Protein Alignment SHANK1 and Shank1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: XP_011525315.1
• Gene: SHANK1 / 50944
• HGNCID: 15474
• Length: 2169
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: NP_113939.2
• Gene: Shank1 / 78957
• RGDID: 621011
• Length: 2167
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 2175
• Identity: 2030/2175 - (93%)
• Similarity: 2068/2175 - (95%)
• Gaps: 14/2175 - (0%)

Human     1 MTHSPATSEDEERHSASECPEGGSESDSSPDGPGRGPRGTRGQGSGAPGSLASVRGLQGRSMSVP 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||:||||||:|||.|||||||||||
  Rat     1 MTHSPATSEDEERHSASECPEGGSESDSSPDGPGRGPQGTRGRGSGAPGNLASTRGLQGRSMSVP 65

Human    66 DDAHFSMMVFRIGIPDLHQTKCLRFNPDATIWTAKQQVLCALSESLQDVLNYGLFQPATSGRDAN 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 DDAHFSMMVFRIGIPDLHQTKCLRFNPDATIWTAKQQVLCALSESLQDVLNYGLFQPATSGRDAN 130

Human   131 FLEEERLLREYPQSFEKGVPYLEFRYKTRVYKQTNLDEKQLAKLHTKTGLKKFLEYVQLGTSDKV 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 FLEEERLLREYPQSFEKGVPYLEFRYKTRVYKQTNLDEKQLAKLHTKTGLKKFLEYVQLGTSDKV 195

Human   196 ARLLDKGLDPNYHDSDSGETPLTLAAQTEGSVEVIRTLCLGGAHIDFRARDGMTALHKAACARHC 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 ARLLDKGLDPNYHDSDSGETPLTLAAQTEGSVEVIRTLCLGGAHIDFRARDGMTALHKAACARHC 260

Human   261 LALTALLDLGGSPNYKDRRGLTPLFHTAMVGGDPRCCELLLFNRAQLGIADENGWQEIHQACQRG 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||
  Rat   261 LALTALLDLGGSPNYKDRRGLTPLFHTAMVGGDPRCCELLLYNRAQLGIADENGWQEIHQACQRG 325

Human   326 HSQHLEHLLFYGAEPGAQNASGNTALHICALYNKETCARILLYRGADKDVKNNNGQTPFQVAVIA 390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||
  Rat   326 HSQHLEHLLFYGAEPGAQNASGNTALHICALYNKETCARILLYRGANKDVKNNNGQTPFQVAVIA 390

Human   391 GNFELGELIRNHREQDVVPFQESPKYAARRRGPPGTGLTVPPALLRANSDTSMALPDWMVFSAPG 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 GNFELGELIRNHREQDVVPFQESPKYAARRRGPPGAGLTVPPALLRANSDTSMALPDWMVFSAPG 455

Human   456 AASSGAPGPTSGSQGQSQPSAPTTKLSSGTLRSASSPRGARARSPSRGRHPEDAKRQPRGRPSSS 520
            |:|||.||||||.|||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 ASSSGTPGPTSGPQGQSQPSAPSTKLSSGTLRSASSPRGARARSPSRGRHPEDAKRQPRGRPSSS 520

Human   521 GTPREGPAGGTGGSGGPGGSLGSRGRRRKLYSAVPGRSFMAVKSYQAQAEGEISLSKGEKIKVLS 585
            ||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
  Rat   521 GTPRDGPAGGTGGSGGPGGSLGSRGRRRKLYSAVPGRSFMAVKSYQAQGEGEISLSKGEKIKVLS 585

Human   586 IGEGGFWEGQVKGRVGWFPSDCLEEVANRSQESKQESRSDKAKRLFRHYTVGSYDSFDAPSLMDG 650
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.:||||||||||||||||||||||||||||:||
  Rat   586 IGEGGFWEGQVKGRVGWFPSDCLEEVANRSQEGRQESRSDKAKRLFRHYTVGSYDSFDAPSLIDG 650

