DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment OGDH and Ogdh

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001425936.1 Gene:OGDH / 4967 HGNCID:8124 Length:1038 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_038948146.1 Gene:Ogdh / 360975 RGDID:1561359 Length:1038 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1038 Identity:1000/1038 - (96%)
Similarity:1016/1038 - (97%) Gaps:0/1038 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MFHLRTCAAKLRPLTASQTVKTFSQNRPAAARTFQQIRCYSAPVAAEPFLSGTSSNYVEEMYCAW 65
            ||||||||||||||||||||||||||:|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MFHLRTCAAKLRPLTASQTVKTFSQNKPAAIRTFQQIRCYSAPVAAEPFLSGTSSNYVEEMYCAW 65

Human    66 LENPKSVHKSWDIFFRNTNAGAPPGTAYQSPLPLSRGSLAAVAHAQSLVEAQPNVDKLVEDHLAV 130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||.:|||||||||||||||||||||||
  Rat    66 LENPKSVHKSWDIFFRNTNAGAPPGTAYQSPLSLSRSSLATMAHAQSLVEAQPNVDKLVEDHLAV 130

Human   131 QSLIRAYQIRGHHVAQLDPLGILDADLDSSVPADIISSTDKLDLAVFKERLRMLTVGGFYGLDES 195
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
  Rat   131 QSLIRAYQIRGHHVAQLDPLGILDADLDSSVPADIISSTDKLDLAVFKERLRMLTVGGFYGLHES 195

Human   196 DLDKVFHLPTTTFIGGQESALPLREIIRRLEMAYCQHIGVEFMFINDLEQCQWIRQKFETPGIMQ 260
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 DLDKVFHLPTTTFIGGQEPALPLREIIRRLEMAYCQHIGVEFMFINDLEQCQWIRQKFETPGIMQ 260

Human   261 FTNEEKRTLLARLVRSTRFEEFLQRKWSSEKRFGLEGCEVLIPALKTIIDKSSENGVDYVIMGMP 325
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||
  Rat   261 FTNEEKRTLLARLVRSTRFEEFLQRKWSSEKRFGLEGCEVLIPALKTIIDMSSANGVDYVIMGMP 325

Human   326 HRGRLNVLANVIRKELEQIFCQFDSKLEAADEGSGDVKYHLGMYHRRINRVTDRNITLSLVANPS 390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 HRGRLNVLANVIRKELEQIFCQFDSKLEAADEGSGDMKYHLGMYHRRINRVTDRNITLSLVANPS 390

Human   391 HLEAADPVVMGKTKAEQFYCGDTEGKKVMSILLHGDAAFAGQGIVYETFHLSDLPSYTTHGTVHV 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 HLEAADPVVMGKTKAEQFYCGDTEGKKVMSILLHGDAAFAGQGIVYETFHLSDLPSYTTHGTVHV 455

Human   456 VVNNQIGFTTDPRMARSSPYPTDVARVVNAPIFHVNSDDPEAVMYVCKVAAEWRSTFHKDVVVDL 520
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||
  Rat   456 VVNNQIGFTTDPRMARSSPYPTDVARVVNAPIFHVNSDDPEAVMYVCKVAAEWRNTFHKDVVVDL 520

Human   521 VCYRRNGHNEMDEPMFTQPLMYKQIRKQKPVLQKYAELLVSQGVVNQPEYEEEISKYDKICEEAF 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   521 VCYRRNGHNEMDEPMFTQPLMYKQIRKQKPVLQKYAELLVSQGVVNQPEYEEEISKYDKICEEAF 585

Human   586 ARSKDEKILHIKHWLDSPWPGFFTLDGQPRSMSCPSTGLTEDILTHIGNVASSVPVENFTIHGGL 650
            .|||||||||||||||||||||||||||||||:||||||.|||||||||||||||||||||||||
  Rat   586 TRSKDEKILHIKHWLDSPWPGFFTLDGQPRSMTCPSTGLEEDILTHIGNVASSVPVENFTIHGGL 650

Human   651 SRILKTRGEMVKNRTVDWALAEYMAFGSLLKEGIHIRLSGQDVERGTFSHRHHVLHDQNVDKRTC 715
            |||||||.|:|.|||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   651 SRILKTRRELVTNRTVDWALAEYMAFGSLLKEGIHVRLSGQDVERGTFSHRHHVLHDQNVDKRTC 715

Human   716 IPMNHLWPNQAPYTVCNSSLSEYGVLGFELGFAMASPNALVLWEAQFGDFHNTAQCIIDQFICPG 780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|.||||||||||||
  Rat   716 IPMNHLWPNQAPYTVCNSSLSEYGVLGFELGFAMASPNALVLWEAQFGDFNNMAQCIIDQFICPG 780

Human   781 QAKWVRQNGIVLLLPHGMEGMGPEHSSARPERFLQMCNDDPDVLPDLKEANFDINQLYDCNWVVV 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|:|.||||:|||||||:||
  Rat   781 QAKWVRQNGIVLLLPHGMEGMGPEHSSARPERFLQMCNDDPDVLPNLQEENFDISQLYDCNWIVV 845

Human   846 NCSTPGNFFHVLRRQILLPFRKPLIIFTPKSLLRHPEARSSFDEMLPGTHFQRVIPEDGPAAQNP 910
            |||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||
  Rat   846 NCSTPGNFFHVLRRQILLPFRKPLIVFTPKSLLRHPEARTSFDEMLPGTHFQRVIPEDGPAAQNP 910

Human   911 ENVKRLLFCTGKVYYDLTRERKARDMVGQVAITRIEQLSPFPFDLLLKEVQKYPNAELAWCQEEH 975
            :.||||||||||||||||||||||||..:||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
  Rat   911 DKVKRLLFCTGKVYYDLTRERKARDMAEEVAITRIEQLSPFPFDLLLKEAQKYPNAELAWCQEEH 975

Human   976 KNQGYYDYVKPRLRTTISRAKPVWYAGRDPAAAPATGNKKTHLTELQRLLDTAFDLDVFKNFS 1038
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||
  Rat   976 KNQGYYDYVKPRLRTTIDRAKPVWYAGRDPAAAPATGNKKTHLTELQRFLDTAFDLDAFKKFS 1038

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
OGDHNP_001425936.1 None
OgdhXP_038948146.1 SucA 49..1031 CDD:440333 947/981 (97%)

Return to query results.
Submit another query.