DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment PIK3CD and Pik3cd

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_005017.3 Gene:PIK3CD / 5293 HGNCID:8977 Length:1044 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_038966422.1 Gene:Pik3cd / 366508 RGDID:1310990 Length:1048 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1048 Identity:981/1048 - (93%)
Similarity:1007/1048 - (96%) Gaps:4/1048 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MPPGVDCPMEFWTKEENQSVVVDFLLPTGVYLNFPVSRNANLSTIKQLLWHRAQYEPLFHMLSGP 65
            ||||||||||||||||:|||.||||||||||||||||||||||||||:|||||||||.|||||.|
  Rat     1 MPPGVDCPMEFWTKEESQSVAVDFLLPTGVYLNFPVSRNANLSTIKQVLWHRAQYEPFFHMLSDP 65

Human    66 EAYVFTCINQTAEQQELEDEQRRLCDVQPFLPVLRLVAREGDRVKKLINSQISLLIGKGLHEFDS 130
            |||||||:||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 EAYVFTCVNQTAEQQELEDEQRRLCDIQPFLPVLRLVAREGDRVKKLINSQISLLIGKGLHEFDS 130

Human   131 LCDPEVNDFRAKMCQFCEEAAARRQQLGWEAWLQYSFPLQLEPSAQTWGPGTLRLPNRALLVNVK 195
            |.||||||||.||.||||||||.||||||..||||||||||||||:.|..|.|.:.||.||||||
  Rat   131 LRDPEVNDFRTKMRQFCEEAAAHRQQLGWVEWLQYSFPLQLEPSARGWRAGLLHVSNRPLLVNVK 195

Human   196 FEGSEESFTFQVSTKDVPLALMACALRKKATVFRQPLVEQPEDYTLQVNGRHEYLYGSYPLCQFQ 260
            ||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||:||:|.|||||||||||||||||.||
  Rat   196 FEGSEESFTFQVSTKDMPLALMACALRKKATVFRQPLVERPEEYALQVNGRHEYLYGSYPLCHFQ 260

Human   261 YICSCLHSGLTPHLTMVHSSSILAMRDEQSNPAPQVQKPRAKPPPIPAKKPSSVSLWSLEQPFRI 325
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|
  Rat   261 YICSCLHSGLTPHLTMVHSSSILAMRDEQSNPAPQVQKPRVKPPPIPAKKPSSVSLWSLEQPFCI 325

Human   326 ELIQGSKVNADERMKLVVQAGLFHGNEMLCKTVSSSEVSVCSEPVWKQRLEFDINICDLPRMARL 390
            |||:|.||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||:||||||||||
  Rat   326 ELIEGRKVNADERMKLVVQAGLFHGNEMLCKTVSSSEVNVCSEPVWKQRLEFDISICDLPRMARL 390

Human   391 CFALYAVIEKAKKARSTKKKSKKADCPIAWANLMLFDYKDQLKTGERCLYMWPSVPDEKGELLNP 455
            |||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||
  Rat   391 CFALYAVVEKAKKARSTKKKSKKADCPIAWANLMLFDYKDQLKTGERCLYMWPSVPDEKGELMNP 455

Human   456 TGTVRSNPNTDSAAALLICLPEVAPHPVYYPALEKILELGRHSECVHVTEEEQLQLREILERRGS 520
            .||||.||||:|||||:|.||||||||||:||||||||||||.|...:|||||||||||||||||
  Rat   456 AGTVRGNPNTESAAALVIYLPEVAPHPVYFPALEKILELGRHGERGRITEEEQLQLREILERRGS 520

Human   521 GELYEHEKDLVWKLRHEVQEHFPEALARLLLVTKWNKHEDVA---QMLYLLCSWPELPVLSALEL 582
            |||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||
  Rat   521 GELYEHEKDLVWKMRHEVQEHFPEALARLLLVTKWNKHEDVAQLSQMLYLLCSWPELPVLSALEL 585

Human   583 LDFSFPDCHVGSFAIKSLRKLTDDELFQYLLQLVQVLKYESYLDCELTKFLLDRALANRKIGHFL 647
            ||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
  Rat   586 LDFSFPDCYVGSFAIKSLRKLTDDELFQYLLQLVQVLKYESYLDCELTKFLLGRALANRKIGHFL 650

Human   648 FWHLRSEMHVPSVALRFGLILEAYCRGSTHHMKVLMKQGEALSKLKALNDFVKLSSQKTPKPQTK 712
            ||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
  Rat   651 FWHLRSEMHVPSVALRFGLIMEAYCRGSTHHMKVLMKQGEALSKLKALNDFVKASSQKTTKPQTK 715

Human   713 ELMHLCMRQEAYLEALSHLQSPLDPSTLLAEVC-VEQCTFMDSKMKPLWIMYSNEEAGSGGSVGI 776
            |:||:|||||.|:||||||||||||||||.||| |||||||||||||||||||:|:||..|||||
  Rat   716 EMMHMCMRQETYMEALSHLQSPLDPSTLLEEVCSVEQCTFMDSKMKPLWIMYSSEKAGGAGSVGI 780

Human   777 IFKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDVLWKQEGLDLRMTPYGCLPTGDRTGLIEVVLRSDTIANIQLNK 841
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
  Rat   781 IFKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDFLWKQEGLDLRMTPYGCLPTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNK 845

Human   842 SNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQ 906
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   846 SNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQ 910

Human   907 LFHIDFGHFLGNFKTKFGINRERVPFILTYDFVHVIQQGKTNNSEKFERFRGYCERAYTILRRHG 971
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   911 LFHIDFGHFLGNFKTKFGINRERVPFILTYDFVHVIQQGKTNNSEKFERFRGYCERAYTILRRHG 975

Human   972 LLFLHLFALMRAAGLPELSCSKDIQYLKDSLALGKTEEEALKHFRVKFNEALRESWKTKVNWLAH 1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   976 LLFLHLFALMRAAGLPELSCSKDIQYLKDSLALGKTEEEALKHFRVKFNEALRESWKTKVNWLAH 1040

Human  1037 NVSKDNRQ 1044
            ||||||||
  Rat  1041 NVSKDNRQ 1048

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
PIK3CDNP_005017.3 PI3K_p85B 34..107 CDD:460483 67/72 (93%)
PI3K_rbd 175..281 CDD:395642 91/105 (87%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 287..312 23/24 (96%)
C2_PI3K_class_I_beta_delta 314..481 CDD:176075 154/166 (93%)
PI3Ka 503..684 CDD:214537 175/183 (96%)
PI3Kc_IA_delta 676..1042 CDD:270718 352/366 (96%)
G-loop. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00269 751..757 5/5 (100%)
Catalytic loop. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00269 890..898 7/7 (100%)
Activation loop. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00269 909..935 25/25 (100%)
Pik3cdXP_038966422.1 PI3K_p85B 34..107 CDD:460483 67/72 (93%)
PI3K_rbd 182..281 CDD:395642 88/98 (90%)
C2_PI3K_class_I_beta_delta 314..481 CDD:176075 154/166 (93%)
PI3Ka 504..687 CDD:214537 175/182 (96%)
PI3Kc_IA_delta 679..1046 CDD:270718 352/366 (96%)

Return to query results.
Submit another query.