Human   651 IGPGSDYIIKEKTVLLQKKDSEGFGFVLRGAKAQTPIEEFTPTPAFPALQYLESVDEGGVAWRAG 715
            |..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   651 IDSGSDYIIKEKTVLLQKKDSEGFGFVLRGAKAQTPIEEFTPTPAFPALQYLESVDEGGVAWRAG 715

Human   716 LRMGDFLIEVNGQNVVKVGHRQVVNMIRQGGNTLMVKVVMVTRHPDMDEAVHKKAPQQAKRLPPP 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
  Rat   716 LRMGDFLIEVNGQNVVKVGHRQVVNMIRQGGNTLMVKVVMVTRHPDMDEAVHKKASQQAKRLPPP 780

Human   781 TISLRSKSMTSELEEMVSPWKKKSEYEQQPAPVPSMEKKRTVYQMALNKLDEILAAAQQTISASE 845
            .||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   781 AISLRSKSMTSELEEMVSPWKKKIEYEQQPAAVPSMEKKRTVYQMALNKLDEILAAAQQTISASE 845

Human   846 SPGPGGLASLGKHRPKGFFATESSFDPHHRAQPSYERPSFLPPGPGLMLRQKSIGAAEDDRPYLA 910
            ||||||||||||||||||||||||||||||:||||:|||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   846 SPGPGGLASLGKHRPKGFFATESSFDPHHRSQPSYDRPSFLPPGPGLMLRQKSIGAAEDDRPYLA 910

Human   911 PPAMKFSRSLSVPGSEDIPPPPTTSPPEPPYSTPPVPSSSGRLTPSPRGGPFNPGSGGPLPASSP 975
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||
  Rat   911 PPAMKFSRSLSVPGSEDIPPPPTTSPPEPPYSTPPAPSSSGRLTPSPRGGPFNPSSGGPLPASSP 975

Human   976 ASFDGPSPPDTRVGSREKSLYHSGPLPPAHHHPPHHHHHHAPPPQPHHHHAHPPHPPEMETGGSP 1040
            :|||||||||||.|.||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   976 SSFDGPSPPDTRGGGREKSLYHSAALPPAHHHPPHHHHHHAPPPQPHHHHAHPPHPPEMETGGSP 1040

Human  1041 DDPPPRLALGPQPSLRGWRGGGPSPTPGAPSPSHHGSAGGGGGSSQGPALRYFQLPPRAASAAMY 1105
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|:||..|.:|.||||||||||||||||||
  Rat  1041 DDPPPRLALGPQPSLRGWRGGGPSPTSGAPSPSHHSSSGGSSGPTQAPALRYFQLPPRAASAAMY 1105

Human  1106 VPARSGRGRKGPLVKQTKVEGEPQKGGGLPPAPSPTSPASPQPPPAVAAPSEKNSIPIPTIIIKA 1170
            ||||||||||||||||||||||||| |.:|.|.||||||.|:..|..|.||||||||||||||||
  Rat  1106 VPARSGRGRKGPLVKQTKVEGEPQK-GSIPSASSPTSPALPRSEPPPAGPSEKNSIPIPTIIIKA 1169

Human  1171 PSTSSSGRSSQGSSTEAEPPTQPEPTGGGGGGGSSPSPAPAMSPVPPSPSPVPTPASPSGPATLD 1235
            |||||||||||||||||||||||:   |.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
  Rat  1170 PSTSSSGRSSQGSSTEAEPPTQPD---GAGGGGSSPSPAPATSPVPPSPSPVPTPASPSGPATLD 1231

Human  1236 FTSQFGAALVGAARREGGWQNEARRRSTLFLSTDAGDEDGGDGGLGTGAAPGPRLRHSKSIDEGM 1300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|..|||||||||||||||
  Rat  1232 FTSQFGAALVGAARREGGWQNEARRRSTLFLSTDAGDEDGGDSGLGPGGPPGPRLRHSKSIDEGM 1296

