DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ATP2A3 and atp2a3

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_011522183.1 Gene:ATP2A3 / 489 HGNCID:813 Length:1114 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_697108.5 Gene:atp2a3 / 568671 ZFINID:ZDB-GENE-060531-103 Length:1005 Species:Danio rerio


Alignment Length:992 Identity:774/992 - (78%)
Similarity:885/992 - (89%) Gaps:3/992 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MEAAHLLPAADVLRHFSVTAEGGLSPAQVTGARERYGPNELPSEEGKSLWELVLEQFEDLLVRIL 65
            ||.||...|::||.:|.|....||:..||....::|||||||:||||||||||:|||||||||||
Zfish     1 MENAHTKSASEVLANFGVNENTGLTLEQVKNNFDKYGPNELPAEEGKSLWELVVEQFEDLLVRIL 65

Human    66 LLAALVSFVLAWFEEGEETTTAFVEPLVIMLILVANAIVGVWQERNAESAIEALKEYEPEMGKVI 130
            ||||.||||||.||||||:|||||||:||:|||||||::|||||||||:|||||||||||||||.
Zfish    66 LLAACVSFVLALFEEGEESTTAFVEPIVILLILVANAVIGVWQERNAENAIEALKEYEPEMGKVY 130

Human   131 RSDRKGVQRIRARDIVPGDIVEVAVGDKVPADLRLIEIKSTTLRVDQSILTGESVSVTKHTEAIP 195
            |.:|..||||:|||||||||||::||||||||:|:..||||||||||||||||||||.|||:.:|
Zfish   131 RMNRTAVQRIKARDIVPGDIVEISVGDKVPADIRITSIKSTTLRVDQSILTGESVSVIKHTDPVP 195

Human   196 DPRAVNQDKKNMLFSGTNITSGKAVGVAVATGLHTELGKIRSQMAAVEPERTPLQRKLDEFGRQL 260
            |||||||||||||||||||.:|:|:||.|:||:.||:||||:||||.|.|:||||:||||||:||
Zfish   196 DPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGRAIGVVVSTGVSTEIGKIRNQMAATEQEKTPLQQKLDEFGQQL 260

Human   261 SHAISVICVAVWVINIGHFADPAHGGSWLRGAVYYFKIAVALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRR 325
            |..||:||:|||||||||||||.|||||:|||:||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   261 SKVISLICIAVWVINIGHFADPVHGGSWIRGAIYYFKIAVALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRR 325

Human   326 MARKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMSVCRMFVVAEADAGSCLLHEFTISGTTYT 390
            ||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.:||..||.||||||||:||.
Zfish   326 MAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMSVCRMFVVNKADDSSCSLHEFTISGSTYA 390

Human   391 PEGEVRQGDQPVRCGQFDGLVELATICALCNDSALDYNEAKGVYEKVGEATETALTCLVEKMNVF 455
            |||||.:.|:.|:||.:||||||||||:|||||:||||||||||||||||||||||.||||||||
Zfish   391 PEGEVLKADKQVQCGDYDGLVELATICSLCNDSSLDYNEAKGVYEKVGEATETALTTLVEKMNVF 455

Human   456 DTDLQALSRVERAGACNTVIKQLMRKEFTLEFSRDRKSMSVYCTPTRPHPTGQGSKMFVKGAPES 520
            .|||..||:|:||.|||.:|:|||:|:|||||||||||||||||   |:.|...||||||||||.
Zfish   456 KTDLSGLSKVDRAAACNLIIRQLMQKKFTLEFSRDRKSMSVYCT---PNGTNSQSKMFVKGAPEG 517

Human   521 VIERCSSVRVGSRTAPLTPTSREQILAKIRDWGSGSDTLRCLALATRDAPPRKEDMELDDCSKFV 585
            ||:||..||||....|||...:|::::.|||||:|.||||||||||||:||..:.|:|::..||.
Zfish   518 VIDRCQFVRVGKERFPLTMAVKEELMSTIRDWGTGRDTLRCLALATRDSPPAVDKMDLENAGKFA 582

Human   586 QYETDLTFVGCVGMLDPPRPEVAACITRCYQAGIRVVMITGDNKGTAVAICRRLGIFGDTEDVAG 650
            :||:.||||||||||||||.||...|..|.:|||||:||||||||||||||||:|||.:.|||.|
Zfish   583 EYESSLTFVGCVGMLDPPRKEVIGSIKLCNKAGIRVIMITGDNKGTAVAICRRIGIFSENEDVEG 647

Human   651 KAYTGREFDDLSPEQQRQACRTARCFARVEPAHKSRIVENLQSFNEITAMTGDGVNDAPALKKAE 715
            :||||||||||:||.||:|.:.|||||||||||||:||..||||:||||||||||||||||||||
Zfish   648 RAYTGREFDDLAPEAQREAVKRARCFARVEPAHKSKIVAYLQSFDEITAMTGDGVNDAPALKKAE 712

Human   716 IGIAMGSGTAVAKSAAEMVLSDDNFASIVAAVEEGRAIYSNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAI 780
            |||||||||||||||:|||||||||::||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||
Zfish   713 IGIAMGSGTAVAKSASEMVLSDDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAI 777

Human   781 LGLPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMEKLPRSPREALISGWLFFRYLAIGVYVG 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|.||:|:|.||||||||||||||.|||
Zfish   778 LGLPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMDKPPRNPKEPLISGWLFFRYLAIGGYVG 842

Human   846 LATVAAATWWFVYDAEGPHINFYQLRNFLKCSEDNPLFAGIDCEVFESRFPTTMALSVLVTIEMC 910
            |.||:|||||:::|.:||.::|||||:|::|:|:||:|.||:|||||||:||||||||||||||.
Zfish   843 LGTVSAATWWYLFDEDGPQVSFYQLRHFMQCTEENPMFEGINCEVFESRYPTTMALSVLVTIEMF 907

Human   911 NALNSVSENQSLLRMPPWMNPWLLVAVAMSMALHFLILLVPPLPLIFQVTPLSGRQWVVVLQISL 975
            |||||:||||||||||||:|.|||.|:.:|::||||||.|.|||||||||||...||::|.:||:
Zfish   908 NALNSLSENQSLLRMPPWVNIWLLGAIILSLSLHFLILHVEPLPLIFQVTPLHFSQWIIVFKISI 972

Human   976 PVILLDEALKYLSRNHM 992
            |||||||||||:||:|:
Zfish   973 PVILLDEALKYISRHHL 989

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ATP2A3XP_011522183.1 P-type_ATPase_SERCA 5..989 CDD:319778 768/983 (78%)
atp2a3XP_697108.5 P-type_ATPase_SERCA 5..986 CDD:319778 768/983 (78%)

Return to query results.
Submit another query.