DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment SCAPER and Scaper

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_047288576.1 Gene:SCAPER / 49855 HGNCID:13081 Length:1431 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001074810.1 Gene:Scaper / 244891 MGIID:1925976 Length:1398 Species:Mus musculus


Alignment Length:1373 Identity:1198/1373 - (87%)
Similarity:1258/1373 - (91%) Gaps:12/1373 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human    61 ENLKNDGKPKCQTGGKSKRTIQGTHKTTKQSTAVDCKITSSTTGDKHFDKSPTKTRHPRKIDLRA 125
            |:..:|||||||||||||||||||||||||:|||:|||| ||||:||||||||||||||||||||
Mouse    36 ESKDDDGKPKCQTGGKSKRTIQGTHKTTKQNTAVECKIT-STTGEKHFDKSPTKTRHPRKIDLRA 99

Human   126 RYWAFLFDNLRRAVDEIYVTCESDQSVVECKEVLMMLDNYVRDFKALIDWIQLQEKLEKTDAQSR 190
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Mouse   100 RYWAFLFDNLRRAVDEIYVTCESDQSVVECKEVLMMLDYYVRDFKALIDWIQLQEKLEKTDAQSR 164

Human   191 PTSLAWEVKKMSPGRHVIPSPSTDRINVTSNARRSLNFGGSTGTVPAPRLAPTGVSWADKVKAHH 255
            ||||||||||||||||||.||||||:||||.||||||||...|.|.||.||||||||||||||||
Mouse   165 PTSLAWEVKKMSPGRHVIQSPSTDRMNVTSTARRSLNFGSLPGAVTAPCLAPTGVSWADKVKAHH 229

Human   256 TGSTASSEITPAQSCPPMTVQKASRKNERKDAEGWETVQRGRPIRSRSTAVMPKVSLATEATRSK 320
            ||| |..|.||||||.||||||.||||||||||||||||||||:|||||||:|||||.||..|||
Mouse   230 TGS-APPEATPAQSCAPMTVQKTSRKNERKDAEGWETVQRGRPVRSRSTAVIPKVSLVTETLRSK 293

Human   321 DDSDKENVCLLPDESIQKGQFVGDGTSNTIESHPKDS-LHSCDHPLAEKTQFTVSTLDDVKNSGS 384
            |||||||:||||:||||||:.  :...:|:||..||| |||.||||:|:|||||..|||||||||
Mouse   294 DDSDKENICLLPEESIQKGKL--EDRCSTVESLSKDSLLHSSDHPLSERTQFTVCILDDVKNSGS 356

Human   385 IRDNYVRTSEISAVHIDTECVSVMLQAGTPPLQVNEEKFPAEKARIENEM-DPSDISNVSAANLS 448
            .:|:.|.||||.|:..|..||:.......|     .::.|||...:..|| |||||||||||:.|
Mouse   357 SQDSSVHTSEIPAIDSDAVCVAPQNTTALP-----TDRVPAETTGMVTEMTDPSDISNVSAADWS 416

Human   449 MAEVLAKKEELADRLEKANEEAIASAIAEEEQLTREIEAEENNDINIETDNDSDFSASMGSGSVS 513
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|
Mouse   417 MAEVLAKKEELADRLEKANEEAIASAIAEEEQLTREIEAEENNDINIETDNDSDFSASMGSGSLS 481

Human   514 FCGMSMDWNDVLADYEARESWRQNTSWGDIVEEEPARPPGHGIHMHEKLSSPSRKRTIAESKKKH 578
            |||:|:|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||:
Mouse   482 FCGVSLDWNDVLADYEARESWRQNTSWGDIVEEEPARLPGHGIHMHEKLSSPSRKRTIAESKKKY 546

Human   579 EEKQMKAQQLREKLREEKTLKLQKLLEREKDVRKWKEELLDQRRRMMEEKLLHAEFKREVQLQAI 643
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   547 EEKHMKAQQLREKLREEKTLKLQKLLEREKDVRKWKEELLDQRRRMMEEKLLHAEFKREVQLQAI 611

Human   644 VKKAQEEEAKVNEIAFINTLEAQNKRHDVLSKLKEYEQRLNELQEERQRRQEEKQARDEAVQERK 708
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   612 VKKAQEEEAKVNEIAFINTLEAQNKRHDVLSKLKEYEQRLNELQEERQRRQEEKQARDEAVQERK 676

Human   709 RALEAERQARVEELLMKRKEQEARIEQQRQEKEKAREDAARERARDREERLAALTAAQQEAMEEL 773
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   677 RALEAERQARVEELLMKRKEQEARIEQQRQEKEKAREDAARERARDREERLAALTAAQQEAMEEL 741

