DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ATP2A2 and sca-1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_733765.1 Gene:ATP2A2 / 488 HGNCID:812 Length:1042 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_499386.1 Gene:sca-1 / 176512 WormBaseID:WBGene00004736 Length:1059 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:1044 Identity:715/1044 - (68%)
Similarity:839/1044 - (80%) Gaps:25/1044 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MENAHTKTVEEVLGHFGVNESTGLSLEQVKKLKERWGSNELPAEEGKTLLELVIEQFEDLLVRIL 65
            ||:||.|...||...||.... ||:.:||:.|:.::|.||:||||||:|.||::|||:||||:||
 Worm     1 MEDAHAKDANEVCKFFGTGPE-GLTPQQVETLRNKYGENEMPAEEGKSLWELILEQFDDLLVKIL 64

Human    66 LLAACISFVLAWFEEGE---ETITAFVEPFVILLILVANAIVGVWQERNAENAIEALKEYEPEMG 127
            ||||.||||||.|||.|   |.:|||||||||||||:|||.||||||||||:||||||||||||.
 Worm    65 LLAAIISFVLALFEEHEDQTEAVTAFVEPFVILLILIANATVGVWQERNAESAIEALKEYEPEMA 129

Human   128 KVYRQDRKSVQRIKAKDIVPGDIVEIAVGDKVPADIRLTSIKSTTLRVDQSILTGESVSVIKHTD 192
            ||.|.....:|.::||::||||:||::||||:|||:||..|.|||:|:|||||||||||||||||
 Worm   130 KVIRSGHHGIQMVRAKELVPGDLVEVSVGDKIPADLRLVKIYSTTIRIDQSILTGESVSVIKHTD 194

Human   193 PVPDPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGKAMGVVVATGVNTEIGKIRDEMVATEQERTPLQQKLDEFG 257
            .|||||||||||||.||||||:|:|||.|:|..||:.|||||||.||..||.|:|||||||||||
 Worm   195 SVPDPRAVNQDKKNCLFSGTNVASGKARGIVFGTGLTTEIGKIRTEMAETENEKTPLQQKLDEFG 259

Human   258 EQLSKVISLICIAVWIINIGHFNDPVHGGSWIRGAIYYFKIAVALAVAAIPEGLPAVITTCLALG 322
            ||||||||:||:|||.|||||||||.|||||::||||||||||||||||||||||||||||||||
 Worm   260 EQLSKVISVICVAVWAINIGHFNDPAHGGSWVKGAIYYFKIAVALAVAAIPEGLPAVITTCLALG 324

Human   323 TRRMAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMSVCRMFILDRVEGDTCSLNEFTITGS 387
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.:|||..:..||..:..||.|:||
 Worm   325 TRRMAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMSVSKMFIAGQASGDNINFTEFAISGS 389

Human   388 TYAPIGEVHKDDKPVN--CHQYDGLVELATICALCNDSALDYNEAKGVYEKVGEATETALTCLVE 450
            ||.|:|:|..:.:.:|  ..:::.|.|||.|||:||||::||||.|.:||||||||||||..|.|
 Worm   390 TYEPVGKVSTNGREINPAAGEFESLTELAMICAMCNDSSVDYNETKKIYEKVGEATETALIVLAE 454

Human   451 KMNVFDTELKGLSKIERANACNSVIKQLMKKEFTLEFSRDRKSMSVYCTPNKPSRTSMSKMFVKG 515
            |||||.|...|||..|....||.||:|..||||||||||||||||.||.|  .|..|.:||||||
 Worm   455 KMNVFGTSKAGLSPKELGGVCNRVIQQKWKKEFTLEFSRDRKSMSAYCFP--ASGGSGAKMFVKG 517

Human   516 APEGVIDRCTHIRVGSTKVPMTSGVKQKIMSVIREWGSGSDTLRCLALATHDNPLRREEMHLEDS 580
            |||||:.||||:||...|||:||.:.|||:....::|:|.||||||||.|.|.|:....|:||||
 Worm   518 APEGVLGRCTHVRVNGQKVPLTSAMTQKIVDQCVQYGTGRDTLRCLALGTIDTPVSVSNMNLEDS 582

Human   581 ANFIKYETNLTFVGCVGMLDPPRIEVASSVKLCRQAGIRVIMITGDNKGTAVAICRRIGIFGQDE 645
            ..|:|||.::||||.||||||||.||:.|:|.|..|||||||||||||.||.||.||||:||::|
 Worm   583 TQFVKYEQDITFVGVVGMLDPPRTEVSDSIKACNHAGIRVIMITGDNKNTAEAIGRRIGLFGENE 647

Human   646 DVTSKAFTGREFDELNPSAQRDACLNARCFARVEPSHKSKIVEFLQSFDEITAMTGDGVNDAPAL 710
            |.|.||:||||||:|.|..|.:||..|:.|||||||||||||:.|||..||||||||||||||||
 Worm   648 DTTGKAYTGREFDDLPPEQQSEACRRAKLFARVEPSHKSKIVDILQSQGEITAMTGDGVNDAPAL 712

Human   711 KKAEIGIAMGSGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIF 775
            |||||||:|||||||||:|||||||||||::||:||||||||||||||||||||||||||||.||
 Worm   713 KKAEIGISMGSGTAVAKSASEMVLADDNFASIVSAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVSIF 777

Human   776 LTAALGFPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMNKPPRNPKEPLISGWLFFRYLAIG 840
            :.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||::.||:..:.||||||||||||:|
 Worm   778 MVAALGIPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMDRHPRSANDGLISGWLFFRYLAVG 842

Human   841 CYVGAATVGAAAWWFIAADGGPRVSFYQLSHFLQCKEDNPDFEGVDCAIFESPYPMTMALSVLVT 905
            .|||.|||||:.|||:..:.||::::|||:|:::|:.:..:|..:|||:||..:|..||||||||
 Worm   843 TYVGVATVGASMWWFLLYEEGPQITYYQLTHWMRCEIEPDNFADLDCAVFEDNHPNAMALSVLVT 907

Human   906 IEMCNALNSLSENQSLLRMPPWENIWLVGSICLSMSLHFLILYVEPLPLIFQITPLNVTQWLMVL 970
            |||.||:||||||||||.||||:||||:.:|.|||||||:||||:.:..||||||||..:|:.||
 Worm   908 IEMLNAINSLSENQSLLVMPPWKNIWLMAAISLSMSLHFVILYVDIMATIFQITPLNWVEWIAVL 972

Human   971 KISLPVILMDETLKFVARNYLEPGKECVQPATKSCSFSACTDGISWPFVLLIMPLVIWVYSTDTN 1035
            ||||||:|:||.|||:||||::...|.|....:|.                 :.|:.||..|...
 Worm   973 KISLPVLLLDEILKFIARNYIDGKPETVGAKARSA-----------------ISLLAWVSVTLAY 1020

Human  1036 FSDM 1039
            |:.|
 Worm  1021 FAWM 1024

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ATP2A2NP_733765.1 P-type_ATPase_SERCA 5..988 CDD:319778 699/987 (71%)
Interaction with HAX1. /evidence=ECO:0000269|PubMed:18971376 575..594 11/18 (61%)
Interaction with PLN. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P04191 787..807 19/19 (100%)
Interaction with TMEM64 and PDIA3. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:O55143 788..1042 148/252 (59%)
Interaction with PLN. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P04191 931..942 6/10 (60%)
sca-1NP_499386.1 P-type_ATPase_SERCA 5..990 CDD:319778 699/987 (71%)

Return to query results.
Submit another query.