DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment NOTCH2 and Notch2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_077719.2 Gene:NOTCH2 / 4853 HGNCID:7882 Length:2471 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_035058.2 Gene:Notch2 / 18129 MGIID:97364 Length:2473 Species:Mus musculus


Alignment Length:2474 Identity:2287/2474 - (92%)
Similarity:2376/2474 - (96%) Gaps:4/2474 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MPALRPALLWALLALWLCCAAPAHALQCRDGYEPCVNEGMCVTYHNGTGYCKCPEGFLGEYCQHR 65
            |||||||.|.|||.||||.|.||||||||.|.|||||||.|||||||||:|:|||||||||||||
Mouse     1 MPALRPAALRALLWLWLCGAGPAHALQCRGGQEPCVNEGTCVTYHNGTGFCRCPEGFLGEYCQHR 65

Human    66 DPCEKNRCQNGGTCVAQAMLGKATCRCASGFTGEDCQYSTSHPCFVSRPCLNGGTCHMLSRDTYE 130
            |||||||||||||||.|.||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Mouse    66 DPCEKNRCQNGGTCVPQGMLGKATCRCAPGFTGEDCQYSTSHPCFVSRPCQNGGTCHMLSRDTYE 130

Human   131 CTCQVGFTGKECQWTDACLSHPCANGSTCTTVANQFSCKCLTGFTGQKCETDVNECDIPGHCQHG 195
            ||||||||||:||||||||||||.||||||:||:||||||..|.||||||.|:|||||||.||||
Mouse   131 CTCQVGFTGKQCQWTDACLSHPCENGSTCTSVASQFSCKCPAGLTGQKCEADINECDIPGRCQHG 195

Human   196 GTCLNLPGSYQCQCPQGFTGQYCDSLYVPCAPSPCVNGGTCRQTGDFTFECNCLPGFEGSTCERN 260
            ||||||||||:||||||||||:|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   196 GTCLNLPGSYRCQCPQGFTGQHCDSPYVPCAPSPCVNGGTCRQTGDFTFECNCLPGFEGSTCERN 260

Human   261 IDDCPNHRCQNGGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVDECLLQPNACQNGGTCANRNGGYGCV 325
            |||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Mouse   261 IDDCPNHKCQNGGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVDECLLQPNACQNGGTCTNRNGGYGCV 325

Human   326 CVNGWSGDDCSENIDDCAFASCTPGSTCIDRVASFSCMCPEGKAGLLCHLDDACISNPCHKGALC 390
            ||||||||||||||||||:||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||
Mouse   326 CVNGWSGDDCSENIDDCAYASCTPGSTCIDRVASFSCLCPEGKAGLLCHLDDACISNPCHKGALC 390

Human   391 DTNPLNGQYICTCPQGYKGADCTEDVDECAMANSNPCEHAGKCVNTDGAFHCECLKGYAGPRCEM 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   391 DTNPLNGQYICTCPQGYKGADCTEDVDECAMANSNPCEHAGKCVNTDGAFHCECLKGYAGPRCEM 455

Human   456 DINECHSDPCQNDATCLDKIGGFTCLCMPGFKGVHCELEINECQSNPCVNNGQCVDKVNRFQCLC 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||
Mouse   456 DINECHSDPCQNDATCLDKIGGFTCLCMPGFKGVHCELEVNECQSNPCVNNGQCVDKVNRFQCLC 520

Human   521 PPGFTGPVCQIDIDDCSSTPCLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGVLCEENIDNCDPDPCHHGQCQ 585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||:|||||||||||||||||
Mouse   521 PPGFTGPVCQIDIDDCSSTPCLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGILCDENIDNCDPDPCHHGQCQ 585

Human   586 DGIDSYTCICNPGYMGAICSDQIDECYSSPCLNDGRCIDLVNGYQCNCQPGTSGVNCEINFDDCA 650
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||
Mouse   586 DGIDSYTCICNPGYMGAICSDQIDECYSSPCLNDGRCIDLVNGYQCNCQPGTSGLNCEINFDDCA 650

Human   651 SNPCIHGICMDGINRYSCVCSPGFTGQRCNIDIDECASNPCRKGATCINGVNGFRCICPEGPHHP 715
            ||||:||:|:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Mouse   651 SNPCMHGVCVDGINRYSCVCSPGFTGQRCNIDIDECASNPCRKGATCINDVNGFRCICPEGPHHP 715

