DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ATP2A2 and atp2a2b

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_733765.1 Gene:ATP2A2 / 488 HGNCID:812 Length:1042 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_005161253.2 Gene:atp2a2b / 568265 ZFINID:ZDB-GENE-030131-867 Length:1041 Species:Danio rerio


Alignment Length:1042 Identity:911/1042 - (87%)
Similarity:983/1042 - (94%) Gaps:1/1042 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MENAHTKTVEEVLGHFGVNESTGLSLEQVKKLKERWGSNELPAEEGKTLLELVIEQFEDLLVRIL 65
            ||||||||||||...|.|||||||.|||||:.:|:||.|||||||||:|.|||:|||||||||||
Zfish     1 MENAHTKTVEEVYSFFAVNESTGLGLEQVKRQREKWGPNELPAEEGKSLWELVVEQFEDLLVRIL 65

Human    66 LLAACISFVLAWFEEGEETITAFVEPFVILLILVANAIVGVWQERNAENAIEALKEYEPEMGKVY 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish    66 LLAACISFVLAWFEEGEETITAFVEPFVILLILIANAIVGVWQERNAENAIEALKEYEPEMGKVY 130

Human   131 RQDRKSVQRIKAKDIVPGDIVEIAVGDKVPADIRLTSIKSTTLRVDQSILTGESVSVIKHTDPVP 195
            |||||:||||||:|||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   131 RQDRKTVQRIKARDIVPGDIVEVAVGDKVPADIRLTSIKSTTLRVDQSILTGESVSVIKHTDPVP 195

Human   196 DPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGKAMGVVVATGVNTEIGKIRDEMVATEQERTPLQQKLDEFGEQL 260
            ||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||.:||||||||||||||||:||
Zfish   196 DPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGKAVGVVVATGVNTEIGKIRDEMASTEQERTPLQQKLDEFGQQL 260

Human   261 SKVISLICIAVWIINIGHFNDPVHGGSWIRGAIYYFKIAVALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRR 325
            ||||||||||||||||||||||||||||:|||:||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   261 SKVISLICIAVWIINIGHFNDPVHGGSWVRGAVYYFKIAVALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRR 325

Human   326 MAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMSVCRMFILDRVEGDTCSLNEFTITGSTYA 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|:..|:||.|.||:|:|||||
Zfish   326 MAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMSVCRMFIVDQANGNTCFLKEFSISGSTYA 390

Human   391 PIGEVHKDDKPVNCHQYDGLVELATICALCNDSALDYNEAKGVYEKVGEATETALTCLVEKMNVF 455
            |.|:|..:.|||.|.::|.|||:|:||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   391 PDGQVCHEGKPVQCSKFDALVEMASICALCNDSSLDYNEAKGVYEKVGEATETALTCLVEKMNVF 455

Human   456 DTELKGLSKIERANACNSVIKQLMKKEFTLEFSRDRKSMSVYCTPNKPSRTSMSKMFVKGAPEGV 520
            |||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||| :|:||.|||||||||||
Zfish   456 DTELKGLSKVERANACNSVIKQLMKKEFTLEFSRDRKSMSVYCTPNK-ARSSMGKMFVKGAPEGV 519

Human   521 IDRCTHIRVGSTKVPMTSGVKQKIMSVIREWGSGSDTLRCLALATHDNPLRREEMHLEDSANFIK 585
            ||||||||||..|||||.|:|:||||||||:|:|.||||||||||.||||.:|.:.||||..|::
Zfish   520 IDRCTHIRVGGNKVPMTPGIKEKIMSVIREYGTGRDTLRCLALATRDNPLSKESLVLEDSTRFVE 584

Human   586 YETNLTFVGCVGMLDPPRIEVASSVKLCRQAGIRVIMITGDNKGTAVAICRRIGIFGQDEDVTSK 650
            |||:||||||||||||||.|||:|:||||||||||||||||||||||||||||||||:::||:..
Zfish   585 YETDLTFVGCVGMLDPPRAEVAASIKLCRQAGIRVIMITGDNKGTAVAICRRIGIFGENDDVSRM 649

Human   651 AFTGREFDELNPSAQRDACLNARCFARVEPSHKSKIVEFLQSFDEITAMTGDGVNDAPALKKAEI 715
            |:||||||:|:.:|||:|.|.|||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||
Zfish   650 AYTGREFDDLSAAAQREAVLTARCFARVEPSHKSKIVEFLQSYDEITAMTGDGVNDAPALKKAEI 714

Human   716 GIAMGSGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAAL 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   715 GIAMGSGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAAL 779

Human   781 GFPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMNKPPRNPKEPLISGWLFFRYLAIGCYVGA 845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||.:|||||||||||||||||||||
Zfish   780 GFPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMSKPPRNAREPLISGWLFFRYLAIGCYVGA 844

Human   846 ATVGAAAWWFIAADGGPRVSFYQLSHFLQCKEDNPDFEGVDCAIFESPYPMTMALSVLVTIEMCN 910
            |||||||||||||:.||||:||||||||||..|||:|||:.|.||.|||||||||||||||||||
Zfish   845 ATVGAAAWWFIAAEDGPRVTFYQLSHFLQCAPDNPEFEGLQCEIFGSPYPMTMALSVLVTIEMCN 909

Human   911 ALNSLSENQSLLRMPPWENIWLVGSICLSMSLHFLILYVEPLPLIFQITPLNVTQWLMVLKISLP 975
            ||||:|||||||.||||||:||:|:||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||
Zfish   910 ALNSVSENQSLLHMPPWENVWLLGAICLSMSLHFLILYVEPLPMIFQITPLNVTQWLMVLKISLP 974

Human   976 VILMDETLKFVARNYLEPGKECVQPATKSCSFSACTDGISWPFVLLIMPLVIWVYSTDTNFSDMF 1040
            |||:||.|||.|||||:..|:...|..|:||.||||:|||||||.|.:|||:|:||||||.:::|
Zfish   975 VILLDEVLKFAARNYLDKPKDLDNPKGKACSLSACTEGISWPFVALSLPLVLWIYSTDTNVAELF 1039

Human  1041 WS 1042
            ||
Zfish  1040 WS 1041

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ATP2A2NP_733765.1 P-type_ATPase_SERCA 5..988 CDD:319778 872/982 (89%)
Interaction with HAX1. /evidence=ECO:0000269|PubMed:18971376 575..594 11/18 (61%)
Interaction with PLN. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P04191 787..807 19/19 (100%)
Interaction with TMEM64 and PDIA3. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:O55143 788..1042 210/253 (83%)
Interaction with PLN. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P04191 931..942 8/10 (80%)
atp2a2bXP_005161253.2 None

Return to query results.
Submit another query.