DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment PIK3CB and Pik3cb

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_006210.1 Gene:PIK3CB / 5291 HGNCID:8976 Length:1070 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_445933.1 Gene:Pik3cb / 85243 RGDID:620917 Length:1070 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1070 Identity:1026/1070 - (95%)
Similarity:1047/1070 - (97%) Gaps:0/1070 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MCFSFIMPPAMADILDIWAVDSQIASDGSIPVDFLLPTGIYIQLEVPREATISYIKQMLWKQVHN 65
            |||..||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MCFRSIMPPAMADTLDIWAVDSQIASDGSISVDFLLPTGIYIQLEVPREATISYIKQMLWKQVHN 65

Human    66 YPMFNLLMDIDSYMFACVNQTAVYEELEDETRRLCDVRPFLPVLKLVTRSCDPGEKLDSKIGVLI 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
  Rat    66 YPMFNLLMDIDSYMFACVNQTAVYEELEDETRRLCDVRPFLPVLKLVTRSCDPAEKLDSKIGVLI 130

Human   131 GKGLHEFDSLKDPEVNEFRRKMRKFSEEKILSLVGLSWMDWLKQTYPPEHEPSIPENLEDKLYGG 195
            ||||||||:||||||||||||||||||:||.|||||||:||||.|||||||||:.||||||||||
  Rat   131 GKGLHEFDALKDPEVNEFRRKMRKFSEDKIQSLVGLSWIDWLKHTYPPEHEPSVLENLEDKLYGG 195

Human   196 KLIVAVHFENCQDVFSFQVSPNMNPIKVNELAIQKRLTIHGKEDEVSPYDYVLQVSGRVEYVFGD 260
            ||:|||||||.|||||||||||:||||:|||||||||||.|||:|.||.||||||||||||||||
  Rat   196 KLVVAVHFENSQDVFSFQVSPNLNPIKINELAIQKRLTIRGKEEEASPCDYVLQVSGRVEYVFGD 260

Human   261 HPLIQFQYIRNCVMNRALPHFILVECCKIKKMYEQEMIAIEAAINRNSSNLPLPLPPKKTRIISH 325
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||:|||
  Rat   261 HPLIQFQYIRNCVMNRTLPHFILVECCKIKKMYEQEMIAIEAAINRNSSSLPLPLPPKKTRVISH 325

Human   326 VWENNNPFQIVLVKGNKLNTEETVKVHVRAGLFHGTELLCKTIVSSEVSGKNDHIWNEPLEFDIN 390
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||:||||||||||.||||||
  Rat   326 VWGNNNPFQIVLVKGNKLNTEETVKVHVRAGLFHGTELLCKTVVSSEISGKNDHIWNEQLEFDIN 390

Human   391 ICDLPRMARLCFAVYAVLDKVKTKKSTKTINPSKYQTIRKAGKVHYPVAWVNTMVFDFKGQLRTG 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|
  Rat   391 ICDLPRMARLCFAVYAVLDKVKTKKSTKTINPSKYQTIRKAGKVHYPVAWVNTMVFDFKGQLRSG 455

Human   456 DIILHSWSSFPDELEEMLNPMGTVQTNPYTENATALHVKFPENKKQPYYYPPFDKIIEKAAEIAS 520
            |:|||||||||||||||||||||||||||.|||||||:|||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 DVILHSWSSFPDELEEMLNPMGTVQTNPYAENATALHIKFPENKKQPYYYPPFDKIIEKAAEIAS 520

Human   521 SDSANVSSRGGKKFLPVLKEILDRDPLSQLCENEMDLIWTLRQDCREIFPQSLPKLLLSIKWNKL 585
            .||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
  Rat   521 GDSANVSSRGGKKFLAVLKEILDRDPLSQLCENEMDLIWTLRQDCRENFPQSLPKLLLSIKWNKL 585

