DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ATP2A3 and Atp2a3

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_011522183.1 Gene:ATP2A3 / 489 HGNCID:813 Length:1114 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_063124535.1 Gene:Atp2a3 / 25391 RGDID:2175 Length:1189 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:992 Identity:943/992 - (95%)
Similarity:966/992 - (97%) Gaps:0/992 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MEAAHLLPAADVLRHFSVTAEGGLSPAQVTGARERYGPNELPSEEGKSLWELVLEQFEDLLVRIL 65
            ||.||||.||||||.|||||||||:..|||.|||||||||||:||||||||||:|||||||||||
  Rat   191 MEEAHLLSAADVLRRFSVTAEGGLTLEQVTDARERYGPNELPTEEGKSLWELVVEQFEDLLVRIL 255

Human    66 LLAALVSFVLAWFEEGEETTTAFVEPLVIMLILVANAIVGVWQERNAESAIEALKEYEPEMGKVI 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   256 LLAALVSFVLAWFEEGEETTTAFVEPLVIMLILVANAIVGVWQERNAESAIEALKEYEPEMGKVI 320

Human   131 RSDRKGVQRIRARDIVPGDIVEVAVGDKVPADLRLIEIKSTTLRVDQSILTGESVSVTKHTEAIP 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||
  Rat   321 RSDRKGVQRIRARDIVPGDIVEVAVGDKVPADLRLIEIKSTTLRVDQSILTGESVSVTKHTDAIP 385

Human   196 DPRAVNQDKKNMLFSGTNITSGKAVGVAVATGLHTELGKIRSQMAAVEPERTPLQRKLDEFGRQL 260
            |||||||||||||||||||.||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   386 DPRAVNQDKKNMLFSGTNIASGKALGVAVATGLHTELGKIRSQMAAVEPERTPLQRKLDEFGRQL 450

Human   261 SHAISVICVAVWVINIGHFADPAHGGSWLRGAVYYFKIAVALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRR 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   451 SHAISVICVAVWVINIGHFADPAHGGSWLRGAVYYFKIAVALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRR 515

Human   326 MARKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMSVCRMFVVAEADAGSCLLHEFTISGTTYT 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||:|.||||||||||||
  Rat   516 MARKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMSVCRMFVVAEAEAGACRLHEFTISGTTYT 580

Human   391 PEGEVRQGDQPVRCGQFDGLVELATICALCNDSALDYNEAKGVYEKVGEATETALTCLVEKMNVF 455
            ||||||||:|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   581 PEGEVRQGEQLVRCGQFDGLVELATICALCNDSALDYNEAKGVYEKVGEATETALTCLVEKMNVF 645

Human   456 DTDLQALSRVERAGACNTVIKQLMRKEFTLEFSRDRKSMSVYCTPTRPHPTGQGSKMFVKGAPES 520
            ||||:.|||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||..|..|||||||||||||
  Rat   646 DTDLKGLSRVERAGACNSVIKQLMRKEFTLEFSRDRKSMSVYCTPTRADPKAQGSKMFVKGAPES 710

Human   521 VIERCSSVRVGSRTAPLTPTSREQILAKIRDWGSGSDTLRCLALATRDAPPRKEDMELDDCSKFV 585
            ||||||||||||||.||:.||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||:|||||:||
  Rat   711 VIERCSSVRVGSRTVPLSATSREHILAKIRDWGSGSDTLRCLALATRDTPPRKEDMQLDDCSQFV 775

Human   586 QYETDLTFVGCVGMLDPPRPEVAACITRCYQAGIRVVMITGDNKGTAVAICRRLGIFGDTEDVAG 650
            ||||.||||||||||||||||||||||||.:||||||||||||||||||||||||||||||||.|
  Rat   776 QYETGLTFVGCVGMLDPPRPEVAACITRCSRAGIRVVMITGDNKGTAVAICRRLGIFGDTEDVLG 840

Human   651 KAYTGREFDDLSPEQQRQACRTARCFARVEPAHKSRIVENLQSFNEITAMTGDGVNDAPALKKAE 715
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   841 KAYTGREFDDLSPEQQRQACRTARCFARVEPAHKSRIVENLQSFNEITAMTGDGVNDAPALKKAE 905

Human   716 IGIAMGSGTAVAKSAAEMVLSDDNFASIVAAVEEGRAIYSNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAI 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||
  Rat   906 IGIAMGSGTAVAKSAAEMVLSDDNFASIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAI 970

Human   781 LGLPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMEKLPRSPREALISGWLFFRYLAIGVYVG 845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||
  Rat   971 LGLPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMEKLPRNPREALISGWLFFRYLAIGVYVG 1035

Human   846 LATVAAATWWFVYDAEGPHINFYQLRNFLKCSEDNPLFAGIDCEVFESRFPTTMALSVLVTIEMC 910
            |||||||||||:||||||.:.|:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1036 LATVAAATWWFLYDAEGPQVTFHQLRNFLKCSEDNPLFAGIDCEVFESRFPTTMALSVLVTIEMC 1100

Human   911 NALNSVSENQSLLRMPPWMNPWLLVAVAMSMALHFLILLVPPLPLIFQVTPLSGRQWVVVLQISL 975
            ||||||||||||||||||:|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||:||
  Rat  1101 NALNSVSENQSLLRMPPWLNPWLLGAVVMSMALHFLILLVPPLPLIFQVTPLSGRQWGVVLQMSL 1165

Human   976 PVILLDEALKYLSRNHM 992
            ||||||||||||||:|:
  Rat  1166 PVILLDEALKYLSRHHV 1182

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ATP2A3XP_011522183.1 P-type_ATPase_SERCA 5..989 CDD:319778 937/983 (95%)
Atp2a3XP_063124535.1 None

Return to query results.
Submit another query.