DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment l(2)03659 and Abcc6

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_610482.3 Gene:l(2)03659 / 47905 FlyBaseID:FBgn0010549 Length:1374 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_112275.1 Gene:Abcc6 / 81642 RGDID:620268 Length:1502 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1355 Identity:424/1355 - (31%)
Similarity:681/1355 - (50%) Gaps:128/1355 - (9%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    80 NEKEKVLPENPRARSNFISSLCFWYTIPIFRKGYRKTLDSTDLYRPLEEQKSDILGNRLCASWER 144
            :|..|.|...|.|.::|.|...||:...:..|||||.|...||:....|..|:.|.::|...|.|
  Rat   200 SEDSKPLNPCPEAEASFPSKAMFWWASGLLWKGYRKLLGPKDLWSLERENSSEELVSQLEREWRR 264

  Fly   145 EL-----------------------KNDGRSPSLVRALLRVF--GWQLGFPGLAIFVVELGLRTL 184
            ..                       :...|.| |:||:.|||  .:.||...|   |:....|..
  Rat   265 NFSELPGHKGHSGMGTPETEAFLQPERSQRGP-LLRAIWRVFRSTFLLGTLSL---VISDAFRFA 325

  Fly   185 QPIFLVKLISYFSGEPDAANAGFYYAVAQIVISALTVMILTPTTFGIHHVCFKMRVAMGSMIFRK 249
            .|..|...:.:......:|..|:..||...:.:.|..:......:.:..:..::|.|:..:::||
  Rat   326 VPKLLSLFLEFMGDLESSAWTGWLLAVLMFLSACLQTLFEQQYMYRVKVLQMRLRTAITGLVYRK 390

  Fly   250 ALRLTKGALGDTTSGHVVNLISNDIPRLDSAPYTVHYLWVGPLQVLVITYLMYQEIGISAVFGVL 314
            .|.|:.|:...:.:|.||||:|.|:.||..:...::.||:..|.::|....::|.:|.||:..|.
  Rat   391 VLVLSSGSRKSSAAGDVVNLVSVDVQRLVESILHLNGLWLLFLWIIVCFVYLWQLLGPSALTAVA 455

  Fly   315 FMLLFMPIQMYLGTRTSAIQLKAAERTDNRIRMVNEIISAIQVLKMYAWEQPFEQMVTHAREKEM 379
            ..|..:|:..::..:.|..|.:...:..:|.|:.:.::..::.:|.:.||..|.:.:.|.|.:|:
  Rat   456 VFLSLLPLNFFITKKRSFHQEEQMRQKASRARLTSSMLRTVRTIKSHGWECAFLERLLHIRGQEL 520

  Fly   380 NTIRQGQYIRGFDFARRIVLSRVAIFL-SLVGYVILGKV-----FTPEIAFMITAYYNVLLAAMS 438
            ..::...::    |:..:|..:|:.|| :||.:.:...|     ...|.||:.....::|..|.:
  Rat   521 GALKTSAFL----FSVSLVSFQVSTFLVALVVFAVHTLVAEDNAMDAEKAFVTLTVLSILNKAQA 581

  Fly   439 IYVPSAIIQTAQFLTSIRRVEQFMQSEELGSSDKSEGPSKDTVPGNPPSNNNEADLLKSAISIRD 503
             ::|.::....|...|..|:..|:..||:..:.....||:.:              .|..|||.:
  Rat   582 -FLPFSVHCLVQARVSFDRLAAFLCLEEVDPNGMVLSPSRCS--------------SKDRISIHN 631

  Fly   504 LKAKWDPNSPDYTLSGINLEIKPGSVVAVIGLTGSGKSSLIQAILGELKANSGQLQVNGSLSYTS 568
            ....|...||. .|.||||.:..|.::||:|..|:|||||:.|:||||....|.:.:.||::|..
  Rat   632 GTFAWSQESPP-CLHGINLTVPQGCLLAVVGPVGAGKSSLLSALLGELLKVEGSVSIEGSVAYVP 695

  Fly   569 QESWLFSGTVRQNILFGQPMDSQRYEEVVKKCALERDFDLLPLRDNTIVGERGATLSGGQKARIS 633
            ||:|:.:.:|.:|:.|.|.:|....:||::.|||..|....|...:|.|||:|..||||||.|:|
  Rat   696 QEAWVQNTSVVENVCFRQELDLPWLQEVLEACALGSDVASFPAGVHTPVGEQGMNLSGGQKQRLS 760

  Fly   634 LARSVYRKASIYLLDDPLSAVDASVARHLFDQCV--RGHLRGSTVVLVTHQEQFLPHVDQIVILA 696
            |||:|||:|::||:||||:|:||.|::.:|.|.:  .|.|:|:|.:||||....||..|||::||
  Rat   761 LARAVYRRAAVYLMDDPLAALDAHVSQEVFKQVIGPSGLLQGTTRILVTHTLHVLPQADQILVLA 825

