DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ATP2A3 and SERCA

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_011522183.1 Gene:ATP2A3 / 489 HGNCID:813 Length:1114 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_726381.1 Gene:SERCA / 49297 FlyBaseID:FBgn0263006 Length:1020 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:989 Identity:673/989 - (68%)
Similarity:795/989 - (80%) Gaps:0/989 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MEAAHLLPAADVLRHFSVTAEGGLSPAQVTGARERYGPNELPSEEGKSLWELVLEQFEDLLVRIL 65
            ||..|.......|..|....|.||:..|:...:::|||||||:|||||:|:||||||:||||:||
  Fly     1 MEDGHSKTVEQSLNFFGTDPERGLTLDQIKANQKKYGPNELPTEEGKSIWQLVLEQFDDLLVKIL 65

Human    66 LLAALVSFVLAWFEEGEETTTAFVEPLVIMLILVANAIVGVWQERNAESAIEALKEYEPEMGKVI 130
            ||||::|||||.|||.|||.|||||||||:|||:|||:||||||||||||||||||||||||||:
  Fly    66 LLAAIISFVLALFEEHEETFTAFVEPLVILLILIANAVVGVWQERNAESAIEALKEYEPEMGKVV 130

Human   131 RSDRKGVQRIRARDIVPGDIVEVAVGDKVPADLRLIEIKSTTLRVDQSILTGESVSVTKHTEAIP 195
            |.|:.|:|::||::|||||:|||:||||:|||:|:..|.|||||:||||||||||||.|||:|||
  Fly   131 RQDKSGIQKVRAKEIVPGDLVEVSVGDKIPADIRITHIYSTTLRIDQSILTGESVSVIKHTDAIP 195

Human   196 DPRAVNQDKKNMLFSGTNITSGKAVGVAVATGLHTELGKIRSQMAAVEPERTPLQRKLDEFGRQL 260
            |||||||||||:||||||:.:|||.||.:.|||.|.:||||::|:..|..:||||:||||||.||
  Fly   196 DPRAVNQDKKNILFSGTNVAAGKARGVVIGTGLSTAIGKIRTEMSETEEIKTPLQQKLDEFGEQL 260

Human   261 SHAISVICVAVWVINIGHFADPAHGGSWLRGAVYYFKIAVALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRR 325
            |..|||||||||.||||||.||||||||::||:||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly   261 SKVISVICVAVWAINIGHFNDPAHGGSWIKGAIYYFKIAVALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRR 325

Human   326 MARKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMSVCRMFVVAEADAGSCLLHEFTISGTTYT 390
            ||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||:..:.:.......||.::|:||.
  Fly   326 MAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMSVSRMFIFDKVEGNDSSFLEFEMTGSTYE 390

Human   391 PEGEVRQGDQPVRCGQFDGLVELATICALCNDSALDYNEAKGVYEKVGEATETALTCLVEKMNVF 455
            |.|||....|.::...:|.|.||:|||.:|||||:||||.|..:|||||||||||..|.||:|.|
  Fly   391 PIGEVFLNGQRIKAADYDTLQELSTICIMCNDSAIDYNEFKQAFEKVGEATETALIVLAEKLNSF 455

Human   456 DTDLQALSRVERAGACNTVIKQLMRKEFTLEFSRDRKSMSVYCTPTRPHPTGQGSKMFVKGAPES 520
            ..:...|.|...|.||...|:...:|||||||||||||||.||||.:....|.|.|:|||||||.
  Fly   456 SVNKSGLDRRSAAIACRGEIETKWKKEFTLEFSRDRKSMSSYCTPLKASRLGTGPKLFVKGAPEG 520

Human   521 VIERCSSVRVGSRTAPLTPTSREQILAKIRDWGSGSDTLRCLALATRDAPPRKEDMELDDCSKFV 585
            |:|||:..|||:...|||...:.:|||....:|:|.|||||||||..|:|.:.::|:|.|.:||.
  Fly   521 VLERCTHARVGTTKVPLTSALKAKILALTGQYGTGRDTLRCLALAVADSPMKPDEMDLGDSTKFY 585

Human   586 QYETDLTFVGCVGMLDPPRPEVAACITRCYQAGIRVVMITGDNKGTAVAICRRLGIFGDTEDVAG 650
            |||.:|||||.||||||||.||...|.||..|||||::||||||.||.|||||:|:|.:.||..|
  Fly   586 QYEVNLTFVGVVGMLDPPRKEVFDSIVRCRAAGIRVIVITGDNKATAEAICRRIGVFAEDEDTTG 650

Human   651 KAYTGREFDDLSPEQQRQACRTARCFARVEPAHKSRIVENLQSFNEITAMTGDGVNDAPALKKAE 715
            |:|:|||||||||.:|:.|...:|.|:||||.|||:|||.|||.|||:|||||||||||||||||
  Fly   651 KSYSGREFDDLSPTEQKAAVARSRLFSRVEPQHKSKIVEFLQSMNEISAMTGDGVNDAPALKKAE 715

Human   716 IGIAMGSGTAVAKSAAEMVLSDDNFASIVAAVEEGRAIYSNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAI 780
            ||||||||||||||||||||:||||:|||:|||||||||:|||||||||||||:||||.|||||.
  Fly   716 IGIAMGSGTAVAKSAAEMVLADDNFSSIVSAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNIGEVVSIFLTAA 780

Human   781 LGLPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMEKLPRSPREALISGWLFFRYLAIGVYVG 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||...|.||||||||||:|||.|||
  Fly   781 LGLPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMEKPPRKADEGLISGWLFFRYMAIGFYVG 845

Human   846 LATVAAATWWFVYDAEGPHINFYQLRNFLKCSEDNPLFAGIDCEVFESRFPTTMALSVLVTIEMC 910
            .|||.||.||||:..|||.::::||.:.|.|......|.|:||::|......||||||||||||.
  Fly   846 AATVGAAAWWFVFSDEGPKLSYWQLTHHLSCLGGGDEFKGVDCKIFSDPHAMTMALSVLVTIEML 910

Human   911 NALNSVSENQSLLRMPPWMNPWLLVAVAMSMALHFLILLVPPLPLIFQVTPLSGRQWVVVLQISL 975
            ||:||:||||||:.||||.|.||:.::|:|..|||:||.|..|..:|||||||..:|:.|::.|:
  Fly   911 NAMNSLSENQSLITMPPWCNLWLIGSMALSFTLHFVILYVDVLSTVFQVTPLSAEEWITVMKFSI 975

Human   976 PVILLDEALKYLSR 989
            ||:||||.||:::|
  Fly   976 PVVLLDETLKFVAR 989

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ATP2A3XP_011522183.1 P-type_ATPase_SERCA 5..989 CDD:319778 670/983 (68%)
SERCANP_726381.1 P-type_ATPase_SERCA 5..989 CDD:319778 670/983 (68%)

Return to query results.
Submit another query.