DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment SERCA and ATP2A2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_726381.1 Gene:SERCA / 49297 FlyBaseID:FBgn0263006 Length:1020 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_733765.1 Gene:ATP2A2 / 488 HGNCID:812 Length:1042 Species:Homo sapiens


Alignment Length:989 Identity:717/989 - (72%)
Similarity:838/989 - (84%) Gaps:1/989 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MEDGHSKTVEQSLNFFGTDPERGLTLDQIKANQKKYGPNELPTEEGKSIWQLVLEQFDDLLVKIL 65
            ||:.|:||||:.|..||.:...||:|:|:|..::::|.||||.||||::.:||:|||:||||:||
Human     1 MENAHTKTVEEVLGHFGVNESTGLSLEQVKKLKERWGSNELPAEEGKTLLELVIEQFEDLLVRIL 65

  Fly    66 LLAAIISFVLALFEEHEETFTAFVEPLVILLILIANAVVGVWQERNAESAIEALKEYEPEMGKVV 130
            ||||.||||||.|||.|||.||||||.||||||:|||:||||||||||:|||||||||||||||.
Human    66 LLAACISFVLAWFEEGEETITAFVEPFVILLILVANAIVGVWQERNAENAIEALKEYEPEMGKVY 130

  Fly   131 RQDKSGIQKVRAKEIVPGDLVEVSVGDKIPADIRITHIYSTTLRIDQSILTGESVSVIKHTDAIP 195
            |||:..:|:::||:|||||:||::||||:|||||:|.|.|||||:|||||||||||||||||.:|
Human   131 RQDRKSVQRIKAKDIVPGDIVEIAVGDKVPADIRLTSIKSTTLRVDQSILTGESVSVIKHTDPVP 195

  Fly   196 DPRAVNQDKKNILFSGTNVAAGKARGVVIGTGLSTAIGKIRTEMSETEEIKTPLQQKLDEFGEQL 260
            |||||||||||:||||||:|||||.|||:.||::|.|||||.||..||:.:||||||||||||||
Human   196 DPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGKAMGVVVATGVNTEIGKIRDEMVATEQERTPLQQKLDEFGEQL 260

  Fly   261 SKVISVICVAVWAINIGHFNDPAHGGSWIKGAIYYFKIAVALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRR 325
            |||||:||:|||.|||||||||.||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human   261 SKVISLICIAVWIINIGHFNDPVHGGSWIRGAIYYFKIAVALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRR 325

  Fly   326 MAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMSVSRMFIFDKVEGNDSSFLEFEMTGSTYE 390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|:|||:..|..||.:|||||.
Human   326 MAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMSVCRMFILDRVEGDTCSLNEFTITGSTYA 390

  Fly   391 PIGEVFLNGQRIKAADYDTLQELSTICIMCNDSAIDYNEFKQAFEKVGEATETALIVLAEKLNSF 455
            |||||..:.:.:....||.|.||:|||.:|||||:||||.|..:|||||||||||..|.||:|.|
Human   391 PIGEVHKDDKPVNCHQYDGLVELATICALCNDSALDYNEAKGVYEKVGEATETALTCLVEKMNVF 455

  Fly   456 SVNKSGLDRRSAAIACRGEIETKWKKEFTLEFSRDRKSMSSYCTPLKASRLGTGPKLFVKGAPEG 520
            .....||.:...|.||...|:...||||||||||||||||.||||.|.||.... |:||||||||
Human   456 DTELKGLSKIERANACNSVIKQLMKKEFTLEFSRDRKSMSVYCTPNKPSRTSMS-KMFVKGAPEG 519

  Fly   521 VLERCTHARVGTTKVPLTSALKAKILALTGQYGTGRDTLRCLALAVADSPMKPDEMDLGDSTKFY 585
            |::||||.|||:||||:||.:|.||:::..::|:|.|||||||||..|:|::.:||.|.||..|.
Human   520 VIDRCTHIRVGSTKVPMTSGVKQKIMSVIREWGSGSDTLRCLALATHDNPLRREEMHLEDSANFI 584

  Fly   586 QYEVNLTFVGVVGMLDPPRKEVFDSIVRCRAAGIRVIVITGDNKATAEAICRRIGVFAEDEDTTG 650
            :||.||||||.||||||||.||..|:..||.||||||:||||||.||.|||||||:|.:|||.|.
Human   585 KYETNLTFVGCVGMLDPPRIEVASSVKLCRQAGIRVIMITGDNKGTAVAICRRIGIFGQDEDVTS 649

  Fly   651 KSYSGREFDDLSPTEQKAAVARSRLFSRVEPQHKSKIVEFLQSMNEISAMTGDGVNDAPALKKAE 715
            |:::|||||:|:|:.|:.|...:|.|:||||.|||||||||||.:||:|||||||||||||||||
Human   650 KAFTGREFDELNPSAQRDACLNARCFARVEPSHKSKIVEFLQSFDEITAMTGDGVNDAPALKKAE 714

  Fly   716 IGIAMGSGTAVAKSAAEMVLADDNFSSIVSAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNIGEVVSIFLTAA 780
            |||||||||||||:|:||||||||||:||:|||||||||||||||||||||||:||||.||||||
Human   715 IGIAMGSGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAA 779

  Fly   781 LGLPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMEKPPRKADEGLISGWLFFRYMAIGFYVG 845
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||...|.||||||||||:|||.|||
Human   780 LGFPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMNKPPRNPKEPLISGWLFFRYLAIGCYVG 844

  Fly   846 AATVGAAAWWFVFSDEGPKLSYWQLTHHLSCLGGGDEFKGVDCKIFSDPHAMTMALSVLVTIEML 910
            |||||||||||:.:|.||::|::||:|.|.|.....:|:||||.||..|:.|||||||||||||.
Human   845 AATVGAAAWWFIAADGGPRVSFYQLSHFLQCKEDNPDFEGVDCAIFESPYPMTMALSVLVTIEMC 909

  Fly   911 NAMNSLSENQSLITMPPWCNLWLIGSMALSFTLHFVILYVDVLSTVFQVTPLSAEEWITVMKFSI 975
            ||:|||||||||:.||||.|:||:||:.||.:|||:||||:.|..:||:|||:..:|:.|:|.|:
Human   910 NALNSLSENQSLLRMPPWENIWLVGSICLSMSLHFLILYVEPLPLIFQITPLNVTQWLMVLKISL 974

  Fly   976 PVVLLDETLKFVAR 989
            ||:|:|||||||||
Human   975 PVILMDETLKFVAR 988

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
SERCANP_726381.1 P-type_ATPase_SERCA 5..989 CDD:319778 713/983 (73%)
ATP2A2NP_733765.1 P-type_ATPase_SERCA 5..988 CDD:319778 713/983 (73%)
Interaction with HAX1. /evidence=ECO:0000269|PubMed:18971376 575..594 11/18 (61%)
Interaction with PLN. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P04191 787..807 19/19 (100%)
Interaction with TMEM64 and PDIA3. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:O55143 788..1042 142/201 (71%)
Interaction with PLN. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P04191 931..942 6/10 (60%)

Return to query results.
Submit another query.