DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Atpalpha and Atp4a

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_732572.1 Gene:Atpalpha / 48971 FlyBaseID:FBgn0002921 Length:1041 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_036641.1 Gene:Atp4a / 24216 RGDID:2177 Length:1034 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1040 Identity:627/1040 - (60%)
Similarity:781/1040 - (75%) Gaps:15/1040 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    10 GRADSYRVATV-IATDDDNRTADGQYKSRRKMPAKV------NKKENLDDLKQELDIDFHKISPE 67
            |:|::|.:.:| :.|......|       .||..|.      .|||.|:::|:|::::.|::|..
  Rat     2 GKAENYELYSVELGTGPGGNMA-------AKMSKKKAGGGGGKKKEKLENMKKEMEMNDHQLSVS 59

  Fly    68 ELYQRFQTHPENGLSHAKAKENLERDGPNALTPPKQTPEWVKFCKNLFGGFAMLLWIGAILCFVA 132
            ||.|::||....||..:.|.|.|.|||||||.||:.|||:|||.:.|.||...|:|:.|.:|.:|
  Rat    60 ELEQKYQTSATKGLKASLAAELLLRDGPNALRPPRGTPEYVKFARQLAGGLQCLMWVAAAICLIA 124

  Fly   133 YSIQASTSEEPADDNLYLGIVLSAVVIVTGIFSYYQESKSSKIMESFKNMVPQFATVIREGEKLT 197
            ::||||..:...||||||.:.|.|||:|||.|.||||.||:.|:.||||:|||.|||||:|:|..
  Rat   125 FAIQASEGDLTTDDNLYLALALIAVVVVTGCFGYYQEFKSTNIIASFKNLVPQQATVIRDGDKFQ 189

  Fly   198 LRAEDLVLGDVVEVKFGDRIPADIRIIEARNFKVDNSSLTGESEPQSRGAEFTHENPLETKNLAF 262
            :.|:.||:||:||:|.|||:||||||:.|:..||||||||||||||:|..|.|||:||||:|:||
  Rat   190 INADQLVVGDLVEMKGGDRVPADIRILSAQGCKVDNSSLTGESEPQTRSPECTHESPLETRNIAF 254

  Fly   263 FSTNAVEGTAKGVVISCGDHTVMGRIAGLASGLDTGETPIAKEIHHFIHLITGVAVFLGVTFFVI 327
            |||..:||||:|:|:|.||.|::||||.||||::..:||||.||.||:.:|.|:|:..|.||||:
  Rat   255 FSTMCLEGTAQGLVVSTGDRTIIGRIASLASGVENEKTPIAIEIEHFVDIIAGLAILFGATFFVV 319

  Fly   328 AFILGYHWLDAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMASKNCLVKNLEAVETLGSTSTIC 392
            |..:||.:|.|::|.:.|:||.|||||||||||||:|||||:|||||:||||||||||||||.||
  Rat   320 AMCIGYTFLRAMVFFMAIVVAYVPEGLLATVTVCLSLTAKRLASKNCVVKNLEAVETLGSTSVIC 384

  Fly   393 SDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIIEADTTEDQSGVQYDRTSPGFKALSRIATLCNRAEFKGGQDG 457
            ||||||||||||||:|:||||.|..|||||||||..:|::|..::||.|:.||||||.||.|||.
  Rat   385 SDKTGTLTQNRMTVSHLWFDNHIHTADTTEDQSGQTFDQSSETWRALCRVLTLCNRAAFKSGQDA 449

  Fly   458 VPILKKEVSGDASEAALLKCMELALGDVMNIRKRNKKIAEVPFNSTNKYQVSIHETEDTNDPRYL 522
            ||:.|:.|.|||||.||||..||.||:.|..|.|..|:.|:|||||||:|:|||..||..|||:|
  Rat   450 VPVPKRIVIGDASETALLKFSELTLGNAMGYRDRFPKVCEIPFNSTNKFQLSIHTLEDPRDPRHL 514

