DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Cadps and Cadps2

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001245439.1 Gene:Cadps / 49968 FlyBaseID:FBgn0053653 Length:1534 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_006236209.1 Gene:Cadps2 / 312166 RGDID:1559440 Length:1312 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1507 Identity:783/1507 - (51%)
Similarity:997/1507 - (66%) Gaps:237/1507 - (15%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MIDPSSSEEEGEDDAVPNVSSKGRLTNTTKGTSAVSIIGGSAGSVVGSNIPVSGSNTDLIGNQRQ 65
            |:||||||||.::    .:..:.|......|                             |:|| 
  Rat     1 MLDPSSSEEESDE----GLEEESREVLVAPG-----------------------------GSQR- 31

  Fly    66 SNISSICNRNDVGNISVAALGSTSNKIEQICGNRADTGNLEVPSNGIPSGISQETLNQSVGSSRA 130
                              |..:|:.:           |..:.|...              |....
  Rat    32 ------------------APPATARE-----------GRRDAPGRS--------------GGGGG 53

  Fly   131 NSLPRPLSPSPSLTSEKHETAEPHGKHEREEEERKRRIQLYVFISRCISYPFNAKQPTDMTKRQT 195
            ....||:|||||:.||..:  ||..:.: ||:||:.|:|||||:.|||:|||||||||||.:||.
  Rat    54 GGAARPVSPSPSVLSEGRD--EPERQLD-EEQERRIRLQLYVFVVRCIAYPFNAKQPTDMARRQQ 115

  Fly   196 KISKQQLEIITQRFQAFLKGETQIMADEAFQNAVQSYHDVFLKSERVLKMVQSGASSQHDFREVF 260
            |::||||:::.:||||||.|||||:|||||.|||:||::|||||:||.:|||||....:||||||
  Rat   116 KLNKQQLQLLKERFQAFLNGETQIVADEAFCNAVRSYYEVFLKSDRVARMVQSGGCCANDFREVF 180

  Fly   261 RNNIEKRVRSLPEIDGLSKETVLTSWMAKFDIILKGTGEED-SKRPSRMQQSLNSELILSKEQLY 324
            :.|||||||||||||||||||||:||:||:|.|.:  |||| .|:|:||..|..|||||||||||
  Rat   181 KKNIEKRVRSLPEIDGLSKETVLSSWIAKYDAIYR--GEEDLCKQPNRMTLSAVSELILSKEQLY 243

  Fly   325 DMFQQILLVKKFEHQILFNALMLDSADEQAAAIRRELDGRMQRVGEMEKNRKLMPKFVLKEMESL 389
            :||||||.:||.|||:|:||..||:||||||.||||||||:|...:|.|.|: .|:|:.||||::
  Rat   244 EMFQQILGIKKLEHQLLYNACQLDNADEQAAQIRRELDGRLQLAEKMAKERR-FPQFISKEMETM 307

  Fly   390 YVEELKSSINLLMANLESLPVSKGNMDSKYGLQKLKRYNHSTPSFLKLILRSHGSLSKLEGDSED 454
            |:|||::|:|||||||||||||||..:.|  ||||||..:|  :||.|            ||  :
  Rat   308 YIEELRASVNLLMANLESLPVSKGGPEFK--LQKLKRSQNS--AFLDL------------GD--E 354

  Fly   455 GSTQLTKLDVVLTFQLEVIVMEVKGLKSLAPNRIVYCTMEVENGEKLQTDQAEASKPMWDTQGDF 519
            ...||:|.||||:|.||:::|||:||||:|||||||||||||.||||||||||||:|.|.|||||
  Rat   355 NEIQLSKSDVVLSFTLEIVIMEVQGLKSVAPNRIVYCTMEVEGGEKLQTDQAEASRPQWGTQGDF 419

  Fly   520 TTTHPLPVVKVKLYTENPGMLALEDKELGKVTLKPTPLSSKSPEWHRMIVPKNLPDQDIRIKIAC 584
            :||||.|||||||:||:.|:|||||||||:|.|.||..||||.|.|||:||||..|.|::||:|.
  Rat   420 STTHPRPVVKVKLFTESTGVLALEDKELGRVVLYPTSNSSKSAELHRMVVPKNSQDSDLKIKLAV 484

  Fly   585 RLDKPLNMKHCGYLYAIGKSVWKKWKRRYFVLVQVSQYTFAMCSYKEKKSEPSEMMQLDGYTVDY 649
            |:|||.:|||.|||||:|:.|||:||:||||||||||||||||||:||||||.|:|||:||||||
  Rat   485 RMDKPPHMKHSGYLYALGQKVWKRWKKRYFVLVQVSQYTFAMCSYREKKSEPQELMQLEGYTVDY 549

  Fly   650 IEAASANLMFGIDLNGGRYFFNAVREGDSISFACDDENECSLWVMAMYRATGQSHKPTPPITQDK 714
            .:....       |.||:.|||||:|||::.||.|||.:..|||.|||||||||:||.|.:...|
  Rat   550 TDPHPG-------LQGGQVFFNAVKEGDTVIFASDDEQDRILWVQAMYRATGQSYKPVPAVQSQK 607

  Fly   715 NS-------AMSKIQG-DADKARKHGMEDFISTDPCTFDHATLFKTLQNLTLEYRLNDPYASLGW 771
            .:       |.:::.| |||:.:||||::|||..||..|||.||:.||..||::||||.|:.|||
  Rat   608 LNPKGGTLHADAQLFGKDADRFQKHGMDEFISASPCKLDHAFLFRILQRQTLDHRLNDSYSCLGW 672

