Protein Alignment CNOT3 and Cnot3

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001427582.1
• Gene: CNOT3 / 4849
• HGNCID: 7879
• Length: 771
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: NP_001100941.2
• Gene: Cnot3 / 308311
• RGDID: 1304771
• Length: 751
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 771
• Identity: 719/771 - (93%)
• Similarity: 728/771 - (94%)
• Gaps: 20/771 - (2%)

Human     1 MADKRKLQGEIDRCLKKVSEGVEQFEDIWQKLHNAANANQKEKYEADLKKEIKKLQRLRDQIKTW 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MADKRKLQGEIDRCLKKVSEGVEQFEDIWQKLHNAANANQKEKYEADLKKEIKKLQRLRDQIKTW 65

Human    66 VASNEIKDKRQLIDNRKLIETQMERFKVVERETKTKAYSKEGLGLAQKVDPAQKEKEEVGQWLTN 130
            |||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 VASNEIKDKRQLIENRKLIETQMERFKVVERETKTKAYSKEGLGLAQKVDPAQKEKEEVGQWLTN 130

Human   131 TIDTLNMQVDQFESEVESLSVQTRKKKGDKDQKQDRIEGLKRHIEKHRYHVRMLETILRMLDNDS 195
            ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 TIDTLNMQVDQFESEVESLSVQTRKKKGDKD-KQDRIEGLKRHIEKHRYHVRMLETILRMLDNDS 194

Human   196 ILVDAIRKIKDDVEYYVDSSQDPDFEENEFLYDDLDLEDIPQALVATSPPSHSHMEDEIFNQSSS 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   195 ILVDAIRKIKDDVEYYVDSSQDPDFEENEFLYDDLDLEDIPQALVATSPPSHSHMEDEIFNQSSS 259

Human   261 TPTSTTSSSPIPPSPANCTTENSEDDKKRGRSTDSEVSQSPAKNGSKPVHSNQHPQSPAVPPTYP 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   260 TPTSTTSSSPIPPSPANCTTENSEDDKKRGRSTDSEVSQSPAKNGSKPVHSNQHPQSPAVPPTYP 324

Human   326 SGPPPAASALSTTPGNNGVPAPAAPPSALGPKASPAPSHNSGTPAPYAQAVAPPAPSGPSTTQPR 390
            ||||||.||||:||||||...|||||||||||||||||||||||||||||||||..||||..|||
  Rat   325 SGPPPATSALSSTPGNNGASTPAAPPSALGPKASPAPSHNSGTPAPYAQAVAPPNASGPSNAQPR 389

Human   391 PPSVQPSGGGGGGSGGGGSSSSSNSSAGGGAGKQNGATSYSSVVADSPAEVALSSSGGNNASSQA 455
            |||.|||||.||||  |||||:|||..|||||||||||||||||||||||||||||||::|||||
  Rat   390 PPSAQPSGGSGGGS--GGSSSNSNSGTGGGAGKQNGATSYSSVVADSPAEVALSSSGGSSASSQA 452

Human   456 LGPPSGPHNPPPSTSKEPSAAAPTGAGGVAPGSGNNSGGPSLLVPLPVNPPSSPTPSFSDAKAAG 520
            |||.||||||.|||.||.|.|||:|||.||.||||||||||||||||||||||||||||:|||||
  Rat   453 LGPTSGPHNPAPSTLKESSTAAPSGAGSVASGSGNNSGGPSLLVPLPVNPPSSPTPSFSEAKAAG 517

Human   521 ALLNGPPQFSTAPEIKAPEPLSSLKSMAERAAISSGIEDPVPTLHLTERDIILSSTSAPPASAQP 585
            .||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||.|:||
  Rat   518 TLLNGPPQFSTTPEIKAPEPLSSLKSMAERAAISSGIEDPVPTLHLTDRDIILSSTSAPPTSSQP 582

Human   586 PLQLSEVNIPLSLGVCPLGPVPLTKEQLYQQAMEEAAWHHMPHPSDSERIRQYLPRNPCPTPPYH 650
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   583 PLQLSEVNIPLSLGVCPLGPVSLTKEQLYQQAMEEAAWHHMPHPSDSERIRQYLPRNPCPTPPYH 647

Human   651 HQMPPPHSDTVEFYQRLSTETLFFIFYYLEGTKAQYLAAKALKKQSWRFHTKYMMWFQRHEEPKT 715
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   648 HQMPPPHSDTVEFYQRLSTETLFFIFYYLEGTKAQYLAAKALKKQSWRFHTKYMMWFQRHEEPKT 712

Human   716 ITDEFEQIPDHLLVHSLTAFSPGQGTYIYFDYEKWGQRKKEGFTFEYRYLEDRDLQ 771
            ||||||                 |||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   713 ITDEFE-----------------QGTYIYFDYEKWGQRKKEGFTFEYRYLEDRDLQ 751

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CNOT3	NP_001427582.1	None
Cnot3	NP_001100941.2	Not3	3..229	CDD:461155	224/226 (99%)
		PHA03247	<288..657	CDD:223021	337/370 (91%)
		NOT2_3_5	618..743	CDD:461199	124/141 (88%)