DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment GEMIN4 and Gemin4

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_011522212.1 Gene:GEMIN4 / 50628 HGNCID:15717 Length:1062 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001102507.1 Gene:Gemin4 / 497958 RGDID:1563715 Length:1058 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1055 Identity:858/1055 - (81%)
Similarity:949/1055 - (89%) Gaps:0/1055 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     8 GPLNICEEMTILHGGFLLAEQLFHPKALAELTKSDWERVGRPIVEALREISSAAAHSQPFAWKKK 72
            |||||||||||||||||:||||||||||.:|||||||.||:||||||:|||||.|||||||||||
  Rat     4 GPLNICEEMTILHGGFLMAEQLFHPKALEQLTKSDWEHVGQPIVEALKEISSATAHSQPFAWKKK 68

Human    73 ALIIIWAKVLQPHPVTPSDTETRWQEDLFFSVGNMIPTINHTILFELLKSLEASGLFIQLLMALP 137
            ||||||||||||.||:||||:||||||:||||||||||||||:||||||||||||||||||||||
  Rat    69 ALIIIWAKVLQPSPVSPSDTDTRWQEDVFFSVGNMIPTINHTVLFELLKSLEASGLFIQLLMALP 133

Human   138 TTICHAELERFLEHVTVDTSAEDVAFFLDVWWEVMKHKGHPQDPLLSQFSAMAHKYLPALDEFPH 202
            |||..:||:.||||:|:|||::|||||||||||:|||||..||||||||..|||||||:.|||.|
  Rat   134 TTIGRSELQSFLEHMTIDTSSKDVAFFLDVWWEMMKHKGDEQDPLLSQFRTMAHKYLPSSDEFSH 198

Human   203 PPKRLRSDPDACPTMPLLAMLLRGLTQIQSRILGPGRKCCALANLADMLTVFALTEDDPQEVSAT 267
            ||||.:||||..||||||||||.||.|||.|||..|.||||||||||||:||||.|||.||||||
  Rat   199 PPKRFKSDPDVGPTMPLLAMLLNGLKQIQKRILSLGMKCCALANLADMLSVFALMEDDTQEVSAT 263

Human   268 VYLDKLATVISVWNSDTQNPYHQQALAEKVKEAERDVSLTSLAKLPSETIFVGCEFLHHLLREWG 332
            |||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||:|:|.|.:::||:|||
  Rat   264 VYLDKLATVISVWNSDTQNPYHQQALADKVKEAERDVSLTSLAKLPSETVFMGFELMYNLLQEWG 328

Human   333 EELQAVLRSSQGTSYDSYRLCDSLTSFSQNATLYLNRTSLSKEDRQVVSELAECVRDFLRKTSTV 397
            .|||.:|.|||||:||:|||||||||||||..|||:..||.||:|:||.|||:||||||||||.:
  Rat   329 TELQDMLNSSQGTNYDTYRLCDSLTSFSQNLELYLDTASLPKEEREVVLELAKCVRDFLRKTSRM 393

Human   398 LKNRALEDITASIAMAVIQQKMDRHMEVCYIFASEKKWAFSDEWVACLGSNRALFRQPDLVLRLL 462
            |.::.|||||||||||:|:|||||:||:||||||||||||||||||||.:||.|||:|||||.||
  Rat   394 LNDKGLEDITASIAMAIIEQKMDRYMEMCYIFASEKKWAFSDEWVACLVNNRCLFREPDLVLSLL 458

Human   463 ETVIDVSTADRAIPESQIRQVIHLILECYADLSLPGKNKVLAGILRSWGRKGLSEKLLAYVEGFQ 527
            |||::|..::|.||::.|:|||.|.||||.|||||.|||||:|:|...|.||||::|..|:||||
  Rat   459 ETVMEVINSNRVIPQTHIKQVICLTLECYEDLSLPDKNKVLSGVLHYLGPKGLSDRLSNYLEGFQ 523

