DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment GEMIN4 and Gemin4

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_011522212.1 Gene:GEMIN4 / 50628 HGNCID:15717 Length:1062 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_796341.2 Gene:Gemin4 / 276919 MGIID:2449313 Length:1058 Species:Mus musculus


Alignment Length:1055 Identity:861/1055 - (81%)
Similarity:950/1055 - (90%) Gaps:0/1055 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     8 GPLNICEEMTILHGGFLLAEQLFHPKALAELTKSDWERVGRPIVEALREISSAAAHSQPFAWKKK 72
            |||||||||||||||||:||||||||||.:|||||||.||:||||||:|||||.|||||||||||
Mouse     4 GPLNICEEMTILHGGFLMAEQLFHPKALVQLTKSDWEHVGQPIVEALKEISSATAHSQPFAWKKK 68

Human    73 ALIIIWAKVLQPHPVTPSDTETRWQEDLFFSVGNMIPTINHTILFELLKSLEASGLFIQLLMALP 137
            ||||||.|||||.||:||||:||||||:||||||||||||||:||||||||||||||||||||||
Mouse    69 ALIIIWTKVLQPSPVSPSDTDTRWQEDVFFSVGNMIPTINHTVLFELLKSLEASGLFIQLLMALP 133

Human   138 TTICHAELERFLEHVTVDTSAEDVAFFLDVWWEVMKHKGHPQDPLLSQFSAMAHKYLPALDEFPH 202
            |||..:||:.||||:|||||::|||||||||||:|||||..||||||||..|||||||:.|||.|
Mouse   134 TTIGRSELQSFLEHMTVDTSSKDVAFFLDVWWEMMKHKGDQQDPLLSQFRTMAHKYLPSSDEFSH 198

Human   203 PPKRLRSDPDACPTMPLLAMLLRGLTQIQSRILGPGRKCCALANLADMLTVFALTEDDPQEVSAT 267
            ||||.:||||..||||||||||.||.|||.|||..|.||||||||||||:||||.|||.||||||
Mouse   199 PPKRFKSDPDVGPTMPLLAMLLNGLKQIQKRILSLGMKCCALANLADMLSVFALLEDDTQEVSAT 263

Human   268 VYLDKLATVISVWNSDTQNPYHQQALAEKVKEAERDVSLTSLAKLPSETIFVGCEFLHHLLREWG 332
            ||||||||||||||||||||||:||||:|||||||||||||||||||||:|:|.|.:::||:|||
Mouse   264 VYLDKLATVISVWNSDTQNPYHRQALADKVKEAERDVSLTSLAKLPSETVFMGFELMYNLLQEWG 328

Human   333 EELQAVLRSSQGTSYDSYRLCDSLTSFSQNATLYLNRTSLSKEDRQVVSELAECVRDFLRKTSTV 397
            .|||.:|.|||||:||:|||||||||||||..|||:.|::.||:|:|||||||||||||||||.:
Mouse   329 AELQDMLNSSQGTNYDTYRLCDSLTSFSQNLELYLDTTNMPKEEREVVSELAECVRDFLRKTSRM 393

Human   398 LKNRALEDITASIAMAVIQQKMDRHMEVCYIFASEKKWAFSDEWVACLGSNRALFRQPDLVLRLL 462
            |.::.|||||||||||:|:||||||||:||||||||||||||||||||.:||:|||:|||||.||
Mouse   394 LNDKGLEDITASIAMAIIEQKMDRHMEMCYIFASEKKWAFSDEWVACLVNNRSLFREPDLVLSLL 458

Human   463 ETVIDVSTADRAIPESQIRQVIHLILECYADLSLPGKNKVLAGILRSWGRKGLSEKLLAYVEGFQ 527
            |||::|.::||.||:.||:|||.|.||||.|||||.|||||:|:|...|.||||::|..|:||||
Mouse   459 ETVMEVISSDRVIPQPQIKQVICLTLECYEDLSLPDKNKVLSGVLHYLGPKGLSDRLSDYLEGFQ 523

