DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment SERCA and Atp2a1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_726381.1 Gene:SERCA / 49297 FlyBaseID:FBgn0263006 Length:1020 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_478120.1 Gene:Atp2a1 / 116601 RGDID:621293 Length:994 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:994 Identity:718/994 - (72%)
Similarity:835/994 - (84%) Gaps:0/994 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MEDGHSKTVEQSLNFFGTDPERGLTLDQIKANQKKYGPNELPTEEGKSIWQLVLEQFDDLLVKIL 65
            ||..|||:.|:.|::||.....|||.||:|.:.:||||||||.|||||:|:||:|||:||||:||
  Rat     1 MEAAHSKSTEECLSYFGVSETTGLTPDQVKRHLEKYGPNELPAEEGKSLWELVVEQFEDLLVRIL 65

  Fly    66 LLAAIISFVLALFEEHEETFTAFVEPLVILLILIANAVVGVWQERNAESAIEALKEYEPEMGKVV 130
            ||||.||||||.|||.|||.||||||.||||||||||:||||||||||:|||||||||||||||.
  Rat    66 LLAACISFVLAWFEEGEETVTAFVEPFVILLILIANAIVGVWQERNAENAIEALKEYEPEMGKVY 130

  Fly   131 RQDKSGIQKVRAKEIVPGDLVEVSVGDKIPADIRITHIYSTTLRIDQSILTGESVSVIKHTDAIP 195
            |.|:..:|:::|::|||||:|||:||||:||||||..|.|||||:|||||||||||||||||.:|
  Rat   131 RADRKSVQRIKARDIVPGDIVEVAVGDKVPADIRILSIKSTTLRVDQSILTGESVSVIKHTDPVP 195

  Fly   196 DPRAVNQDKKNILFSGTNVAAGKARGVVIGTGLSTAIGKIRTEMSETEEIKTPLQQKLDEFGEQL 260
            |||||||||||:||||||:|||||.|:|..||:||.|||||.:|:.||:.|||||||||||||||
  Rat   196 DPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGKAVGIVATTGVSTEIGKIRDQMAATEQDKTPLQQKLDEFGEQL 260

  Fly   261 SKVISVICVAVWAINIGHFNDPAHGGSWIKGAIYYFKIAVALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRR 325
            |||||:||||||.|||||||||.|||||.:|||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 SKVISLICVAVWLINIGHFNDPVHGGSWFRGAIYYFKIAVALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRR 325

  Fly   326 MAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMSVSRMFIFDKVEGNDSSFLEFEMTGSTYE 390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.:|||.|||:|:..|..||.:|||||.
  Rat   326 MAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMSVCKMFIIDKVDGDICSLNEFSITGSTYA 390

  Fly   391 PIGEVFLNGQRIKAADYDTLQELSTICIMCNDSAIDYNEFKQAFEKVGEATETALIVLAEKLNSF 455
            |.|||..|.:.::|..||.|.||:|||.:||||::|:||.|..:|||||||||||..|.||:|.|
  Rat   391 PEGEVLKNDKPVRAGQYDGLVELATICALCNDSSLDFNETKGVYEKVGEATETALTTLVEKMNVF 455

  Fly   456 SVNKSGLDRRSAAIACRGEIETKWKKEFTLEFSRDRKSMSSYCTPLKASRLGTGPKLFVKGAPEG 520
            :.....|.:...|.||...|....||||||||||||||||.||:|.|:||...|.|:||||||||
  Rat   456 NTEVRSLSKVERANACNSVIRQLMKKEFTLEFSRDRKSMSVYCSPAKSSRAAVGNKMFVKGAPEG 520

  Fly   521 VLERCTHARVGTTKVPLTSALKAKILALTGQYGTGRDTLRCLALAVADSPMKPDEMDLGDSTKFY 585
            |::||.:.|||||:||||..:|.||:::..::|||||||||||||..|:|.|.:||.|.||.||.
  Rat   521 VIDRCNYVRVGTTRVPLTGPVKEKIMSVIKEWGTGRDTLRCLALATRDTPPKREEMVLDDSAKFM 585

  Fly   586 QYEVNLTFVGVVGMLDPPRKEVFDSIVRCRAAGIRVIVITGDNKATAEAICRRIGVFAEDEDTTG 650
            :||::|||||||||||||||||..||..||.||||||:||||||.||.|||||||:|:|:|:...
  Rat   586 EYEMDLTFVGVVGMLDPPRKEVTGSIQLCRDAGIRVIMITGDNKGTAIAICRRIGIFSENEEVAD 650

  Fly   651 KSYSGREFDDLSPTEQKAAVARSRLFSRVEPQHKSKIVEFLQSMNEISAMTGDGVNDAPALKKAE 715
            ::|:|||||||...||:.|..|:..|:||||.|||||||:|||.:||:|||||||||||||||||
  Rat   651 RAYTGREFDDLPLAEQREACRRACCFARVEPSHKSKIVEYLQSYDEITAMTGDGVNDAPALKKAE 715

  Fly   716 IGIAMGSGTAVAKSAAEMVLADDNFSSIVSAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNIGEVVSIFLTAA 780
            |||||||||||||:|:||||||||||:||:|||||||||||||||||||||||:||||.||||||
  Rat   716 IGIAMGSGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAA 780

  Fly   781 LGLPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMEKPPRKADEGLISGWLFFRYMAIGFYVG 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||::|||...|.||||||||||||||.|||
  Rat   781 LGLPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMDRPPRSPKEPLISGWLFFRYMAIGGYVG 845

  Fly   846 AATVGAAAWWFVFSDEGPKLSYWQLTHHLSCLGGGDEFKGVDCKIFSDPHAMTMALSVLVTIEML 910
            |||||||||||:::::||.:||.||||.:.|.....||.|:||::|..|..|||||||||||||.
  Rat   846 AATVGAAAWWFLYAEDGPHVSYHQLTHFMQCTEHNPEFDGLDCEVFEAPEPMTMALSVLVTIEMC 910

  Fly   911 NAMNSLSENQSLITMPPWCNLWLIGSMALSFTLHFVILYVDVLSTVFQVTPLSAEEWITVMKFSI 975
            ||:|||||||||:.||||.|:||:||:.||.:|||:|||||.|..:|::..|...:|:.|:|.|:
  Rat   911 NALNSLSENQSLLRMPPWVNIWLLGSICLSMSLHFLILYVDPLPMIFKLRALDFTQWLMVLKISL 975

  Fly   976 PVVLLDETLKFVARKIADG 994
            ||:.|||.|||:||...:|
  Rat   976 PVIGLDELLKFIARNYLEG 994

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
SERCANP_726381.1 P-type_ATPase_SERCA 5..989 CDD:319778 713/983 (73%)
Atp2a1NP_478120.1 P-type_ATPase_SERCA 5..989 CDD:319778 713/983 (73%)
Interaction with PLN. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P04191 788..808 19/19 (100%)
Interaction with PLN. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P04191 932..943 6/10 (60%)

Return to query results.
Submit another query.