DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment NOTCH4 and Notch4

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_004548.3 Gene:NOTCH4 / 4855 HGNCID:7884 Length:2003 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001002827.1 Gene:Notch4 / 406162 RGDID:1303282 Length:1961 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1998 Identity:1585/1998 - (79%)
Similarity:1705/1998 - (85%) Gaps:47/1998 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     9 LLLLLLLLCVSVVRPRGLLCGSFPEPCANGGTCLSLSLGQGTCQCAPGFLGETCQFPDPCQNAQL 73
            ||||||.|...|:..|.||||..|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||.:.||
  Rat     6 LLLLLLPLSFPVILTRELLCGGSPEPCANGGTCLRLSQGQGTCQCAPGFLGETCQFPDPCWDTQL 70

Human    74 CQNGGSCQALLPAPLGLPSSPSPLTPSFLCTCLPGFTGERCQAKLEDPCPPSFCSKRGRCHIQAS 138
            |:||||||||||......|..|||||.|.|||..||||:|||:.||:.|||||||..|.|.:|.|
  Rat    71 CENGGSCQALLPTAPSSHSPTSPLTPHFSCTCPSGFTGDRCQSPLEELCPPSFCSNGGHCSVQVS 135

Human   139 GRPQCSCMPGWTGEQCQLRDFCSANPCVNGGVCLATYPQIQCHCPPGFEGHACERDVNECFQDPG 203
            |||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||.:||
  Rat   136 GRPQCSCEPGWTGEQCQLRDFCSANPCANGGVCLATYPQIQCRCPTGFEGHICERDVNECFLEPG 200

Human   204 PCPKGTSCHNTLGSFQCLCPVGQEGPRCELRAGPCPPRGCSNGGTCQLMPEKDSTFHLCLCPPGF 268
            |||:||||||||||||||||||||||:|:||.|.|.|..|.|||||||:||.|:|||||||||||
  Rat   201 PCPRGTSCHNTLGSFQCLCPVGQEGPQCKLRKGACLPGTCLNGGTCQLVPEGDTTFHLCLCPPGF 265

Human   269 IGPDCEVNPDNCVSHQCQNGGTCQDGLDTYTCLCPETWTGWDCSEDVDECETQGPPHCRNGGTCQ 333
            .|.:||:|||:||.:|||||.||||||.|||||||:||.|||||||:||||.||||.||||||||
  Rat   266 TGLNCEMNPDDCVRNQCQNGATCQDGLGTYTCLCPKTWKGWDCSEDIDECEAQGPPRCRNGGTCQ 330

Human   334 NSAGSFHCVCVSGWGGTSCEENLDDCIAATCAPGSTCIDRVGSFSCLCPPGRTGLLCHLEDMCLS 398
            ||||.|||||||||||..|:||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.
  Rat   331 NSAGGFHCVCVSGWGGEGCDENLDDCAAATCALGSTCIDRVGSFSCLCPPGRTGLLCHLEDMCLR 395

Human   399 QPCHGDAQCSTNPLTGSTLCLCQPGYSGPTCHQDLDECLMAQQGPSPCEHGGSCLNTPGSFNCLC 463
            ||||.:||||||||||||||:|||||||||||||||||.|||||||||||||||:||||||||||
  Rat   396 QPCHVNAQCSTNPLTGSTLCICQPGYSGPTCHQDLDECQMAQQGPSPCEHGGSCINTPGSFNCLC 460

Human   464 PPGYTGSRCEADHNECLSQPCHPGSTCLDLLATFHCLCPPGLEGQLCEVETNECASAPCLNHADC 528
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||:|||||.|||||.||||.|.|
  Rat   461 LPGYTGSRCEADHNECLSQPCHPGSTCLDLLATFQCLCPPGLEGRLCEVEINECASNPCLNQAAC 525

Human   529 HDLLNGFQCICLPGFSGTRCEEDIDECRSSPCANGGQCQDQPGAFHCKCLPGFEGPRCQTEVDEC 593
            ||.||||.|:|||||:|.|||:|:|||.|:||||||.||||||||||:||||||||||:||.|||
  Rat   526 HDQLNGFLCLCLPGFTGARCEKDMDECSSAPCANGGHCQDQPGAFHCECLPGFEGPRCETEADEC 590

Human   594 LSDPCPVGASCLDLPGAFFCLCPSGFTGQLCEVPLCAPNLCQPKQICKDQKDKANCLCPDGSPGC 658
            .|||||||||||||||||.|||..||||||||||||:|.||||.|.|:||:.:|.||||||||||
  Rat   591 RSDPCPVGASCLDLPGAFLCLCRPGFTGQLCEVPLCSPILCQPGQQCQDQEHRAPCLCPDGSPGC 655

