DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment SERCA and ATP2A1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_726381.1 Gene:SERCA / 49297 FlyBaseID:FBgn0263006 Length:1020 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_775293.1 Gene:ATP2A1 / 487 HGNCID:811 Length:1001 Species:Homo sapiens


Alignment Length:989 Identity:711/989 - (71%)
Similarity:827/989 - (83%) Gaps:0/989 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MEDGHSKTVEQSLNFFGTDPERGLTLDQIKANQKKYGPNELPTEEGKSIWQLVLEQFDDLLVKIL 65
            ||..|:||.|:.|.:||.....|||.||:|.|.:|||.||||.||||::|:||:|||:||||:||
Human     1 MEAAHAKTTEECLAYFGVSETTGLTPDQVKRNLEKYGLNELPAEEGKTLWELVIEQFEDLLVRIL 65

  Fly    66 LLAAIISFVLALFEEHEETFTAFVEPLVILLILIANAVVGVWQERNAESAIEALKEYEPEMGKVV 130
            ||||.||||||.|||.|||.||||||.||||||||||:||||||||||:|||||||||||||||.
Human    66 LLAACISFVLAWFEEGEETITAFVEPFVILLILIANAIVGVWQERNAENAIEALKEYEPEMGKVY 130

  Fly   131 RQDKSGIQKVRAKEIVPGDLVEVSVGDKIPADIRITHIYSTTLRIDQSILTGESVSVIKHTDAIP 195
            |.|:..:|:::|::|||||:|||:||||:||||||..|.|||||:||||||||||||||||:.:|
Human   131 RADRKSVQRIKARDIVPGDIVEVAVGDKVPADIRILAIKSTTLRVDQSILTGESVSVIKHTEPVP 195

  Fly   196 DPRAVNQDKKNILFSGTNVAAGKARGVVIGTGLSTAIGKIRTEMSETEEIKTPLQQKLDEFGEQL 260
            |||||||||||:||||||:|||||.|:|..||:.|.|||||.:|:.||:.|||||||||||||||
Human   196 DPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGKALGIVATTGVGTEIGKIRDQMAATEQDKTPLQQKLDEFGEQL 260

  Fly   261 SKVISVICVAVWAINIGHFNDPAHGGSWIKGAIYYFKIAVALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRR 325
            |||||:||||||.|||||||||.|||||.:|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human   261 SKVISLICVAVWLINIGHFNDPVHGGSWFRGAIYYFKIAVALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRR 325

  Fly   326 MAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMSVSRMFIFDKVEGNDSSFLEFEMTGSTYE 390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.:|||.|||:|:.....||.:|||||.
Human   326 MAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMSVCKMFIIDKVDGDICLLNEFSITGSTYA 390

  Fly   391 PIGEVFLNGQRIKAADYDTLQELSTICIMCNDSAIDYNEFKQAFEKVGEATETALIVLAEKLNSF 455
            |.|||..|.:.::...||.|.||:|||.:||||::|:||.|..:|||||||||||..|.||:|.|
Human   391 PEGEVLKNDKPVRPGQYDGLVELATICALCNDSSLDFNEAKGVYEKVGEATETALTTLVEKMNVF 455

  Fly   456 SVNKSGLDRRSAAIACRGEIETKWKKEFTLEFSRDRKSMSSYCTPLKASRLGTGPKLFVKGAPEG 520
            :.:...|.:...|.||...|....||||||||||||||||.||:|.|:||...|.|:||||||||
Human   456 NTDVRSLSKVERANACNSVIRQLMKKEFTLEFSRDRKSMSVYCSPAKSSRAAVGNKMFVKGAPEG 520

  Fly   521 VLERCTHARVGTTKVPLTSALKAKILALTGQYGTGRDTLRCLALAVADSPMKPDEMDLGDSTKFY 585
            |::||.:.|||||:||||..:|.||:|:..::|||||||||||||..|:|.|.:||.|.||.:|.
Human   521 VIDRCNYVRVGTTRVPLTGPVKEKIMAVIKEWGTGRDTLRCLALATRDTPPKREEMVLDDSARFL 585

  Fly   586 QYEVNLTFVGVVGMLDPPRKEVFDSIVRCRAAGIRVIVITGDNKATAEAICRRIGVFAEDEDTTG 650
            :||.:|||||||||||||||||..||..||.||||||:||||||.||.|||||||:|.|:|:...
Human   586 EYETDLTFVGVVGMLDPPRKEVTGSIQLCRDAGIRVIMITGDNKGTAIAICRRIGIFGENEEVAD 650

  Fly   651 KSYSGREFDDLSPTEQKAAVARSRLFSRVEPQHKSKIVEFLQSMNEISAMTGDGVNDAPALKKAE 715
            ::|:|||||||...||:.|..|:..|:||||.|||||||:|||.:||:|||||||||||||||||
Human   651 RAYTGREFDDLPLAEQREACRRACCFARVEPSHKSKIVEYLQSYDEITAMTGDGVNDAPALKKAE 715

  Fly   716 IGIAMGSGTAVAKSAAEMVLADDNFSSIVSAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNIGEVVSIFLTAA 780
            |||||||||||||:|:||||||||||:||:|||||||||||||||||||||||:||||.||||||
Human   716 IGIAMGSGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAA 780

  Fly   781 LGLPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMEKPPRKADEGLISGWLFFRYMAIGFYVG 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||::|||...|.||||||||||||||.|||
Human   781 LGLPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMDRPPRSPKEPLISGWLFFRYMAIGGYVG 845

  Fly   846 AATVGAAAWWFVFSDEGPKLSYWQLTHHLSCLGGGDEFKGVDCKIFSDPHAMTMALSVLVTIEML 910
            |||||||||||:::::||.::|.||||.:.|......|:|:||::|..|..|||||||||||||.
Human   846 AATVGAAAWWFLYAEDGPHVNYSQLTHFMQCTEDNTHFEGIDCEVFEAPEPMTMALSVLVTIEMC 910

  Fly   911 NAMNSLSENQSLITMPPWCNLWLIGSMALSFTLHFVILYVDVLSTVFQVTPLSAEEWITVMKFSI 975
            ||:|||||||||:.||||.|:||:||:.||.:|||:|||||.|..:|::..|...:|:.|:|.|:
Human   911 NALNSLSENQSLLRMPPWVNIWLLGSICLSMSLHFLILYVDPLPMIFKLRALDLTQWLMVLKISL 975

  Fly   976 PVVLLDETLKFVAR 989
            ||:.|||.||||||
Human   976 PVIGLDEILKFVAR 989

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
SERCANP_726381.1 P-type_ATPase_SERCA 5..989 CDD:319778 707/983 (72%)
ATP2A1NP_775293.1 P-type_ATPase_SERCA 5..989 CDD:319778 707/983 (72%)
Interaction with PLN. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P04191 788..808 19/19 (100%)
Interaction with PLN. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P04191 932..943 6/10 (60%)

Return to query results.
Submit another query.