DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dora and Zswim8

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001356949.1 Gene:Dora / 50356 FlyBaseID:FBgn0085430 Length:2371 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_063130443.1 Gene:Zswim8 / 361004 RGDID:1309414 Length:1897 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2093 Identity:820/2093 - (39%)
Similarity:1040/2093 - (49%) Gaps:513/2093 - (24%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     2 DRFSFDDSIRFEEDSLCSWSSEPESLCNNWRGWKKPAAGSGAGNGGLSGMGGMAVAGGSGAPPFG 66
            :||||:||.|||||||||:.||.||||.|||||:|.:||..:..||                  |
  Rat    12 ERFSFEDSDRFEEDSLCSFISEAESLCQNWRGWRKQSAGPNSPTGG------------------G 58

  Fly    67 GAGASGSCTPGGNGTAMANTSTCGRHYEVSTLAELAARCVASYIPFELVEHVYPPVPEQLQLRIA 131
            |.|.||       ||.|       |...|..|.||:|:.||.:||||:||.||||||||||||||
  Rat    59 GGGGSG-------GTRM-------RDGLVIPLVELSAKQVAFHIPFEVVEKVYPPVPEQLQLRIA 109

  Fly   132 FWSFPDNEEDIRLYSCLANSSADEFNRGDSLFRLRAVKDPLQIGFHLSASVVNQ---TPRAYFNV 193
            |||||:|||||||||||||.|||||.|||.|||:|||||||||||||||:||..   .|:..:||
  Rat   110 FWSFPENEEDIRLYSCLANGSADEFQRGDQLFRMRAVKDPLQIGFHLSATVVPPQMVPPKGAYNV 174

  Fly   194 AVTFDRRRISSCNCTCTSSAYWCSHVVAVCLHRIHCPQEVCLRAPVSESLTRLQRDQLQKFAQYL 258
            ||.|||.|::||:|||.:.|.||:||||:||.|||....|||||||||||:||||||||||||||
  Rat   175 AVMFDRCRVTSCSCTCGAGAKWCTHVVALCLFRIHNASAVCLRAPVSESLSRLQRDQLQKFAQYL 239

  Fly   259 ISELPQQILPTAQRLLDELLSAQPTAINTVCGAPDPTAGASINDQTSWYLDEKTLHNNIKRILIK 323
            |||||||||||||||||||||:|.|||||||||||||||.|.:||::|||||.||.:|||:.|.|
  Rat   240 ISELPQQILPTAQRLLDELLSSQSTAINTVCGAPDPTAGPSASDQSTWYLDESTLTDNIKKTLHK 304

  Fly   324 FCLPAPIVFSDVN--YLTNSAPPAAAEWSSLLRPLRGREPEGMWNLLSIVREMYRRCDRNAVRLL 386
            ||.|:|:||||||  ||:::.|||||||:.||||||||||||:||||||||||::|.|.||..||
  Rat   305 FCGPSPVVFSDVNSMYLSSTEPPAAAEWACLLRPLRGREPEGVWNLLSIVREMFKRRDSNAAPLL 369

  Fly   387 EIITEECLYCDQILIWWFQTKLALMMGSHGHSGGKHSNTHSNSTALQHACSSLCDEIVALWRLAA 451
            ||:|::||..:||..||:..:.:   .||..:.|....::..|....|||:|:|||:|.|||||.
  Rat   370 EILTDQCLTYEQITGWWYSVRTS---ASHSSASGHTGRSNGQSEVAAHACASMCDEMVTLWRLAV 431

  Fly   452 LNPGLAPDERDMLHAQFTAWHLKILDRVVKSRMMPSYTNKHQQNSRSETELFIGFKPAIEACYLD 516
            |:|.|:|..|..|.||...|.||:::.|           |..|:.::...||.||:||:||||.:
  Rat   432 LDPALSPQRRRELCAQLRQWQLKVIENV-----------KRGQHKKTLERLFPGFRPAVEACYFN 485

  Fly   517 W-EGYPIPGVTHTHDTNPIYYSPFTCFKHTDLKGESNNPGQLNATQALMSNNKHYNYFSSSSDHG 580
            | |.||:||||::.....:    ..|:    .:.....||                        .
  Rat   486 WEEAYPLPGVTYSGTDRKL----ALCW----ARALPTRPG------------------------A 518

  Fly   581 MHAGAFKQRLDRPFRESRFYTNPA--DLDGGAALAGGGSG--------RFS------------TG 623
            ..:||.::...||..     |.||  ..:.||...|.|.|        |.|            :|
  Rat   519 SRSGALEESRPRPLP-----TEPAVRPKEPGAKRKGLGEGVSSQRGPRRLSAEGDKALHKMCPSG 578

