :.|:||.
  Fly   474 KAQSDPVLQY--IHTYLLTGQVARESFITSIGGVRSSSVLEVKSIDRIRSS---RPSQSSMTDEF 533

  Fly   527 REEFKKMPVGGFNIRSPCCRDNSND--EKVNHGLGMFCVAFKDSSLEWSYLHKPDFILKYSVLLA 589
            ||||:.|||||.|:.|||||....|  :|....:|:||.|||||||||:|||:||||.|.|:|||
  Fly   534 REEFRNMPVGGINLNSPCCRRTRLDTHKKTQREIGIFCAAFKDSSLEWNYLHQPDFIFKSSMLLA 598

  Fly   590 WGIGCCLIYIQIVNDKFTICVECIVIDMVVFTFLTSLLFISWFKKVCWWRCVENDSRKYGRVSCK 654
            |||||||||||||.:.|: |..|||:|:|.|.||||||.::|:|.||||:....:.|.||:.||.
  Fly   599 WGIGCCLIYIQIVTNNFS-CTACIVVDLVTFFFLTSLLCLAWYKNVCWWKSGRYEFRIYGKYSCM 662

  Fly   655 LFKIWERIQHSFVLRVTIYMSIVASYYLLISTILLNCDKNQYELDVINSKLYHYDIVTDNCFNPW 719
            .|.|:|:||||..||:|:|:.|:.|||.:||.|:||||::.|||..|.||:|||::..|.||:||
  Fly   663 AFHIFEKIQHSVSLRITVYLGILFSYYAVISLIMLNCDRDMYELSYIESKIYHYEMDRDTCFHPW 727

  Fly   720 VFTDMISLIVGVSYTFARIPFALKMLITCCATVAYLVIVFFQYSFIFEHSATTTPFMKAELAHCL 784
            |||:|||||:|:|||||||||.||::|:||.|:|||:|||||::|||:|||||||||||||||||
  Fly   728 VFTNMISLILGISYTFARIPFGLKIVISCCETLAYLLIVFFQFAFIFQHSATTTPFMKAELAHCL 792

  Fly   785 RVCMMLLTMYAKERQSEFNTKINFKINQDLQGKQKAADITNKSIIILLTNILPSHVVEVYLDSVA 849
            |||||||||||||||||||||:|:|:|.|||.||||||:||:||||||.||||||||::||:|:|
  Fly   793 RVCMMLLTMYAKERQSEFNTKMNYKLNVDLQNKQKAADLTNQSIIILLNNILPSHVVDLYLNSLA 857

  Fly   850 NHELYYENYKMVSVMFAMLINFQMDLPSLRVLNDIITEFDRLLNAYKEYYVVEKIKVVGCTYMAA 914
            .||||||||:||||||||||||.|:||||||||||||:|||||.||:||||||||||||||||||
  Fly   858 KHELYYENYRMVSVMFAMLINFPMNLPSLRVLNDIITQFDRLLTAYREYYVVEKIKVVGCTYMAA 922

  Fly   915 CGLDFTLAKSKFGSRTHASYSSELEQVLYRKESKGTENDH------DEVAFIMTTFALDLMRVLS 973
            |||||.|| |......|...||...:|.:.:..:.|:.::      |||.||||||||||||.|:
  Fly   923 CGLDFNLA-SNIRQTDHFRNSSLHVEVEHARNHRMTDENYDSDMNNDEVVFIMTTFALDLMRTLA 986

  Fly   974 VCNKAYAGRPFDRALSTGEICIGISTGEIMAGVVGASQPHYDIWGNPVNMASRMESTGLPGHIHV 1038
            .||:||:...|:|:||.|:||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
  Fly   987 ACNRAYSSSFFERSLSQGKICIGISSGEIMAGVVGASQPHYDIWGNPVNMASRMESTGLPGHIQV 1051

  Fly  1039 TQETANILEQFDIMCMYRGMTFVKGRGEIPTYFVGIDDNLKFLPSNVKKNNMSKRFSILSSLVPV 1103
            |:|:|.||::|||.|:|||||||||||:|||||||||:||||:.:.:...::|:|||::|||.|.
  Fly  1052 TEESAKILQEFDIKCIYRGMTFVKGRGDIPTYFVGIDENLKFMSAKLVNRSLSRRFSVMSSLDPD 1116

  Fly  1104 HSRSTTSSE 1112
            ..|.::||:
  Fly  1117 SLRKSSSSD 1125

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ACXBNP_620474.2 AcyC 85..452 CDD:441717 257/366 (70%)
Nucleotidyl_cyc_III 298..484 CDD:448371 149/185 (81%)
Nucleotidyl_cyc_III 853..1072 CDD:448371 162/224 (72%)
ACXCNP_609593.1 Nucleotidyl_cyc_III 307..466 CDD:448371 134/158 (85%)
Nucleotidyl_cyc_III 861..1085 CDD:448371 162/224 (72%)

Return to query results.
Submit another query.