DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment SERCA and atp2a2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_726381.1 Gene:SERCA / 49297 FlyBaseID:FBgn0263006 Length:1020 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_031748548.1 Gene:atp2a2 / 100489059 XenbaseID:XB-GENE-1012933 Length:1083 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:989 Identity:712/989 - (71%)
Similarity:840/989 - (84%) Gaps:1/989 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MEDGHSKTVEQSLNFFGTDPERGLTLDQIKANQKKYGPNELPTEEGKSIWQLVLEQFDDLLVKIL 65
            ||:.|:||||:.|..|..:...||:|:|:|..::::|.||||.||||::|:||:|||:||||:||
 Frog     1 MENAHTKTVEEVLAHFNVNESTGLSLEQVKKQKERWGANELPAEEGKTLWELVIEQFEDLLVRIL 65

  Fly    66 LLAAIISFVLALFEEHEETFTAFVEPLVILLILIANAVVGVWQERNAESAIEALKEYEPEMGKVV 130
            ||||.||||||.|||.|||.||||||.||||||:|||:||||||||||:|||||||||||||||.
 Frog    66 LLAACISFVLAWFEEGEETITAFVEPFVILLILVANAIVGVWQERNAENAIEALKEYEPEMGKVY 130

  Fly   131 RQDKSGIQKVRAKEIVPGDLVEVSVGDKIPADIRITHIYSTTLRIDQSILTGESVSVIKHTDAIP 195
            |||:..:|:::|::|||||:|||:||||:|||||:|.|.|||||:|||||||||||||||||.:|
 Frog   131 RQDRKSVQRIKARDIVPGDIVEVAVGDKVPADIRLTSIKSTTLRVDQSILTGESVSVIKHTDPVP 195

  Fly   196 DPRAVNQDKKNILFSGTNVAAGKARGVVIGTGLSTAIGKIRTEMSETEEIKTPLQQKLDEFGEQL 260
            |||||||||||:||||||:|||||.|||:.||::|.|||||.||..||:.:||||||||||||||
 Frog   196 DPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGKAIGVVVATGVNTEIGKIRDEMVATEQERTPLQQKLDEFGEQL 260

  Fly   261 SKVISVICVAVWAINIGHFNDPAHGGSWIKGAIYYFKIAVALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRR 325
            |||||:||:|||.|||||||||.||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   261 SKVISLICIAVWIINIGHFNDPVHGGSWIRGAIYYFKIAVALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRR 325

  Fly   326 MAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMSVSRMFIFDKVEGNDSSFLEFEMTGSTYE 390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||::....||.:|||||.
 Frog   326 MAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMSVCRMFIVDKVEGDNCFLNEFNITGSTYA 390

  Fly   391 PIGEVFLNGQRIKAADYDTLQELSTICIMCNDSAIDYNEFKQAFEKVGEATETALIVLAEKLNSF 455
            |:|||..:.:.:|...||.|.||:|||.:||||::|:||.|..:|||||||||||..|.||:|.|
 Frog   391 PMGEVLKDDKLVKCHQYDGLVELATICALCNDSSLDFNEAKGVYEKVGEATETALTCLVEKMNVF 455

  Fly   456 SVNKSGLDRRSAAIACRGEIETKWKKEFTLEFSRDRKSMSSYCTPLKASRLGTGPKLFVKGAPEG 520
            ..:..||.|...|.||...|:...||||||||||||||||.||||.|.||.... |:||||||||
 Frog   456 DTDLKGLSRIERANACNSVIKQLMKKEFTLEFSRDRKSMSVYCTPNKPSRTSMS-KMFVKGAPEG 519

  Fly   521 VLERCTHARVGTTKVPLTSALKAKILALTGQYGTGRDTLRCLALAVADSPMKPDEMDLGDSTKFY 585
            :::||||.|||:.|||||:.:|.||:::..::|||||||||||||..|:|.:.::|:|.|||.|.
 Frog   520 LIDRCTHIRVGSIKVPLTAGIKQKIMSVIREWGTGRDTLRCLALATHDNPPRKEDMNLEDSTNFI 584

  Fly   586 QYEVNLTFVGVVGMLDPPRKEVFDSIVRCRAAGIRVIVITGDNKATAEAICRRIGVFAEDEDTTG 650
            .||.||||||.||||||||.||..|:..||.||||||:||||||.||.|||||:|:|.||||.:.
 Frog   585 NYETNLTFVGCVGMLDPPRTEVAASVKMCRQAGIRVIMITGDNKGTAVAICRRVGIFREDEDVSE 649

  Fly   651 KSYSGREFDDLSPTEQKAAVARSRLFSRVEPQHKSKIVEFLQSMNEISAMTGDGVNDAPALKKAE 715
            ::::|||||:|||..|:.|...:|.|:||||.|||||||||||.:||:|||||||||||||||||
 Frog   650 RAFTGREFDELSPAAQRDACLNARCFARVEPSHKSKIVEFLQSFDEITAMTGDGVNDAPALKKAE 714

  Fly   716 IGIAMGSGTAVAKSAAEMVLADDNFSSIVSAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNIGEVVSIFLTAA 780
            |||||||||||||:|:||||||||||:||:|||||||||||||||||||||||:||||.||||||
 Frog   715 IGIAMGSGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAA 779

  Fly   781 LGLPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMEKPPRKADEGLISGWLFFRYMAIGFYVG 845
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||...|.||||||||||:|||.|||
 Frog   780 LGFPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMNKPPRNPKEPLISGWLFFRYLAIGCYVG 844

  Fly   846 AATVGAAAWWFVFSDEGPKLSYWQLTHHLSCLGGGDEFKGVDCKIFSDPHAMTMALSVLVTIEML 910
            |||||||||||:.:::||:::::||:|.|.|.....:|.||:|:||..|:.|||||||||||||.
 Frog   845 AATVGAAAWWFIAAEDGPRITFYQLSHFLQCREENPDFDGVECEIFESPYPMTMALSVLVTIEMC 909

  Fly   911 NAMNSLSENQSLITMPPWCNLWLIGSMALSFTLHFVILYVDVLSTVFQVTPLSAEEWITVMKFSI 975
            ||:|||||||||:.||||.|:||:||:.||.:|||:||||:.|..:||:|||:..:|:.|:|.|:
 Frog   910 NALNSLSENQSLLRMPPWENVWLLGSICLSMSLHFLILYVEPLPLIFQITPLNLIQWLMVLKISL 974

  Fly   976 PVVLLDETLKFVAR 989
            ||:|||||||:|||
 Frog   975 PVILLDETLKYVAR 988

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
SERCANP_726381.1 P-type_ATPase_SERCA 5..989 CDD:319778 708/983 (72%)
atp2a2XP_031748548.1 P-type_ATPase_SERCA 5..988 CDD:319778 708/983 (72%)

Return to query results.
Submit another query.