Human  1301 FSAEPYLRLESAGSGAGYGGYGAGSRAYGGGGGSSAFTSFLPPRPLVHPLTGKALDPASPLGLAL 1365
            |||||||||||.||..|||.|.||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1297 FSAEPYLRLESGGSSGGYGAYAAGSRAYGGSGSSSAFTSFLPPRPLVHPLTGKALDPASPLGLAL 1361

Human  1366 AARERALKESSEGGGAPQPPPRPPSPRYEAPPPTPHH------HSPHAHHEPVLRLWGASPPDPA 1424
            |||||||||||||||.||||||||||||:|||||.||      |||||.|||||||||    |||
  Rat  1362 AARERALKESSEGGGTPQPPPRPPSPRYDAPPPTLHHHSPHSPHSPHARHEPVLRLWG----DPA 1422

Human  1425 RRELGYRAGLGSQEKSLPASPPAARRSLLHRLPPTAPGVGPLLLQLGTEPPAPHPGVSKPWRSAA 1489
            |||||||||||||||:|.|||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.||:||
  Rat  1423 RRELGYRAGLGSQEKALTASPPAARRSLLHRLPPTAPGVGPLLLQLGPEPPTPHPGVSKAWRTAA 1487

Human  1490 PEEPERLPLHVRFLENCQPRAPVTSGRGPPSEDGPGVPPPSPRRSVPPSPTSPRASEENGLPLLV 1554
            ||||||||||||||||||.|.|....||..:|||||||||||||.:|.||||||.:|||||||||
  Rat  1488 PEEPERLPLHVRFLENCQARPPPAGTRGSSTEDGPGVPPPSPRRVLPTSPTSPRGNEENGLPLLV 1552

Human  1555 LPPPAPSVDVEDGEFLFVEPLPPPLEFSNSFEKPESPLTPGPPHPLPDTPAPATPLPPVPPPAVA 1619
            ||||||||||:||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|:||||||..||||||
  Rat  1553 LPPPAPSVDVDDGEFLFAEPLPPPLEFSNSFEKPESPLTPGPPHPLPDPPSPATPLPAAPPPAVA 1617

Human  1620 AAPPTLDSTASSLTSYDSEVATLTQGASAAPGDPHPPGPPAPAAPAPAAPQPGPDPPPGTDSGIE 1684
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||..|||||||||||.|||||||||||||||||
  Rat  1618 AAPPTLDSTASSLTSYDSEVATLTQGAPAAPGDPPAPGPPAPAAPAPPAPQPGPDPPPGTDSGIE 1682

Human  1685 EVDSRSSSDHPLETISSASTLSSLSAEGGGSAGGGGGAGAGVASGPELLDTYVAYLDGQAFGGSS 1749
            ||||||||||||||||||||||||||||||:.||..|.|||||||.||||||||||||||||||.
  Rat  1683 EVDSRSSSDHPLETISSASTLSSLSAEGGGNTGGVAGGGAGVASGTELLDTYVAYLDGQAFGGSG 1747

Human  1750 TPGPPYPPQLMTPSKLRGRALGASGGLRPGPSGGLRDPVTPTSPTVSVTGAGTDGLLALRACSGP 1814
            ||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||
  Rat  1748 TPGPPYPPQLMTPSKLRGRALGTSGNLRPGPSGGLRDPVTPTSPTVSVTGAGTDGLLALSACPGP 1812

Human  1815 PTAGVAGGPVAVEPEVPPVPLPTASSLPRKLLPWEEGPGPPPPPLPGPLAQPQASALATVKASII 1879
            .|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||
  Rat  1813 STAGVAGGPVAVEPEVPPVPLPAASSLPRKLLPWEEGPGPPPPPLPGPLSQPQASALATVKASII 1877

