DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment OPA1 and Opa1

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_047304162.1 Gene:OPA1 / 4976 HGNCID:8140 Length:1047 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001420836.1 Gene:Opa1 / 171116 RGDID:708423 Length:1015 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:994 Identity:951/994 - (95%)
Similarity:970/994 - (97%) Gaps:0/994 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MWRLRRAAVACEVCQSLVKHSSGIKGSLPLQKLHLVSRSIYHSHHPTLKLQRPQLRTSFQQFSSL 65
            |||..|||:||||||||||||||::.::|||||||||||||.||||.||||||||||||||||||
  Rat     1 MWRAGRAALACEVCQSLVKHSSGVQRNVPLQKLHLVSRSIYRSHHPALKLQRPQLRTSFQQFSSL 65

Human    66 TNLPLRKLKFSPIKYGYQPRRNFWPARLATRLLKLRYLILGSAVGGGYTAKKTFDQWKDMIPDLS 130
            |||.|.|||.||.||||||||||||||||.|||||||:|||||||||||||||||:|||||||||
  Rat    66 TNLSLHKLKLSPTKYGYQPRRNFWPARLAARLLKLRYIILGSAVGGGYTAKKTFDEWKDMIPDLS 130

Human   131 EYKWIVPDIVWEIDEYIDFEKIRKALPSSEDLVKLAPDFDKIVESLSLLKDFFTSGHKLVSEVIG 195
            :|||||||.:||||||||.|||||||||||||...|||.|||.|||||||||||:|.|||||||.
  Rat   131 DYKWIVPDFIWEIDEYIDLEKIRKALPSSEDLANFAPDLDKIAESLSLLKDFFTAGPKLVSEVIE 195

Human   196 ASDLLLLLGSPEETAFRATDRGSESDKHFRKGLLGELILLQQQIQEHEEEARRAAGQYSTSYAQQ 260
            ||:.|||||:|.||||||||.|||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 ASEPLLLLGTPGETAFRATDHGSESDKHYRKGLLGELILLQQQIQEHEEEARRAAGQYSTSYAQQ 260

Human   261 KRKVSDKEKIDQLQEELLHTQLKYQRILERLEKENKELRKLVLQKDDKGIHHRKLKKSLIDMYSE 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 KRKVSDKEKIDQLQEELLHTQLKYQRILERLEKENKELRKLVLQKDDKGIHHRKLKKSLIDMYSE 325

Human   326 VLDVLSDYDASYNTQDHLPRVVVVGDQSAGKTSVLEMIAQARIFPRGSGEMMTRSPVKVTLSEGP 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 VLDVLSDYDASYNTQDHLPRVVVVGDQSAGKTSVLEMIAQARIFPRGSGEMMTRSPVKVTLSEGP 390

Human   391 HHVALFKDSSREFDLTKEEDLAALRHEIELRMRKNVKEGCTVSPETISLNVKGPGLQRMVLVDLP 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 HHVALFKDSSREFDLTKEEDLAALRHEIELRMRKNVKEGCTVSPETISLNVKGPGLQRMVLVDLP 455

Human   456 GVINTVTSGMAPDTKETIFSISKAYMQNPNAIILCIQDGSVDAERSIVTDLVSQMDPHGRRTIFV 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 GVINTVTSGMAPDTKETIFSISKAYMQNPNAIILCIQDGSVDAERSIVTDLVSQMDPHGRRTIFV 520

Human   521 LTKVDLAEKNVASPSRIQQIIEGKLFPMKALGYFAVVTGKGNSSESIEAIREYEEEFFQNSKLLK 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   521 LTKVDLAEKNVASPSRIQQIIEGKLFPMKALGYFAVVTGKGNSSESIEAIREYEEEFFQNSKLLK 585

Human   586 TSMLKAHQVTTRNLSLAVSDCFWKMVRESVEQQADSFKATRFNLETEWKNNYPRLRELDRNELFE 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   586 TSMLKAHQVTTRNLSLAVSDCFWKMVRESVEQQADSFKATRFNLETEWKNNYPRLRELDRNELFE 650

Human   651 KAKNEILDEVISLSQVTPKHWEEILQQSLWERVSTHVIENIYLPAAQTMNSGTFNTTVDIKLKQW 715
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   651 KAKNEILDEVISLSQVTPKHWEEILQQSLWERVSTHVIENIYLPAAQTMNSGTFNTTVDIKLKQW 715

Human   716 TDKQLPNKAVEVAWETLQEEFSRFMTEPKGKEHDDIFDKLKEAVKEESIKRHKWNDFAEDSLRVI 780
            ||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   716 TDKQLPNKAVEVAWETLQDEFSRFMTEPKGKEHDDIFDKLKEAVKEESIKRHKWNDFAEDSLRVI 780

Human   781 QHNALEDRSISDKQQWDAAIYFMEEALQARLKDTENAIENMVGPDWKKRWLYWKNRTQEQCVHNE 845
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||:||||||||:||||||||||||||
  Rat   781 QHNALEDRSISDKQQWDAAIYFMEEALQGRLKDTENAIENMIGPDWKKRWIYWKNRTQEQCVHNE 845

Human   846 TKNELEKMLKCNEEHPAYLASDEITTVRKNLESRGVEVDPSLIKDTWHQVYRRHFLKTALNHCNL 910
            ||||||||||.|:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   846 TKNELEKMLKVNDEHPAYLASDEITTVRKNLESRGVEVDPSLIKDTWHQVYRRHFLKTALNHCNL 910

Human   911 CRRGFYYYQRHFVDSELECNDVVLFWRIQRMLAITANTLRQQLTNTEVRRLEKNVKEVLEDFAED 975
            ||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   911 CRRGFYYYQRHFIDSELECNDVVLFWRIQRMLAITANTLRQQLTNTEVRRLEKNVKEVLEDFAED 975

Human   976 GEKKIKLLTGKRVQLAEDL 994
            ||||:||||||||||||||
  Rat   976 GEKKVKLLTGKRVQLAEDL 994

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
OPA1XP_047304162.1 DLP_1 342..616 CDD:206738 273/273 (100%)
OPA1_C 672..994 CDD:466080 313/321 (98%)
Opa1NP_001420836.1 DLP_1 342..616 CDD:206738 273/273 (100%)
OPA1_C 672..1015 CDD:466080 315/323 (98%)

Return to query results.
Submit another query.