DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment PC and PCB

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_000911.2 Gene:PC / 5091 HGNCID:8636 Length:1178 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_724841.1 Gene:PCB / 36020 FlyBaseID:FBgn0027580 Length:1197 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1192 Identity:800/1192 - (67%)
Similarity:964/1192 - (80%) Gaps:36/1192 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human    16 IRRTSTAPAASPNVR-----------RLEYKPIKKVMVANRGEIAIRVFRACTELGIRTVAIYSE 69
            :|:|      .|.||           ::|||||:.|:||||||||||||||||||||::||:|||
  Fly    13 LRKT------QPRVRLNAIFKNGYSSKVEYKPIRSVLVANRGEIAIRVFRACTELGIKSVAVYSE 71

Human    70 QDTGQMHRQKADEAYLIGRGLAPVQAYLHIPDIIKVAKENNVDAVHPGYGFLSERADFAQACQDA 134
            ||...||||||||:|::|:||.||:|||:||::|:|.|||:||||||||||||||:|||||..||
  Fly    72 QDKMHMHRQKADESYIVGKGLPPVEAYLNIPELIRVCKENDVDAVHPGYGFLSERSDFAQAVIDA 136

Human   135 GVRFIGPSPEVVRKMGDKVEARAIAIAAGVPVVPGTDAPITSLHEAHEFSNTYGFPIIFKAAYGG 199
            |:||||||||||:||||||.||..||.||||:|||||.|:|:..||.||...:|.|:||||||||
  Fly   137 GLRFIGPSPEVVQKMGDKVAARVAAIEAGVPIVPGTDGPVTTKEEALEFCKKHGLPVIFKAAYGG 201

Human   200 GGRGMRVVHSYEELEENYTRAYSEALAAFGNGALFVEKFIEKPRHIEVQILGDQYGNILHLYERD 264
            ||||||||...|::||::.||.|||.|||||||:|:|||||:|||||||:|||:.||::||||||
  Fly   202 GGRGMRVVRKMEDVEESFQRASSEAKAAFGNGAMFIEKFIERPRHIEVQLLGDKAGNVVHLYERD 266

Human   265 CSIQRRHQKVVEIAPAAHLDPQLRTRLTSDSVKLAKQVGYENAGTVEFLVDRHGKHYFIEVNSRL 329
            ||:|||||||||||||..|..::|.::|..:|:||:.||||||||||||.|..|..||||||:||
  Fly   267 CSVQRRHQKVVEIAPAPRLPIEIRDKMTEAAVRLARHVGYENAGTVEFLCDESGNFYFIEVNARL 331

Human   330 QVEHTVTEEITDVDLVHAQIHVAEGRSLPDLGLRQENIRINGCAIQCRVTTEDPARSFQPDTGRI 394
            |||||||||||.:|||.:||.||||.:||:||..|:.|...|.||||||||||||..|||:|||:
  Fly   332 QVEHTVTEEITGIDLVQSQIRVAEGMTLPELGYTQDKIVPRGYAIQCRVTTEDPANDFQPNTGRL 396

Human   395 EVFRSGEGMGIRLDNASAFQGAVISPHYDSLLVKVIAHGKDHPTAATKMSRALAEFRVRGVKTNI 459
            ||||||||||||||:|||:.||:|||:|||||||||:|..|..::|:||:|||.|||:|||||||
  Fly   397 EVFRSGEGMGIRLDSASAYAGAIISPYYDSLLVKVISHASDLQSSASKMNRALREFRIRGVKTNI 461

Human   460 AFLQNVLNNQQFLAGTVDTQFIDENPELFQLRPAQNRAQKLLHYLGHVMVNGPTTPIPVKASPSP 524
            .||.|||.||:||.|.:||.||||:|:||:.:|:.|||||||:|:|.|:||||.||:.....|:.
  Fly   462 PFLLNVLENQKFLHGVLDTYFIDEHPQLFKFKPSLNRAQKLLNYMGEVLVNGPQTPLATTLKPAL 526

Human   525 TDPVVPAVP-----------------IGPPPAGFRDILLREGPEGFARAVRNHPGLLLMDTTFRD 572
            ..|.||.||                 :..||.|.|::|:.||||.||:.|||...||||||||||
  Fly   527 VSPHVPEVPLDLSPEAIEREERGEAKVTEPPKGLREVLVCEGPEAFAKEVRNRKELLLMDTTFRD 591

