Protein Alignment SERCA and CG6230

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_726381.1
• Gene: SERCA / 49297
• FlyBaseID: FBgn0263006
• Length: 1020
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_609490.1
• Gene: CG6230 / 34546
• FlyBaseID: FBgn0027582
• Length: 1225
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 1051
• Identity: 225/1051 - (21%)
• Similarity: 373/1051 - (35%)
• Gaps: 305/1051 - (29%)

  Fly    22 RGL-TLDQIKANQKKYGPNELPTEEGKSIWQLVLEQFDDLLVKILLLAAIISFVLALFEE----- 80
            ||| |.:.||...:.||.||:         ::|:.:|.:|.::   .|....||..:|..
  Fly   213 RGLETEEDIKRATQTYGNNEM---------EMVVPEFHELFIE---RATAPFFVFQVFSVGLWCM 265

  Fly    81 ----HEETFTAFVEPLVILLILIANAVVGVWQERNAESAIEALKEYEPEMGKVVRQDKSGIQKVR 141
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  Fly   266 DDYWYYSLFTLF--------MLIAFECTIVKQQLRNMSEIRKMGN-KPYLIYAFRQNK--WRHLG 319

  Fly   142 AKEIVPGDLVEV--SVGDKI-PADIRITHIYSTTLR----IDQSILTGESVSVIKHTDAIPDPRA 199
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  Fly   320 SDELLPGDLVSITRSQNDNIVPCDLVI-------LRGSCIVDESMLTGESVPLMKESLESLDNLD 377

  Fly   200 VNQD-----KKNILFSGTNVAA-------------GKARGVVIGTGLSTAIGKIRTEMSETEEIK 246
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  Fly   378 VEMDAEGDGKLFVLFGGTKVVQHTAPTKESLRAPDGGCIGYVIRTGFNTSQGKL---------LR 433

  Fly   247 TPLQQKLDEFG------EQLSKVISVICVAVWAINIGHFNDPAHGGSWIKGA-------IYYFKI 298
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  Fly   434 TIL------FGANRATENNVETFAFIAFLMVFAVAAASY-------VWVKGSEDPERNRYKLFLE 485

  Fly   299 AVALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRRMAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMSV 363
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  Fly   486 CTLILTSIIPPDLPIELTLAVNTSLIQLTKLFVFCTEPFRIPFAGKVQICCFDKTGTLTTDNLMV 550

  Fly   364 SRMFIFDKVEGNDSSFLEFEMTGSTYEPIGEVFLNGQ--RIKAADYDTLQELSTICIMCNDSAID 426
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  Fly   551 --------------------------EGIAGLAPNGACVPIEKAEGNTVQVLA--C--CHSLALL 585

  Fly   427 YNEFKQAFEKVGEATETALIVLAEKLNSFSVNKSGLDRRSAAIACRGEIE-TKWKKEFTLEFSRD 490
            .:..      ||:..|.|.:...:..         |.:..:.|..|.:.: .|..:.:  .||..
  Fly   586 DDGL------VGDPLEKATLAAVDWT---------LTKMDSVIPKRPQFKPLKIIQRY--HFSSA 633

  Fly   491 RKSMS-------SYCTPLKASRLGTGPKLFVKGAPEGVLERCTHARVGTTKVPLTSALK-AKILA 547
            .|.||       .|...:|  .:|.     ||||||.:.:..........||.|..|.: |::||
  Fly   634 LKRMSVLAGHLIPYSNEVK--HIGA-----VKGAPEVIQKMLREVPADYEKVYLEYARRGARVLA 691

  Fly   548 L-TGQYGT-GRDTLRCLALAVADSPMKPDEMDLGDSTKFYQYEVNLTFVGVVGM---LDPPRKEV 607
            | ....|| |...:|         .||.:|:           |.:|||.|.:.:   :.|..|.|
  Fly   692 LGIKDLGTLGAQRVR---------EMKREEV-----------ECDLTFAGFLIISCPMKPDSKSV 736

  Fly   608 FDSIVRCRAAGIRVIVITGDNKATAEAICR-------RIGVFAEDEDTTGKSYSGREFD------ 659
            ...:::   :..:|::||||:..||..:.|       ::.:....|:....::|....|
  Fly   737 IKELIQ---SSHKVVMITGDSPLTACHVARELRFTRKKLIILTPPEEDRKNNWSWVSIDGDQSYE 798

  Fly   660 -DLSPTEQKAA-----------------------------VARSRLFSRVEPQHKSKIVEFLQSM 694
             |..|..:|.:                             :.:..:.:|..|:.|..::..|:.:
  Fly   799 LDTKPGSKKLSHLLATHDLCITGEGLQYLQQNQPQYMRQLLPQITVCARFAPKQKELVITQLKQL 863

  Fly   695 NEISAMTGDGVNDAPALKKAEIGIAMGSGTAV--AKSAAEMVLADDNFSSIVSAVEEGRAIYNNM 757
            ...:.|.|||.||..|||.|.:|:::.:...|  .::..|...|..|.::|.:..:
  Fly   864 GYCTLMCGDGTNDVGALKHANVGVSLLTSAPVKRKRTEEEQQQAAANAAAIAAQAQ--------- 919

  Fly   758 KQFIRYLISSNIGEVVSIFLTAALGLPEALIPVQLLWVNLVTD---------GLPATALGFNPPD 813
                     :|..:.::....|.....|.|...|....|.:.|         |..:.|..|....
  Fly   920 ---------ANANQQLTTRERALRRRQEHLNQTQARLQNALRDMEEQTMVKLGDASIAAPFTSKS 975

  Fly   814 LDIM-----EKPPRKADEGLISGWLFFRYMAIGFYVGAATVGAAAWWFVFSDEGPKLSYWQLTHH 873
            ..||     .|..|..   |::....|:.:|:...:.|                    |.|...:
  Fly   976 SSIMCVNHIIKQGRCT---LVTTLQMFKILALNALIQA--------------------YCQSVLY 1017

  Fly   874 LSCLGGGDEFKGVDCKIFSDPHAMTMALSVLVTIEMLNAMNSLSENQSLITMPPWCNLWLIGSMA 938
            :      |..|      |||..|....:.:......:.....|.....:..:|...|.:.|.::.
  Fly  1018 I------DGIK------FSDTQATMQGIFIAACFLFITRAKPLKTLSKVAPLPNIFNFYTISTIL 1070

  Fly   939 LSFTLHFVILY 949
            ..|.:||..||
  Fly  1071 SQFAVHFGTLY 1081

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
SERCA	NP_726381.1	P-type_ATPase_SERCA	5..989	CDD:319778	225/1051 (21%)
CG6230	NP_609490.1	P-type_ATPase_cation	220..1152	CDD:319843	221/1044 (21%)