DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ATP2A1 and atp2a1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_775293.1 Gene:ATP2A1 / 487 HGNCID:811 Length:1001 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001428356.1 Gene:atp2a1 / 260440 ZFINID:ZDB-GENE-020905-1 Length:1005 Species:Danio rerio


Alignment Length:996 Identity:853/996 - (85%)
Similarity:925/996 - (92%) Gaps:0/996 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MEAAHAKTTEECLAYFGVSETTGLTPDQVKRNLEKYGLNELPAEEGKTLWELVIEQFEDLLVRIL 65
            ||.||.|.|.||||||||||:|||||:|||:|..|||.|||||||||::||||:|||||||||||
Zfish     1 MENAHTKETPECLAYFGVSESTGLTPEQVKKNQAKYGFNELPAEEGKSIWELVVEQFEDLLVRIL 65

Human    66 LLAACISFVLAWFEEGEETITAFVEPFVILLILIANAIVGVWQERNAENAIEALKEYEPEMGKVY 130
            |||||||||||||||||||:|||||||||||||||||:||||||||||:||||||||||||||||
Zfish    66 LLAACISFVLAWFEEGEETVTAFVEPFVILLILIANAVVGVWQERNAESAIEALKEYEPEMGKVY 130

Human   131 RADRKSVQRIKARDIVPGDIVEVAVGDKVPADIRILAIKSTTLRVDQSILTGESVSVIKHTEPVP 195
            |:|||||||||||:|||||||||:|||||||||||.||:|||||||||||||||||||||||.||
Zfish   131 RSDRKSVQRIKAREIVPGDIVEVSVGDKVPADIRITAIRSTTLRVDQSILTGESVSVIKHTESVP 195

Human   196 DPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGKALGIVATTGVGTEIGKIRDQMAATEQDKTPLQQKLDEFGEQL 260
            ||||||||||||||||||||||||:|:|..|||.|||||||||||||||:|||||||||||||||
Zfish   196 DPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGKAIGVVVATGVSTEIGKIRDQMAATEQEKTPLQQKLDEFGEQL 260

Human   261 SKVISLICVAVWLINIGHFNDPVHGGSWFRGAIYYFKIAVALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRR 325
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||:||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   261 SKVISLICVAVWLINIGHFNDPVHGGSWIRGAVYYFKIAVALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRR 325

Human   326 MAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMSVCKMFIIDKVDGDICLLNEFSITGSTYA 390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||:|:||:|:...|:::.|:||.|.
Zfish   326 MAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMCVTKMFVIEKVEGESVTLDQYDISGSKYT 390

Human   391 PEGEVLKNDKPVRPGQYDGLVELATICALCNDSSLDFNEAKGVYEKVGEATETALTTLVEKMNVF 455
            |||||.||..||:.||:|||||||||||||||||||:||:||:||||||||||||..||||||||
Zfish   391 PEGEVTKNGLPVKCGQFDGLVELATICALCNDSSLDYNESKGIYEKVGEATETALCCLVEKMNVF 455

Human   456 NTDVRSLSKVERANACNSVIRQLMKKEFTLEFSRDRKSMSVYCSPAKSSRAAVGNKMFVKGAPEG 520
            |||||.||||||||.|.:||:|||||:||||||||||||||||||||:|:|.|||||||||||||
Zfish   456 NTDVRGLSKVERANTCCAVIKQLMKKDFTLEFSRDRKSMSVYCSPAKASKAPVGNKMFVKGAPEG 520

Human   521 VIDRCNYVRVGTTRVPLTGPVKEKIMAVIKEWGTGRDTLRCLALATRDTPPKREEMVLDDSARFL 585
            |||||.||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||.|.:.|||.|:||.:|.
Zfish   521 VIDRCAYVRVGTTRVPLTGPVKDKIMAVIKEWGTGRDTLRCLALATRDNPLRPEEMNLEDSTKFA 585

Human   586 EYETDLTFVGVVGMLDPPRKEVTGSIQLCRDAGIRVIMITGDNKGTAIAICRRIGIFGENEEVAD 650
            ||||||||||.|||||||||||.|||:|||.||||||||||||||||:|||||||||.::|:|..
Zfish   586 EYETDLTFVGCVGMLDPPRKEVVGSIELCRAAGIRVIMITGDNKGTAVAICRRIGIFSDDEDVTG 650

Human   651 RAYTGREFDDLPLAEQREACRRACCFARVEPSHKSKIVEYLQSYDEITAMTGDGVNDAPALKKAE 715
            ||:||||||||||.:||||.|:|||:|||||||||||||:||.:|||||||||||||||||||||
Zfish   651 RAFTGREFDDLPLPQQREAVRKACCYARVEPSHKSKIVEFLQGFDEITAMTGDGVNDAPALKKAE 715

Human   716 IGIAMGSGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAA 780
            |||||||||||||:||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   716 IGIAMGSGTAVAKSASEMVLADDNFSSIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAA 780

Human   781 LGLPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMDRPPRSPKEPLISGWLFFRYMAIGGYVG 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.:.|||||||||||||||||:|||||||
Zfish   781 LGLPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMGKAPRSPKEPLISGWLFFRYLAIGGYVG 845

Human   846 AATVGAAAWWFLYAEDGPHVNYSQLTHFMQCTEDNTHFEGIDCEVFEAPEPMTMALSVLVTIEMC 910
            ||||.||.|||||.::||.|::.||:||||||.||..|.||:||||||..|||||||||||||||
Zfish   846 AATVAAAGWWFLYCDEGPMVSFYQLSHFMQCTADNEDFAGIECEVFEAAPPMTMALSVLVTIEMC 910

Human   911 NALNSLSENQSLLRMPPWVNIWLLGSICLSMSLHFLILYVDPLPMIFKLRALDLTQWLMVLKISL 975
            ||||||||||||||||||.|:||.|::.|||||||:|:|||||||||||..|:..||::|||:|.
Zfish   911 NALNSLSENQSLLRMPPWSNLWLAGAMTLSMSLHFMIIYVDPLPMIFKLTHLNFDQWIVVLKLSF 975

Human   976 PVIGLDEILKFVARNYLEDPE 996
            |||.:||.||||||||||:.:
Zfish   976 PVILIDEALKFVARNYLEEKD 996

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ATP2A1NP_775293.1 P-type_ATPase_SERCA 5..989 CDD:319778 844/983 (86%)
Interaction with PLN. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P04191 788..808 19/19 (100%)
Interaction with PLN. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P04191 932..943 6/10 (60%)
atp2a1NP_001428356.1 None

Return to query results.
Submit another query.