DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment SERCA and si:dkey-28b4.8

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_726381.1 Gene:SERCA / 49297 FlyBaseID:FBgn0263006 Length:1020 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_684227.1 Gene:si:dkey-28b4.8 / 562640 ZFINID:ZDB-GENE-090501-2 Length:1056 Species:Danio rerio


Alignment Length:996 Identity:680/996 - (68%)
Similarity:819/996 - (82%) Gaps:7/996 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MEDGHSKTVEQSLNFFGTDPERGLTLDQIKANQKKYGPNELPTEEGKSIWQLVLEQFDDLLVKIL 65
            |::.|:||||:.|.:|..:...||:.:|::.:::::||||||.|||||:|:||||||:||||:||
Zfish     1 MDNAHTKTVEEVLGYFSVNETTGLSSEQLRKSRERWGPNELPAEEGKSLWELVLEQFEDLLVRIL 65

  Fly    66 LLAAIISFVLALFEEHEETFTAFVEPLVILLILIANAVVGVWQERNAESAIEALKEYEPEMGKVV 130
            ||||.|||.||.|||.|.|.||||||.||||||||||:||||||||||:||||||:||||||||.
Zfish    66 LLAACISFTLAWFEEGEGTITAFVEPFVILLILIANAIVGVWQERNAENAIEALKQYEPEMGKVY 130

  Fly   131 RQDKSGIQKVRAKEIVPGDLVEVSVGDKIPADIRITHIYSTTLRIDQSILTGESVSVIKHTDAIP 195
            |||:..:|:|||::|||||:|||:||||:|||||:|.|.|||||:||||||||||||:||||.:|
Zfish   131 RQDRKSVQRVRARDIVPGDIVEVAVGDKVPADIRLTSIRSTTLRVDQSILTGESVSVLKHTDPVP 195

  Fly   196 DPRAVNQDKKNILFSGTNVAAGKARGVVIGTGLSTAIGKIRTEMSETEEIKTPLQQKLDEFGEQL 260
            |||||||||||:||||||:|||:|.|||:.||:.|.|||||.||:.|:..:||||||||:|||||
Zfish   196 DPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGRAIGVVVATGVHTEIGKIRDEMAATDPERTPLQQKLDQFGEQL 260

  Fly   261 SKVISVICVAVWAINIGHFNDPAHGGSWIKGAIYYFKIAVALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRR 325
            |.||:|||||||.|||||||||.|||||::||:||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   261 SMVITVICVAVWGINIGHFNDPVHGGSWLRGAVYYFKIAVALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRR 325

  Fly   326 MAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMSVSRMFIFDKVEGNDSSFLEFEMTGSTYE 390
            ||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||.|.|.|......||.:|||||.
Zfish   326 MARKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMSVSRLFIVDMVAGERCLLNEFTVTGSTYA 390

  Fly   391 PIGEVFLNGQRIKAADYDTLQELSTICIMCNDSAIDYNEFKQAFEKVGEATETALIVLAEKLNSF 455
            |.|||..:|.:::.:.|:.|.|:::||.:||||::||||.|..||||||||||||..|.||:|.|
Zfish   391 PEGEVSKDGVQVRCSQYEGLVEMASICALCNDSSLDYNESKGVFEKVGEATETALCCLVEKMNVF 455

  Fly   456 SVNKSGLDRRSAAIACRGEIETKWKKEFTLEFSRDRKSMSSYCTPLKASRLGTGPKLFVKGAPEG 520
            ..:..||.....|.||...|:...:||.||||||||||||.:|:|.|.:|..:|.|:|||||||.
Zfish   456 DTDLRGLTSAERATACCSVIKQLMRKELTLEFSRDRKSMSVFCSPNKLTRSASGAKMFVKGAPES 520

  Fly   521 VLERCTHARV-GTTKVPLTSALKAKILALTGQYGTGRDTLRCLALAVADSPMKPDEMDLGDSTKF 584
            |||||...|| |.|:|||:|.|:.::|:...::|:|||||||||:|..|||..|..::|.:|..|
Zfish   521 VLERCRWIRVSGGTRVPLSSDLREQLLSTVREWGSGRDTLRCLAMATRDSPPDPRTLNLENSAAF 585

  Fly   585 YQYEVNLTFVGVVGMLDPPRKEVFDSIVRCRAAGIRVIVITGDNKATAEAICRRIGVFAEDEDTT 649
            .:||.:|||||.|||||||||||.:::..||.||||||:||||||.||.:|||::|:..|.|:..
Zfish   586 SEYESDLTFVGCVGMLDPPRKEVLNAVRMCRQAGIRVIMITGDNKGTALSICRQVGIITEQEEEE 650

  Fly   650 ------GKSYSGREFDDLSPTEQKAAVARSRLFSRVEPQHKSKIVEFLQSMNEISAMTGDGVNDA 708
                  |...:|||||:|.|..|:.|...:|.|:||||.|||:|||:|||:::|:||||||||||
Zfish   651 AEGGLYGSGLTGREFDELPPHLQRQACRTARCFARVEPTHKSRIVEYLQSLSDITAMTGDGVNDA 715

  Fly   709 PALKKAEIGIAMGSGTAVAKSAAEMVLADDNFSSIVSAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNIGEVV 773
            ||||||||||||||||||||||:||:|||||||:||:||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   716 PALKKAEIGIAMGSGTAVAKSASEMILADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNIGEVV 780

  Fly   774 SIFLTAALGLPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMEKPPRKADEGLISGWLFFRYM 838
            .||||||||:||||||||||||||||||.|||||||||||||||.:|||...|.|||.|||.||:
Zfish   781 CIFLTAALGMPEALIPVQLLWVNLVTDGFPATALGFNPPDLDIMSRPPRSPKEPLISSWLFCRYL 845

  Fly   839 AIGFYVGAATVGAAAWWFVFSDEGPKLSYWQLTHHLSCLGGGDEFKGVDCKIFSDPHAMTMALSV 903
            .:|.||||||||||||||:.:.:||||:::||:|:|.|..|..||.||.|.:|..|:.|||||||
Zfish   846 IVGCYVGAATVGAAAWWFMAAHDGPKLTFYQLSHYLQCSEGHAEFAGVQCSVFESPYPMTMALSV 910

  Fly   904 LVTIEMLNAMNSLSENQSLITMPPWCNLWLIGSMALSFTLHFVILYVDVLSTVFQVTPLSAEEWI 968
            ||||||.||:|||||||||:.||||.|.||:|::.||..|||:|||||.|..:||:.|||..:|:
Zfish   911 LVTIEMCNALNSLSENQSLLKMPPWSNPWLVGAICLSMALHFLILYVDPLPVIFQIRPLSWPQWV 975

  Fly   969 TVMKFSIPVVLLDETLKFVAR 989
            .|:|.|:||:|:||.|||:||
Zfish   976 VVLKMSLPVILMDEALKFLAR 996

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
SERCANP_726381.1 P-type_ATPase_SERCA 5..989 CDD:319778 677/990 (68%)
si:dkey-28b4.8XP_684227.1 P-type_ATPase_SERCA 5..996 CDD:319778 677/990 (68%)

Return to query results.
Submit another query.