Human   573 AHQSLLATRVRTHDLKKIAPYVAHNFSKLFSMENWGGATFDVAMRFLYECPWRRLQELRELIPNI 637
            |||||||||||:|||.||:|||.|.|:.|:|:|||||||||||:|||:||||.||:|:|:.||||
  Fly   592 AHQSLLATRVRSHDLLKISPYVTHKFNNLYSLENWGGATFDVALRFLHECPWERLEEMRKRIPNI 656

Human   638 PFQMLLRGANAVGYTNYPDNVVFKFCEVAKENGMDVFRVFDSLNYLPNMLLGMEAAGSAGGVVEA 702
            |||||||||||||||:||||||:||||:|.:.|||:||||||||||||::|||||||.|||||||
  Fly   657 PFQMLLRGANAVGYTSYPDNVVYKFCELAVQTGMDIFRVFDSLNYLPNLILGMEAAGKAGGVVEA 721

Human   703 AISYTGDVADPSRTKYSLQYYMGLAEELVRAGTHILCIKDMAGLLKPTACTMLVSSLRDRFPDLP 767
            ||||||||:||.||||.|:||..||:|||:||||:||||||||||||.:..:|::::||:.||:|
  Fly   722 AISYTGDVSDPKRTKYDLKYYTNLADELVKAGTHVLCIKDMAGLLKPESARLLITAIRDKHPDIP 786

Human   768 LHIHTHDTSGAGVAAMLACAQAGADVVDVAADSMSGMTSQPSMGALVACTRGTPLDTEVPMERVF 832
            :|||||||||||||:|||||.|||||||||.||||||||||||||:||..:||||||.:.:..|.
  Fly   787 IHIHTHDTSGAGVASMLACANAGADVVDVAVDSMSGMTSQPSMGAVVASLQGTPLDTNLDLRTVS 851

Human   833 DYSEYWEGARGLYAAFDCTATMKSGNSDVYENEIPGGQYTNLHFQAHSMGLGSKFKEVKKAYVEA 897
            :||.|||..|.|||.|:||.||:|||:|||.|||||||||||.|||.|:|||..|::|||||.||
  Fly   852 EYSAYWEQTRTLYAPFECTTTMRSGNADVYLNEIPGGQYTNLQFQAFSLGLGDFFEDVKKAYREA 916

Human   898 NQMLGDLIKVTPSSKIVGDLAQFMVQNGLSRAEAEAQAEELSFPRSVVEFLQGYIGVPHGGFPEP 962
            |.:|||:||||||||:|||||||||||.|:..:...:|||||||:||||:|||.||:||||||||
  Fly   917 NLLLGDIIKVTPSSKVVGDLAQFMVQNDLTADQVLERAEELSFPKSVVEYLQGSIGIPHGGFPEP 981

Human   963 FRSKVLKDLPRVEGRPGASLPPLDLQALEKELVDRHGEEVTPEDVLSAAMYPDVFAHFKDFTATF 1027
            .||:||||:||:||||||.|..||...|:|||.:.| ..||..||:|||:||.|...|.:|...:
  Fly   982 LRSRVLKDMPRIEGRPGAELKDLDFDKLKKELQESH-TCVTNRDVMSAALYPQVTNDFLNFREKY 1045

Human  1028 GPLDSLNTRLFLQGPKIAEEFEVELERGKTLHIKALAVS-DLNRAGQRQVFFELNGQLRSILVKD 1091
            ||:|.|:||:||.|||:.|||:|.|||||||.:|||||| ||...|.|:||||||||||::.:.|
  Fly  1046 GPVDKLDTRIFLTGPKVGEEFDVPLERGKTLSVKALAVSADLKPNGIREVFFELNGQLRAVHILD 1110

Human  1092 TQAMKEMHFHPKALKDVKGQIGAPMPGKVIDIKVVAGAKVAKGQPLCVLSAMKMETVVTSPMEGT 1156
            .:|:||:|.||||.|..|.::||||||.||||:|..|.||.|||||.||||||||.||.||:.|.
  Fly  1111 KEAVKEIHVHPKANKSNKSEVGAPMPGTVIDIRVKVGDKVEKGQPLVVLSAMKMEMVVQSPLAGV 1175

Human  1157 VRKVHVTKDMTLEGDDLILEIE 1178
            |:|:.:.....|||:|||:.||
  Fly  1176 VKKLEIANGTKLEGEDLIMIIE 1197

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
PCNP_000911.2 PycA 35..1177 CDD:440660 791/1159 (68%)
PCBNP_724841.1 PycA 37..1196 CDD:440660 791/1159 (68%)

Return to query results.
Submit another query.