  Fly   697 NGQIKALGDYESLL-KTGLITGLGSLSKTDKAKTEEQEPLNLNSPD-----------------NK 743
            ||.|..:|.|:.|| :.|.:.||...::....:.|.:......|.|                 ..
  Rat   826 NGTIAEMGSYQDLLHRNGALVGLLDGARQPAGEGEGEAHAAATSDDLGGFSGGGTPTRRPERPRP 890

  Fly   744 NEVTPIKENSEQT----------VGGSSSGKEHVERQESGGISLALYRKYFQA-GGGLVAFLVML 797
            ::..|:|.::.:.          |.|.::|::.|   :.|.:..|.|..|.:| |..|..:.:.|
  Rat   891 SDAAPVKGSTSEAQMEPSLDDVEVTGLTAGEDSV---QYGRVKSATYLSYLRAVGTPLCTYTLFL 952

  Fly   798 SSSVLAQVAVTGGDYFLTYWVK------KESTAAGHGEMEDMESKSMDVYKYTLIIILSVIMNLS 856
              .:..|||.....|:|:.|..      |:..:|..|.:            :.|:..|..|...:
  Rat   953 --FLCQQVASFCQGYWLSLWADDPVVDGKQMHSALRGSI------------FGLLGCLQAIGLFA 1003

  Fly   857 SSFLLFNIAKKASIRLHNTIFNRVTRADMHFFSINKHGSILNRFTKDMSQVDEVLPVVLVDVMQI 921
            |...:|....:||..|..::...|.|:.:.||.....|::||||:|:...||..:|..:..::..
  Rat  1004 SMAAVFLGGARASCLLFRSLLWDVARSPIGFFERTPVGNLLNRFSKETDIVDVDIPDKMRTLLTY 1068

  Fly   922 ALWLAGIIIVIANVNPLLLVPTLMLSVIFYHLRNLYLKTSRDLKRVEAINRSPVYSHLAASLNGL 986
            |..|..:.:.::...||.:|..|.|.:::...::||:.|...|:|:|:.:.|.|.||||.:..|.
  Rat  1069 AFGLLEVGLAVSMATPLAIVAILPLMLLYAGFQSLYVATCCQLRRLESASYSSVCSHLAETFQGS 1133

  Fly   987 TTIRALDAQRVLEKEFDSYQDAHSSAFFMYI-------STSQAFGYCMNCICVIYISIITLSFFA 1044
            ..:||..||.....:.|:..|.:....|..:       :..:..|   |.:..:..:...||...
  Rat  1134 QVVRAFQAQGPFTAQHDALMDENQRISFPRLVADRWLAANLELLG---NGLVFVAATCAVLSKAH 1195

  Fly  1045 FPPGNGADVGLVITQAMGLIDMVQWGVRQTAELENTMTAVERVVEYESIEPEGMLEAPDDKKPPK 1109
            ...|.   .|..::.|:.:...:||.||...:|||:|.|||||.:|.....|.....|.....| 
  Rat  1196 LSAGL---AGFSVSAALQVTQTLQWVVRSWTDLENSMVAVERVQDYVHTPKEAPWRLPSSAAQP- 1256

  Fly  1110 TWPEQGEIIFKELNLRYTPNAKAENVLKSLSFVIQPREKVGIVGRTGAGKSSLINALFRL-SYTD 1173
            .||..|:|.|::..||:.|  :....::.:|..|...||||||||||||||||...|.|| ..|:
  Rat  1257 LWPCGGQIEFRDFGLRHRP--ELPMAVQGVSLKIHAGEKVGIVGRTGAGKSSLTWGLLRLQEATE 1319

  Fly  1174 GSVLIDTRDTRQMGLHDLRRQISIIPQEPVLFSGTMRYNLDPFDEYSDEKLWGCLEEVKLKEVVS 1238
            |.:.||......||||.||.:|:||||:||||.|::|.|||...|.:||.:|..||.|:||..|:
  Rat  1320 GGIWIDGVPITDMGLHTLRSRITIIPQDPVLFPGSLRMNLDLLQENTDEGIWAALETVQLKAFVT 1384

  Fly  1239 DLPDGLASKISEGGTNFSVGQRQLVCLARAILRENRILVMDEATANVDPQTDGLIQATIRSKFRD 1303
            .||..|..:.|..|.:.||||:||:|||||:||:.:||::|||||:|||.|:..:||.:...|..
  Rat  1385 SLPGQLQYECSGQGDDLSVGQKQLLCLARALLRKTQILILDEATASVDPGTEIQMQAALERWFAQ 1449

  Fly  1304 CTVLTIAHRLHTIIDSDKVMVMDAGRVVEFGSPYELMTKSDSKVFHNLVNQSGRA 1358
            ||||.|||||.::::..:|:|||.|:|.|.|||.:|:.:..  :|:.|..:||.|
  Rat  1450 CTVLLIAHRLRSVMNCARVLVMDEGQVAESGSPAQLLAQKG--LFYRLAQESGLA 1502

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
l(2)03659NP_610482.3 PLN03130 83..1369 CDD:215595 423/1352 (31%)
Abcc6NP_112275.1 MRP_assoc_pro 36..1501 CDD:188098 422/1352 (31%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 854..909 5/54 (9%)

Return to query results.
Submit another query.