DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment SERCA and atp2a1l

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_726381.1 Gene:SERCA / 49297 FlyBaseID:FBgn0263006 Length:1020 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_005156129.1 Gene:atp2a1l / 494489 ZFINID:ZDB-GENE-041229-2 Length:993 Species:Danio rerio


Alignment Length:993 Identity:711/993 - (71%)
Similarity:828/993 - (83%) Gaps:3/993 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MEDGHSKTVEQSLNFFGTDPERGLTLDQIKANQKKYGPNELPTEEGKSIWQLVLEQFDDLLVKIL 65
            |||.|:|...:.|.:|......||:.:|.|.|..|||.||||.|||||||:|::|||:||||:||
Zfish     1 MEDAHTKGPAECLAYFSVSETTGLSPEQFKKNLAKYGYNELPAEEGKSIWELIIEQFEDLLVRIL 65

  Fly    66 LLAAIISFVLALFEEHEETFTAFVEPLVILLILIANAVVGVWQERNAESAIEALKEYEPEMGKVV 130
            ||||.||||||.|||.|||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Zfish    66 LLAACISFVLAWFEEGEETITAFVEPFVILLILIANAVVGVWQERNAESAIEALKEYEPEMGKVY 130

  Fly   131 RQDKSGIQKVRAKEIVPGDLVEVSVGDKIPADIRITHIYSTTLRIDQSILTGESVSVIKHTDAIP 195
            |.|:..:|.::|:||||||:||||||||:|||||||||.|||||:||||||||||||||||:.:|
Zfish   131 RSDRKSVQMIKAREIVPGDIVEVSVGDKVPADIRITHIRSTTLRVDQSILTGESVSVIKHTEPVP 195

  Fly   196 DPRAVNQDKKNILFSGTNVAAGKARGVVIGTGLSTAIGKIRTEMSETEEIKTPLQQKLDEFGEQL 260
            |||||||||||:||||||:|||||.||.:.||::|.|||||.:|:.||:.|||||||||||||||
Zfish   196 DPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGKAVGVAVATGVATEIGKIRDQMAATEQEKTPLQQKLDEFGEQL 260

  Fly   261 SKVISVICVAVWAINIGHFNDPAHGGSWIKGAIYYFKIAVALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRR 325
            |||||:||||||.|||||||||.||||||:||:||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   261 SKVISLICVAVWMINIGHFNDPVHGGSWIRGAVYYFKIAVALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRR 325

  Fly   326 MAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMSVSRMFIFDKVEGNDSSFLEFEMTGSTYE 390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|::||:.|:::|:......|:::||.|.
Zfish   326 MAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMCVTKMFVIDRIDGDHVELDSFDISGSKYT 390

  Fly   391 PIGEVFLNGQRIKAADYDTLQELSTICIMCNDSAIDYNEFKQAFEKVGEATETALIVLAEKLNSF 455
            |.|||...|.::..:.||.|.||:|||.:||||::||||.|:.:|||||||||||..|.||:|.|
Zfish   391 PEGEVTKLGAKVDCSQYDGLVELATICALCNDSSLDYNETKKIYEKVGEATETALCCLVEKMNVF 455

  Fly   456 SVNKSGLDRRSAAIACRGEIETKWKKEFTLEFSRDRKSMSSYCTPLKASRLGTGPKLFVKGAPEG 520
            ..|...|.:...|.||...::...||.|||||||||||||.||||:|..   .|.|:||||||||
Zfish   456 KSNVGNLSKVERANACCSVVKQLMKKNFTLEFSRDRKSMSVYCTPVKGD---AGSKMFVKGAPEG 517

  Fly   521 VLERCTHARVGTTKVPLTSALKAKILALTGQYGTGRDTLRCLALAVADSPMKPDEMDLGDSTKFY 585
            |::|||:.|||:|:||||.|:|.||:.:..::|||||||||||||..|||:|.:||:|.|||||.
Zfish   518 VIDRCTYVRVGSTRVPLTGAVKDKIMNVIKEWGTGRDTLRCLALATRDSPLKVEEMNLEDSTKFA 582

  Fly   586 QYEVNLTFVGVVGMLDPPRKEVFDSIVRCRAAGIRVIVITGDNKATAEAICRRIGVFAEDEDTTG 650
            .||.:|||||.|||||||||||..||..|||||||||:||||||.||.|||||||:|:||||.||
Zfish   583 DYETDLTFVGCVGMLDPPRKEVTGSIELCRAAGIRVIMITGDNKGTAVAICRRIGIFSEDEDVTG 647

  Fly   651 KSYSGREFDDLSPTEQKAAVARSRLFSRVEPQHKSKIVEFLQSMNEISAMTGDGVNDAPALKKAE 715
            |:|:|||||||..:||..||.|:..|:||||.||||||||||..:||:|||||||||||||||||
Zfish   648 KAYTGREFDDLPHSEQSEAVRRACCFARVEPSHKSKIVEFLQGYDEITAMTGDGVNDAPALKKAE 712

  Fly   716 IGIAMGSGTAVAKSAAEMVLADDNFSSIVSAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNIGEVVSIFLTAA 780
            |||||||||||||||:|||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Zfish   713 IGIAMGSGTAVAKSASEMVLADDNFSSIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNIGEVVCIFLTAA 777

  Fly   781 LGLPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMEKPPRKADEGLISGWLFFRYMAIGFYVG 845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||:||.||||...|.|||||||||||.:|.|||
Zfish   778 LGLPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLEIMGKPPRSPKEPLISGWLFFRYMTVGAYVG 842

  Fly   846 AATVGAAAWWFVFSDEGPKLSYWQLTHHLSCLGGGDEFKGVDCKIFSDPHAMTMALSVLVTIEML 910
            ||||.|||:||::.:|||:::|:||:|.:.|....::|.|::|::|.....|||||||||||||.
Zfish   843 AATVAAAAYWFIYDEEGPQVTYYQLSHFMQCHEENEDFTGIECEVFEACPPMTMALSVLVTIEMC 907

  Fly   911 NAMNSLSENQSLITMPPWCNLWLIGSMALSFTLHFVILYVDVLSTVFQVTPLSAEEWITVMKFSI 975
            ||:|||||||||:.||||.|.||:.:|.||.:|||:|:|||.:..:|::|.|:.|:|..|:|.|.
Zfish   908 NALNSLSENQSLVRMPPWSNGWLLSAMTLSMSLHFMIIYVDPMPMIFRLTHLNTEQWFVVLKLSF 972

  Fly   976 PVVLLDETLKFVARKIAD 993
            ||:|:||.|||:||...|
Zfish   973 PVILIDEMLKFLARNYVD 990

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
SERCANP_726381.1 P-type_ATPase_SERCA 5..989 CDD:319778 705/983 (72%)
atp2a1lXP_005156129.1 P-type_ATPase_SERCA 5..986 CDD:319778 705/983 (72%)

Return to query results.
Submit another query.