Human   659 APPEDNCTCHHGHCQRSSCVCDVGWTGPECEAELGGCISAPCAHGGTCYPQPSGYNCTCPTGYTG 723
            .|.||:|.|||||||||.|||:.||||||||.|||||:|.||||||||:||||||||:|..||||
  Rat   656 VPAEDDCPCHHGHCQRSLCVCNEGWTGPECETELGGCLSTPCAHGGTCHPQPSGYNCSCLAGYTG 720

Human   724 PTCSEEMTACHSGPCLNGGSCNPSPGGYYCTCPPSHTGPQCQTSTDYCVSAPCFNGGTCVNRPGT 788
            .|||||:||||||||||||||:..|.||.||||||||||.|||:.|:|.||.|.|||||:::|||
  Rat   721 LTCSEEITACHSGPCLNGGSCSIHPEGYSCTCPPSHTGPHCQTAVDHCASASCLNGGTCMSKPGT 785

Human   789 FSCLCAMGFQGPRCEGKLRPSCADSPCRNRATCQDSPQGPRCLCPTGYTGGSCQTLMDLCAQKPC 853
            |.|.||.||||..||.|:.|||||:||||:|||||:|:|.||||..||||.|||||:||||:|||
  Rat   786 FFCHCATGFQGLHCEKKIHPSCADNPCRNKATCQDTPRGARCLCSPGYTGSSCQTLIDLCARKPC 850

Human   854 PRNSHCLQTGPSFHCLCLQGWTGPLCNLPLSSCQKAALSQGIDVSSLCHNGGLCVDSGPSYFCHC 918
            |..:.|||:||||||||.|||||.||:||| |||.||:|||:::|:||.|||||:|:|.||||.|
  Rat   851 PHTARCLQSGPSFHCLCHQGWTGSLCDLPL-SCQAAAMSQGVEISNLCQNGGLCIDTGSSYFCRC 914

Human   919 PPGFQGSLCQDHVNPCESRPCQNGATCMAQPSGYLCQCAPGYDGQNCSKELDACQSQPCHNHGTC 983
            ||||:|.||||.||||.|:||.:||||:.||:||:|||||||:||||||..|||||.||||||||
  Rat   915 PPGFEGKLCQDTVNPCTSKPCLHGATCVPQPNGYVCQCAPGYEGQNCSKVHDACQSGPCHNHGTC 979

Human   984 TPKPGGFHCACPPGFVGLRCEGDVDECLDQPCHPTGTAACHSLANAFYCQCLPGHTGQWCEVEID 1048
            ||:||||||||||||||||||||||||||:||||:|||:|||||||||||||||||||.||||:|
  Rat   980 TPRPGGFHCACPPGFVGLRCEGDVDECLDRPCHPSGTASCHSLANAFYCQCLPGHTGQRCEVEMD 1044

Human  1049 PCHSQPCFHGGTCEATAGSPLGFICHCPKGFEGPTCSHRAPSCGFHHCHHGGLCLPSPKPGFPPR 1113
            .|.||||.:||:||.|.|.|.||.|.||:||||||||.:||:||.||||:|||||||||||.||.
  Rat  1045 LCQSQPCSNGGSCEVTTGPPPGFTCRCPEGFEGPTCSRKAPACGNHHCHNGGLCLPSPKPGSPPL 1109

Human  1114 CACLSGYGGPDCLTPPAPKGCGPPSPCLYNGSCSETTGLGGPGFRCSCPHSSPGPRCQKPGAKGC 1178
            ||||||:|||||||||||.||||||||::||||:||.|||.|||:|:||..|||||||:|||.||
  Rat  1110 CACLSGFGGPDCLTPPAPPGCGPPSPCMHNGSCTETPGLGNPGFQCTCPPDSPGPRCQRPGANGC 1174

Human  1179 EGRSGDGACDAGCSGPGGNWDGGDCSLGVPDPWKGCPSHSRCWLLFRDGQCHPQCDSEECLFDGY 1243
            |||.||||||||||||||:||||||||||||||||||.||:||||||||:|||||||||||||||
  Rat  1175 EGRGGDGACDAGCSGPGGDWDGGDCSLGVPDPWKGCPPHSQCWLLFRDGRCHPQCDSEECLFDGY 1239

Human  1244 DCETPPACTPAYDQYCHDHFHNGHCEKGCNTAECGWDGGDCRPEDGDPEWGPSLALLVVLSPPAL 1308
            |||.||.|||||||||.|||||||||||||.|:|||||||||||..|.|.|||||||||||||||
  Rat  1240 DCEIPPTCTPAYDQYCRDHFHNGHCEKGCNNAQCGWDGGDCRPEGDDSEGGPSLALLVVLSPPAL 1304