Human   528 EDLNTTFNQLTQSASEQGLAKAVASVARLVIVHPEVTVKKMCSLAVVNLGTHKFLAQILTAFPAL 592
            ||||||||||.||.|||||||||||||.|||::|||.|||||||||.|||||:||||||||||||
  Rat   524 EDLNTTFNQLAQSTSEQGLAKAVASVAHLVILNPEVVVKKMCSLAVTNLGTHRFLAQILTAFPAL 588

Human   593 RFVEEQGPNSSATFMVSCLKETVWMKFSTPKEEKQFLELLNCLMSPVKPQGIPVAALLEPDEVLK 657
            :|.||||||...:|||||||||||.||||||||||||||::|||:||||||||:|||||||||||
  Rat   589 KFTEEQGPNPYTSFMVSCLKETVWTKFSTPKEEKQFLELVSCLMNPVKPQGIPIAALLEPDEVLK 653

Human   658 EFVLPFLRLDVEEVDLSLRIFIQTLEANACREEYWLQTCSPFPLLFSLCQLLDRFSKYWQLPKEK 722
            |||||||.||:|||.|||::|||||||||..||||||||||||||||||||||.|||:||||:||
  Rat   654 EFVLPFLMLDMEEVGLSLKLFIQTLEANAGLEEYWLQTCSPFPLLFSLCQLLDSFSKFWQLPREK 718

Human   723 RCLSLDRKDLAIHILELLCEIVSANAETFSPDVWIKSLSWLHRKLEQLDWTVGLRLKSFFEGHFK 787
            |.|:||.|||..||||||||||.||.||||||.|.||||||||||:|||||||||||.|||||||
  Rat   719 RYLTLDSKDLVTHILELLCEIVLANIETFSPDTWAKSLSWLHRKLDQLDWTVGLRLKDFFEGHFK 783

Human   788 CEVPATLFEICKLSEDEWTSQAHPGYGAGTGLLAWMECCCVSSGISERMLSLLVVDVGNPEEVRL 852
            |||||||||||||||.:||||||.|||.|||||||||||.:|:.::|:|||||||:|||||||||
  Rat   784 CEVPATLFEICKLSEAQWTSQAHEGYGPGTGLLAWMECCSISNSVTEQMLSLLVVNVGNPEEVRL 848

Human   853 FSKGFLVALVQVMPWCSPQEWQRLHQLTRRLLEKQLLHVPYSLEYIQFVPLLNLKPFAQELQLSV 917
            ||||||||||||||||||||||.|.||||:|||||||||||||||:||||||||:||||||||||
  Rat   849 FSKGFLVALVQVMPWCSPQEWQYLQQLTRKLLEKQLLHVPYSLEYVQFVPLLNLRPFAQELQLSV 913

Human   918 LFLRTFQFLCSHSCRDWLPLEGWNHVVKLLCGSLTRLLDSVRAIQAAGPWVQGPEQDLTQEALFV 982
            |.||.||||||.||.:||||:||:|||||||.|||.:||:||.||:.|||.||.|.|||||.|||
  Rat   914 LSLRAFQFLCSQSCCNWLPLDGWSHVVKLLCSSLTSVLDAVRLIQSVGPWAQGQEGDLTQETLFV 978

Human   983 YTQVFCHALHIMAMLHPEVCEPLYVLALETLTCYETLSKTNPSVSSLLQRAHEQRFLKSIAEGIG 1047
            |||:|||.|||||||..||||||||||||.|||||||||||||||||||:..|||||||||:.|.
  Rat   979 YTQMFCHVLHIMAMLPQEVCEPLYVLALEILTCYETLSKTNPSVSSLLQKVDEQRFLKSIAKNIS 1043

Human  1048 PEERRQTLLQKMSSF 1062
            |||||||||||:::|
  Rat  1044 PEERRQTLLQKINNF 1058

Return to query results.
Submit another query.