Human   716 SCYSQVNECLSNPCIHGNCTGGLSGYKCLCDAGWVGINCEVDKNECLSNPCQNGGTCDNLVNGYR 780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||:|||||||
Mouse   716 SCYSQVNECLSNPCIHGNCTGGLSGYKCLCDAGWVGVNCEVDKNECLSNPCQNGGTCNNLVNGYR 780

Human   781 CTCKKGFKGYNCQVNIDECASNPCLNQGTCFDDISGYTCHCVLPYTGKNCQTVLAPCSPNPCENA 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||:|||||||||||||||||||||||
Mouse   781 CTCKKGFKGYNCQVNIDECASNPCLNQGTCFDDVSGYTCHCMLPYTGKNCQTVLAPCSPNPCENA 845

Human   846 AVCKESPNFESYTCLCAPGWQGQRCTIDIDECISKPCMNHGLCHNTQGSYMCECPPGFSGMDCEE 910
            |||||:|||||::|||||||||:|||:|:||||||||||:|:||||||||:||||||||||||||
Mouse   846 AVCKEAPNFESFSCLCAPGWQGKRCTVDVDECISKPCMNNGVCHNTQGSYVCECPPGFSGMDCEE 910

Human   911 DIDDCLANPCQNGGSCMDGVNTFSCLCLPGFTGDKCQTDMNECLSEPCKNGGTCSDYVNSYTCKC 975
            ||:|||||||||||||:|.||||||.|.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|
Mouse   911 DINDCLANPCQNGGSCVDHVNTFSCQCHPGFIGDKCQTDMNECLSEPCKNGGTCSDYVNSYTCTC 975

Human   976 QAGFDGVHCENNINECTESSCFNGGTCVDGINSFSCLCPVGFTGSFCLHEINECSSHPCLNEGTC 1040
            .|||.||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||.||||:||||||:||||.|||
Mouse   976 PAGFHGVHCENNIDECTESSCFNGGTCVDGINSFSCLCPVGFTGPFCLHDINECSSNPCLNAGTC 1040

Human  1041 VDGLGTYRCSCPLGYTGKNCQTLVNLCSRSPCKNKGTCVQKKAESQCLCPSGWAGAYCDVPNVSC 1105
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||:||...||||.||.||||||.||||
Mouse  1041 VDGLGTYRCICPLGYTGKNCQTLVNLCSRSPCKNKGTCVQEKARPHCLCPPGWDGAYCDVLNVSC 1105

Human  1106 DIAASRRGVLVEHLCQHSGVCINAGNTHYCQCPLGYTGSYCEEQLDECASNPCQHGATCSDFIGG 1170
            ..||.::||.|||||||||:||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||:|||||
Mouse  1106 KAAALQKGVPVEHLCQHSGICINAGNTHHCQCPLGYTGSYCEEQLDECASNPCQHGATCNDFIGG 1170

Human  1171 YRCECVPGYQGVNCEYEVDECQNQPCQNGGTCIDLVNHFKCSCPPGTRGLLCEENIDDCARGPHC 1235
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||.||||
Mouse  1171 YRCECVPGYQGVNCEYEVDECQNQPCQNGGTCIDLVNHFKCSCPPGTRGLLCEENIDECAGGPHC 1235

Human  1236 LNGGQCMDRIGGYSCRCLPGFAGERCEGDINECLSNPCSSEGSLDCIQLTNDYLCVCRSAFTGRH 1300
            ||||||:||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||:||.|:|.|:|||||||||
Mouse  1236 LNGGQCVDRIGGYTCRCLPGFAGERCEGDINECLSNPCSSEGSLDCVQLKNNYNCICRSAFTGRH 1300

Human  1301 CETFVDVCPQMPCLNGGTCAVASNMPDGFICRCPPGFSGARCQSSCGQVKCRKGEQCVHTASGPR 1365
            ||||:|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||:||.||||
Mouse  1301 CETFLDVCPQKPCLNGGTCAVASNMPDGFICRCPPGFSGARCQSSCGQVKCRRGEQCIHTDSGPR 1365