Human  1309 DQQLFALARVLSLTLRVGLWVRKDRDGRDMVYPYPGARAEEKLGGTRDPTYQERAAPQTQPLGKE 1373
            ||||.|||||||||||||||||||.:||:||:||||.||:|:|.||||.:..||.||.||..|||
  Rat  1305 DQQLLALARVLSLTLRVGLWVRKDSEGRNMVFPYPGTRAKEELSGTRDSSSWERQAPHTQTPGKE 1369

Human  1374 TDSLSAGFVVVMGVDLSRCGPDHPASRCPWDPGLLLRFLAAMAAVGALEPLLPGPLLAVHPHAGT 1438
            |:||.||||||||||||||||:|||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.||.|||
  Rat  1370 TESLGAGFVVVMGVDLSRCGPEHPASRCPRDSGLLLRFLAAMAAVGALEPLLPGPLLAAHPQAGT 1434

Human  1439 APPANQLPWPVLCSPVAGVILLALGALLVLQLIRRRRREHGALWLPPGFTRRPRTQSAPHRRRPP 1503
            ..||.:||||:|||||.||:|||||||||||||||||||||||||||||.|||:||.||||||||
  Rat  1435 GSPATRLPWPILCSPVVGVLLLALGALLVLQLIRRRRREHGALWLPPGFIRRPQTQQAPHRRRPP 1499

Human  1504 LGEDSIGLKALKPKAEVDEDGVVMCSGPEEGEEVGQAEETGPPSTCQLWSLSGGCGALPQAAMLT 1568
            ||||:||||||||:||||||||||||||||||    ||:|...|.||||.|..||..||||.|||
  Rat  1500 LGEDNIGLKALKPEAEVDEDGVVMCSGPEEGE----AEKTASASRCQLWPLRSGCEGLPQAVMLT 1560

Human  1569 PPQESEMEAPDLDTRGPDGVTPLMSAVCCGEVQSGTFQGAWLGCPEPWEPLLDGGACPQAHTVGT 1633
            ||||.|.|.||.||.||||||||||||.||.|||.|.|...||.|||||||||.|||||||||||
  Rat  1561 PPQECESELPDSDTCGPDGVTPLMSAVFCGGVQSTTVQRLGLGNPEPWEPLLDRGACPQAHTVGT 1625

Human  1634 GETPLHLAARFSRPTAARRLLEAGANPNQPDRAGRTPLHAAVAADAREVCQLLLRSRQTAVDART 1698
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
  Rat  1626 GETPLHLAARFSRPTAARRLLEAGANPNQPDRAGRTPLHTAVAADAREVCQLLLASRQTAVDART 1690

Human  1699 EDGTTPLMLAARLAVEDLVEELIAAQADVGARDKWGKTALHWAAAVNNARAARSLLQAGADKDAQ 1763
            :||||||||||||||||||||||||:||||||||.||||||||||||||||||.|||.|||||||
  Rat  1691 DDGTTPLMLAARLAVEDLVEELIAARADVGARDKRGKTALHWAAAVNNARAARCLLQTGADKDAQ 1755

Human  1764 DNREQTPLFLAAREGAVEVAQLLLGLGAARELRDQAGLAPADVAHQRNHWDLLTLLEGAGP--PE 1826
            |:||||||||||||||||||||||.:||||.|||||||||||||.||:|||||||||||||  .|
  Rat  1756 DSREQTPLFLAAREGAVEVAQLLLEIGAARGLRDQAGLAPADVARQRSHWDLLTLLEGAGPITQE 1820

Human  1827 ARHKA--TPGREAGPFPRARTVSVSVPPHGGGALPRCRTLSAGAGPRGGGACLQARTWSVDLAAR 1889
            ||..|  ||                    ||||.||||||||||.|||||||||||||||||.||
  Rat  1821 ARSHARNTP--------------------GGGAAPRCRTLSAGARPRGGGACLQARTWSVDLGAR 1865

Human  1890 GGGAYSHCRSLSGVGAGGGPTPRGRRFSAGMRGPRPNPAIMRGRYGVAAGRGGRVSTDDWPCDWV 1954
            .|..|:.|||.|  |..|||:.||||.||..||                .||.|||.||||.|||
  Rat  1866 RGAVYARCRSRS--GGSGGPSMRGRRLSADSRG----------------RRGARVSQDDWPRDWV 1912

Human  1955 ALGACGSASNIPIPPPCLTPSPERGSPQLDCGPPALQEMPINQGGEGK 2002
            ||.|||||.:.|||||.|||||||||||:..|.|..||:|:|.||..:
  Rat  1913 ALEACGSACSAPIPPPSLTPSPERGSPQVSWGLPVHQEVPLNSGGRNQ 1960

