Protein Alignment SERCA and Atpalpha

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_726381.1
• Gene: SERCA / 49297
• FlyBaseID: FBgn0263006
• Length: 1020
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_732572.1
• Gene: Atpalpha / 48971
• FlyBaseID: FBgn0002921
• Length: 1041
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 1083
• Identity: 327/1083 - (30%)
• Similarity: 508/1083 - (46%)
• Gaps: 200/1083 - (18%)

  Fly     3 DGHSKTVEQSLNFFGTDPERGLTLDQIKANQKKYGPNELPTEEGKSIWQLVLEQFDDLLVKILLL 67
            |.|..:.|:....|.|.||.||:..:.|.|.::.|||.|...:....|....:........:|.:
  Fly    60 DFHKISPEELYQRFQTHPENGLSHAKAKENLERDGPNALTPPKQTPEWVKFCKNLFGGFAMLLWI 124

  Fly    68 AAIISFVLALFEEHEETFTAFVEP--------LVILLILIANAVVGVWQERNAESAIEALKEYEP 124
            .||:.||....:.     :...||        :|:..::|...:...:||..:...:|:.|...|
  Fly   125 GAILCFVAYSIQA-----STSEEPADDNLYLGIVLSAVVIVTGIFSYYQESKSSKIMESFKNMVP 184

  Fly   125 EMGKVVRQDKSGIQKVRAKEIVPGDLVEVSVGDKIPADIRITHIYSTTLRIDQSILTGESVSVIK 189
            :...|:|:.:.  ..:||:::|.||:|||..||:|||||||  |.:...::|.|.|||||.
  Fly   185 QFATVIREGEK--LTLRAEDLVLGDVVEVKFGDRIPADIRI--IEARNFKVDNSSLTGESE---- 241

  Fly   190 HTDAIPDPRAVN------QDKKNILFSGTNVAAGKARGVVIGTGLSTAIGKIRTEMSETEEIKTP 248
                 |..|...      .:.||:.|..||...|.|:||||..|..|.:|:|....|..:..:||
  Fly   242 -----PQSRGAEFTHENPLETKNLAFFSTNAVEGTAKGVVISCGDHTVMGRIAGLASGLDTGETP 301

  Fly   249 LQQKLDEFGEQLSKVISVICVAVWAINIGHFNDPAHGGSWIKGAIYYFKIAVALAVAAIPEGLPA 313
            :.:::..|...::.|...:.|..:.|..      ..|..|:...|:    .:.:.||.:||||.|
  Fly   302 IAKEIHHFIHLITGVAVFLGVTFFVIAF------ILGYHWLDAVIF----LIGIIVANVPEGLLA 356

  Fly   314 VITTCLALGTRRMAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMSVSRMFIFDK--VEGN- 375
            .:|.||.|..:|||.||.:|::|.:|||||.||.||||||||||.|:|:|:.|: ||.  :|.:
  Fly   357 TVTVCLTLTAKRMASKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMW-FDNQIIEADT 420

  Fly   376 --DSSFLEFEMTGSTYEPIGEVFLNGQRIKAADYDTLQELSTICIMCNDSAIDYNEFKQAFEKV- 437
              |.|.::::.|...:                     :.||.|..:||.:     |||...:.|
  Fly   421 TEDQSGVQYDRTSPGF---------------------KALSRIATLCNRA-----EFKGGQDGVP 459

  Fly   438 -------GEATETAL-----IVLAEKLNSFSVNKSGLDRRSAAIACRGEIETKWKKEFTLEFSRD 490
                   |:|:|.||     :.|.:.:|                     |..:.||...:.|:
  Fly   460 ILKKEVSGDASEAALLKCMELALGDVMN---------------------IRKRNKKIAEVPFN-- 501

  Fly   491 RKSMSSYCTPLKASRLGTGPK--LFVKGAPEGVLERCTHARVGTTKVPLTSALKAKILALTGQY- 552
              |.:.|...:..:.....|:  |.:|||||.:||||:...:...:..|...:|.   |....|
  Fly   502 --STNKYQVSIHETEDTNDPRYLLVMKGAPERILERCSTIFINGKEKVLDEEMKE---AFNNAYM 561

  Fly   553 ---GTGRDTLRCLALAVADSPMKPDEMDLGDSTKFYQYEV-----NLTFVGVVGMLDPPRKEVFD 609
               |.|.     ..|...|..:..|:...|  .||...::     ||.|||::.|:||||..|.|
  Fly   562 ELGGLGE-----RVLGFCDFMLPSDKYPNG--FKFNTDDINFPIDNLRFVGLMSMIDPPRAAVPD 619

  Fly   610 SIVRCRAAGIRVIVITGDNKATAEAICRRIGVFAEDEDTTGKSYSGR---EFDDLSPTEQKAAVA 671
            ::.:||:|||:||::|||:..||:||.:.:|:.:|..:|. :..:.|   ...:::|.|.||||.
  Fly   620 AVAKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKSVGIISEGNETV-EDIAQRLNIPVSEVNPREAKAAVV 683

  Fly   672 RSR--------------------LFSRVEPQHKSKIVEFLQSMNEISAMTGDGVNDAPALKKAEI 716
            ...                    :|:|..||.|..|||..|.|..|.|:|||||||:||||||:|
  Fly   684 HGAELRDVSSDQLDEILRYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRMGAIVAVTGDGVNDSPALKKADI 748

  Fly   717 GIAMG-SGTAVAKSAAEMVLADDNFSSIVSAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNIGEVVSIFLTAA 780
            |:||| :|:.|:|.||:|:|.||||:|||:.|||||.|::|:|:.|.|.::|||.| :|.||...
  Fly   749 GVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLTSNIPE-ISPFLAFI 812

  Fly   781 L-GLPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMEKPPRKA--DEGLISGWLFFRYMAIGF 842
            | .:|..|..|.:|.::|.||.:||.:|.:...:.|||::|||..  |:.:.|..:...|..||.
  Fly   813 LCDIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEHAEADIMKRPPRDPFNDKLVNSRLISMAYGQIGM 877

  Fly   843 YVGAATVGAAAWWFVFSDEG--PKLSY-----W------QLTHHLSCLGGGDEFKGVDCKIFSDP 894
            ...||  |...::.:.::.|  ||..:     |      .||...     |.|:...|.|.....
  Fly   878 IQAAA--GFFVYFVIMAENGFLPKKLFGIRKMWDSKAVNDLTDSY-----GQEWTYRDRKTLEYT 935

  Fly   895 HAMTMALSVLVTIEMLNAMNSLSENQSLIT--MPPWCNLWLIGSMALSFTLHF------VILYVD 951
            ......:|::| ::..:.:...:...|:..  |..|         ||:|.|.|      .:.|..
  Fly   936 CHTAFFISIVV-VQWADLIICKTRRNSIFQQGMRNW---------ALNFGLVFETVLAAFLSYCP 990

  Fly   952 VLSTVFQVTPLSAEEWITVMKFSIPVVLLDETLKFVARKIADG 994
            .:....::.||....|...:.|::.:.:.|||.:|..|:...|
  Fly   991 GMEKGLRMYPLKLVWWFPAIPFALAIFIYDETRRFYLRRNPGG 1033

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
SERCA	NP_726381.1	P-type_ATPase_SERCA	5..989	CDD:319778	324/1074 (30%)
Atpalpha	NP_732572.1	ATPase-IIC_X-K	45..1041	CDD:273445	327/1083 (30%)