Protein Alignment PEX6 and Pex6

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_000278.3
• Gene: PEX6 / 5190
• HGNCID: 8859
• Length: 980
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: XP_063122650.1
• Gene: Pex6 / 117265
• RGDID: 621637
• Length: 1034
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 1036
• Identity: 854/1036 - (82%)
• Similarity: 898/1036 - (86%)
• Gaps: 58/1036 - (5%)

Human     1 MALAVLRVLEPFPTETPPLAVLLPPGGPWPAAELGLVLALRPAGESPAGPALLVAALEGPDAGTE 65
            ||||||.|||||||||||||||||||||||...:|||||||||.||||||||||||:||..|..|
  Rat     1 MALAVLHVLEPFPTETPPLAVLLPPGGPWPVTGVGLVLALRPASESPAGPALLVAAVEGSGAQCE 65

Human    66 EQGPGPPQLLVSRALLRLLALGSGAWVRARAVRRPPALGWALLGTSLGPGLGPRVGPLLVRRGET 130
            ::|||||.|||||.|||:|||..||.||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||
  Rat    66 QRGPGPPPLLVSRTLLRVLALSPGARVRARPVRRPPALGWALLGTSPGPGLGPRVGPLLVRRGET 130

Human   131 LPVPGPRVLETRPALQGLLGPGTRLAVTELRGRARLCPESGDSSRPPPPPVVSSFAVSGTVRRLQ 195
            |||||.||||||||||||||||||||||||:||.:|.|||.|.:.|||||||||||||.::|:|:
  Rat   131 LPVPGSRVLETRPALQGLLGPGTRLAVTELQGRTKLDPESRDHNHPPPPPVVSSFAVSHSIRQLR 195

Human   196 GVLGGTGDSLGVSRSCLRGLGLFQGEWVWVAQARESSNTSQPHLARVQVLEPRWDLSDRLGPGSG 260
            ||||||||:|||||||||.||||||||||||:..|..||||||||:|||||||||||.||||.||
  Rat   196 GVLGGTGDALGVSRSCLRSLGLFQGEWVWVARVGELPNTSQPHLAQVQVLEPRWDLSARLGPNSG 260

Human   261 PLGEPLADGLALVPATLAFNLGCDPLEMGELRIQRYLEGSIAPEDKGSCSLLPGPPFARELHIEI 325
            ..||||||||..|||||||||||||||:||||||||||.|.|.|||||||||||||||||||||:
  Rat   261 QPGEPLADGLVFVPATLAFNLGCDPLEVGELRIQRYLEDSTAAEDKGSCSLLPGPPFARELHIEV 325

Human   326 VSSPHYSTNGNYDGVLYRHFQIPRVVQEGDVLCVPTIGQVEILEGSPEKLPRWREMFFKVKKTVG 390
            :.|||...||.||.|||:||..||||||||||||.|.|||||||||.|:||||||:|||||||||
  Rat   326 LPSPHCGVNGKYDHVLYQHFHTPRVVQEGDVLCVSTAGQVEILEGSLERLPRWREVFFKVKKTVG 390

Human   391 EAPDGPASAYLADTTHTSLYMVGSTLSPVPWLPSEESTLWSSLSPPGLEALVSELCAVLKPRLQP 455
            |||||||||:||||||||||:.|:|||.||.|||..|..|.|||||||||||:||||||||.|||
  Rat   391 EAPDGPASAFLADTTHTSLYLAGTTLSRVPPLPSGRSPPWDSLSPPGLEALVNELCAVLKPHLQP 455

Human   456 GGALLTGTSSVLLRGPPGCGKTTVVAAACSHLGLHLLKVPCSSLCAESSGAVETKLQAIFSRARR 520
            ||.||||||.|||:||||.||||.|.||||.|||||||||||||||:||..||||||..||||||
  Rat   456 GGTLLTGTSCVLLQGPPGSGKTTAVTAACSRLGLHLLKVPCSSLCADSSRTVETKLQTTFSRARR 520

Human   521 CRPAVLLLTAVDLLGRDRDGLGEDARVMAVLRHLLLNEDPLNSCPPLMVVATTSRAQDLPADVQT 585
            |||.||||||:||||||||||||||||:|.||||||:||||:.||||||||||||.||||.||:|
  Rat   521 CRPVVLLLTALDLLGRDRDGLGEDARVVATLRHLLLDEDPLSRCPPLMVVATTSRVQDLPTDVRT 585

Human   586 AFPHELEVPALSEGQRLSILRALTAHLPLGQEVNLAQLARRCAGFVVGDLYALLTHSSRAACTRI 650
            |||||||||.|||.||||:|:||||||||||||||:||||||||||||||||||||:||||||||
  Rat   586 AFPHELEVPVLSESQRLSVLQALTAHLPLGQEVNLSQLARRCAGFVVGDLYALLTHASRAACTRI 650

Human   651 KNSGLAGGLTEEDEGELCAAGFPLLAEDFGQALEQLQTAHSQAVGAPKIPSVSWHDVGGLQEVKK 715
            |.:|||  ::|||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||:|||
  Rat   651 KAAGLA--MSEEDEGELCAAGFPLLAEDFGQALDQLQTAHSQAVGAPKIPSVSWHDVGGLQDVKK 713

Human   716 EILETIQLPLEHPELLSLGLRRSGLLLHGPPGTGKTLLAKAVATECSLTFLSVKGPELINMYVGQ 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   714 EILETIQLPLEHPELLSLGLRRSGLLLHGPPGTGKTLLAKAVATECSLTFLSVKGPELINMYVGQ 778

Human   781 SEENVREVFARARAAAPCIIFFDELDSLAPSRGRSGDSGGVMDRVVSQLLAELDGLHSTQDVFVI 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   779 SEENVREVFARARAAAPCIIFFDELDSLAPSRGRSGDSGGVMDRVVSQLLAELDGLHSTQDVFVI 843

Human   846 GATNRPDLLDPALLRPGRFDKLVFVGANEDRASQLRVLSAITRKFKLEPSVSLVNVLDCCPPQLT 910
            |||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||.||||:|||||||||||
  Rat   844 GATNRPDLLDPALLRPGRFDKLVFVGASEDRASQLRVLSAITRKFKLEASVSLMNVLDCCPPQLT 908

Human   911 GADLYSLCSDAMTAALKRRVHDLEE---------------------------------------- 935
            ||||||||||||..||||||.||||
  Rat   909 GADLYSLCSDAMMTALKRRVRDLEEGEPLPALDGNQETRGDSPGIPEERLSRRHLPRLLSYLGID 973

Human   936 ----------------GLEPGSSALMLTMEDLLQAAARLQPSVSEQELLRYKRIQRKFAAC 980
                            ||||.||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   974 YSWGQGSGLTVPRHPSGLEPRSSALLLTMEDLLQAAARLQPSVSEQELLRYKRIQRKFAAC 1034

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
PEX6	NP_000278.3	CDC48	<466..977	CDD:273521	468/566 (83%)
Pex6	XP_063122650.1	None