  Fly   624 LGSVAVGGAGAGGLGQMSGGVNNSVGG-SAAAEVNPVQQQLPSGSAGVGASVTNAKVVVATDGNR 687
            ..:..:||.|:||......|....:.. .::.|.:..:..|...|..:||               
  Rat   579 AKAKVLGGPGSGGKSSAGSGSKRRLSSEDSSLEPDLAEMSLDDSSLALGA--------------- 628

  Fly   688 SSASSEGFCENDDFGGDTSSSHNYCPPGQAVVPGQKSALTESDSQSSFDA-VSHQSKDEPP---V 748
                     |...|||...|... ||| .|...|..:.|.|.......|| |......|||   .
  Rat   629 ---------EASTFGGFPESPPP-CPP-SAGSRGPSTFLPEPPDTYEEDAGVYFSEGPEPPTASA 682

  Fly   749 GGVGVAVGV----EQALSTSDTSSASSSSSSASTASGSSNSSTSSMLMAGQEATVGVGGAVQQTT 809
            |..|:..|.    :...||.|:.|....:..|:.|.|..:....:..::.|:   |.||      
  Rat   683 GRPGLLPGEVCTRDDLPSTDDSGSGLHKTKEAAPAVGEEDDDYQAYYLSAQD---GAGG------ 738

  Fly   810 RRLSKDESFSSSSDEFNQGGVGGSAGRVAMASSGSGSGAGDTVAVGSGSTAGGDLTPVPSTSAAA 874
                        .:|..:||.|                                           
  Rat   739 ------------EEEKAEGGTG------------------------------------------- 748

  Fly   875 RAALAASSTGPVISASPHLAASAAGGLGVLGVGADQPCTSSAHAARALAAAVAASSDKPHVFSNV 939
                                                                    ::..:|:.:
  Rat   749 --------------------------------------------------------EEHDLFAGL 757

  Fly   940 RP--TEDAWDILLARAEGLHAHGHGAEACILAVRLAEQMLANPPNLLLELPPAPKRKGKKQNVNP 1002
            :|  .|...::|.|.||.|||||:..||..|.|.||:.:|||||:|.:|.|||   ||||..|: 
  Rat   758 KPLEQESRMEVLFACAEALHAHGYSNEASRLTVELAQDLLANPPDLKVEPPPA---KGKKNKVS- 818

  Fly  1003 ISHQLTVVASATLSKCAFLCTVLSENSEHYHIGFRICLFALEMPRPPASTKPLEVKLANQEADIL 1067
             :.:.|.||:.||:|.|||.|||||..||:::.||:.:||||:.|||||||.||||||.||:::.
  Rat   819 -TSRQTWVATNTLTKAAFLLTVLSERPEHHNLAFRVGMFALELQRPPASTKALEVKLAYQESEVA 882

  Fly  1068 ALLKRLPLGSAELQVIRERAEQLRSGTFKTRGEALLPINLATFIFDALVTLSPLGGSTIVPGVAS 1132
            ||||::|.|.:|:..||.|||:||.||. .....:||:.||:||||.|  .:|         |.|
  Rat   883 ALLKKIPRGPSEMSTIRCRAEELREGTL-CDYRPVLPLMLASFIFDVL--CAP---------VVS 935

  Fly  1133 TSGVSSAAGKSMVNTGTRLLLYKHNSDESLGFDAAVAALGLKANVSEAEHPLLCEGTRRQRGDLA 1197
            .:| |....::..|        :...||.|||:|||||||:|..|||||||||||||||::||||
  Rat   936 LTG-SRPPSRNWSN--------EMPGDEELGFEAAVAALGMKTTVSEAEHPLLCEGTRREKGDLA 991

  Fly  1198 LTLLSHYKDEPRKIAKIMEKLLDRDIHTLLNAP-LLPAYYSSNPPVRTRSNQPTRREDHDYGGGS 1261
            |.|:..|||:..|:.||::|||||:..|  :.| .|.::|||:.|.......|::.       |:
  Rat   992 LALMITYKDDQAKLKKILDKLLDRESQT--HKPQTLSSFYSSSRPATANQRSPSKH-------GA 1047

  Fly  1262 GCASSNCNPVANLCELLPADYGSVGG---------------NSRPHSSTSAELELSMCALSMASS 1311
            ..|.....|:.: ....||..|:|.|               .|.|||...          .:...
  Rat  1048 PSAPGALQPLTS-SSAGPAQPGNVAGAGPAPTEGFTEKNVPESSPHSPCE----------GLPPE 1101

  Fly  1312 GSQSGGVQGMVPTTNAAGTTG-----------------------------TPSSSSTTVSGSQNP 1347
            .:.:...:|.||:..|.|:.|                             |.|.||.|:|.....
  Rat  1102 AALTPRPEGKVPSRLALGSRGGYNGRGWGSPGRPKKKHTGMASIDSSAPETTSDSSPTLSRRPLR 1166