Human   586 EDVAQLQALLQIWPKLPPREALELLDFNYPDQYVREYAVGCLRQMSDEELSQYLLQLVQVLKYEP 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   586 EDVAQLQALLQIWPKLPPREALELLDFNYPDQYVREYAVGCLRQMSDEELSQYLLQLVQVLKYEP 650

Human   651 FLDCALSRFLLERALGNRRIGQFLFWHLRSEVHIPAVSVQFGVILEAYCRGSVGHMKVLSKQVEA 715
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||:||||||||||||||||||||||||||
  Rat   651 FLDCALSRFLLERALDNRRIGQFLFWHLRSEVHTPAVSIQFGVILEAYCRGSVGHMKVLSKQVEA 715

Human   716 LNKLKTLNSLIKLNAVKLNRAKGKEAMHTCLKQSAYREALSDLQSPLNPCVILSELYVEKCKYMD 780
            |||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||
  Rat   716 LNKLKTLNSLIKLNAMKLNRAKGKEAMHTCLKQSAYREALSDLQSPLNPCVILSELYVEKCRYMD 780

Human   781 SKMKPLWLVYNNKVFGEDSVGVIFKNGDDLRQDMLTLQMLRLMDLLWKEAGLDLRMLPYGCLATG 845
            ||||||||||:|:.||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   781 SKMKPLWLVYSNRAFGEDAVGVIFKNGDDLRQDMLTLQMLRLMDLLWKEAGLDLRMLPYGCLATG 845

Human   846 DRSGLIEVVSTSETIADIQLNSSNVAAAAAFNKDALLNWLKEYNSGDDLDRAIEEFTLSCAGYCV 910
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   846 DRSGLIEVVSTSETIADIQLNSSNVAATAAFNKDALLNWLKEYNSGDDLDRAIEEFTLSCAGYCV 910

Human   911 ASYVLGIGDRHSDNIMVKKTGQLFHIDFGHILGNFKSKFGIKRERVPFILTYDFIHVIQQGKTGN 975
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   911 ASYVLGIGDRHSDNIMVKKTGQLFHIDFGHILGNFKSKFGIKRERVPFILTYDFIHVIQQGKTGN 975

Human   976 TEKFGRFRQCCEDAYLILRRHGNLFITLFALMLTAGLPELTSVKDIQYLKDSLALGKSEEEALKQ 1040
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   976 TEKFGRFRQCCEDAYLILRRHGNLFITLFALMLTAGLPELTSVKDIQYLKDSLALGKSEEEALKQ 1040

Human  1041 FKQKFDEALRESWTTKVNWMAHTVRKDYRS 1070
            ||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1041 FKQKFDEALRESWTTKVNWMAHTVRKDYRS 1070

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
PIK3CBNP_006210.1 PI3K_p85B 41..118 CDD:197539 76/76 (100%)
PI3K_rbd 180..288 CDD:197540 96/107 (90%)
C2_PI3K_class_I_beta_delta 324..501 CDD:176075 168/176 (95%)
Nuclear localization signal 410..418 7/7 (100%)
PI3Ka_I 532..702 CDD:238444 164/169 (97%)
PI3Kc_IA_beta 706..1067 CDD:270717 353/360 (98%)
G-loop. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00269 778..784 5/5 (100%)
Catalytic loop. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00269 916..924 7/7 (100%)
Activation loop. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00269 935..961 25/25 (100%)
Pik3cbNP_445933.1 PI3K_p85B 41..118 CDD:197539 76/76 (100%)
PI3K_rbd 180..288 CDD:197540 96/107 (90%)
C2_PI3K_class_I_beta_delta 324..501 CDD:176075 168/176 (95%)
Nuclear localization signal (NLS). /evidence=ECO:0000250 410..418 7/7 (100%)
PI3Ka_I 532..702 CDD:238444 164/169 (97%)
PI3Kc_IA_beta 706..1067 CDD:270717 353/360 (98%)
G-loop. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00269 778..784 5/5 (100%)
Catalytic loop. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00269 916..924 7/7 (100%)
Activation loop. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00269 935..961 25/25 (100%)

Return to query results.
Submit another query.