Human  1366 CFCPSPRDCESGCASSPCQHGGSCHPQRQPPYYSCQCAPPFSGSRCELYTAPPSTPPATCLSQYC 1430
            |||.:|:||||||||:||||||:|:||||||:|||:|.|.|.||.|||||||.|||||||.||||
Mouse  1366 CFCLNPKDCESGCASNPCQHGGTCYPQRQPPHYSCRCPPSFGGSHCELYTAPTSTPPATCQSQYC 1430

Human  1431 ADKARDGVCDEACNSHACQWDGGDCSLTMENPWANCSSPLPCWDYINNQCDELCNTVECLFDNFE 1495
            |||||||:||||||||||||||||||||||:|||||:|.|.||:||||||||.|||.||||||||
Mouse  1431 ADKARDGICDEACNSHACQWDGGDCSLTMEDPWANCTSTLRCWEYINNQCDEQCNTAECLFDNFE 1495

Human  1496 CQGNSKTCKYDKYCADHFKDNHCDQGCNSEECGWDGLDCAADQPENLAEGTLVIVVLMPPEQLLQ 1560
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||:||||:|||||||
Mouse  1496 CQRNSKTCKYDKYCADHFKDNHCDQGCNSEECGWDGLDCASDQPENLAEGTLIIVVLLPPEQLLQ 1560

Human  1561 DARSFLRALGTLLHTNLRIKRDSQGELMVYPYYGEKSAAMKKQRMTRRSLP--GEQEQEVAGSKV 1623
            |:||||||||||||||||||:||||.||||||:||||||||||:|||||||  .||||||.|||:
Mouse  1561 DSRSFLRALGTLLHTNLRIKQDSQGALMVYPYFGEKSAAMKKQKMTRRSLPEEQEQEQEVIGSKI 1625

Human  1624 FLEIDNRQCVQDSDHCFKNTDAAAALLASHAIQGTLSYPLVSVVSESLTPERTQLLYLLAVAVVI 1688
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||..:|...||||||||||||
Mouse  1626 FLEIDNRQCVQDSDQCFKNTDAAAALLASHAIQGTLSYPLVSVFSELESPRNAQLLYLLAVAVVI 1690

Human  1689 ILFIILLGVIMAKRKRKHGSLWLPEGFTLRRDASNHKRREPVGQDAVGLKNLSVQVSEANLIGTG 1753
            |||.|||||||||||||||.||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||:|
Mouse  1691 ILFFILLGVIMAKRKRKHGFLWLPEGFTLRRDSSNHKRREPVGQDAVGLKNLSVQVSEANLIGSG 1755

Human  1754 TSEHWVDDEGPQPKKVKAEDEALLSEEDDPIDRRPWTQQHLEAADIRRTPSLALTPPQAEQEVDV 1818
            |||||||||||||||.||||||||| |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Mouse  1756 TSEHWVDDEGPQPKKAKAEDEALLS-EDDPIDRRPWTQQHLEAADIRHTPSLALTPPQAEQEVDV 1819

Human  1819 LDVNVRGPDGCTPLMLASLRGGSSDLSDEDEDAEDSSANIITDLVYQGASLQAQTDRTGEMALHL 1883
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1820 LDVNVRGPDGCTPLMLASLRGGSSDLSDEDEDAEDSSANIITDLVYQGASLQAQTDRTGEMALHL 1884

Human  1884 AARYSRADAAKRLLDAGADANAQDNMGRCPLHAAVAADAQGVFQILIRNRVTDLDARMNDGTTPL 1948
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1885 AARYSRADAAKRLLDAGADANAQDNMGRCPLHAAVAADAQGVFQILIRNRVTDLDARMNDGTTPL 1949

Human  1949 ILAARLAVEGMVAELINCQADVNAVDDHGKSALHWAAAVNNVEATLLLLKNGANRDMQDNKEETP 2013
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1950 ILAARLAVEGMVAELINCQADVNAVDDHGKSALHWAAAVNNVEATLLLLKNGANRDMQDNKEETP 2014

Human  2014 LFLAAREGSYEAAKILLDHFANRDITDHMDRLPRDVARDRMHHDIVRLLDEYNVTPSPPGTVLTS 2078
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2015 LFLAAREGSYEAAKILLDHFANRDITDHMDRLPRDVARDRMHHDIVRLLDEYNVTPSPPGTVLTS 2079

