DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment PEX1 and Pex1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_000457.1 Gene:PEX1 / 5189 HGNCID:8850 Length:1283 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001280735.1 Gene:Pex1 / 71382 MGIID:1918632 Length:1284 Species:Mus musculus


Alignment Length:1285 Identity:1053/1285 - (81%)
Similarity:1150/1285 - (89%) Gaps:3/1285 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MWGSDRLAGAGGGGAAVTVAFTNARDCFLHLPRRLVAQLHLLQNQAIEVVWSHQPAFLSWVEGRH 65
            ||.||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||...|||.:||||||||
Mouse     1 MWSSDRLAGAGSGGAVVTVAFTNARDCFLHLPRRLVAQLHLLQNQAIEVASDHQPTYLSWVEGRH 65

Human    66 FSDQGENVAEINRQVGQKLGLSNGGQVFLKPCSHVVSCQQVEVEPLSADDWEILELHAVSLEQHL 130
            |:||.|||||||||||||||||:|.||||:||||||||||||||||||||||||||||:||||||
Mouse    66 FNDQSENVAEINRQVGQKLGLSSGDQVFLRPCSHVVSCQQVEVEPLSADDWEILELHAISLEQHL 130

Human   131 LDQIRIVFPKAIFPVWVDQQTYIFIQIVALIPAASYGRLETDTKLLIQPKTRRAKENTFSKADAE 195
            |||||||||||:.|:|||||||||||||.|:|||.||||||:||||||||||:|||:||.|....
Mouse   131 LDQIRIVFPKAVVPIWVDQQTYIFIQIVTLMPAAPYGRLETNTKLLIQPKTRQAKESTFPKEGDA 195

Human   196 YKKLHSYGRDQKGMMKELQTKQLQSNTVGITESNENESEIPVDSSSVASLWTMIGSIFSFQSEKK 260
            :.::|||||:|||:.|||||:||.:|:.|||.||..:.::| ......|.|.::||:.||..:.|
Mouse   196 HGQVHSYGREQKGLSKELQTRQLHTNSEGITASNGRDPKVP-GGPLKPSWWAVLGSMLSFGPDSK 259

Human   261 QETSWGLTEINAFKNMQSKVVPLDNIFRVCKSQPPSIYNASATSVFHKHCAIHVFPWDQEYFDVE 325
            ||::||..|:.|||||||:..||:..||||:.||||....:|||||||||..|||||||||||||
Mouse   260 QESAWGSLELGAFKNMQSQAAPLEGTFRVCQVQPPSARTTTATSVFHKHCTAHVFPWDQEYFDVE 324

Human   326 PSFTVTYGKLVKLLSPKQQQSKTKQNVLSPEKEKQMSEPLDQKKIRSDHNEEDEKACVLQVVWNG 390
            |||||||||||||.||||||.|:||.||.|:||||:|:..|.|:|.|:.:||..:||||:|||||
Mouse   325 PSFTVTYGKLVKLHSPKQQQDKSKQGVLLPDKEKQLSKSPDHKQISSNRSEEAAEACVLKVVWNG 389

Human   391 LEELNNAIKYTKNVEVLHLGKVWIPDDLRKRLNIEMHAVVRITPVEVTPKIPRSLKLQPRENLPK 455
            ||||.||.::|:::|:||.|||||||||||||||||||||||||:|.||||||||||||||||||
Mouse   390 LEELKNATEFTESLELLHRGKVWIPDDLRKRLNIEMHAVVRITPLETTPKIPRSLKLQPRENLPK 454

Human   456 DISEEDIKTVFYSWLQQSTTTMLPLVISEEEFIKLETKDGLKEFSLSIVHSWEKEKD--KNIFLL 518
            |::||.|||||.||:|||.|||||||||:||.||||.||||:|||||.|||.||||:  |.:|:|
Mouse   455 DVNEETIKTVFSSWVQQSATTMLPLVISKEERIKLEIKDGLREFSLSTVHSQEKEKEEGKTVFVL 519

Human   519 SPNLLQKTTIQVLLDPMVKEENSEEIDFILPFLKLSSLGGVNSLGVSSLEHITHSLLGRPLSRQL 583
            |..||||.::||||:||:|||.|.||||:||.|.|||||||::||.|::||||||||||||||||
Mouse   520 SSILLQKISVQVLLEPMIKEEQSAEIDFLLPSLTLSSLGGVSALGASAMEHITHSLLGRPLSRQL 584

Human   584 MSLVAGLRNGALLLTGGKGSGKSTLAKAICKEAFDKLDAHVERVDCKALRGKRLENIQKTLEVAF 648
            |:|||||||||||:||||||||||.||||||||.|.|||.||.||||||||||||:|||.|||||
Mouse   585 MALVAGLRNGALLITGGKGSGKSTFAKAICKEAQDTLDARVETVDCKALRGKRLESIQKALEVAF 649