Human  1880 SELSSKLQQFGGSSAAGGALPWARGGSGGGGDSHHGGASYVPERTSSLQRQRLSDDSQSSLLSKP 1944
            ||||||||||||||.||||||||||||||..|||||||||:|||||||||||||:|||:||||||
  Rat  1878 SELSSKLQQFGGSSTAGGALPWARGGSGGSTDSHHGGASYIPERTSSLQRQRLSEDSQTSLLSKP 1942

Human  1945 VSSLFQNWPKPPLPPLPTGTGVSPTAAAAPGATSPSASSSSTSTRHLQGVEFEMRPPLLRRAPSP 2009
            .||:|||||||||||||||:|||.:.|||||||||||||:|.|||||||||||||||||||||||
  Rat  1943 SSSIFQNWPKPPLPPLPTGSGVSSSTAAAPGATSPSASSASASTRHLQGVEFEMRPPLLRRAPSP 2007

Human  2010 SLLPASEHKVSPAPRPSSLPILPSGPLYPGLFDIRGSPTGGAGGSADPFAPVFVPPHPGISGGLG 2074
            ||||||:|||||||||||||||||||:||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||
  Rat  2008 SLLPASDHKVSPAPRPSSLPILPSGPIYPGLFDIRSSPTGGAGGSTDPFAPVFVPPHPGISGGLG 2072

Human  2075 GALSGASRSLSPTRLLSLPPDKPFGAKPLGFWTKFDVADWLEWLGLAEHRAQFLDHEIDGSHLPA 2139
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||
  Rat  2073 GALSGASRSLSPTRLLSLPPDKPFGAKPLGFWTKFDVADWLEWLGLSEHRAQFLDHEIDGSHLPA 2137

Human  2140 LTKEDYVDLGVTRVGHRMNIDRALKFFLER 2169
            ||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2138 LTKEDYVDLGVTRVGHRMNIDRALKFFLER 2167

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
SHANK1	XP_011525315.1	FERM_F0_SHANK1	70..158	CDD:340695	87/87 (100%)
		ANKYR	166..407	CDD:440430	238/240 (99%)
		ANK repeat	212..244	CDD:293786	31/31 (100%)
		ANK repeat	246..277	CDD:293786	30/30 (100%)
		ANK repeat	279..344	CDD:293786	63/64 (98%)
		ANK repeat	346..377	CDD:293786	29/30 (97%)
		SH3	557..608	CDD:473055	49/50 (98%)
		PDZ_SHANK1_3-like	656..757	CDD:467228	100/100 (100%)
		SAM_Shank1,2,3	2102..2167	CDD:188905	63/64 (98%)
Shank1	NP_113939.2	Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1..63		57/61 (93%)
		FERM_F0_SHANK1	70..158	CDD:340695	87/87 (100%)
		ANKYR	166..407	CDD:440430	238/240 (99%)
		ANK 1	195..210		14/14 (100%)
		ANK 2	212..245		32/32 (100%)
		ANK repeat	212..244	CDD:293786	31/31 (100%)
		ANK 3	246..278		31/31 (100%)
		ANK repeat	246..277	CDD:293786	30/30 (100%)
		ANK 4	279..312		31/32 (97%)
		ANK repeat	279..311	CDD:293786	30/31 (97%)
		ANK 5	313..345		31/31 (100%)
		ANK repeat	313..344	CDD:293786	30/30 (100%)
		ANK 6	346..378		30/31 (97%)
		ANK repeat	346..377	CDD:293786	29/30 (97%)
		ANK 7	379..395		15/15 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	413..432		17/18 (94%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	453..546		87/92 (95%)
		SH3	557..608	CDD:473055	49/50 (98%)
		PDZ_SHANK1_3-like	656..757	CDD:467228	100/100 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	841..894		50/52 (96%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	917..1233		286/319 (90%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1245..1294		44/48 (92%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1308..1417		91/108 (84%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1429..1725		260/295 (88%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1740..1787		43/46 (93%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1842..1866		22/23 (96%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1898..1988		76/89 (85%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	2002..2029		25/26 (96%)
		SAM_Shank1,2,3	2100..2165	CDD:188905	63/64 (98%)