DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment PLD2 and Pld2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_002654.3 Gene:PLD2 / 5338 HGNCID:9068 Length:933 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_038941178.1 Gene:Pld2 / 25097 RGDID:3350 Length:972 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:972 Identity:844/972 - (86%)
Similarity:875/972 - (90%) Gaps:39/972 - (4%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MTATPESLFPTGDELDSSQLQMESDEVDTLKEGEDPADRMHPFLAIYELQSLKVHPLVFAPGVPV 65
            ||.|...|||.||.|:||||.||.|||||||||||||||||||||||:||.|:.|||||||||||
  Rat     1 MTVTQTDLFPYGDYLNSSQLHMEPDEVDTLKEGEDPADRMHPFLAIYDLQPLRAHPLVFAPGVPV 65

Human    66 TAQVVGTERYTSGSKVGTCTLYSVRLTHGDFSWTTKKKYRHFQELHRDLLRHKVLMSLLPLARFA 130
            .||||||||||||||||||||||||||||||:||||||:||||||||||.|||||||||||||||
  Rat    66 IAQVVGTERYTSGSKVGTCTLYSVRLTHGDFTWTTKKKFRHFQELHRDLQRHKVLMSLLPLARFA 130

Human   131 VAYSPARDAGNREMPSLPRAGPEGSTRHAASKQKYLENYLNRLLTMSFYRNYHAMTEFLEVSQLS 195
            .|:||||:|.|..:|||||.|.|||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 AAHSPAREAANENIPSLPRGGSEGSARHTASKQKYLENYLNRLLTMSFYRNYHAMTEFLEVSQLS 195

Human   196 FIPDLGRKGLEGMIRKRSGGHRVPGLTCCGRDQVCYRWSKRWLVVKDSFLLYMCLETGAISFVQL 260
            ||||||.|||||:||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||..||||||||||
  Rat   196 FIPDLGSKGLEGVIRKRSGGHRVPGFTCCGRDQVCYRWSKRWLVVKDSFLLYMRPETGAISFVQL 260

Human   261 FDPGFEVQVGKRSTEARHGVRIDTSHRSLILKCSSYRQARWWAQEITELAQGPGRDFLQLHRHDS 325
            |||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||:|||
  Rat   261 FDPGFEVQVGKRSTEARYGVRIDTSHRSLILKCSSYRQARWWGQEITELAQGPGRDFLQLHQHDS 325

Human   326 YAPPRPGTLARWFVNGAGYFAAVADAILRAQEEIFITDWWLSPEVYLKRPAHSDDWRLDIMLKRK 390
            ||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||:||||||||||||||||||||
  Rat   326 YAPPRPGTLARWFVNGAGYFAAVADAILRAREEIFITDWWLSPEIYLKRPAHSDDWRLDIMLKRK 390

Human   391 AEEGVRVSILLFKEVELALGINSGYSKRALMLLHPNIKVMRHPDQVTLWAHHEKLLVVDQVVAFL 455
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||.||||
  Rat   391 AEEGVRVSILLFKEVELALGINSGYSKRTLMLLHPNIKVMRHPDLVTLWAHHEKLLVVDQAVAFL 455

Human   456 GGLDLAYGRWDDLHYRLTDLGDSSESAASQPPTPRPDSPATPDLSHNQFFWLGKDYSNLITKDWV 520
            ||||||||||||:.||||||||.||||.||.|||..|..||||||||.|||||||||||||||||
  Rat   456 GGLDLAYGRWDDVQYRLTDLGDPSESADSQTPTPGSDPAATPDLSHNHFFWLGKDYSNLITKDWV 520

Human   521 QLDRPFE---------------------------------------DFIDRETTPRMPWRDVGVV 546
            |||||||                                       |||||||||||||||||||
  Rat   521 QLDRPFEEEVRTGTQPEQEPGGLLLPGSFPVDSSVSFLPEPRTTTPDFIDRETTPRMPWRDVGVV 585

Human   547 VHGLPARDLARHFIQRWNFTKTTKAKYKTPTYPYLLPKSTSTANQLPFTLPGGQCTTVQVLRSVD 611
            |||:.|||||||||||||||||.||:||.|.||||||||.||||.|||.:||.||.|||||||||
  Rat   586 VHGVAARDLARHFIQRWNFTKTIKARYKIPQYPYLLPKSASTANHLPFIIPGAQCATVQVLRSVD 650

Human   612 RWSAGTLENSILNAYLHTIRESQHFLYIENQFFISCSDGRTVLNKVGDEIVDRILKAHKQGWCYR 676
            ||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||.|:|
  Rat   651 RWSAGTLESSILNAYLHTIRESQHFLYIENQFFISCSDGRTVLNKVGDEIVDRILKAHEQGQCFR 715

Human   677 VYVLLPLLPGFEGDISTGGGNSIQAILHFTYRTLCRGEYSILHRLKAAMGTAWRDYISICGLRTH 741
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||
  Rat   716 VYVLLPLLPGFEGDISTGGGNSIQAILHFTYRTLCRGEYSILHRLKAAMGTAWRDYMSICGLRTH 780

Human   742 GELGGHPVSELIYIHSKVLIADDRTVIIGSANINDRSLLGKRDSELAVLIEDTETEPSLMNGAEY 806
            |||||||:|||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||:||||||.|||||:|.||
  Rat   781 GELGGHPISELIYIHSKLLIADDRTVIIGSANINDRSLLGKRDSELAILIEDTEMEPSLMDGVEY 845

Human   807 QAGRFALSLRKHCFGVILGANTRPDLDLRDPICDDFFQLWQDMAESNANIYEQIFRCLPSNATRS 871
            ||||||||||||||.|||||||.||||||||:|||||||||:.||:||.||||||||||||||||
  Rat   846 QAGRFALSLRKHCFSVILGANTWPDLDLRDPVCDDFFQLWQETAENNATIYEQIFRCLPSNATRS 910

Human   872 LRTLREYVAVEPLATVSPPLARSELTQVQGHLVHFPLKFLEDESLLPPLGSKEGMIPLEVWT 933
            ||.||||||||.||||||.||:|||..::|||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   911 LRALREYVAVESLATVSPSLAQSELAHIRGHLVHFPLKFLEDESLLPPLGSKEGMIPLEVWT 972

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
PLD2NP_002654.3 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..34 23/32 (72%)
PLN02866 66..918 CDD:215467 775/890 (87%)
Catalytic 441..788 316/385 (82%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 477..497 12/19 (63%)
Pld2XP_038941178.1 PLN02866 67..957 CDD:215467 775/889 (87%)

Return to query results.
Submit another query.