  Fly   523 LVMKGAPERILERCSTIFINGKEKVLDEEMKEAFNNAYMELGGLGERVLGFCDFMLPSDKYPNGF 587
            |||||||||:|||||:|.|.|:|..|||:.:|||..||:.||||||||||||...|....||.|:
  Rat   515 LVMKGAPERVLERCSSILIKGQELPLDEQWREAFQTAYLSLGGLGERVLGFCQLYLNEKDYPPGY 579

  Fly   588 KFNTDDINFPIDNLRFVGLMSMIDPPRAAVPDAVAKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKSVGII 652
            .|:.:.:|||...|.|.||:||||||||.|||||.|||:|||:||||||||||||||||.|||||
  Rat   580 TFDVEAMNFPSSGLCFAGLVSMIDPPRATVPDAVLKCRTAGIRVIMVTGDHPITAKAIAASVGII 644

  Fly   653 SEGNETVEDIAQRLNIPVSEVNPREAKAAVVHGAELRDVSSDQLDEILRYHTEIVFARTSPQQKL 717
            |||:|||||||.||.:||.:||.::|:|.|::|.:|:|:...:|.|.||.|.|:|||||||||||
  Rat   645 SEGSETVEDIAARLRMPVDQVNKKDARACVINGMQLKDMDPSELVEALRTHPEMVFARTSPQQKL 709

  Fly   718 IIVEGCQRMGAIVAVTGDGVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEE 782
            :|||.|||:||||||||||||||||||||||||||||||||.:|.|||||||||||||||||||:
  Rat   710 VIVESCQRLGAIVAVTGDGVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDAAKNAADMILLDDNFASIVTGVEQ 774

  Fly   783 GRLIFDNLKKSIAYTLTSNIPEISPFLAFILCDIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEHAEA 847
            |||||||||||||||||.||||::|:|.:|...:|||||.:|||.|:|.||:.|::|||||.||:
  Rat   775 GRLIFDNLKKSIAYTLTKNIPELTPYLIYITVSVPLPLGCITILFIELCTDIFPSVSLAYEKAES 839

  Fly   848 DIMKRPPRDPFNDKLVNSRLISMAYGQIGMIQAAAGFFVYFVIMAENGFLPKKLFGIRKMWDSKA 912
            |||...||:|..|:|||..|.:.:|.|||.||:.|||..||..||:.|:.|....|:|..|:...
  Rat   840 DIMHLRPRNPRRDRLVNEPLAAYSYFQIGAIQSFAGFADYFTAMAQEGWFPLLCVGLRPQWEDHH 904

  Fly   913 VNDLTDSYGQEWTYRDRKTLEYTCHTAFFISIVVVQWADLIICKTRRNSIFQQG-MRNWALNFGL 976
            :.||.||||||||:..|...:|||:|.|||||.:.|.||::|.||||.|.|||| .||..|...:
  Rat   905 LQDLQDSYGQEWTFGQRLYQQYTCYTVFFISIEMCQIADVLIRKTRRLSAFQQGFFRNRILVIAI 969

  Fly   977 VFETVLAAFLSYCPGMEKGLRMYPLKLVWWFPAIPFALAIFIYDETRRFYLRRNPGGWLEQETYY 1041
            ||:..:..||.|||||.......|::..||...:||.|.||:|||.|:..:|..||.|.:||.||
  Rat   970 VFQVCIGCFLCYCPGMPNIFNFMPIRFQWWLVPMPFGLLIFVYDEIRKLGVRCCPGSWWDQELYY 1034

  Fly  1042  1041
              Rat  1035  1034

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
AtpalphaNP_732572.1 ATPase-IIC_X-K 45..1041 CDD:273445 616/996 (62%)
Atp4aNP_036641.1 H-K_ATPase_N 2..>27 CDD:312544 7/31 (23%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 15..40 6/31 (19%)
ATPase-IIC_X-K 42..1034 CDD:273445 613/991 (62%)

Return to query results.
Submit another query.