Human   774 QKKIQLKHDESIRRHMEQIEQRKEKAAELSSGRHANTDYAPKLTPYERKKQCSLCNVLISSEVYL 838
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||:|||||
Mouse   742 QKKIQLKHDESIRRHMEQIEQRKEKAAELSSGRHASTDYAPKLTPYERKKQCSLCNVLIASEVYL 806

Human   839 FSHVKGRKHQQAVRENTSIQGRELSDEEVEHLSLKKYIIDIVVESTAPAEALKDGEERQKNKKKA 903
            |||:||:|||||||||:||||||||||||||||||||::|||:||.||.|.:|||||||||||||
Mouse   807 FSHIKGKKHQQAVRENSSIQGRELSDEEVEHLSLKKYVVDIVIESAAPPEPVKDGEERQKNKKKA 871

Human   904 KKIKARMNFRAKEYESLMETKNSGSDSPYKAKLQRLAKDLLKQVQVQDSGSWANNKVSALDRTLG 968
            ||||||||.||||||:|:|||||||:||||||||||.|||:||:||||||||.|||.||||||||
Mouse   872 KKIKARMNIRAKEYENLVETKNSGSESPYKAKLQRLTKDLVKQLQVQDSGSWVNNKASALDRTLG 936

Human   969 EITRILEKENVADQIAFQAAGGLTALEHILQAVVPATNVNTVLRIPPKSLCNAINVYNLTCNNCS 1033
            ||.||||||||.|||:||.||||||||:|||.|.||||:|||.||||||||||||||:|.|||||
Mouse   937 EIARILEKENVPDQISFQVAGGLTALENILQVVTPATNMNTVSRIPPKSLCNAINVYSLACNNCS 1001

Human  1034 ENCSDVLFSNKITFLMDLLIHQLTVYVPDENNTILGRNTNKQVFEGLTTGLLKVSAVVLGCLIAN 1098
            |||:||||||||||||||||||||||||||||.:||||||||||||||||||:..|||..|||||
Mouse  1002 ENCTDVLFSNKITFLMDLLIHQLTVYVPDENNAVLGRNTNKQVFEGLTTGLLRAGAVVFSCLIAN 1066

Human  1099 RPDGNCQPATPKIPTQEMKNKPSQGDPFNNRVQDLISYVVNMGLIDKLCACFLSVQGPVDENPKM 1163
            |||||.:||||||.||||||||||||.||:||||||||||||||||:|..|||||||||||||||
Mouse  1067 RPDGNSRPATPKISTQEMKNKPSQGDAFNSRVQDLISYVVNMGLIDRLHGCFLSVQGPVDENPKM 1131

Human  1164 AIFLQHAAGLLHAMCTLCFAVTGRSYSIFDNNRQDPTGLTAALQATDLAGVLHMLYCVLFHGTIL 1228
            |.|||||||.|..||.|||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||:||||||.
Mouse  1132 ATFLQHAAGFLRGMCMLCFAVTGRSSSIFDNNHQDPTGLTAALQATDLAGVLHMLYCILFHGTIS 1196

Human  1229 DPSTASPKENYTQNTIQVAIQSLRFFNSFAALHLPAFQSIVGAEGLSLAFRHMASSLLGHCSQVS 1293
            |..| |||::||||||||||||||||||||.|.|.||||:|||||||||||||||||||||||||
Mouse  1197 DAGT-SPKDSYTQNTIQVAIQSLRFFNSFAILDLSAFQSVVGAEGLSLAFRHMASSLLGHCSQVS 1260

Human  1294 CESLLHEVIVCVGYFTVNHPDNQVIVQSGRHPTVLQKLCQLPFQYFSDPRLIKVLFPSLIAACYN 1358
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||:|
Mouse  1261 CESLLHEVIVCVGYFTVNHPDNQVIVQSGRHPTVLQKLCQLPFQYFSDPRLIKVLFPSLITACHN 1325

Human  1359 NHQNKIILEQEMSCVLLATFIQDLAQTPGQAENQPYQPKGKCLGSQDYLELANRFPQQAWEEARQ 1423
            |||||:|||||||||||||||||.|||||..:||....|||.....:||||||||||||||||||
Mouse  1326 NHQNKLILEQEMSCVLLATFIQDFAQTPGHVDNQSSSLKGKFQNPGNYLELANRFPQQAWEEARQ 1390

Human  1424 FFLKKEKK 1431
            ||||||||
Mouse  1391 FFLKKEKK 1398

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
SCAPERXP_047288576.1 SCAPER_N 114..211 CDD:406813 94/96 (98%)
SMC_N <370..742 CDD:481474 327/372 (88%)
Smc <568..>802 CDD:440809 231/233 (99%)
ZnF_U1 821..853 CDD:197732 28/31 (90%)
ScaperNP_001074810.1 SCAPER_N 88..185 CDD:406813 94/96 (98%)
Smc <536..>784 CDD:440809 244/247 (99%)
ZnF_U1 789..821 CDD:197732 28/31 (90%)

Return to query results.
Submit another query.