Protein Alignment NSF and Nsf

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_006169.2
• Gene: NSF / 4905
• HGNCID: 8016
• Length: 744
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: NP_068516.2
• Gene: Nsf / 60355
• RGDID: 621594
• Length: 744
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 744
• Identity: 729/744 - (97%)
• Similarity: 742/744 - (99%)
• Gaps: 0/744 - (0%)

Human     1 MAGRSMQAARCPTDELSLTNCAVVNEKDFQSGQHVIVRTSPNHRYTFTLKTHPSVVPGSIAFSLP 65
            ||||:|||||||||||||:|||||||||:||||||:|||||||:|.|||:||||||||.||||||
  Rat     1 MAGRTMQAARCPTDELSLSNCAVVNEKDYQSGQHVMVRTSPNHKYIFTLRTHPSVVPGCIAFSLP 65

Human    66 QRKWAGLSIGQEIEVSLYTFDKAKQCIGTMTIEIDFLQKKSIDSNPYDTDKMAAEFIQQFNNQAF 130
            |||||||||||:|||:||:|||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 QRKWAGLSIGQDIEVALYSFDKAKQCIGTMTIEIDFLQKKNIDSNPYDTDKMAAEFIQQFNNQAF 130

Human   131 SVGQQLVFSFNEKLFGLLVKDIEAMDPSILKGEPATGKRQKIEVGLVVGNSQVAFEKAENSSLNL 195
            |||||||||||:|||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 SVGQQLVFSFNDKLFGLLVKDIEAMDPSILKGEPASGKRQKIEVGLVVGNSQVAFEKAENSSLNL 195

Human   196 IGKAKTKENRQSIINPDWNFEKMGIGGLDKEFSDIFRRAFASRVFPPEIVEQMGCKHVKGILLYG 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 IGKAKTKENRQSIINPDWNFEKMGIGGLDKEFSDIFRRAFASRVFPPEIVEQMGCKHVKGILLYG 260

Human   261 PPGCGKTLLARQIGKMLNAREPKVVNGPEILNKYVGESEANIRKLFADAEEEQRRLGANSGLHII 325
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  Rat   261 PPGCGKTLLARQIGKMLNAREPKVVNGPEILNKYVGESEANIRKLFADAEEEQRRLGANSGLHII 325

Human   326 IFDEIDAICKQRGSMAGSTGVHDTVVNQLLSKIDGVEQLNNILVIGMTNRPDLIDEALLRPGRLE 390
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  Rat   326 IFDEIDAICKQRGSMAGSTGVHDTVVNQLLSKIDGVEQLNNILVIGMTNRPDLIDEALLRPGRLE 390

Human   391 VKMEIGLPDEKGRLQILHIHTARMRGHQLLSADVDIKELAVETKNFSGAELEGLVRAAQSTAMNR 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 VKMEIGLPDEKGRLQILHIHTARMRGHQLLSADVDIKELAVETKNFSGAELEGLVRAAQSTAMNR 455

Human   456 HIKASTKVEVDMEKAESLQVTRGDFLASLENDIKPAFGTNQEDYASYIMNGIIKWGDPVTRVLDD 520
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  Rat   456 HIKASTKVEVDMEKAESLQVTRGDFLASLENDIKPAFGTNQEDYASYIMNGIIKWGDPVTRVLDD 520

Human   521 GELLVQQTKNSDRTPLVSVLLEGPPHSGKTALAAKIAEESNFPFIKICSPDKMIGFSETAKCQAM 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   521 GELLVQQTKNSDRTPLVSVLLEGPPHSGKTALAAKIAEESNFPFIKICSPDKMIGFSETAKCQAM 585

Human   586 KKIFDDAYKSQLSCVVVDDIERLLDYVPIGPRFSNLVLQALLVLLKKAPPQGRKLLIIGTTSRKD 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   586 KKIFDDAYKSQLSCVVVDDIERLLDYVPIGPRFSNLVLQALLVLLKKAPPQGRKLLIIGTTSRKD 650

Human   651 VLQEMEMLNAFSTTIHVPNIATGEQLLEALELLGNFKDKERTTIAQQVKGKKVWIGIKKLLMLIE 715
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  Rat   651 VLQEMEMLNAFSTTIHVPNIATGEQLLEALELLGNFKDKERTTIAQQVKGKKVWIGIKKLLMLIE 715

Human   716 MSLQMDPEYRVRKFLALLREEGASPLDFD 744
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  Rat   716 MSLQMDPEYRVRKFLALMREEGASPLDFD 744

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
NSF	NP_006169.2	CDC48_N	6..83	CDD:215012	67/76 (88%)
		CDC48_2	111..183	CDD:215011	69/71 (97%)
		CDC48	159..>606	CDD:273521	445/446 (100%)
		RecA-like_NSF-SEC18_r1-like	219..395	CDD:410912	175/175 (100%)
Nsf	NP_068516.2	CDC48_N	6..83	CDD:215012	67/76 (88%)
		CDC48_2	111..183	CDD:215011	69/71 (97%)
		CDC48	159..>606	CDD:273521	445/446 (100%)
		RecA-like_NSF-SEC18_r1-like	219..395	CDD:410912	175/175 (100%)