DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment PEX6 and Pex6

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_000278.3 Gene:PEX6 / 5190 HGNCID:8859 Length:980 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_663463.1 Gene:Pex6 / 224824 MGIID:2385054 Length:981 Species:Mus musculus


Alignment Length:981 Identity:863/981 - (87%)
Similarity:902/981 - (91%) Gaps:1/981 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MALAVLRVLEPFPTETPPLAVLLPPGGPWPAAELGLVLALRPAGESPAGPALLVAALEGPDAGTE 65
            |||||||||:|||||||||||||||||||||..||||||||||.||||.|||||||:||..|..|
Mouse     1 MALAVLRVLDPFPTETPPLAVLLPPGGPWPATGLGLVLALRPASESPAKPALLVAAVEGSGAQGE 65

Human    66 EQGPGPPQLLVSRALLRLLALGSGAWVRARAVRRPPALGWALLGTSLGPGLGPRVGPLLVRRGET 130
            ::|||||.|||||||||:||||.||.||||.||||||||||||.|:.||||||||||||||||||
Mouse    66 QRGPGPPPLLVSRALLRVLALGPGARVRARLVRRPPALGWALLATAPGPGLGPRVGPLLVRRGET 130

Human   131 LPVPGPRVLETRPALQGLLGPGTRLAVTELRGRARLCPESGDSSRPPPPPVVSSFAVSGTVRRLQ 195
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||:|..||.|.|.|||||||||||.|.:||||:
Mouse   131 LPVPGSRVLETRPALQGLLGPGTRLAVTELRGRAKLGQESRDHSHPPPPPVVSSFAASHSVRRLR 195

Human   196 GVLGGTGDSLGVSRSCLRGLGLFQGEWVWVAQARESSNTSQPHLARVQVLEPRWDLSDRLGPGSG 260
            ||||||||:|||||||||.|||||||||||||..|..|:|||.||:||||||||:||:||||.||
Mouse   196 GVLGGTGDALGVSRSCLRSLGLFQGEWVWVAQVAELPNSSQPRLAQVQVLEPRWELSERLGPNSG 260

Human   261 PL-GEPLADGLALVPATLAFNLGCDPLEMGELRIQRYLEGSIAPEDKGSCSLLPGPPFARELHIE 324
            .. ||||||||..:||||||||||||||:||||||||||||||||:|||||.|||||||||||||
Mouse   261 QQPGEPLADGLVFLPATLAFNLGCDPLEVGELRIQRYLEGSIAPENKGSCSPLPGPPFARELHIE 325

Human   325 IVSSPHYSTNGNYDGVLYRHFQIPRVVQEGDVLCVPTIGQVEILEGSPEKLPRWREMFFKVKKTV 389
            |:||||||.|||||.|||||||.||||||||||||.|.|||||||||.|:|||||||||||||||
Mouse   326 ILSSPHYSANGNYDHVLYRHFQTPRVVQEGDVLCVSTAGQVEILEGSLERLPRWREMFFKVKKTV 390

Human   390 GEAPDGPASAYLADTTHTSLYMVGSTLSPVPWLPSEESTLWSSLSPPGLEALVSELCAVLKPRLQ 454
            ||||:|||||:||||||||||:.|:.||.||.|||..|..|.|||||||||||:||||:|||.||
Mouse   391 GEAPEGPASAFLADTTHTSLYLAGTALSHVPSLPSGRSPPWDSLSPPGLEALVNELCAILKPHLQ 455

Human   455 PGGALLTGTSSVLLRGPPGCGKTTVVAAACSHLGLHLLKVPCSSLCAESSGAVETKLQAIFSRAR 519
            |||.||||||.|||:||||.||||.|.||||.|||||||||||||||:||.||||||||.|||||
Mouse   456 PGGTLLTGTSCVLLQGPPGSGKTTAVTAACSRLGLHLLKVPCSSLCADSSRAVETKLQATFSRAR 520

Human   520 RCRPAVLLLTAVDLLGRDRDGLGEDARVMAVLRHLLLNEDPLNSCPPLMVVATTSRAQDLPADVQ 584
            ||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||:||.|:.||||||||||||.||||.|||
Mouse   521 RCRPAVLLLTAVDLLGRDRDGLGEDARVAATLRHLLLDEDALSRCPPLMVVATTSRVQDLPTDVQ 585

Human   585 TAFPHELEVPALSEGQRLSILRALTAHLPLGQEVNLAQLARRCAGFVVGDLYALLTHSSRAACTR 649
            ||||||||||.|||.||||||:||||||||||||||.||||||||||||||||||||:.||||||
Mouse   586 TAFPHELEVPVLSEAQRLSILQALTAHLPLGQEVNLPQLARRCAGFVVGDLYALLTHTCRAACTR 650

Human   650 IKNSGLAGGLTEEDEGELCAAGFPLLAEDFGQALEQLQTAHSQAVGAPKIPSVSWHDVGGLQEVK 714
            |:.||.||||:|||||:||.||||||||||||||:|||||||||||||:|||||||||||||:||
Mouse   651 IRASGSAGGLSEEDEGDLCVAGFPLLAEDFGQALDQLQTAHSQAVGAPRIPSVSWHDVGGLQDVK 715

Human   715 KEILETIQLPLEHPELLSLGLRRSGLLLHGPPGTGKTLLAKAVATECSLTFLSVKGPELINMYVG 779
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   716 KEILETIQLPLEHPELLSLGLRRSGLLLHGPPGTGKTLLAKAVATECSLTFLSVKGPELINMYVG 780

Human   780 QSEENVREVFARARAAAPCIIFFDELDSLAPSRGRSGDSGGVMDRVVSQLLAELDGLHSTQDVFV 844
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   781 QSEENVREVFARARAAAPCIIFFDELDSLAPSRGRSGDSGGVMDRVVSQLLAELDGLHSTQDVFV 845

Human   845 IGATNRPDLLDPALLRPGRFDKLVFVGANEDRASQLRVLSAITRKFKLEPSVSLVNVLDCCPPQL 909
            ||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||.||||.||||||||||
Mouse   846 IGATNRPDLLDPALLRPGRFDKLVFVGASEDRASQLRVLSAITRKFKLEASVSLANVLDCCPPQL 910

Human   910 TGADLYSLCSDAMTAALKRRVHDLEEGLEPGSSALMLTMEDLLQAAARLQPSVSEQELLRYKRIQ 974
            |||||||||||||..||||||.|||||||..||||:|||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   911 TGADLYSLCSDAMMTALKRRVRDLEEGLELRSSALLLTMEDLLQAAARLQPSVSEQELLRYKRIQ 975

Human   975 RKFAAC 980
            ||||||
Mouse   976 RKFAAC 981

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
PEX6NP_000278.3 CDC48 <466..977 CDD:273521 470/510 (92%)
Pex6NP_663463.1 CDC48 <467..978 CDD:273521 470/510 (92%)

Return to query results.
Submit another query.