DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment PIK3CD and Pik3cd

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_005017.3 Gene:PIK3CD / 5293 HGNCID:8977 Length:1044 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_006538704.1 Gene:Pik3cd / 18707 MGIID:1098211 Length:1074 Species:Mus musculus


Alignment Length:1074 Identity:988/1074 - (91%)
Similarity:1015/1074 - (94%) Gaps:30/1074 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MPPGVDCPMEFWTKEENQSVVVDFLLPTGVYLNFPVSRNANLSTIKQLLWHRAQYEPLFHMLSGP 65
            ||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||.|
Mouse     1 MPPGVDCPMEFWTKEESQSVVVDFLLPTGVYLNFPVSRNANLSTIKQVLWHRAQYEPLFHMLSDP 65

Human    66 EAYVFTCINQTAEQQELEDEQRRLCDVQPFLPVLRLVAREGDRVKKLINSQISLLIGKGLHEFDS 130
            |||||||:||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse    66 EAYVFTCVNQTAEQQELEDEQRRLCDIQPFLPVLRLVAREGDRVKKLINSQISLLIGKGLHEFDS 130

Human   131 LCDPEVNDFRAKMCQFCEEAAARRQQLGWEAWLQYSFPLQLEPSAQTWGPGTLRLPNRALLVNVK 195
            |.||||||||.||.||||||||.||||||..||||||||||||||:.|..|.||:.|||||||||
Mouse   131 LRDPEVNDFRTKMRQFCEEAAAHRQQLGWVEWLQYSFPLQLEPSARGWRAGLLRVSNRALLVNVK 195

Human   196 FEGSEESFTFQVSTKDVPLALMACALRKKATVFRQPLVEQPEDYTLQVNGRHEYLYGSYPLCQFQ 260
            ||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||:|.||||||||||||:||||.||
Mouse   196 FEGSEESFTFQVSTKDMPLALMACALRKKATVFRQPLVEQPEEYALQVNGRHEYLYGNYPLCHFQ 260

Human   261 YICSCLHSGLTPHLTMVHSSSILAMRDEQSNPAPQVQKPRAKPPPIPAKKPSSVSLWSLEQPFRI 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Mouse   261 YICSCLHSGLTPHLTMVHSSSILAMRDEQSNPAPQVQKPRAKPPPIPAKKPSSVSLWSLEQPFSI 325

Human   326 ELIQGSKVNADERMKLVVQAGLFHGNEMLCKTVSSSEVSVCSEPVWKQRLEFDINICDLPRMARL 390
            |||:|.||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||::|||||||||
Mouse   326 ELIEGRKVNADERMKLVVQAGLFHGNEMLCKTVSSSEVNVCSEPVWKQRLEFDISVCDLPRMARL 390

Human   391 CFALYAVIEKAKKARSTKKKSKKADCPIAWANLMLFDYKDQLKTGERCLYMWPSVPDEKGELLNP 455
            |||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   391 CFALYAVVEKAKKARSTKKKSKKADCPIAWANLMLFDYKDQLKTGERCLYMWPSVPDEKGELLNP 455

Human   456 TGTVRSNPNTDSAAALLICLPEVAPHPVYYPALEKILELGRHSECVHVTEEEQLQLREILERRGS 520
            .||||.||||:|||||:|.||||||||||:||||||||||||.|...:|||||||||||||||||
Mouse   456 AGTVRGNPNTESAAALVIYLPEVAPHPVYFPALEKILELGRHGERGRITEEEQLQLREILERRGS 520

Human   521 GELYEHEKDLVWKLRHEVQEHFPEALARLLLVTKWNKHEDVA----------------------- 562
            |||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||                       
Mouse   521 GELYEHEKDLVWKMRHEVQEHFPEALARLLLVTKWNKHEDVAQVSREGGSGRQPRGRWTVPAHPY 585

Human   563 ------QMLYLLCSWPELPVLSALELLDFSFPDCHVGSFAIKSLRKLTDDELFQYLLQLVQVLKY 621
                  ||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   586 LTTKLSQMLYLLCSWPELPVLSALELLDFSFPDCYVGSFAIKSLRKLTDDELFQYLLQLVQVLKY 650

Human   622 ESYLDCELTKFLLDRALANRKIGHFLFWHLRSEMHVPSVALRFGLILEAYCRGSTHHMKVLMKQG 686
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||
Mouse   651 ESYLDCELTKFLLGRALANRKIGHFLFWHLRSEMHVPSVALRFGLIMEAYCRGSTHHMKVLMKQG 715

Human   687 EALSKLKALNDFVKLSSQKTPKPQTKELMHLCMRQEAYLEALSHLQSPLDPSTLLAEVC-VEQCT 750
            ||||||||||||||:|||||.||||||:||:|||||.|:||||||||||||||||.||| |||||
Mouse   716 EALSKLKALNDFVKVSSQKTTKPQTKEMMHMCMRQETYMEALSHLQSPLDPSTLLEEVCSVEQCT 780

Human   751 FMDSKMKPLWIMYSNEEAGSGGSVGIIFKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDVLWKQEGLDLRMTPYGC 815
            ||||||||||||||:|||||.|:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   781 FMDSKMKPLWIMYSSEEAGSAGNVGIIFKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDVLWKQEGLDLRMTPYGC 845

Human   816 LPTGDRTGLIEVVLRSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGEALDRAIEEFTLSCA 880
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   846 LPTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGEALDRAIEEFTLSCA 910

Human   881 GYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQLFHIDFGHFLGNFKTKFGINRERVPFILTYDFVHVIQQG 945
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   911 GYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQLFHIDFGHFLGNFKTKFGINRERVPFILTYDFVHVIQQG 975

Human   946 KTNNSEKFERFRGYCERAYTILRRHGLLFLHLFALMRAAGLPELSCSKDIQYLKDSLALGKTEEE 1010
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   976 KTNNSEKFERFRGYCERAYTILRRHGLLFLHLFALMRAAGLPELSCSKDIQYLKDSLALGKTEEE 1040

Human  1011 ALKHFRVKFNEALRESWKTKVNWLAHNVSKDNRQ 1044
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1041 ALKHFRVKFNEALRESWKTKVNWLAHNVSKDNRQ 1074

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
PIK3CDNP_005017.3 PI3K_p85B 34..107 CDD:460483 68/72 (94%)
PI3K_rbd 175..281 CDD:395642 93/105 (89%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 287..312 24/24 (100%)
C2_PI3K_class_I_beta_delta 314..481 CDD:176075 154/166 (93%)
PI3Ka 503..684 CDD:214537 175/209 (84%)
PI3Kc_IA_delta 676..1042 CDD:270718 354/366 (97%)
G-loop. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00269 751..757 5/5 (100%)
Catalytic loop. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00269 890..898 7/7 (100%)
Activation loop. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00269 909..935 25/25 (100%)
Pik3cdXP_006538704.1 PI3K_p85B 34..107 CDD:460483 68/72 (94%)
PI3K_rbd 182..281 CDD:395642 90/98 (92%)
C2_PI3K_class_I_beta_delta 314..481 CDD:176075 154/166 (93%)
PI3Ka 504..713 CDD:214537 175/208 (84%)
PI3Kc_IA_delta 705..1072 CDD:270718 354/366 (97%)

Return to query results.
Submit another query.