Human  2079 ALSPVICGPNRSFLSLKHTPMGKKSRRPSAKSTMPTSLPNLAKEAKDAKGSRRKKSLSEKVQLSE 2143
            |||||:||||||||||||||||||:|||:.|||||||||||||||||||||||||.|:|||||||
Mouse  2080 ALSPVLCGPNRSFLSLKHTPMGKKARRPNTKSTMPTSLPNLAKEAKDAKGSRRKKCLNEKVQLSE 2144

Human  2144 SSVTLSPVDSLESPHTYVSDTTSSPMITSPGILQASPNPMLATAAPPAPVHAQHALSFSNLHEMQ 2208
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|:||.|||.||||.||||||||||:||
Mouse  2145 SSVTLSPVDSLESPHTYVSDATSSPMITSPGILQASPTPLLAAAAPAAPVHTQHALSFSNLHDMQ 2209

Human  2209 PLAHGASTVLPSVSQLLSHHHIVSPGSGSAGSLSRLHPVPVPADWMNRMEVNETQYNEMFGMVLA 2273
            |||.||||||||||||||||||..|||.|||||.||||||||||||||:|:|||||:||||||||
Mouse  2210 PLAPGASTVLPSVSQLLSHHHIAPPGSSSAGSLGRLHPVPVPADWMNRVEMNETQYSEMFGMVLA 2274

Human  2274 PAEGTHPGI-APQSRPPEGKHITTPREPLPPIVTFQLIPKGSIAQPAGAPQPQSTCPPAVAGPLP 2337
            ||||.|||| |||||||||||::|.||||||||||||||||||||.|||||.||:||||||||||
Mouse  2275 PAEGAHPGIAAPQSRPPEGKHMSTQREPLPPIVTFQLIPKGSIAQAAGAPQTQSSCPPAVAGPLP 2339

Human  2338 TMYQIPEMARLPSVAFPTAMMPQQDGQVAQTILPAYHPFPASVGKYPTPPSQHSYASSNAAERTP 2402
            :|||||||.||||||||..|||||:|||||||:|.||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2340 SMYQIPEMPRLPSVAFPPTMMPQQEGQVAQTIVPTYHPFPASVGKYPTPPSQHSYASSNAAERTP 2404

Human  2403 SHSGHLQGEHPYLTPSPESPDQWSSSSPHSASDWSDVTTSPTPGGAGGGQRGPGTHMSEPPHNNM 2467
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||:||
Mouse  2405 SHGGHLQGEHPYLTPSPESPDQWSSSSPHSASDWSDVTTSPTPGGGGGGQRGPGTHMSEPPHSNM 2469

