DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment PIK3CB and pik3cb

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_006210.1 Gene:PIK3CB / 5291 HGNCID:8976 Length:1070 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001072928.1 Gene:pik3cb / 780390 XenbaseID:XB-GENE-482674 Length:1065 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:1076 Identity:824/1076 - (76%)
Similarity:945/1076 - (87%) Gaps:23/1076 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     7 MPPAMADILDIWAVDSQIASDGSIPVDFLLPTGIYIQLEVPREATISYIKQMLWKQVHNYPMFNL 71
            |||.| |.:|||..|:.:..|  |.||.|||||||:|::|||:|:||:|||:|||...:||:|:|
 Frog     1 MPPIM-DHMDIWTADTPLPPD--ICVDVLLPTGIYVQMDVPRDASISHIKQLLWKHAQSYPLFHL 62

Human    72 LMDIDSYMFACVNQTAVYEELEDETRRLCDVRPFLPVLKLVTRSCDPGEKLDSKIGVLIGKGLHE 136
            |::||||||.|||..||:|||||||:|||||||||||||||:|||:|.|||||||||||||||.|
 Frog    63 LLEIDSYMFQCVNHNAVHEELEDETQRLCDVRPFLPVLKLVSRSCNPAEKLDSKIGVLIGKGLQE 127

Human   137 FDSLKDPEVNEFRRKMRKFSEEKILSLVGLSWMDWLKQTYPPEHEPSIPENLEDKLYGGKLIVAV 201
            ||:|||.||.|||.|||..||.||.||:||:|::|||:|:|||.||||.:|::.|||||.::||:
 Frog   128 FDALKDNEVMEFRSKMRSISEAKIQSLLGLTWVEWLKRTFPPELEPSIQDNIQGKLYGGNIVVAI 192

Human   202 HFENCQDVFSFQVSPNMNPIKVNELAIQKRLTIHGKE-DEVSPYDYVLQVSGRVEYVFGDHPLIQ 265
            |||||||||||||||||.|:|||||||:|||||||:| :||.|.|:||||:||:|:|||||||||
 Frog   193 HFENCQDVFSFQVSPNMVPVKVNELAIRKRLTIHGREAEEVDPEDFVLQVNGRLEFVFGDHPLIQ 257

Human   266 FQYIRNCVMNRALPHFILVECCKIKKMYEQEMIAIEAAINRNSS---NLPLPLPPKK-------T 320
            ||||||||||:||||..|||||.|||:::|||..||.|:.|.||   .||:||||||       .
 Frog   258 FQYIRNCVMNKALPHLTLVECCNIKKLFDQEMSEIEHAVRRKSSMHPALPMPLPPKKRGASMKTL 322

Human   321 RIISHVWENNNPFQIVLVKGNKLNTEETVKVHVRAGLFHGTELLCKTIVSSEVSGKNDHIWNEPL 385
            .:...||....|::|:|.||::||||::|.  ||||||||||||||..::.||.|||||:|||.|
 Frog   323 NMRDIVWNIVQPYKIILSKGSRLNTEDSVL--VRAGLFHGTELLCKPTMTPEVQGKNDHVWNETL 385

Human   386 EFDINICDLPRMARLCFAVYAVLDKVKTKKSTKTINPSKYQTIRKAGKVHYPVAWVNTMVFDFKG 450
            ||:||:||||||||||||:||||||.:.|      |.:|||||:|:||:|:|||||||||||:||
 Frog   386 EFEINVCDLPRMARLCFAIYAVLDKPRNK------NKTKYQTIKKSGKMHFPVAWVNTMVFDYKG 444

Human   451 QLRTGDIILHSWSSFPDELEEMLNPMGTVQTNPYTENATALHVKFPENKKQPYYYPPFDKIIEKA 515
            |||:||.:||.||||||||||||||||||:|||||||.|.||:||.:..|:|..|||||||:|||
 Frog   445 QLRSGDHVLHCWSSFPDELEEMLNPMGTVRTNPYTENTTTLHIKFHDYSKEPISYPPFDKILEKA 509

Human   516 AEIA-SSDSANVSSRGGKKFLPVLKEILDRDPLSQLCENEMDLIWTLRQDCREIFPQSLPKLLLS 579
            |||| :|||.:.|.|||||....||||::||||.||.|||.|||||||.||||.||.||||||||
 Frog   510 AEIARNSDSLSTSGRGGKKLNIELKEIMERDPLCQLSENEKDLIWTLRYDCRENFPGSLPKLLLS 574