Human   528 EDLNTTFNQLTQSASEQGLAKAVASVARLVIVHPEVTVKKMCSLAVVNLGTHKFLAQILTAFPAL 592
            ||||||||||.||.|||||||||||||.|||::|||.|||||||||.|||||:||||||||||||
Mouse   524 EDLNTTFNQLAQSTSEQGLAKAVASVAHLVILNPEVVVKKMCSLAVTNLGTHRFLAQILTAFPAL 588

Human   593 RFVEEQGPNSSATFMVSCLKETVWMKFSTPKEEKQFLELLNCLMSPVKPQGIPVAALLEPDEVLK 657
            :|.||||.|...:|||||||||||.||||||||||||||::||.:||||||||||||||||||||
Mouse   589 KFTEEQGANPCTSFMVSCLKETVWTKFSTPKEEKQFLELVSCLTNPVKPQGIPVAALLEPDEVLK 653

Human   658 EFVLPFLRLDVEEVDLSLRIFIQTLEANACREEYWLQTCSPFPLLFSLCQLLDRFSKYWQLPKEK 722
            |||||||.||:|||.|||::|||||||||..||||||||||||||||||||||.|||:||||:||
Mouse   654 EFVLPFLMLDMEEVGLSLKLFIQTLEANAGLEEYWLQTCSPFPLLFSLCQLLDSFSKFWQLPREK 718

Human   723 RCLSLDRKDLAIHILELLCEIVSANAETFSPDVWIKSLSWLHRKLEQLDWTVGLRLKSFFEGHFK 787
            |.|:||.|||..||||||||||.||.||||||.|.||||||||||:|||||||||||:|||||||
Mouse   719 RYLTLDSKDLVTHILELLCEIVLANTETFSPDTWAKSLSWLHRKLDQLDWTVGLRLKNFFEGHFK 783

Human   788 CEVPATLFEICKLSEDEWTSQAHPGYGAGTGLLAWMECCCVSSGISERMLSLLVVDVGNPEEVRL 852
            ||||||||:||||||.:||||.|.|||.|||||||||||.|||.||::||||||:||||||||||
Mouse   784 CEVPATLFDICKLSEAQWTSQVHEGYGPGTGLLAWMECCSVSSSISDQMLSLLVMDVGNPEEVRL 848

Human   853 FSKGFLVALVQVMPWCSPQEWQRLHQLTRRLLEKQLLHVPYSLEYIQFVPLLNLKPFAQELQLSV 917
            ||||||||||||||||||||||.|.||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   849 FSKGFLVALVQVMPWCSPQEWQYLQQLTRKLLEKQLLHVPYSLEYIQFVPLLNLKPFAQELQLSV 913

Human   918 LFLRTFQFLCSHSCRDWLPLEGWNHVVKLLCGSLTRLLDSVRAIQAAGPWVQGPEQDLTQEALFV 982
            |.||.||||||.||.:||||:||:|||||||.|||.:||:||.:|:.|||.||.|.|||||.|||
Mouse   914 LSLRVFQFLCSQSCCNWLPLDGWSHVVKLLCNSLTSVLDAVRLMQSVGPWAQGQEGDLTQETLFV 978

Human   983 YTQVFCHALHIMAMLHPEVCEPLYVLALETLTCYETLSKTNPSVSSLLQRAHEQRFLKSIAEGIG 1047
            |||:|||.|||||||..||||||||||||.|||||||||:|||||||||:..|||||||||:.|.
Mouse   979 YTQMFCHVLHIMAMLPQEVCEPLYVLALEILTCYETLSKSNPSVSSLLQKVDEQRFLKSIAKNIS 1043

Human  1048 PEERRQTLLQKMSSF 1062
            |||||||||||:::|
Mouse  1044 PEERRQTLLQKINNF 1058

Return to query results.
Submit another query.