  Fly   772 FSPGQVFVLDEYCARYGVRGCYRHLCYLSDLLDRAEKQHMIDPTLIHYSFAFCASHVHGNRPDGV 836
            |||||||||||||||||||||:||||||::|::.:|...:|||||:||||||||||||||||||:
  Rat   673 FSPGQVFVLDEYCARYGVRGCHRHLCYLTELMEHSENGAVIDPTLLHYSFAFCASHVHGNRPDGI 737

  Fly   837 GSITHEEKEKFSEIKERLRQLLEFQITNFRYCFPFGRPEGALKATLSLLERVLMKDIVTPVPPEE 901
            |:::.||||:|.|||:||..|||.||::|||||||||||||||||||||||||||||.||:|.||
  Rat   738 GTVSVEEKERFEEIKDRLSSLLENQISHFRYCFPFGRPEGALKATLSLLERVLMKDIATPIPAEE 802

  Fly   902 VRQMIKKSLETAALVNYTRLSNKAKID-----EDLRGDVIVPAPKKLEDLIHLAELCVDLLQQNE 961
            |:::::|.||.|||:|||||:..|||:     |....:...|| :|||:::||||||:::|||||
  Rat   803 VKKVVRKCLEKAALINYTRLTEYAKIEGPAEKETETMNQATPA-RKLEEVLHLAELCIEVLQQNE 866

  Fly   962 EHYGELRKHDKMDKKKLLKEDEDVSGGHNESEVDLIDSTGLISASELATAASTDGSSFRYCMPTH 1026
            ||:.|.|:                                                         
  Rat   867 EHHAEGRE--------------------------------------------------------- 874

  Fly  1027 AVYTPPVPTAFAWFSDLLVEHAEIFWSLFAVDMDRVLSEQAPDTWDSFPLFQILNDYLRTDDNLR 1091
                     ||||:.|||.||||.||:||.||||..|..|..|:|:||||||:||::||.|..|.
  Rat   875 ---------AFAWWPDLLAEHAEKFWALFTVDMDTALEAQPQDSWESFPLFQLLNNFLRNDTLLC 930

  Fly  1092 NGRFHQHLRDTFAPLVVRYVDLMESSIAQSIHKGFEKERWESKGINAALNPAALNNAAQALNTAA 1156
            ||:||:||::.|.||||||||||||:||||||:|||:|.|:           .:.|.|.:|...|
  Rat   931 NGKFHKHLQEIFVPLVVRYVDLMESAIAQSIHRGFEQETWQ-----------PVKNIANSLPNVA 984

  Fly  1157 LN--PSMILCGKKDQVNFYVPKLPKQSNS--TAANDEMRNGCATSEDLFWKLDALQSFIRDLHWP 1217
            |.  ||:.|         .:|::|..|..  .|:..|..||.||||||||||||||.|:.|||||
  Rat   985 LPKVPSLPL---------NLPQIPSFSTPPWMASLYESTNGSATSEDLFWKLDALQMFVFDLHWP 1040

  Fly  1218 DAEFRQHLEQRLKMMAVDMIEQCIQRTDSSFQSWLKKNIAFISTDYILPSEMCAMVNVILDAKNQ 1282
            :.||..|||||||:||.||||.|::||.::|:..|:|  |..:||..:|:.:|.|.||::|||.|
  Rat  1041 EQEFAHHLEQRLKLMASDMIEACVKRTRTAFELKLQK--ANKTTDLRIPASVCTMFNVLVDAKKQ 1103

  Fly  1283 SFKLTTIDGIDLY-----KFHAKIDDQIDKANVAMTQGLSGKLMSVLESTLSKLARYDEGSLIGS 1342
            |.||..:||...:     ::|:||||.||.....:...|..|.:||||..||||:|||||:...|
  Rat  1104 STKLCALDGGQEFGNQWQQYHSKIDDLIDNTVKEVIALLVSKFVSVLEGVLSKLSRYDEGTFFSS 1168

  Fly  1343 ILSFT--------NVSSSGKDLGQGYVNFFRNNMDQVRGKIADDLWTLHFFEQWYSQQINMLCNW 1399
            |||||        :|...|.||...|:.|.|.|.|.:|.|:.::::....|:||||..:.::|.|
  Rat  1169 ILSFTVKAAAKYVDVPKPGMDLADTYIMFVRQNQDILREKVNEEMYIEKLFDQWYSNSMKVICVW 1233

  Fly  1400 LSERVDHALHYAQVASISHIIKKIYSDFELQGVLEDKLNSKAYQAVAQRMATEEATCA------- 1457
            |::|:|..||..|:.::..|:||.|.||.||||||..||||.|..:.:|:..||||.:       
  Rat  1234 LADRLDLQLHIYQLKTLIKIVKKTYRDFRLQGVLEGTLNSKTYDTLHRRLTVEEATASVSEGGGL 1298

  Fly  1458 --LTMPDACEDE 1467
              :||.|:.|:|
  Rat  1299 QGITMKDSDEEE 1310

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CadpsNP_001245439.1 PH_CADPS 585..711 CDD:269940 83/125 (66%)
PH 593..699 CDD:278594 69/105 (66%)
DUF1041 904..1066 CDD:283860 55/166 (33%)
Cadps2XP_006236209.1 C2 369..452 CDD:214577 65/82 (79%)
PH_CADPS 485..604 CDD:269940 83/125 (66%)
PH 493..592 CDD:278594 69/105 (66%)
DUF1041 805..905 CDD:283860 55/166 (33%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C166341048
Domainoid 1 1.000 530 1.000 Domainoid score I277
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 1 1.050 1422 1.000 Inparanoid score I108
OMA 1 1.010 - - QHG48904
OrthoDB 1 1.010 - - D138870at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0004367
OrthoInspector 1 1.000 - - otm44625
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_105391
Panther 1 1.100 - - O PTHR12166
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X3090
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1312.910

Return to query results.
Submit another query.