Human   580 IKWNKLEDVAQLQALLQIWPKLPPREALELLDFNYPDQYVREYAVGCLRQMSDEELSQYLLQLVQ 644
            :||||||||||||||||||.|||||:|||||||||||||||||||.||:.|||||||||||||||
 Frog   575 VKWNKLEDVAQLQALLQIWSKLPPRDALELLDFNYPDQYVREYAVNCLKPMSDEELSQYLLQLVQ 639

Human   645 VLKYEPFLDCALSRFLLERALGNRRIGQFLFWHLRSEVHIPAVSVQFGVILEAYCRGSVGHMKVL 709
            |||||||||||||||||:|||.|||||||||||||||||.||||||||::|||||||||.|||||
 Frog   640 VLKYEPFLDCALSRFLLQRALDNRRIGQFLFWHLRSEVHNPAVSVQFGLLLEAYCRGSVAHMKVL 704

Human   710 SKQVEALNKLKTLNSLIKLNAVKLNRAKGKEAMHTCLKQSAYREALSDLQSPLNPCVILSELYVE 774
            |:||||||||:|||.|||||||||::.|.|:.|||||:::||:|||..:||||||.:.||||.||
 Frog   705 SRQVEALNKLRTLNGLIKLNAVKLSKVKNKDNMHTCLRENAYKEALMHIQSPLNPSITLSELVVE 769

Human   775 KCKYMDSKMKPLWLVYNNKVFGEDSVGVIFKNGDDLRQDMLTLQMLRLMDLLWKEAGLDLRMLPY 839
            |||||||||||||:||||:.||.||:|:|||||||||||||.||:|||||:||||||||||::||
 Frog   770 KCKYMDSKMKPLWIVYNNRGFGSDSLGIIFKNGDDLRQDMLALQLLRLMDMLWKEAGLDLRIVPY 834

Human   840 GCLATGDRSGLIEVVSTSETIADIQLNSSNVAAAAAFNKDALLNWLKEYNSGDDLDRAIEEFTLS 904
            ||||||||.|.|||||.:||||||||:|||:||||||||||||||:||.:|||||:|||||||||
 Frog   835 GCLATGDRCGFIEVVSAAETIADIQLDSSNLAAAAAFNKDALLNWIKECHSGDDLERAIEEFTLS 899

Human   905 CAGYCVASYVLGIGDRHSDNIMVKKTGQLFHIDFGHILGNFKSKFGIKRERVPFILTYDFIHVIQ 969
            |||||||:|||||||||:|||||:|||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
 Frog   900 CAGYCVATYVLGIGDRHNDNIMVRKTGQLFHIDFGHILGNFKSKFKIKRERGPFILTYDFIHVIQ 964

Human   970 QGKTGNTEKFGRFRQCCEDAYLILRRHGNLFITLFALMLTAGLPELTSVKDIQYLKDSLALGKSE 1034
            |||.||||||||||||||||||||||:|||.|||||||||||||||:|||||||:||||||||.|
 Frog   965 QGKPGNTEKFGRFRQCCEDAYLILRRNGNLIITLFALMLTAGLPELSSVKDIQYVKDSLALGKKE 1029

Human  1035 EEALKQFKQKFDEALRESWTTKVNWMAHTVRKDYRS 1070
            |:|||||:|||||||:|||||||||||||:||||::
 Frog  1030 EDALKQFRQKFDEALKESWTTKVNWMAHTMRKDYKA 1065

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
PIK3CBNP_006210.1 PI3K_p85B 41..118 CDD:197539 55/76 (72%)
PI3K_rbd 180..288 CDD:197540 83/108 (77%)
C2_PI3K_class_I_beta_delta 324..501 CDD:176075 120/176 (68%)
Nuclear localization signal 410..418 2/7 (29%)
PI3Ka_I 532..702 CDD:238444 146/169 (86%)
PI3Kc_IA_beta 706..1067 CDD:270717 304/360 (84%)
G-loop. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00269 778..784 5/5 (100%)
Catalytic loop. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00269 916..924 6/7 (86%)
Activation loop. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00269 935..961 23/25 (92%)
pik3cbNP_001072928.1 PI3K_p85B 35..108 CDD:460483 52/72 (72%)
PI3K_rbd 172..279 CDD:197540 82/106 (77%)
C2_PI3K_class_I_beta_delta 328..495 CDD:176075 120/174 (69%)
PI3Ka_I 533..697 CDD:238444 144/163 (88%)
PI3Kc_IA_beta 701..1062 CDD:270717 304/360 (84%)

Return to query results.
Submit another query.