Human   649 SEAVWMQPSVVLLDDLDLIAGLPAVPEHEHSPDAVQSQRLAHALNDMIKEFISMGSLVALIATSQ 713
            |||.|.||||:||||||||||||:|||.||||:||||||||||||||||||:|.|||||||||||
Mouse   650 SEAAWRQPSVILLDDLDLIAGLPSVPEQEHSPEAVQSQRLAHALNDMIKEFVSTGSLVALIATSQ 714

Human   714 SQQSLHPLLVSAQGVHIFQCVQHIQPPNQEQRCEILCNVIKNKLDCDINKFTDLDLQHVAKETGG 778
            .||||||.||||||:|.||||||:||||.|||||||.:|:||||.|||:.|.|||||.:||:|..
Mouse   715 LQQSLHPSLVSAQGIHTFQCVQHLQPPNPEQRCEILHSVVKNKLGCDISNFPDLDLQCIAKDTEA 779

Human   779 FVARDFTVLVDRAIHSRLSRQSISTREKLVLTTLDFQKALRGFLPASLRSVNLHKPRDLGWDKIG 843
            ||||||||||||||||.||||..|:||.|.|||.|||||||||||||||:|||||||||||||||
Mouse   780 FVARDFTVLVDRAIHSSLSRQHSSSREDLTLTTSDFQKALRGFLPASLRNVNLHKPRDLGWDKIG 844

Human   844 GLHEVRQILMDTIQLPAKYPELFANLPIRQRTGILLYGPPGTGKTLLAGVIARESRMNFISVKGP 908
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||.|||||:|||
Mouse   845 GLHEVRQILMDTIQLPAKYPELFANLPIRQRTGILLYGPPGTGKTLLAGVVARESGMNFISIKGP 909

Human   909 ELLSKYIGASEQAVRDIFIRAQAAKPCILFFDEFESIAPRRGHDNTGVTDRVVNQLLTQLDGVEG 973
            ||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   910 ELLSKYIGASEQAVRDVFIRAQAAKPCILFFDEFESIAPRRGHDNTGVTDRVVNQLLTQLDGVEG 974

Human   974 LQGVYVLAATSRPDLIDPALLRPGRLDKCVYCPPPDQVSRLEILNVLSDSLPLADDVDLQHVASV 1038
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||.|||||||||||||
Mouse   975 LQGVYVLAATSRPDLIDPALLRPGRLDKCVYCPPPDQVSRLEILTVLSKSLALADDVDLQHVASV 1039

Human  1039 TDSFTGADLKALLYNAQLEALHGMLLSSGLQDGSSSSDSDLSLSSMVFLNHSSGSDDSAGDGECG 1103
            |||||||||||||||||||||.|.||.|||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1040 TDSFTGADLKALLYNAQLEALQGRLLPSGLPDGGSSSDSDLSLSSMVFLNHSSGSDDSAGDGECG 1104

Human  1104 LDQSLVSLEMSEILPDESKFNMYRLYFGSSYESELGNGTSSDLSSQCLSAPSSMTQDLPGVPGKD 1168
            |:|||:|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||:|||||..||||
Mouse  1105 LEQSLLSLEMSEILPDESKFNMYRLYFGSSYESELGNGTPSDLSSHCLSAPSSVTQDLPAAPGKD 1169

Human  1169 QLFSQPPVLRTASQEGCQELTQEQRDQLRADISIIKGRYRSQSGEDESMNQPGPIKTRLAISQSH 1233
            .||:|.||.||.||||||:|||||||||||:|||||||||||||||||:||||||||..||||:|
Mouse  1170 PLFTQHPVFRTPSQEGCQDLTQEQRDQLRAEISIIKGRYRSQSGEDESLNQPGPIKTTFAISQAH 1234

Human  1234 LMTALGHTRPSISEDDWKNFAELYESFQNPKRRKNQSGTMFRPGQKVTLA 1283
            |||||.|||||||||:.|.||||||:|||||:|||||||:||.|||||||
Mouse  1235 LMTALAHTRPSISEDEGKEFAELYENFQNPKKRKNQSGTVFRTGQKVTLA 1284

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
PEX1NP_000457.1 PEX-2N 17..98 CDD:462730 70/80 (88%)
PEX-1N 104..179 CDD:462729 66/74 (89%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 346..367 11/20 (55%)
CDC48 <595..1065 CDD:273521 418/469 (89%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1260..1283 19/22 (86%)
Pex1NP_001280735.1 PEX-2N 17..98 CDD:462730 70/80 (88%)
PEX-1N 104..179 CDD:462729 66/74 (89%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 339..373 21/33 (64%)
CDC48 <596..1061 CDD:273521 415/464 (89%)
RecA-like_PEX1_r2 849..1006 CDD:410934 152/156 (97%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1261..1284 19/22 (86%)

Return to query results.
Submit another query.