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
NOTCH4NP_004548.3 EGF_CA 194..225 CDD:429571 27/30 (90%)
EGF 280..308 CDD:394967 22/27 (81%)
EGF_CA 314..353 CDD:238011 32/38 (84%)
EGF_CA <364..390 CDD:238011 24/25 (96%)
EGF_CA 432..473 CDD:238011 37/40 (93%)
EGF_CA 475..511 CDD:238011 33/35 (94%)
EGF_CA 515..549 CDD:238011 25/33 (76%)
EGF_CA 551..587 CDD:238011 30/35 (86%)
EGF_CA 590..625 CDD:238011 29/34 (85%)
EGF_CA <699..726 CDD:238011 21/26 (81%)
EGF_CA <736..765 CDD:238011 22/28 (79%)
EGF_CA 769..803 CDD:238011 21/33 (64%)
EGF_CA <813..842 CDD:238011 20/28 (71%)
EGF_CA <899..928 CDD:238011 20/28 (71%)
EGF_CA 931..965 CDD:238011 24/33 (73%)
EGF_CA 970..1004 CDD:238011 31/33 (94%)
EGF_CA 1047..1084 CDD:238011 23/36 (64%)
Notch 1168..1204 CDD:459658 31/35 (89%)
LNR 1 1170..1213 38/42 (90%)
Notch 1211..1246 CDD:459658 31/34 (91%)
LNR 2 1214..1250 31/35 (89%)
Notch 1249..1285 CDD:459658 31/35 (89%)
LNR 3 1251..1294 36/42 (86%)
NOD 1295..1344 CDD:462014 43/48 (90%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1347..1371 13/23 (57%)
NODP 1379..>1420 CDD:462229 37/40 (93%)
JMTM_Notch4 1431..1515 CDD:411988 70/83 (84%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1485..1508 19/22 (86%)
ANK repeat 1586..1630 CDD:293786 34/43 (79%)
ANKYR <1619..1823 CDD:440430 189/203 (93%)
ANK 1 1633..1665 31/31 (100%)
ANK repeat 1634..1664 CDD:293786 29/29 (100%)
ANK repeat 1666..1698 CDD:293786 29/31 (94%)
ANK 2 1666..1698 29/31 (94%)
ANK 3 1700..1732 30/31 (97%)
ANK repeat 1700..1731 CDD:293786 29/30 (97%)
ANK 4 1733..1765 28/31 (90%)
ANK repeat 1733..1764 CDD:293786 27/30 (90%)
ANK 5 1766..1798 28/31 (90%)
ANK repeat 1766..1797 CDD:293786 27/30 (90%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1900..1927 13/26 (50%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1968..2003 22/35 (63%)
Notch4NP_001002827.1 EGF_CA 191..222 CDD:429571 27/30 (90%)
EGF_CA 311..349 CDD:238011 32/37 (86%)
EGF_CA 352..387 CDD:238011 32/34 (94%)
EGF_CA 429..470 CDD:238011 37/40 (93%)
EGF_CA 472..508 CDD:238011 33/35 (94%)
EGF_CA 511..546 CDD:238011 25/34 (74%)
EGF_CA 548..584 CDD:238011 30/35 (86%)
EGF_CA 588..622 CDD:238011 29/33 (88%)
EGF_CA <696..723 CDD:238011 21/26 (81%)
EGF_CA 765..800 CDD:238011 21/34 (62%)
EGF_CA <810..839 CDD:238011 20/28 (71%)
EGF_CA 892..924 CDD:238011 21/31 (68%)
EGF_CA 927..961 CDD:238011 24/33 (73%)
EGF_CA 966..1000 CDD:238011 31/33 (94%)
EGF_CA 1002..1040 CDD:238011 33/37 (89%)
Notch 1207..1242 CDD:459658 31/34 (91%)
Notch 1245..1281 CDD:459658 31/35 (89%)
NOD 1291..1340 CDD:462014 43/48 (90%)
JMTM_Notch4 1436..1511 CDD:411988 64/74 (86%)
ANKYR <1611..1828 CDD:440430 196/216 (91%)
ANK repeat 1626..1656 CDD:293786 29/29 (100%)
ANK repeat 1658..1690 CDD:293786 29/31 (94%)
ANK repeat 1692..1723 CDD:293786 29/30 (97%)
ANK repeat 1725..1756 CDD:293786 27/30 (90%)
ANK repeat 1758..1789 CDD:293786 27/30 (90%)
ANK repeat 1791..1827 CDD:293786 28/35 (80%)

Return to query results.
Submit another query.