Human  2468 QVYA 2471
            ||||
Mouse  2470 QVYA 2473

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
NOTCH2NP_077719.2 EGF_CA 182..218 CDD:238011 32/35 (91%)
EGF_CA 260..296 CDD:238011 34/35 (97%)
EGF_CA 298..335 CDD:238011 35/36 (97%)
EGF_CA 415..454 CDD:238011 38/38 (100%)
EGF_CA 456..492 CDD:238011 35/35 (100%)
EGF_CA 495..530 CDD:238011 33/34 (97%)
EGF_CA 532..568 CDD:238011 34/35 (97%)
EGF_CA 570..604 CDD:238011 33/33 (100%)
EGF_CA 608..643 CDD:238011 33/34 (97%)
EGF_CA 645..679 CDD:238011 30/33 (91%)
EGF_CA 682..717 CDD:238011 33/34 (97%)
EGF_CA 757..793 CDD:238011 34/35 (97%)
EGF_CA 795..831 CDD:238011 33/35 (94%)
EGF_CA 873..909 CDD:238011 31/35 (89%)
EGF_CA 911..947 CDD:238011 29/35 (83%)
EGF_CA 949..985 CDD:238011 32/35 (91%)
EGF_CA 987..1022 CDD:238011 32/34 (94%)
EGF_CA 1026..1061 CDD:238011 31/34 (91%)
EGF_CA 1117..1147 CDD:238011 27/29 (93%)
EGF_CA 1151..1185 CDD:238011 32/33 (97%)
EGF_CA 1188..1223 CDD:238011 34/34 (100%)
EGF_CA 1225..1262 CDD:238011 32/36 (89%)
EGF_CA 1264..1302 CDD:238011 32/37 (86%)
EGF_CA <1312..1343 CDD:238011 30/30 (100%)
Notch 1423..1456 CDD:459658 30/32 (94%)
Notch 1463..1497 CDD:459658 27/33 (82%)
Notch 1501..1534 CDD:459658 32/32 (100%)
NOD 1539..1594 CDD:462014 49/54 (91%)
NODP 1618..1673 CDD:462229 48/54 (89%)
JMTM_Notch2 1659..1740 CDD:411986 70/80 (88%)
ANK repeat 1827..1874 CDD:293786 46/46 (100%)
ANKYR <1851..2066 CDD:440430 214/214 (100%)
ANK repeat 1877..1907 CDD:293786 29/29 (100%)
ANK repeat 1943..1974 CDD:293786 30/30 (100%)
ANK repeat 1976..2007 CDD:293786 30/30 (100%)
ANK repeat 2009..2040 CDD:293786 30/30 (100%)
DUF5585 2068..2422 CDD:465521 317/354 (90%)
Notch2NP_035058.2 EGF_CA 109..143 CDD:238011 31/33 (94%)
EGF_CA 182..218 CDD:238011 32/35 (91%)
EGF_CA 260..296 CDD:238011 34/35 (97%)
EGF_CA 298..335 CDD:238011 35/36 (97%)
EGF_CA 415..454 CDD:238011 38/38 (100%)
EGF_CA 456..492 CDD:238011 35/35 (100%)
EGF_CA 495..530 CDD:238011 33/34 (97%)
EGF_CA 532..567 CDD:238011 33/34 (97%)
EGF_CA 570..604 CDD:238011 33/33 (100%)
EGF_CA 608..643 CDD:238011 33/34 (97%)
EGF_CA 645..679 CDD:238011 30/33 (91%)
EGF_CA 682..717 CDD:238011 33/34 (97%)
EGF_CA 757..793 CDD:238011 34/35 (97%)
EGF_CA 795..831 CDD:238011 33/35 (94%)
EGF_CA 873..909 CDD:238011 31/35 (89%)
EGF_CA 911..947 CDD:238011 29/35 (83%)
EGF_CA 949..985 CDD:238011 32/35 (91%)
EGF_CA 987..1022 CDD:238011 32/34 (94%)
EGF_CA 1025..1061 CDD:238011 31/35 (89%)
EGF_CA 1117..1147 CDD:238011 27/29 (93%)
EGF_CA 1151..1185 CDD:238011 32/33 (97%)
EGF_CA 1188..1223 CDD:238011 34/34 (100%)
EGF_CA 1225..1262 CDD:238011 32/36 (89%)
EGF_CA 1264..1302 CDD:238011 32/37 (86%)
EGF_CA <1312..1343 CDD:238011 30/30 (100%)
Notch 1423..1456 CDD:459658 30/32 (94%)
Negative regulatory region (NRR). /evidence=ECO:0000250 1425..1679 223/253 (88%)
Notch 1463..1497 CDD:459658 27/33 (82%)
Notch 1501..1534 CDD:459658 32/32 (100%)
NOD 1539..1594 CDD:462014 49/54 (91%)
NODP 1620..1675 CDD:462229 48/54 (89%)
JMTM_Notch2 1661..1742 CDD:411986 70/80 (88%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1755..1778 21/22 (95%)
ANK repeat 1828..1875 CDD:293786 46/46 (100%)
ANK 1 1828..1872 43/43 (100%)
ANKYR <1852..2067 CDD:440430 214/214 (100%)
ANK 2 1877..1906 28/28 (100%)
ANK repeat 1878..1908 CDD:293786 29/29 (100%)
ANK 3 1910..1940 29/29 (100%)
ANK repeat 1944..1975 CDD:293786 30/30 (100%)
ANK 4 1944..1973 28/28 (100%)
ANK repeat 1977..2008 CDD:293786 30/30 (100%)
ANK 5 1977..2006 28/28 (100%)
ANK repeat 2010..2041 CDD:293786 30/30 (100%)
ANK 6 2010..2039 28/28 (100%)
PHA03247 <2069..2424 CDD:223021 317/354 (90%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2098..2117 15/18 (83%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2122..2169 43/46 (93%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2382..2473 87/90 (97%)

Return to query results.
Submit another query.