  Fly  1348 NGNPSGSGGGGNG------------GGGNGGGGGGGGGGGGSTSSRSKESR-YKGKRA---YPSI 1396
            .|....|.|.|..            |..:..|.......||:.:...:..| |||:|.   .|.:
  Rat  1167 GGWAPASWGRGQDSDSISSSSSDSLGSSSSSGSRRASASGGARAKTVEVGRCYKGRRPESHAPHV 1231

  Fly  1397 PNQPSEASAHFMFELAKNVLTKAGGNSSTSLFTQASTSQNHHGPHRALHMCAFQLGLYALGLHNC 1461
            |||||||:|||.|||||.||.|||||||||:||..|:|..|.||||.||:|||::|||||||||.
  Rat  1232 PNQPSEAAAHFYFELAKTVLIKAGGNSSTSIFTHPSSSGGHQGPHRNLHLCAFEIGLYALGLHNF 1296

  Fly  1462 VSPNWLSRTYSSHVSWILGQAMEIGAPAISFLIDTWEAHLTPPEAAGMADRASRGWDSNMVYPAA 1526
            |||||||||||||||||.|||||||:.|::.|::.|:.||||||.|.:||||||..|||||..||
  Rat  1297 VSPNWLSRTYSSHVSWITGQAMEIGSAALTILVECWDGHLTPPEVASLADRASRARDSNMVRAAA 1361

  Fly  1527 ELALSVLPHAAALNPNEIQRAILQCKEQSDLMLERACLTVETAAKGGGVYPEVLFQVARYWYELY 1591
            |||||.||||.||||||||||::|||||.:||||:||:.||.|||||||||||||:||..|:.||
  Rat  1362 ELALSCLPHAHALNPNEIQRALVQCKEQDNLMLEKACMAVEEAAKGGGVYPEVLFEVAHQWFWLY 1426

  Fly  1592 MRNTPNNSEFEPHDDTMDHSAVSLSALIESQQQHELQQQQQAVQQQQAVQQQQQVVQQQQQVVQQ 1656
            ......:|       |....|.|.|.                                       
  Rat  1427 EETAGGSS-------TAREGAASCSG--------------------------------------- 1445

  Fly  1657 QQQLGMPNSVVPGGVGPGPGLPVAVQPPVVGSVQNPQAQFQPVGVASLAPLGLAQ-YPPYSFCQG 1720
                   :.:...|.| |.|||.....|  |:        :||.||:.|....|. .|..|....
  Rat  1446 -------SGMRAAGEG-GRGLPEGRGAP--GT--------EPVTVAAAAVTAAATVVPVISVGSS 1492

  Fly  1721 LYAHHHNMSYPPGQMQMFISAGPPPPPQAYGGYQQPPPQQPPNPQQQQQVVQQQVQQQQVVQQQQ 1785
            ||.       .||     :..|..|....|...|   |..|.:||                    
  Rat  1493 LYP-------GPG-----LGHGHSPGLHPYTALQ---PHLPCSPQ-------------------- 1522

  Fly  1786 QQVQMAGQAPPGHPGQQGHPGQP-----PSGFQPQPPPGAF------QALPPQAYQAMQAGPPGP 1839
               .:...|.|.||  ..|..:|     ||...||....||      .::.|.:..|.....|.|
  Rat  1523 ---YLTHPAHPAHP--MPHMPRPAVFPVPSSAYPQGVHPAFLGAQYPYSVTPPSLAATAVSFPVP 1582

  Fly  1840 PMGPPQGYYGPPPPPPPNGPPGVGVGVGVGVGVGVMPMRQHQHQHPVYPFMQQAPPQPPQQQQPP 1904
            .|.|...:       |.:..||:.:...|.:        ...|....:|.:|.| ..|....||.
  Rat  1583 SMAPITVH-------PYHTEPGLPLPTSVAL--------SSVHPASTFPAIQGA-SLPALSTQPS 1631

  Fly  1905 P-----SQPPVRQRQPHQFTPTQLRYLLAAYNVGMLAMETLARRVHDDRPQAKYARNPPYGEDVK 1964
            |     ..||..:......:|..|.:|.|||.|||||:|.|.||.|:|.|. .::|:|||.:|||
  Rat  1632 PLVSGGFPPPEEETHSQPVSPHSLHHLHAAYRVGMLALEMLGRRAHNDHPN-NFSRSPPYTDDVK 1695

  Fly  1965 WLLRISKKLGTQY 1977
            |||.::.|||.::
  Rat  1696 WLLGLAAKLGDRH 1708

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
DoraNP_001356949.1 SWIM 138..>276 CDD:443750 108/140 (77%)
Zswim8XP_063130443.1 None

Return to query results.
Submit another query.